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利用8个微卫星标记分析7个鸭群体的遗传多样性 总被引:1,自引:0,他引:1
研究应用8个微卫星标记对7个鸭群体进行了遗传多样性检测。利用等位基因频率计算了各群体的基因杂合度、多态信息含量及群体间的遗传距离,并根据遗传距离进行了聚类分析。结果表明:8个微卫星标记中除SMO13(PIC=0.480)和APL83(PIC=0.372)为中度多态外,其余标记均为高度多态,可作为有效的遗传标记用于鸭群体间遗传多样性分析和系统发生关系分析。7个鸭群体在微卫星座位的平均杂合度在0.514~0.646,最高的莆田黑鸭为0.646,最低的康贝尔鸭为0.514。从聚类分析结果来看,北京鸭与中型母本、小型母本聚为一类;康贝尔鸭和金定鸭聚为一类;莆田黑鸭与山麻鸭聚为一类。 相似文献
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利用15个微卫星标记检测法国鲁昂鸭、合成品系INR A37与INR A444、北京鸭、金定鸭和绿头野鸭共6个群体223个个体的基因型,通过计算各项群体遗传参数,分析6个鸭群体的遗传结构和关系。结果表明:15个微卫星位点共检测到175个等位基因,其多态信息含量(PIC)介于0.245~0.884。鲁昂鸭的杂合度和PIC是最高的,其次是绿头野鸭,而其他4个鸭群基本处于同一水平。金定鸭和鲁昂鸭之间的奈氏标准遗传距离最远(DS=0.654),而法国2个鸭合成系之间最近(DS=0.140)。基于计算奈氏标准遗传距离所得数据,采用UPGMA方法构建了系统发生树,法国2个鸭合成系、北京鸭和鲁昂鸭聚为一类,而绿头野鸭和金定鸭聚为一类。综合分析,相对于金定鸭,法国的鲁昂鸭和北京鸭在遗传背景上更接近。 相似文献
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本文阐述了微卫星的结构、遗传特性以及微卫星标记在家畜个体亲缘关系鉴定、构建基因图谱、标记辅助选择、评估遗传多样性等四方面的作用。认为微卫星标记是动物遗传育种的一种非常理想的分子遗传标记,但由于已知的微卫星位点较少,加之分析成本较高,微卫星扩增产物在检测过程中常出现各种误判因素等原因而存在应用缺陷,为了更好地利用微卫星,使其成为一种简捷、灵敏、低廉的重要遗传分析方法,必须对其进行更深入地研究。 相似文献
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微卫星遗传标记及其在绵、山羊中的研究进展 总被引:1,自引:1,他引:0
本文简介了微卫星标记特点和使用情况,并与其他标记作了对比.着重回顾了近年来微卫星标记在绵山羊育种中的主要研究进展,包括:遗传多样性分析、遗传图谱构建、功能基因定位、个体鉴定、杂育种优势预测等几个方面,这些研究可探明生物进化的历史,有助于资源保护及开发. 相似文献
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利用微卫星DNA多态性预测半番鸭的杂种优势 总被引:1,自引:0,他引:1
为探究微卫星DNA多态性与鸭肉用性能杂种优势的相关关系,选取10对微卫星标记对金定鸭、樱桃谷鸭、F1(樱桃谷鸭×金定鸭)和番鸭进行遗传多样性检测。利用ONEDscan、GENEPOP、Mstools软件对目的基因进行分型,计算遗传多样性参数以及群体间标准遗传距离,并测定半番鸭各杂交组合F1代体重杂种优势。结果表明:在4个鸭群体共检测到52个等位基因,金定鸭、F1(樱桃谷鸭×金定鸭)、樱桃谷鸭与番鸭群体间标准遗传距离分别为0.57678、0.52220、0.46356,樱桃谷鸭与金定鸭遗传距离为0.38949。并根据遗传距离,采用对数曲线模型对半番鸭体重杂种优势进行了预测,χ2检验结果显示,预测结果与实验测定结果无显著性差异,表明本研究建立的根据微卫星DNA多态性预测半番鸭部分生长阶段体重杂种优势是可行的。 相似文献
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据相关研究报道,在澳洲无角陶赛特羊18号染色体末端微卫星标记CSSM18和TGLA122之间的区域有控制其肌肉生长发育的Callipyge和Canvell基因。研究选择了微卫星标记CSSMl8和TGLAl22之间的TGLA122、LS33、ILSTS54、MCMA26四个微卫星标记,测定了新疆引进的澳洲无角陶赛特羊所产后代163只羔羊早期生长发育性状指标,采用PCR—SSCP技术检测了上述4个标记在研究群体中的多态性,分析了研究群体中4个微卫星标记不同基因型与早期生长发育性状的相关性。结果显示:微卫星标记TGLA122的杂合度0.4301,多态信息含量0.2733,有效等位基因数1.3761;微卫星标记MCMA26的杂合度0.4824,多态信息含量0.3660,有效等位基因数1.577O;微卫星标记LS33的杂合度0.3283,多态信息含量0.2744,有效等位基因数1.3780。微卫星标记TGLA122的3种基因型(AA/BB/AB)对90日龄母羔臀宽影响显著(P〈0.05),对其他生长指标均无显著影响;微卫星标记MCMA26的3种基因型(GG/Tr/GT)对60日龄母羔胸围和臀宽有显著影响,对其他生长指标均无显著影响;微卫星标记LS33的2种基因型(EE/EF)个体的体重和体尺均无显著性差异;微卫星标记ILSTS54在该群体中无多态性。 相似文献
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家畜基因组遗传多态标记—微卫星标记研究进展(上) 总被引:20,自引:0,他引:20
对家畜基因组中多态遗传标记-DNA微卫星标记的研究进展及其应用进行综述,主要涉及以下两大方面:首先是家畜基因组中分子遗传标记,主要是DNA微卫星标记的研究发现及有关该标记的定义,特性等;其次是DNA分子标记在家畜基因组分析研究,家畜遗传连锁图制作 ,基因诊断,家畜品种进化演变和个体系谱确证等方面的应用概况。 相似文献
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微卫星DNA(Microsatellite DNA)与其他DNA分子标记相比较,具有数量多、分布广且均匀、多态性丰富、呈孟德尔共显性遗传、易于检测、分析快速方便等一系列优点,并在动植物遗传多样性评估、遗传连锁图谱构建、绘制系统发生树、QTL定位、标记辅助选择、疾病诊断及血缘关系鉴定等研究领域中得到广泛应用.本文就微卫星标记及其在羊品种遗传育种中的应用作一综述. 相似文献
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四个微卫星标记在苏钟猪中的多态性分析 总被引:2,自引:0,他引:2
微卫星标记是近年来发展起来的一种检测基因DNA多态性的新型DNA标记,因其数量多、分布广、多态性丰富及检测方便等优点而倍受推崇。本文利用四个微卫星标记分析其在苏钟猪中的遗传多样性。结果表明,四个微卫星座位在苏钟猪中均存在较高的遗传多样性,基因杂合度为0.5962-0.8823;多态信息含量为0.5146-0.8709;有效等位基因数为2.4768-8.4935。以上结果表明,本研究采用的四个微卫星标记可以作为苏钟猪的遗传多样性的标记辅助选择。 相似文献
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为了分析北京鸭和樱桃谷鸭的遗传关系,采集包括北京鸭、在英国培育而成的肉鸭品种樱桃谷鸭及其它5个中国地方鸭品种共248个个体,利用11个微卫星标记对这7个鸭品种进行遗传关系分析.FST分析结果表明北京鸭与樱桃谷鸭的遗传分化程度最低,只有0.0795;遗传距离(Ds)分析发现北京鸭与樱桃谷鸭的遗传距离最近,为0.1079;群体分化时间分析表明二者的分化时间为98年,北京鸭与其它地方鸭品种的分化时间在282至694年之间;聚类结果显示北京鸭、樱桃谷鸭和建昌鸭聚为一类;巢湖鸭、高邮鸭、绍兴鸭和金定鸭聚为另一类.这些结果表明了北京鸭与引进品种樱桃谷鸭有非常密切的遗传关系,为樱桃谷鸭培育自北京鸭这一说法提供了分子遗传学的证据,同时本研究还发现北京鸭与樱桃谷鸭在遗传背景上已经发生了一定程度的分化. 相似文献
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研究利用31个微卫星标记,对高邮鸭、攸县麻鸭、巢湖鸭和荆江麻鸭4个品种共240个个体的基因型进行了检测.结果显示:高邮鸭具有较为丰富的遗传多样性,平均等位基因数、平均有效等位基因数、观察杂合度、期望杂合度以及多态信息含量分别为:4.1、2.7、0.853、0.569、0.495.F-统计量分析发现4个家鸭群体间存在明显的遗传分化(Fst=0.285).Structure程序构建的聚类图在K=2时,把4个群体分为两类,并且在K=3、4时,荆江麻鸭和高邮鸭分剐独立出来成为一类,个体鉴别分析没有发现遗传复杂个体和迁入其它群体个体. 相似文献
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