山西地方山羊品种遗传多样性的微卫星分析

(目的)文章宗旨是了解山西省地方山羊品种的遗传多样性,为种质资源保护和利用提供参考依据.(方法)利用5个微卫星标记分析山西省4个地方山羊品种的遗传多样性,基于等位基因组成及频率,运用群体遗传统计软件进行分析.并依据标准遗传距离(DS)和Nei氏遗传距离,分别构建UPGMA系统发生树.(结果)4个地方山羊品种共检测到等位基因(Na)67个,平均有效等位基因数(Ne)为4.94～6.05个,平均多态信息含量(PIC)在0.705 3～0.798 2之间,平均遗传杂合度(H)在0.759 2～0.831 6之间;4个地方山羊品种间遗传分化系数0.046 1,黎城青山羊与阳城白山羊先聚在一起,再与吕梁黑山羊聚在一起,最后与洪洞奶山羊聚在一起形成一类.(结论)结果表明山西省4个地方山羊品种遗传变异大、多样性丰富;品种间遗传分化小.选择5个微卫星座位均为高度多态位点,可作为山西省地方山羊品种遗传多样性评估,也可作为有效遗传标记用于山羊品种遗传多样性和系统发生关系分析.4个地方山羊品种分子系统发生关系与其地理位置、生产特性相一致.     

贵州地方山羊品种遗传背景的微卫星分析

用15个牛微卫星位点,以波尔山羊为对照,研究了4个贵州地方山羊品种(贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊、榕江小香羊)的遗传背景。结果:可分析的多态位点6个(BM1258、D1S104、ILSTS030、INRA063、INRABERN192、RM088),占40%(6/15),反应了牛微卫星位点与山羊有较高同源性;贵州地方山羊品种比波尔山羊具有较高的遗传多样性,高低顺序是贵州白山羊>贵州黑山羊>黔北麻羊>榕江小香羊>波尔山羊;群体遗传分化大,群体变异主要存在于品种内,而品种间的变异较小;贵州白山羊与贵州黑山羊遗传距离最近,其次是榕江小香羊、黔北麻羊,与波尔山羊遗传距离最远,这与它们的地理分布及品种形成相符。     

福建省3个主要地方山羊品种的RAPD分析

利用RAPD方法对福建省的福清山羊、闽东山羊和戴云山羊以及四川省的南江黄羊进行了遗传多样性分析.结果表明:从110条随机引物中筛选出的21条,共扩增出235条带,其中171条带为多态性带,多态位点百分率为72.8％,说明品种之间多态性比较丰富.4个品种的欧氏遗传距离在8.0到10.9之间,其中福清山羊和闽东山羊两个品种...     

中国9个地方山羊品种的遗传多样性和群体结构分析

采用联合国粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)联合推荐的数据库中选取的16对微卫星引物对中国9个地方山羊品种和1个引进品种(波尔山羊)的遗传多样性及群体结构进行分析。结果表明,在15个微卫星位点上共检测到159个等位基因;9个地方山羊品种的Fst值为89.5%,说明89.5%的遗传变异存在于品种内,而10.5%的遗传变异存在于品种间;依据Da遗传距离构建UPGMA系统发生树,表明波尔山羊分开独自聚为一类,9个地方山羊品种分为两类;采用Structure软件对10个山羊品种的群体结构进行分析,可以将其分为4组。所得到的群体关系同聚类图得到的结果基本一致。     

苜蓿地方品种遗传多样性的研究—RAPD标记

利用ＲＡＰＤ技术对中国１８个苜蓿品种和北美９个苜蓿基本种质来源的代表品种各取１０个单株进行多态性分析。结果表明,苜蓿品种内和品种间均具有明显的多态性,如采用混合样分析则掩盖了品种内的多态性,而品种间的多态性则明显降低。７条引物共检测了５２个位点,其中５０个位点是多态的。品种间差异是由该５０个多态位点出现带谱的频率不同而体现的。     

波尔山羊和山西省地方山羊品种微卫星DNA多态性分析及群体间杂种优势预测

（方法）利用5个微卫星标记对山西省5个山羊品种遗传多态性进行分析,（目的）以预测波尔山羊与地方山羊品种的杂种优势,为山西省肉用山羊新品种培育及波尔山羊在山西省合理杂交利用提供理论依据。（结果）5个山羊品种共检测到70．0个等位基因,各位点的等位基因数在9．0～21．0之间;经群体遗传统计分析,5个山羊品种平均有效等位基因数4．94～6．05个,平均多态信息含量0．7053～0．7982,平均基因杂合度0．7592～0．8316。5个山羊品种间遗传分化系数0．0607;波尔山羊与吕梁黑山羊的标准遗传距离最大（0．5083）,其余依次为阳城白山羊（0．4474）、洪洞奶山羊（0．4332）、黎城大青羊（0．3301）。（结论）5个微卫星位点均为高度多态位点,可用于5个山羊品种遗传多样性评估;5个山羊品种在5个微卫星位点多态性丰富,遗传变异大,品种间遗传分化小。据品种间遗传距离推测,波尔山羊与吕梁黑山羊的杂种优势最大,与阳城白山羊和洪洞奶山羊的杂种优势次之,与黎城大青羊的杂种优势最小。     

生态因子对中国地方山羊品种繁殖性状的影响

为了探讨生态因子对中国地方山羊品种繁殖性能的影响,采用简单相关分析和典型相关分析的方法,分析生态因子和繁殖性状间的相关关系,揭示了我国5个生态因子和6个繁殖性状间的内在联系.结果表明,11个变量产生66个相关关系数,其中16个极显著水平相关(P＜0.01),10个显著水平相关(P＜0.05).其中绝对值较大系数年均气温和年均降水量、年均日照时数与无霜期简单相关系数分别为0.573、0.589.典型相关分析结果表明,两组性状间的第1个典型相关系数为0.916,贡献率为53.585％.研究结果为家畜遗传育种与繁育提供科学参考依据.     

贵州地方特色品种资源黑马羊的发展现状问题及对策

毕节地区是贵州黑山羊的原产地和主产区，2006年末存栏69．5万只，出栏39．1万只。数量多，分布广，遗传资源丰富，其中早就分化出一群无角黑山羊个体，老百姓称它为“黑马羊”或“马头羊”，其个体大、母性好、抗病力强、屠宰率高，生产性能比有角黑山羊优越，很具市场竞争力，可以说是贵州黑山羊中的一颗明珠。作为地方特色品种资源，如何保护和开发利用，就成了摆在我们畜牧工作者面前的工作任务。     

河南地方山羊、绵羊品种的科学利用

国外波尔山羊、无角陶塞特、萨福克、特克塞尔、杜泊绵羊等大型肉用山羊、绵羊品种的引入,及南江黄羊、马头山羊、关中奶山羊等省外优良羊种的引入,令河南的广大养羊场户感到无所适从。开展商品肉羊生产或种用生产是完全利用地方品种好呢,还是全部使用外来品种好呢,还是使用外来品种与本地羊种杂交好,杂交又进行到多少代合适,养殖场、户有时拿不定主意。就此,笔者现结     

山东省区保存家蚕品种的RAPD分析

采用RAPD标记技术分析山东省区保存的58个家蚕品种资源的DNA多态性。选用重复性较好的20个引物对58份家蚕品种资源材料扩增的总条带数为155条,多态率为93.73%,RAPD标记在家蚕品种间表现出丰富的多态性。根据58个家蚕品种的指纹图谱,采用UPGMA方法进行聚类分析,构建了供试家蚕品种资源的分子系统发育树,可为家蚕新品种选育提供基础信息。     

贵州白山羊遗传结构的RAPD分析

用27条多态性引物对15份贵州白山羊个体基因组进行RAPD分析。结果共扩增出268条带，其中多态带为112条，多态频率在0～72．73％之间，平均多态频率为41．79％。单个引物获得的扩增带数在4～16条之间，平均每条引物扩增出9．92条带，扩增带分子量范围在230～2800bp。Nei氏公式计算品种内个体阃遗传相似指数平均为0．9156。结果表明：贵州白山羊个体间遗传变异较小，具有较高的遗传稳定性。     

4个绵羊品种随机扩增多态DNA分析

本研究利用RAPD技术研究了小尾寒羊、大尾寒羊、洼地绵羊、滩羊 4个绵羊品种的亲缘关系。从 10 0条引物中筛选出的 16条引物 ,共扩增出 14 6条带 ,其中 94条表现出多态性 ,占 6 4 .4 %。它们间遗传距离较小 ,小尾寒羊与大尾寒羊、洼地绵羊、滩羊的遗传距离分别为 0 .0 6 4 9、0 .0 6 73和 0 .10 2 8,用UPGMA法构建了树状聚类图。结果显示 ,小尾寒羊、大尾寒羊和洼地绵羊首先聚一起 ,说明它们亲缘关系较近 ,起源于共同的原始祖先。据推测滩羊也起源于蒙古羊 ,但它生活在陕西、宁夏等省 ,与山东环境条件差别较大 ,在自然选择的作用下发生了变异 ,这可能是滩羊与其它绵羊间遗传距离大的主要原因。在本研究过程中还发现了各品种的分子标记     

Genetic Analysis of Three Lithuanian Native Horse Breeds

This study was the first to analyze the polymorphic characteristics of a wide range of genetic markers in three Lithuanian horse breeds. Genetic variation at seven red blood cell alloantigen (blood group) loci, 10 biochemical genetic loci and 16 microsatellites was examinated in 31 Zemaitukai, 30 large-type Zemaitukai and 24 Lithuanian Heavy Draught horse and compared to that of other domestic horse breeds. Genetic variability of the Zemaitukai breeds based upon blood groups and biochemical loci was higher than average for domestic horse breeds. For microsatellite loci, the variability of the large-type Zemaitukai and the Heavy Draught breeds also was high compared to the mean variation for domestic breeds; however, for the Zemaitukai breed, variation levels were very near the average for horses.     

4个牦牛品种的RAPD遗传多样性研究

研究采用RAPD分子标记技术对麦洼、九龙、大通和天祝白牦牛等4个牦牛品种共124头牦牛进行了遗传多样性分析.结果表明:①每个RAPD引物扩增的DNA片段数在18～33个,且所有品种均表现多态,标记多态频率平均为38.63%,检测片断大小在0.25～5 kb之间;②用Shannon多样性指数公式计算牦牛品种的遗传多样性指数(H0),结果显示九龙、麦洼、大通、天祝白牦牛的遗传多样性指数分别为0.311、0.262、0.252和0.216;③采用Rogers遗传距离公式分析4个牦牛品种间的遗传距离(DR)结果:天祝白牦牛与九龙牦牛遗传距离最大(0.0414),与大通牦牛的距离最小(0.0383);④根据DR值,将4个牦牛品种聚为两大类,九龙牦牛聚为一类,其它3个牦牛品种聚为一类.大通牦牛和天祝白牦牛在较近的水平上首先聚为一类,然后与麦洼牦牛聚为一大类.     

互助猪保种群遗传多样性的RAPD分析

利用随扩增多态ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）技术分析了互助猪两个保护核心群１８头个体的遗传变异,用Ｓｈａｎｎｏｎ指数计算了遗传变异在两个保种核心群群体内和群体间的分布。结果表明：互助猪两个保护核心群遗传变异有一定差异,分别为４９．００％和３４．５８％。这是由于两个保种群规模不同,导致世代近交增量也不同,同时长期的自群繁育阻碍了基因的相互交流。     

西藏牦牛的RAPD遗传多样性及其分类研究

为了解西藏地区牦牛品种或类群的遗传多样性和亲缘关系,本研究从33个RAPD多态性引物中筛选出8个条带清晰且多态性丰富的引物对西藏地区的巴青牦牛、类乌齐牦牛、丁青牦牛、桑日牦牛、工布江达牦牛、江达牦牛、康布牦牛、桑桑牦牛、嘉黎牦牛、帕里牦牛、斯布牦牛等11个类群的核基因组DNA进行了RAPD分析,并用Nei氏标准距离和UPGMA聚类法分析了类群间的亲缘关系.结果表明:(1)西藏牦牛类群的遗传多样性指数变异范围在0,185 7～0.405 3之间,其中帕里牦牛最小(0.185 7),说明相对较纯,群体较整齐;而工布江达牦牛最大(0.405 3),显示该群体内部具有较多的遗传变异.(2)在11个类群中,其遗传多样性指数大小分别为:工布江达牦牛(0.405 3)＞江达牦牛(0.353 6)＞斯布牦牛(0.344 8)＞康布牦牛(0.342 8)＞嘉黎牦牛(0.332 3)＞桑日牦牛(0.282 3)＞巴青牦牛(0.279 3)＞桑桑牦牛(0.269 8)＞丁青牦牛(0.259 7)＞类乌齐牦牛(0.224 1)＞帕里牦牛(0.185 7),具有西藏东部牦牛类群遗传多样性相对较高,而西部牦牛类群遗传多样性相对较低的趋势,预示着西藏东部可能是牦牛的起源地之一.(3)遗传距离构建的分子聚类关系图表明:西藏11个牦牛类群可分为2大类,帕里牦牛(PL)为一类,其余10个牦牛类群为另一类.综上所述,西藏牦牛具有较丰富的遗传多样性,品种或种群内的遗传分化显著,这是西藏牦牛业持续发展和牦牛适应外界环境的遗传基础,是将来培养牦牛新品种或品系的重要基因资源;西藏牦牛品种可分为2大类群.     

部分地方鸡种种群遗传特征的分析

运用微卫星技术检测10个地方鸡种的杂合度、多态信息含量和遗传距离,探讨种群间的亲缘关系和遗传特征。结果表明：各位点的杂合度为0．2675-0．8316、多态信息含量为0．2478—0．8082;各种群的平均杂合度为0．5564-0．7134、平均多态信息含量为0．4999～0．6808。矮小型黄鸡与其它地方鸡种间的亲缘关系较远,仙居鸡、白耳鸡、泰和鸡、北京油鸡、大骨鸡、萧山鸡距离较近;茶花鸡与固始鸡存在一定的关系;尤溪麻鸡与其它鸡种的距离相对较远。     

5个地方山羊品种血液蛋白多态性及分类的研究

为进一步开发和利用山羊，采用聚丙烯酰胺凝胶电泳法对我国5个地方山羊品种的8个血液蛋白位点进行了多态性检测，结果发现Hb、Alb、Tf、Po、Am等5个位点为多态位点，Cp、Es、Sα2等3个位点为单态位点。通过遗传距离的聚类分析将5个山羊品种分成3类：湘东黑山羊和武雪山羊为一类；内蒙古白绒山羊和辽宁盖县白绒山羊为一类；马头山羊单列为一类。此外，对血清蛋白的染色方法进行了改良。     

大汉梅猪群体遗传结构及繁殖性能的RAPD分析

选用20对引物在大汉梅群体中进行RAPD扩增,共检测出185个位点,其中多态性位点39个,群体的多态频率为21．1％。数据分析结果显示：群体内个体之间的遗传相似系数为0．566～0．979,平均值为0．846,遗传信息较为稳定。通过对群体遗传结构特点及繁殖性能生产记录进行分析,群体总产仔数和活产仔数均达到显著水平（P〈0．05）,可为其建系和选育提供依据,并为以后进一步研究提供理论基础。     

基于全基因组SNP标记分析中国地方鸡品种的遗传多样性和种群结构

旨在对中国地方鸡品种的遗传多样性与种群结构进行分析。本研究使用Affymetrix Axiom 600K高密度鸡基因分型芯片对来自8个品种的157只地方鸡及233只商品鸡进行基因分型,以品种作为分组来计算各分组的观测杂合度、期望杂合度、次等位基因频率、近交系数及核苷酸多样性分析地方鸡群体的遗传多样性,利用进化树、主成分分析、群体结构、MDS等方法分析鸡群体的群体结构,基于状态同源(IBS)和群体分化系数(Fst)分析种群内部与种群之间的亲缘关系,利用长纯合片段(runs of homozygosity, ROH)估算得到基于ROH的近交系数。结果表明,各群体的观测杂合度均高于期望杂合度,次等位基因频率在0.175～0.236之间,近交系数在0.018～0.205之间,核苷酸多样性在0～6×10^-4之间,进化树与主成分分析表明品种间出现了明显的群体分化,地方鸡群体与商品鸡群的MDS分析发现我国地方鸡与商业肉鸡品种的遗传距离较近;IBS遗传距离在0.092 9～0.319 9之间;各品种成对Fst分析表明,群体间呈现中高分化程度(0.09～0.22);此次分析共得到了...