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RAPD和AFLP在分析尼罗罗非鱼遗传多样性研究中的应用比较 总被引:9,自引:0,他引:9
比较了RAPD和AFLP标记技术在尼罗罗非鱼遗传多样性研究中的应用。共筛选20个RAPD引物和7个AFLP引物组合,检测到AFLP标记的有效等位基因数和平均多态信息量稍低于RAPD标记,但AFLP标记的多态性检测效率显著高于RAPD标记。两种分子标记所得遗传相似系数接近。结果表明:AFLP和RAPD适宜于基因组DNA检测,但AFLP优于RAPD。 相似文献
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2种方法银染的AFLP片段再扩增效果比较及改进 总被引:6,自引:0,他引:6
Bassam银染法和Sanguinetti银染法是AFLP标记最常用的检测方法.本研究比较这2种方法银染的AFLP条带再扩增效果的差异,发现Bassam法银染的AFLP片段再扩增效率达到100%,而用同样的PCR条件,sanguinetti法银染的AFLP片段不能被扩增,限制了Sanguinetti法在AFLP标记分析中的应用.为提高Sanguinetti法银染的AFLP片段再扩增效率,对Sanguinetti法银染的AFLP片段回收和再扩增条件进行了改进.通过增加Sanguinetti法显色后的胶板漂洗次数、延长漂洗时间、改变AFLP条带浸泡溶液、增加浸泡液体积和增加PCR循环次数,成功地将Sanguinetti法银染的AFLP条带的再扩增效率提高到100%,从而解决了San-guinetti银染法应用的限制因素. 相似文献
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AFLP分子标记在枣研究中的应用进展 总被引:1,自引:0,他引:1
AFLP技术已广泛应用于果树种质资源的研究,本文就AFLP分子标记技术的原理与特点,以及在枣研究上的应用进行了概述,对当前枣属植物研究领域AFLP应用存在的问题进行了分析,并对其前景作出了展望。 相似文献
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不同猕猴桃品种雌雄植株的AFLP分析 总被引:3,自引:0,他引:3
以猕猴桃(Actinidiaspp.)幼叶为材料提取基因组DNA,从64个引物组合中选取12对引物进行雌、雄集群DNA样品的扩增片段长度多态性(Amplified fragment length polymorphism,AFLP)扩增,再从中选取4对引物进行6对雌、雄DNA样品的AFLP扩增.4对引物共扩增出74个AFLP标记,其中多态性标记为58,多态性标记百分比为78.4%.遗传相似性分析表明,同一品种雌雄样品之间的AFLP电泳图谱表现出一定的差异,但小于不同品种间的差异,而品种间的差异又小于不同种间的差异.同时AFLP多态性初步检测出猕猴桃不同性别在DNA水平上的差异. 相似文献
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番茄AFLP技术体系的优化与建立 总被引:2,自引:2,他引:2
以番茄为材料,通过对扩增长度多态性(AFLP)反应体系中的几个关键参数进行优化,建立了适合于番茄的AFLP分子标记体系。结果表明,用于反应的DNA采用CTAB法提取较好,酶切的基因组DNA以100 ng为宜,酶切-连接采用一步法,37℃条件下进行,反应时间为10 h,预扩增产物的稀释倍数以30倍为宜,采用优化好的体系,29对引物组合在两份供试材料均可扩增出稳定清晰的带纹60~100条。本研究为番茄的分子标记克隆及抗病育种的辅助选择提供了有力工具。 相似文献
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适于蝗虫AFLP标记的酶切反应系统研究 总被引:1,自引:0,他引:1
以东亚飞蝗为材料,对蝗虫基因组DNA双酶切的反应体系及条件进行研究。结果表明,采用PstⅠ和TaqⅠ双酶切系统,建立含Template DNA 2μl、PstⅠ引物(30 ng/μl)2.5μl、TaqⅠ引物(30 ng/μl)2.5μl、dNTPs(ATP,GTP,CTP,TTP各10 mmol/L)0.4μl、MgCl2(25 mmol/L)1.2μl、Taq DNA polymerase(5U/lμ)0.2μl、10×Taq DNA polymerase buffer 2μl的20μl反应系统,在适当的反应条件下进行预扩增和扩增,可以得到理想的目的片段。这为蝗虫AFLP分子标记的获得和进一步研究提供了必要条件,也为AFlP技术在其他昆虫及动物研究中的应用提供依据。 相似文献
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AFLP技术在水产动物研究中的应用 总被引:4,自引:0,他引:4
扩增片断长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)是基于PCR技术对基因组限制性片断进行扩增,其技术原理主要包括酶切、扩增和电泳检测。本文中作者就AFLP技术在水产动物中的遗传多样性、亲缘关系鉴定、遗传图谱构建、辅助育种等方面的应用做一综述。 相似文献
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烟草种质资源遗传多样性及亲缘关系的AFLP分析 总被引:14,自引:4,他引:14
【目的】揭示烟草种质资源的遗传多样性及亲缘关系。【方法】选用4对AFLP选择性扩增引物(EcoRI+3/MseI+3)对48份烟草材料的基因组DNA进行选择性扩增。【结果】共获得321条扩增带,其中174条具有多态性,平均多态检出率为54.2%。对AFLP扩增结果采用UPGMA法进行聚类分析,可以将48份烟草资源分为两大类群,即黄花烟草群和普通烟草群,普通烟草可进一步分为4组;48份材料的遗传距离变幅在1.41~11.0之间。【结论】AFLP标记技术能较好地从分子水平揭示中国烟草种质资源的遗传背景、亲缘关系及演化规律。 相似文献
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以珲春桃、正满早生及其F1为试材,利用16对引物组合对AFLP标记的多态性和分离方式进行分析.结果表明:AFIP标记在F1呈3种分离方式:盂德尔分离、偏离孟德尔分离、异常分离.3种分离位点出现的频率和数量分别为:11.07%、83,11.87%、89,3.86%、29.本试验对偏离孟德尔分离比例和异常分离的AFLP标记进行了分析,为该群体是否适合构建遗传连锁图谱进行评价及进一步利用该群体提供理论依据. 相似文献
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[目的]优化龙眼AFLP银染体系中的影响因素。[方法]以23份龙眼品种和2份龙眼近缘植物龙荔为试材,通过对扩增片段长度多态性(AFLP)反应体系中的几个影响因素(DNA提取、酶切与连接、电泳与银染)进行研究,建立起龙眼AFLP银染分析体系。[结果]用紫外分光光度计检测样品DNA质量和浓度,发现提取的DNA吸光度A260/A280比值在1.8左右,A260/A230的比值大于2.0,说明所提取的DNA样品纯度较高,无蛋白质或盐类的污染。酶切与连接中采用37℃水浴5 h,然后转入65℃水浴2 h的方法能保证酶切充分,又能防止酶切过度。电泳和银染时用4℃预冷的显影液进行显影,可以降低显影速度。[结论]采用该技术体系得到的AFLP指纹式样清晰,重复性强,适宜用作龙眼品种鉴别和遗传多样性分析。 相似文献