太行鸡脾脏SRBC免疫应答基因的筛选与分析

为筛选太行鸡脾脏组织中绵羊红细胞(sheep red blood cell,SRBC)免疫应答的关键基因和信号通路,本研究采用高通量测序技术,构建了太行鸡SRBC免疫组和对照组脾脏组织的数字基因表达谱,对差异表达的基因进行筛选与注释、GO分析和通路的功能显著性富集以及差异基因编码蛋白的互作网络分析。结果表明:太行鸡在免疫6 d后的SRBC抗体滴度平均值为7.653;与对照组相比,差异倍数在2倍以上的共有1 108个基因,其中496个上调表达,612个下调表达,412个上调基因只在免疫组表达,537个下调基因仅在对照组表达;上调基因主要涉及T细胞激活、淋巴细胞增殖和单核细胞增殖等生物学过程,下调基因主要参与免疫效应、防御效应、炎性效应、先天性免疫效应生物学过程;在分子注释系统数据库中注释到的免疫相关的显著调控通路有12条,包括抗原的加工递呈、Toll样受体信号通路、沙门氏菌感染、HTLV-Ⅰ感染和单纯疱疹病毒感染等;56个差异基因编码的蛋白产物存在相互作用,其中16个基因位于网络中心节点,部分差异基因与SRBC相关QTL重叠。初步认为抗原加工与递呈的MHCⅡ类分子途径、T细胞激活等调控通路及RAG2、FOS、MHC B-LBⅢ、HSP90AA1、CXCR4和HSPA8等基因可能是参与调控太行鸡SRBC免疫应答的重要信号通路和基因,但其功能和影响还有待于深入研究。     

基于脾脏转录组筛选北京油鸡和广明白鸡抗热应激相关功能基因

旨在通过对北京油鸡(BY)和“广明2号”白羽肉鸡B系(广明白鸡,GM)在热应激和正常饲养条件下的脾脏转录组进行分析,鉴定两鸡种在应对热应激时的差异表达基因和信号通路,解析不同鸡种耐热性能差异的分子调控机制。试验动物采用相同饲养条件下的25日龄北京油鸡和广明白鸡,测定异嗜性粒细胞与淋巴细胞的比值(H/L)、超氧化物歧化酶(SOD)和总抗氧化能力(T-AOC)等表型数据,采集脾脏组织进行转录组测序(RNA-Seq)。基于RNA-Seq数据,结合表型进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),筛选出与性状相关性较高的模块与基因。脾脏转录组测序结果表明,热应激组相比于对照组,北京油鸡中共鉴定到313个差异表达基因,其中169个上调表达,144个下调表达;广明白鸡中鉴定到235个差异表达基因,其中152个上调表达,83个下调表达。利用WGCNA分析,在北京油鸡中筛选出2个与H/L相关性较高的模块,在广明白鸡中筛选出4个与H/L和T-AOC强相关的模块。通过筛选模块中的Hub基因,发现两品种中均存在TRIM29基因,说明该基因可能在抗热应激方面发挥重要作用。本研究通过转录组分析,揭示了不同鸡种在热应...     

不同滴度鸭肠炎病毒感染对鸭脾脏的转录组变化分析

为探讨不同滴度鸭肠炎病毒(duck enteritis virus,DEV)感染对鸭组织器官转录组的影响,本研究采用2个不同DELD50滴度的DEV,接种50日龄健康鸭90h后,采集脾脏样本,高通量测序技术进行转录组测序,筛选差异表达基因,并应用GO与KEGG数据库进行分析。结果显示,当接种量为100×DELD5 0时,鸭脾脏差异表达基因有685个,其中上调基因341个,主要参与免疫反应、核糖体结构和酶活性等生物学过程,并在核糖体、氧化磷酸化和吞噬体信号通路中显著富集;下调基因为344个,主要参与细胞分化正调控、β转化生长因子生成正调控、酶与相关受体活性、细胞结构等生物学过程,并在细胞黏附分子、内吞作用、肠道免疫网络IgA产生、ECM受体互作、缝隙连接和黏着信号通路上显著富集。当接种量为10-2×DELD50时,鸭脾脏差异表达基因有485个,其中上调基因297个,主要参与细胞功能、蛋白结合和蛋白复合物等生物学过程,并在细胞黏附分子、吞噬体、肠道免疫网络IgA产生、球系列鞘糖脂生物合成及N-糖链合成信号通路中显著富集;下调基因188个,主要参与补体激活、肌肉组织活动调节、受体复合物、酶与受体活性等生物学过程,并在基础转录因子、PPAR信号通路、α-亚麻酸代谢等代谢途径与信号通路上显著富集。这些结果表明不同滴度DEV感染对鸭脾脏转录组产生不同的影响,为深入探究DEV致病分子机制提供基础资料。     

TLR4信号通路关键基因在断奶仔猪不同组织中的mRNA表达

本试验旨在研究Toll样受体4(TLR4)信号通路关键基因在断奶仔猪不同组织的分布情况。选择12头杜×长×大断奶仔猪,屠宰,取脾脏、胸腺、肠道淋巴结、下丘脑、垂体、肾上腺、肝脏、腓肠肌、皮下脂肪、空肠和回肠组织。应用实时荧光定量PCR技术测定TLR4信号通路关键基因,包括TLR4、髓样分化因子(MyD88)、IL-1受体相关激酶1(IRAK1)、肿瘤坏死因子受体相关因子6(TRAF6)、核因子-κB(NF-κB)和肿瘤坏死因子(TNF)-α在各组织的mRNA表达水平。结果表明:TLR4信号通路关键基因在所检测的11个组织中均有表达,并且组织分布规律基本一致。总体看来,主要在免疫组织(脾脏、胸腺、淋巴结)表达量较高,在皮下脂肪和肠道(空肠、回肠)表达量居中,在其他组织中表达量较低。TLR4信号通路关键基因在不同组织中表达差异较大,可能与仔猪各组织对病原的识别和抵抗能力有关。     

基于表达谱芯片筛选鸡不同部位皮肤组织差异表达基因

旨在筛选鸡不同部位(背部和腿部)皮肤组织中的差异表达基因,探讨二者皮肤毛囊出现表型差异的分子机制。以处于上市日龄的(63日龄)商品代肉鸡为素材,利用Agilent鸡全基因组表达谱芯片对皮肤厚度、毛囊密度和直径出现显著差异的背部和腿部皮肤组织mRNA表达水平进行检测,对与皮肤毛囊发生发育相关的候选基因及信号通路进行系统筛查,并运用实时荧光定量PCR技术对部分差异表达基因进行验证。结果显示,芯片分析共筛选到差异表达基因676个(|FC|≥2,P0.05),以腿部皮肤为参照,背部皮肤组织中上调基因223个,下调基因453个。荧光定量PCR验证部分差异表达基因的表达趋势与芯片结果基本一致。GO分析表明,差异表达基因参与细胞增殖和凋亡调控、Wnt信号通路、神经元分化、细胞间黏附调节、细胞命运的确定等生物学过程。KEGG信号通路分析发现,除了部分已知的与皮肤毛囊生长发育相关的信号通路(Wnt和Hedgehog信号通路),ECM受体相互作用、黏着、细胞黏附分子、黏合连接等信号通路也被富集。蛋白互作网络分析表明,这些差异表达基因相互作用形成一个调控网络,可能通过影响皮肤毛囊的生长发育和周期变化来影响皮肤毛囊的性状,推测ECM受体相互作用、黏着、运输等调控通路及DKK1、WNT3A、SHH、FGF1、IGF1等基因可能是参与鸡不同部位皮肤毛囊性状出现差异的重要调控通路和候选基因。     

不同血型狼山鸡免疫性能和TLR4信号通路基因表达的比较分析

为探讨不同血型狼山鸡免疫性能和TLR4信号通路相关基因表达的差异，200只狼山鸡半同胞家系群分为对照组（80只）和肠炎沙门菌攻毒组（SE组）（120只），1日龄嗉囊灌注107 CFU的肠炎沙门菌，7 d后采集雏鸡脾脏、盲肠以及血液，筛选狼山鸡半同胞中B13和B21血型个体，测定B13组和B21组盲肠载菌量及血液IgY、IgM、IL1β和IFNγ等免疫指标，并对不同血型狼山鸡TLR4信号通路中相关基因表达水平进行分析，结果发现对照组和SE组B21血型狼山鸡各项免疫指标均优于B13;SE组2种血型狼山鸡TLR4信号通路基因的表达量均显著高于对照组，TLR4-MyD88-NF-κB1信号通路中，除NF-κB1外，B21血型个体其余关键基因的mRNA表达水平显著低于B13血型个体，而TLR4-TRIF-IRF3信号通路中，除TLR4外，其余关键基因的mRNA表达水平显著高于B13血型个体。综上，B21血型通过抑制促炎因子表达与提高干扰素表达协同方式抵抗肠炎沙门菌感染。     

基于转录组测序鉴定雌性鸡胚性腺不对称发育相关候选基因

本研究旨在通过转录组测序（RNA-seq）鉴定雌性鸡胚性腺不对称发育相关候选基因,为确定雌性鸡胚性腺不对称发育的分子机制提供参考。随机选择6胚龄（E6）和8胚龄（E8）的雌鸡胚胎各18～24只,分离并采集其两侧性腺,每6～8个同侧同期性腺组成一个样品,匀浆后提取总RNA经质控后送商业公司进行转录组测序。每个样品3个生物学重复。通过基因差异表达分析,GO、KEGG信号通路分析和基因集变异分析（GSVA）,筛选雌性鸡胚性腺不对称发育相关候选基因和生物学通路。经实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对筛选出的差异表达基因进行验证。转录组差异表达分析结果显示雌性鸡胚左右两侧性腺在E6和E8分别存在195个和315个差异表达基因。GO功能富集和KEGG信号通路富集分析发现两侧性腺差异表达基因主要富集在卵子发生、细胞发育、piRNA代谢过程等生物学过程并筛选出Pou5f3、STK31、DMRTB1等与鸡胚性腺不对称发育相关的功能基因。本研究为进一步研究雌性鸡胚性腺不对称发育的分子调控机制提供了参考。     

不同品种鸡对肠炎沙门氏菌人工感染初期免疫应答反应的差异

本试验以中国地方鸡种北京油鸡(Beijing-You chicken,BJY)和引入蛋鸡品种白来航鸡(White Leghorn,WL)为试验对象,通过人工感染肠炎沙门氏菌(Salmonella Enteritidis,SE),研究两个不同遗传背景新生雏鸡在接种沙门氏菌后,部分免疫指标和相关基因的变化规律,揭示两品种鸡在早期对SE感染抗性的的异同点。选择1日龄的北京油鸡和白来航鸡各40只,隔离舱饲养,相同日粮水平条件下,两侧胸肌各注射8.7×108cfu·mL-1沙门氏菌0.5mL,分别在攻毒后12、24、72和144h(12hpi、24hpi、72hpi、144hpi)测定IgY、IL-6和TNF-α血清介质变化,荧光定量检测血液载菌量、盲肠组织中TLR4受体、DNMT3a、DNMT3b和DNMT1甲基转移酶基因的表达情况。结果表明:(1)攻毒沙门氏菌后,北京油鸡的IgY、IL-6、TNF-α血清介质水平显著高于白来航鸡(P0.05);(2)在12hpi、24hpi和72hpi,血液载菌量品种间差异不显著(P0.05),但在144hpi白来航鸡血液中载菌量显著高于北京油鸡(P0.05);(3)在24hpi,TLR4受体在北京油鸡盲肠组织中的表达显著高于白来航鸡;北京油鸡与白来航鸡DNMT3a、DNMT3b和DNMT1甲基转移酶基因在两品种间的表达差异显著(P0.05)。结果提示,北京油鸡和白来航鸡对沙门氏菌的免疫性状具有明显的遗传差异,北京油鸡对沙门氏菌的抗性优于白来航鸡。     

山羊副流感病毒3型感染MDBK细胞的miRNA表达谱变化分析

本研究旨在分析山羊副流感病毒3型(CPIV3)感染MDBK细胞和正常MDBK细胞差异表达的miRNA,以探索miRNA在CPIV3感染过程中的作用及其调控机制。将CPIV3感染MDBK细胞,利用高通量测序技术检测分析MDBK细胞中miRNA表达谱,并筛选差异表达的miRNA。对靶基因进行GO注释和KEGG富集。结果显示,有37个miRNA显著差异表达(P0.001),其中18个miRNA在病毒感染中上调,19个miRNA在病毒感染中下调。经RT-qPCR方法验证5个差异表达的候选miRNA,结果与高通量测序分析有很好的一致性。进一步GO功能注释表明:差异表达的miRNA靶基因生物学功能相对集中在免疫调节、细胞生物调控及细胞新陈代谢等生物过程。这些靶基因参与多种细胞的信号通路,包括细胞黏附分子、B细胞受体信号通路、MAPK信号通路、代谢通路、黏合斑、钙离子信号通路和趋化因子信号通路等。本研究为进一步探讨CPIV3致病机制奠定了基础。     

基于RAD-seq技术分析北京油鸡的遗传进化

为分析地方鸡种北京油鸡保种群的遗传多样性和遗传进化机制,本研究对北京油鸡和其他20个不同品种鸡进行简化基因组测序,鉴定其SNP标记,计算遗传统计量,分析北京油鸡的遗传结构和遗传多样性,筛选受到强烈选择的前200个基因并进行功能注释分析。结果显示:北京油鸡保种群体共鉴定出295 849个SNP标记,核苷酸多样度为0.205 9、保种群体的平均观察杂合度为0.200 4、近交系数为0.026 5,在21个品种中近交水平最低;连锁不平衡分析表明北京油鸡群体各等位基因不存在连锁不平衡现象;利用MEGA模型进行聚类分析,结果表明北京油鸡形成一个独立的分支,这与北京油鸡的历史背景相符;通过GO和KEGG对前200个受到强烈选择的基因进行功能注释分析,发现这些差异基因主要富集在细胞形态发生分化、分泌系统、脉管系统、心血管系统、蛋白质磷酸化等信号通路。本研究从分子水平对北京油鸡的种质特性进行了评价,为北京油鸡的品种保护及开发利用提供了分子理论依据。     

矮脚黄鸡、新兴黄鸡、广西三黄鸡产蛋性能比较研究

本试验对广东地区矮脚黄鸡、新兴黄鸡、广西三黄鸡等品种种鸡产蛋性能进行了比较研究。结果表明，矮脚黄鸡的适应性、抗病性较强，死淘率低（6．31％），料蛋比低（5．05），产蛋整齐性好，从开产到产蛋率达80％的天数短（25天）；新兴黄鸡产蛋期产蛋教高达182．44枚，破蛋率低，为1．55％；广西三黄土鸡开产日龄早（148日龄），日采食量低（164．83g），产蛋期只总耗料量为41．37kg。矮脚黄鸡对广东地区高温、多湿的环境适应性较强，适合在广东地区饲养。     

鸡球虫病免疫:Ⅰ.球虫病特点和免疫原理

采用免疫方法控制球虫病已经成为一种趋势，因为它可以从根本上免除球虫抗药性和肉蛋品药残带来的一系列问题。但是随着进入市场球虫病疫苗种类的增多也带来不少问题。球虫病疫苗有毒苗和弱毒苗之分．有三价、四价、五价、七价甚至八价之分。有商品肉鸡用的，也有种鸡用的。商家宣传也各有动人之处，令人眼花缭乱．不知何以适从?如果你了解了球虫和球虫病的重要特点，了解了球虫免疫的原理就能够释疑解惑，就能够理性地选择和正确使用球虫病疫苗。本文拟就上述几个方面介绍，以飧读者。     

挑出低产鸡和假产鸡提高鸡场效益

1低产鸡和假产鸡产生的原因 1．1管理因素①蛋鸡在育成期阶段。鸡群整齐度不达标，没有注意调整鸡群强弱分群饲养，造成部分鸡生长发育迟缓。②育成期限饲方法不当，部分蛋鸡体重超标而低产。③光照的因素，光照不足使蛋鸡推迟开产．过早超长光照使鸡性成熟过早。提前开产造成早衰。     

重组鸡IL-2的抗球虫作用

鸡白细胞介素2(Ch IL-2)是一种重要的细胞因子,对Ch IL-2的抗球虫作用做了初步研究,分别在14日龄和21日龄给实验雏鸡胸部肌肉注射不同剂量的重组Ch IL-2蛋白,28日龄口服接种1×105个活球虫卵囊,结果表明,重组Ch IL-2蛋白能降低相对卵囊产量、减少盲肠病变、提高相对增重。其中以注射250μg重组Ch IL-2蛋白的试验组抗球虫效果最好,相对卵囊产量为23.26%,盲肠病变记分分别为0.4,相对增重率为97.80%,综合抗球虫指数(AC I)达到192.8。抗球虫效果良好,明显的优于其他试验组。     

萨索鸡、涟水土鸡及其杂交F1代生长曲线的拟合分析

为了研究萨索鸡,涟水土鸡及其杂交F1代(萨索鸡♂×涟水土鸡♀)的生长发育规律,为其科学饲养管理及后期选育提供理论依据,本试验测定了萨索鸡,涟水土鸡及其杂交F1代(萨索鸡♂×涟水土鸡♀)0~12周体重数据,利用Logistic、Von Bertalanffy和Gompertz三种非线性生长模型拟合其生长曲线,并比较各生长模型的拟合效果。结果显示,3种模型均能较好地拟合三个群体的生长曲线(R20.99),但综合考虑拟合度和E值及成熟体重后发现,Gompertz模型拟合效果最佳;萨索鸡、涟水土鸡及其杂交F1代相比,具有较大的出雏重,成熟体重、拐点体重、最大周增重、绝对生长速度和相对生长速度,杂交鸡的成熟体重、拐点体重、最大周增重、绝对生长速度和相对生长速度比涟水土鸡都有很大幅度的提高,拐点时间也有提前,显著优于涟水土鸡。Gompertz模型对三个群体的的拟合效果最佳,杂交F1代的生长性能与涟水土鸡相比具有较大幅度的提高。     

鹅副粘病毒对鸡胚及雏鸡致病性的初步研究

鹅副粘病毒是一种引起多种家禽疾病的病毒,通过人工感染鸡胚和雏鸡试验,其结果表明本病毒主要以呼吸系统、消化系统病变为主要临床症状和特征,并且可导致10日龄的鸡胚100％死亡,对雏鸡的致死率为85％。因此,可见其致死率高,广大养殖户应重视鹅副粘病毒的预防。     

惠阳胡须鸡和AA肉鸡IFN-β基因的克隆与序列分析

克隆了惠阳胡须鸡和AA肉鸡IFN-β基因，与Genbank上白色来航鸡IFN-β序列核苷酸同源性分别为99．84％和100％，没有形成新的亚型。二级结构预测表明鸡IFN-β与IFN-α都是全α螺旋蛋白，但α螺旋的长度和组成螺旋的氨基酸上有差别；BLAST结果表明其三级结构与人IFN-β的三级结构最为相似。这对于理解IFN-α、IFN-β与其受体结合方式的不同与他们的生物学活性差异之间的关系奠定了基础。     

腿部变化与鸡病鉴别论断

在饲养过程中有很多难以鉴别的疾病，鸡腿病就是其中的一种。鸡腿病主要是由遗传、营养、传染和环境等因素所致。轻者造成鸡生长受阻，影响增重，型者则终身残疾，造成较大的经济损失。     

探索蛋种鸡企业与青年鸡场的战略合作模式

Pan Yingli