用RT-PCR对新城疫病毒分离株毒力的快速鉴定

根据新城疫病毒NDV强、弱毒株在F蛋白裂解位点氨基酸组成的序列上的差异,参照有关文献,设计了三对引物A+B,A+C,A+D。引物A+B能从Lasoa,B1,I系和强毒F48E8的含毒尿囊液中扩增出362bp的核酸片段,引物A+C仅能从强毒F48E8的含毒尿囊液中扩增出254bp的片段,引物A+D仅能从Lasota,B1,I系的含毒尿囊液扩增出254bp片段。三对引物均不能从IB,IBD,AI的含毒尿囊液和正常鸡胚尿液中扩增出特异片段。从发病鸡群中分离到3株NDV毒株中均被A+C引物扩出,它们的鸡胚平均死亡时间MDT分别为51.8h、53.2h、52.6h,1日龄雏鸡脑内接种指数ICPI为1.65、1.63、1.60,证明是NDV强毒。利用RT-PCR对NDV人工感染鸡最早可于攻毒后第二天从病鸡气管中检测到NDV,其次为泄殖腔和脾、肾。利用RT-PCR对NDV毒力的鉴定与传统生物学试验对强弱毒的测定结果完全吻合。但前者可在24小时内直接对组织匀浆进行诊断,具有快速简便和敏感的特点。     

荧光RT-PCR技术快速检测新城疫病毒

利用荧光RT-PCR技术对910份样品进行NDV检测,结果应用荧光RT-PCR技术可在4小时内从910份样品中检出NDV阳性30份,用病原分离技术检测部分样品,结果完全一致。荧光RT-PCR技术具有特异性高,操作简便,快速高效的特性,而且可以大大地缩短对NDV的检测时间。     

新城疫病毒分子生物学毒力水平研究进展

新城疫病毒分子生物学毒力水平研究进展肖肖郑增忍王树双综述吴时友审校（农业部动物检疫所青岛２６６０３２）新城疫病毒（ＮｅｗｃａｓｔｌｅＤｉｓｅａｓｅＶｉｒｕｓ,ＮＤＶ）属副粘病毒科副粘病毒属成员,由囊膜、核衣壳和核酸三部分组成,其基因组为１５Ｋｂ的单股...     

新城疫病毒分离株real-time RT-PCR检测与其遗传变异特性分析

对肉鸡养殖场的疑似新城疫病例提取病毒核酸,采用便携式real-time RT-PCR仪T-COR4在2 h内检测到5株新城疫病毒,分别编号为RS1、RS2、HY3、LZ4、PL5。对确诊的阳性样品进行病毒增殖,血凝/血凝抑制试验,MDT、EID50、ICPI指数测定,F基因的遗传变异分析,结果显示,RS1、RS2、HY3株为新城疫基因Ⅶd型强毒株,LZ4、HY5株为新城疫基因Ⅱ型弱毒株。     

新城疫病毒通用型实时RT-PCR检测方法的建立与应用

采用TaqMan方法,经引物和探针的设计、筛选及反应条件优化,研究了检测活禽和禽产品中新城疫病毒的通用型实时RT-PCR(RRT-PCR)方法。结果显示,对12株分别为速发型、中发型、缓发型和疫苗株新城疫病毒的尿囊液倍比稀释液的检测极限在10-5~10-7之间;建立的方法与常见禽类病毒无交叉反应,特异性良好;在检测人工感染肉鸡的脏器组织、咽喉、泄殖腔拭子中病毒的灵敏度同鸡胚分离试验基本一致;弱毒疫苗免疫鸡群在免疫后14 d,应用本方法不能从咽喉、泄殖腔拭子中检测到病毒;临床样品检测表明,该方法不仅可以检出中强毒力新城疫毒株,也可检出缓发型野毒株和疫苗毒株。     

RT-PCR对新城疫病毒强弱毒株的快速鉴定

根据新城疫病毒(NDV)F蛋白基因结构的特点及强、弱毒株F蛋白基因裂解位点的序列差异设计了4条引物,并将其配成3对引物,采用RT-PCR试验对来自鸡和七彩山鸡的9株NDV野毒分离株,F48E8和LaSota 2株标准强、弱毒株进行了快速鉴定;并将RT-PCR鉴定结果与NDV常规致病性试验结果进行了比较。结果表明,RT-PCR试验能够快速将11个参试毒株区分为强毒株和弱毒株,其结果与传统致病性试验测定结果基本一致,该方法可以用于ND的快速诊断和强、弱毒株的快速鉴定。     

一步法RT-PCR快速检测鸡新城疫病毒强毒株

本文参照NDV融合蛋白(F)基因序列设计引物，通过一步法RT-PCR扩增到NDV强毒株的170bp大小的特异条带。试验中未检出NDV弱毒株、IBV、AIV、IBDV的RNA，能够检出NDV尿囊液毒的最低滴度为10^-5稀释度(相当于10^3.7EID50病毒量)。对山东省不同地区于1997至2003年所分离的21个NDV强毒株检测全为阳性，而6个NDV弱毒株全为阴性。整个实验操作从病毒核酸提取到判定结果，在5h内即可完成。实验结果表明，该方法特异、敏感，适用于NDV强毒感染鸡群的快速检测。     

新城疫病毒荧光RT-PCR检测方法的建立及应用

经对部分发表在NCBI里的新城疫病毒序列进行比对,在其F基因上找到1段相对保守序列,根据保守序列设计1对引物和1条TaqMan探针,以新城疫Ⅰ系疫苗株(Mukteswar株)作为标准品,通过系列条件优化、特异性、灵敏性和重复性试验,建立了一种灵敏度高、特异性强和重复性好的荧光RT-PCR检测新城疫病毒的方法.该方法能检测最低初始病毒浓度为102.2 ELD50/mL,且在108.2～102.2 ELD50/mL内Ct值与病毒浓度的对数值(lgELD50/mi)呈很好的线性关系,R2达到0.997 5;该方法对禽流感、禽痘病毒和禽大肠杆菌等禽病病原核酸无交叉反应;批间和批内重复性良好;临床样品检测中荧光RT-PCR与鸡胚分毒的符合率、诊断灵敏度和诊断特异性分别为98.5％,50.0％和98.4％.因此,荧光RT-PCR检测方法的建立为新城疫病毒检测提供了一种快速有效的方法,为新城疫病毒的研究奠定了一定的基础.     

一步法RT-PCR快速检测鸡新城疫病毒强毒株

本文参照NDV融合蛋白(F)基因序列设计引物,通过一步法RT-PCR扩增到NDV强毒株的170bp大小的特异条带。试验中未检出NDV弱毒株、IBV、AIV、IBDV的RNA,能够检出NDV尿囊液毒的最低滴度为10-5稀释度(相当于103.7EID50病毒量)。对山东省不同地区于1997至2003年所分离的21个NDV强毒株检测全为阳性,而6个NDV弱毒株全为阴性。整个实验操作从病毒核酸提取到判定结果,在5h内即可完成。实验结果表明,该方法特异、敏感,适用于强毒感染鸡群的快速检测     

新城疫病毒系统发育分析及强弱毒株的鉴别诊断

本文综述了新城疫病毒的流行病学和病毒基因的系统发育情况,对不同ＮＤＶ毒株的强弱毒力鉴别方法进行了详细的介绍,将为新城疫的认识和防制提供新的理论基础和实践方法。     

华南地区三株新城疫地方强毒株的序列测定及其系统发育分析

用设计的特异性引物，通过一步法RT-PCR扩增出5个毒株的897bp片段，对其中的3株病毒cDNA分析表明：各毒株的半胱胺酸位点和个数及糖化位点基本没有改变。各毒株在抗原决定簇氨基酸位点HN基因346-353处的碱基突变甚多，且氨基酸也出现了部分的突变。针对HN基因897bp片段构建了相应的系统发育树，系统发育分析表明：中国（华南）地区NDV各毒株与欧美国家的Ⅱ至Ⅴ基因群明显分离，遗传规律较远；NDV-WS1和NDV-HY与台湾省NDV各毒株归属为一组，与中国毒株的遗传距离较近，均属新近出现的基因型Ⅶ型，NDⅦ型在远东和西欧（Ⅶb）和及中东和南非（Ⅶa）广泛存在，可能形成了ND的第4次大流行。这些一方面说明NDV的变异可能已突破种源屏障，在鸡与鹅之间进行相互传播；另一方面说明中国古老的NDV毒株仍然持续存在，并逐渐向强毒株突变，与其他新出现的基因型毒株“共循环“。     

2株鸽源新城疫病毒的毒力鉴定和基因型分析

2008年从临床鸽病例中分离到2株新城疫病毒毒株,经测定,鸡胚平均死亡时间(MDT)分别为48h和46h,8周龄SPF鸡静脉接种指数(IVPI)分别为2.88和2.91,一日龄雏鸡脑内接种指数(IPCI)分别为1.88和1.89,按照OIE推荐的标准均为强毒株。RT-PCR扩增出融合蛋白(F)基因片段,测序,推导的氨基酸序列中蛋白酶裂解位点附近的氨基酸序列均符合强毒特征序列。根据F蛋白的部分基因序列绘制的系统进化发生树和F基因片段中3种限制性内切酶(RE)位点分布判定这2个毒株均为基因Ⅶc型。     

应用兼并引物RT-PCR快速检测及鉴别气载鸡新城疫病毒

为了快速检测并鉴别鸡舍内外空气中的新城疫病毒(NDV),应用AGI-30气体收集器在一大型商品肉鸡舍舍内外收集气体,同时采集鸡的气管和泄殖腔拭子,采用兼并引物RT-PCR检测气体样品和拭子中的NDV,并鉴别NDV的毒力;同时分离、纯化气体样品中的NDV,用常规毒力学试验鉴别分离株的毒力.结果RT-PCR检测到舍内2/15的气体样品和4/15的拭子中同时有强毒和弱毒株,3/15气体样品和13/15的拭子只有弱毒,舍外上风向5 m处气体样品检测结果均为阴性,舍外下风向5 m处1/3的样品只有弱毒;其他样品均为阴性;从RT-PCR检测为阳性的样品中分离到3株强毒和4株弱毒株;从RT-PCR检测为阴性的样品中均未分离到NDV.结果表明兼并引物RT-PCR可直接、快速对气体样品进行检测及鉴别诊断.     

RT-PCR快速检测口蹄疫病毒

根据口蹄疫病毒VP1基因的序列，设计了1对引物，建立了检测口蹄疫病毒的RT－PCR方法。对FMDV各毒株检测，结果均为阳性，而对猪病毒性疾病相关病毒进行检测，结果均为阴性；检测19份已知阳性样品，检出率100％；与动物接种试验比较，符合率100％，证明该方法特异，与经典方法动物接种试验比较，其灵敏度提高100倍左右；对O3I3株的细胞毒进行检测，其敏感度达10个TCID50。初步结果表明所建立的RT－PCR技术可用于口蹄疫的诊断和流行病学调查。     

35株不同来源的新城疫病毒(NDV)分离株F-糖蛋白基因序列测定和基因型

采用病毒分离试验、鸡胚平均死亡时间毒力试验、RT－PCR和F－糖蛋白基因序列测定及基因分析，对1996－2000年从国内不同地区多种禽类中分离到的新城疫病毒（NDV）分离毒株进行了研究，绘制了基因树。毒力试验结果表明，其中有32株为强毒株，有3株为中等毒力株。DNA序列分析和基因树结果表明，这35株NDV分为4个类群，其中27株为基因Ⅶ型（主要流行毒株），3株为基因Ⅵ型，4株为基因Ⅱ，1株为基因Ⅲ型。结果指示，我国新城疫感染来源是一个值得关注的问题。     

新城疫疫苗株与分离毒株的蚀斑克隆与毒力鉴定

2株NDV贵州分离株(GN、ND99)与2株疫苗毒株(Ⅰ系和Ⅱ系)经检测为生物异质性毒株.利用蚀斑克隆技术对以上4株毒株进行蚀斑纯化,结果得到11株克隆毒株.其中,10株克隆毒株在鸡胚成纤维细胞上形成圆形、透明无色蚀斑,1株形成圆形、透明、红色蚀斑.经RT-PCR检测,11株克隆毒株中6株为弱毒,形成蚀斑的大小在0.4～8mm之间;5株为强毒,形成蚀斑的大小在1.0～2.0mm之间.结果表明:所形成蚀斑的大小与病毒毒力具有一定的相关性.     

RT-PCR结合限制性内切酶分析法区分NDV强弱毒株

通过设计的特异引物，采用RT-PCR对1996年以来分离的45株国内新城疫病毒分离株进行鉴定和分析，并与其MDT实验结果进行比较，建立了RT-PCR结合BglⅠ内切酶分析区分新城疫强弱毒的方法。此方法操作简便、迅速，不仅能区分新城疫的强弱毒株，还可诊断AMPV-1引起的其他禽类的感染。     

应用逆转录套式PCR检测新城疫病毒核酸

选择DNV融合蛋白保守的编码区域,设计并合成了一对外引物和一对内引物,建立并优化了检测新城疫病毒核酸的逆转录套式PCRI地,通过检测NDV感染的实验客观存在病料和临床病料,结果表明,逆转录套式PCR法最低能鉴别出约0.3pg的NDV RNA,攻毒后第8天还能从非免疫鸡和SPF鸡泄殖腔拭子中检出DNV,第8天非免疫鸡泄殖腔拭子中NDV的最大检出率为5/10,第8天SPF鸡泄殖腔拭子中NDV的最大检出率为6/10,对非免疫鸡和SPF鸡的泄殖腔中NDV最佳检出时间均在攻毒后第5天。逆转录套式PCRY应运地临床样品中DNV的最大检出率为6/7,经核酸杂交验证,该法具有很高的特异性和敏感性,也比较简便快速,为从分子水平探讨NDV的发病机理、临床早期快速诊断提供了新的研究手段。