共查询到20条相似文献,搜索用时 15 毫秒
1.
贵州桂花种质资源遗传多样性的ISSR分析 总被引:1,自引:0,他引:1
通过ISSR分子标记,对贵州不同地区的54份桂花种质进行了遗传多样性研究.选取11条多态性引物用于正式扩增,获得清晰、重复性好的DNA谱带93条,多态位性谱带80条,占总扩增带的86%,平均每个引物扩增8.45条;应用810和830的引物组合,构建了桂花种质的ISSR指纹图谱,可以有效区分所有供试材料;利用NTSYS和POPGENE 32进行数据分析,计算出相似系数与遗传距离,构建了54个样本的聚类树状图;以遗传相似系数0.69为阈值把54份供试桂花材料分为4类,聚类结果与地域及海拔具有一定相关性.因此,ISSR技术能够有效地用于桂花种质资源的鉴别及遗传关系的解析. 相似文献
2.
3.
《分子植物育种》2015,(12)
采用正交设计方法,针对影响贵州桃ISSR-PCR反应的引物浓度、模板DNA、Master Mix及退火温度等因素进行优化,建立了适于贵州桃ISSR-PCR标记的反应体系。20μL反应体系含有Master Mix 10.0μL、引物浓度0.375μmol/L、DNA模板40 ng、退火温度为52℃。利用该体系对71份贵州桃资源进行分析,扩增条带清晰,扩增产物在175~2 300 bp之间。12条ISSR引物共扩增112条带,其中多态性条带79条,多态性比率为70.54%。供试材料的Nei's遗传多样性指数(H)为0.211 1±0.184 4,Shannon's信息指数(I)为0.325 1±0.260 8。聚类分析显示71份贵州桃资源遗传相似系数变幅为0.669 6~0.919 6,在相似系数0.80水平处可将供试材料分为8个类群,表明贵州桃资源具有较为丰富的遗传多样性。 相似文献
4.
5.
富贵竹种质资源遗传多样性的ISSR分析 总被引:1,自引:0,他引:1
利用ISSR分子标记技术对10份富贵竹(Dracaena sanderiana)材料进行了遗传多样性研究。从 36个引物中筛选出 8个有效引物,共扩增出125条带,其中多态性条带为69条,多态性比率为55.2%,遗传相似性系数范围在0.64~0.95之间。根据ISSR标记的结果,采用UPGMA聚类分析方法,可将供试材料分为3大类群。研究结果表明, 供试富贵竹材料的遗传多样性相对较低,迫切需要拓宽富贵竹的遗传基础。 相似文献
6.
应用ISSR标记对32份洋葱种质资源的遗传多样性进行了分析。从31个ISSR引物中筛选出4条扩增产物条带清晰、多态性高的引物,在32份资源样品中共扩增出39条带,其中31条带为多态性位点,平均每个引物扩增的多态带数为7.75条,多态性条带比率(PPB)为79.48%。资源间的遗传相似系数在0.552~0.960之间,具有较为丰富的遗传多样性。ISSR聚类分析表明,在L取值为D=0.68时,可将32份洋葱资源分成5类:第一类包括18份种质资源,主要以Yellow Sweet Spanish系统为主;第二类包括1份种质资源,为Bejo Daytona;第三类包括3份种质资源,为Yellow Globe系统;第四类包括9份种质资源,为Yellow globe danvers系统;第五类包括1份种质资源,为Yellow Danvers system系统。较好地揭示了洋葱种质资源间的遗传多样性与亲缘关系,可为洋葱遗传育种和杂交亲本选择提供科学依据。 相似文献
7.
黄瓜种质资源遗传多样性的ISSR分析 总被引:8,自引:0,他引:8
利用ISSR技术对46份黄瓜材料分析,结果表明,8个ISSR引物在46份黄瓜种质中共扩增出42条带,多态性带的比例为85.71%.由Jaccard方法计算遗传相似系数可知,这些材料间的遗传相似系数的变化范围是0.3030~0.8750,其中23(ZN1)和42(四川寸金子)的遗传距离最小(0.3030),其遗传距离最远,34(Edipse)与43(杨泾黄瓜)之间的遗传相似系数最高(0.8750),其遗传距离最近.由聚类分析结果表明,若以相似性系数为0.52为阈值时,可将46份黄瓜品种聚为两类,一类以较强的雌性表现为特征,另一类则多表现为普通性型.若以0.54的相似系数为阈值,46份黄瓜材料可以被分为四大类,虽然不能完全按照生态型将现有黄瓜资源完全聚类,但总体而言,来自于同一生态型的多数资源可以聚在不同的类或亚类中. 相似文献
8.
9.
东南亚茄子种质资源ISSR遗传多样性分析 总被引:3,自引:1,他引:3
为探讨东南亚和中国华南地区茄子育种资源的遗传差异,研究采用ISSR分子标记对来自泰国和马来西亚的10份茄子材料及中国和南美的8份材料进行遗传多样性分析。结果表明,17条ISSR引物共扩增出433条谱带,其中多态性条带390条,平均多态率为92%。17条引物在18份材料中的平均观测等位基因数、平均有效等位基因数、平均Nei’s基因多样度和平均香农信息指数分别为1.8971、1.4778、0.2850、0.4336,18份材料间的遗传相似系数GS在0.55~0.81之间。运用NTSYSpc2.10软件的UPGMA方法进行聚类分析,结果表明在遗传相似系数0.67时18份材料可分为2个类群,其中来自于东南亚的10份材料在第1类群,来自于南美的3份材料在第2类群。研究结果表明,东南亚茄子材料与中国和南美茄子材料间遗传多样性丰富,可为茄子种质资源的进一步研究和利用提供理论依据。 相似文献
10.
新疆薰衣草种质资源遗传多样性的ISSR分析 总被引:1,自引:0,他引:1
本研究应用ISSR标记对19份薰衣草种质的遗传多样性进行分析。结果显示:从100条引物中筛选出9条多态性明显的引物,19份材料DNA共扩增出94条谱带,其中多态性谱带40条,多态性比率为42.6%,平均每个引物扩增条带数为10.4条;9条ISSR引物可将所有样品完全分开,当遗传相似阈值为0.69时,可将样品分为3个类群:第Ⅰ类群13个品种(系)可分为2个亚类,第Ⅱ类群5个品种(系)可分为2个亚类,第Ⅲ类群1个品种(系)。样品间的遗传相似性系数为0.325~0.975(平均0.737)。群体的有效等位基因数、基因多样度、Shannon信息指数分别为1.454 0、0.280 5和0.435 4。研究结果表明,19个新疆薰衣草种质资源遗传多样性水平处于较高。 相似文献
11.
不同山茱萸种质资源形态和ISSR遗传多样性研究 总被引:1,自引:0,他引:1
利用形态特征和ISSR标记对35份山茱萸种质资源进行遗传多样性分析,利用NTSYSpc-2.11F软件分析遗传相似系数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系系统图。结果表明,35份山茱萸在9个性状上差异明显;分子标记中9条引物共得到条扩增条带179条,其中有164条呈现多态性,占91.6%,遗传相似系数变化范围O.575-0.877。对其进行数据化处理后聚类,35份山茱萸材料可划分为2个类群6小组,材料的聚类结果与地理分布、形态特征有一定的相关性。 相似文献
12.
为摸清云南椰子种质资源遗传多样性现状,促进资源的有效利用,以在云南收集的60份椰子种质为试材,利用ISSR分子标记技术对其遗传多样性进行了分析。结果表明:27条ISSR引物共扩增出272个位点,其中230个为多态性位点,多态性比率为84.56%,引物多态性指数为0.85,SM遗传相似系数平均值为0.664。根据各种质的SM,运用NTSYSpc2.10e软件的UPGMA方法构建了种质的系统聚类图,60份椰子被聚为3个类群(A、B、C)。其中,A类群为全部由本地种质组成的一个独立类群;C类群既包括部分本地种质,也包括来源于本地以外的其他种质。研究结果显示出云南椰子种质具有较高的遗传多样性;这些种质与外地种质具有独立性和关联性的特点。该研究结果可为云南椰子种质资源的进一步研究和利用提供参考。 相似文献
13.
利用ISSR分子标记对29个红托竹荪菌株进行遗传多样性分析。结果表明,利用TM值(溶解温度)差异对78条ISSR引物进行筛选,获得34条多态性丰富的引物,其片段大小为100~2 000 bp;各种质间Nei’s遗传距离(GD)值0.131 2~0.997 4之间,遗传相似性系数(GS)在0.401 6~0.877 0之间变化,聚类分析将29个红托竹荪菌株分为三类,Z 8(重庆市石柱县)与Z 10(四川省青川县)菌株间亲缘关系最近,Z 5(兴义市)和Z 2(织金县)菌株间亲缘关系最远,29个红托竹荪菌株具有较大的遗传差异性,遗传信息丰富。 相似文献
14.
中国蚕豆种质资源ISSR标记遗传多样性分析 总被引:7,自引:0,他引:7
利用ISSR标记对中国18个省(区)的527份春播区和秋播区蚕豆资源的遗传多样性与亲缘关系进行分析。结果表明,11个ISSR引物共扩增出278条清晰的条带,其中多态性条带268条(占96%)。不同地理来源蚕豆资源群间的基因多样性指数在0.1267~0.2509之间,平均为0.1716;Shannon指数范围为0.1932~0.3767,平均为0.2608。两指数均以内蒙古资源群最高,云南和甘肃资源群次之,江西资源群体最低。非加权配对算术平均法(UPGMA)的聚类分析和二维主成分分析(PCA)结果表明,中国春播区和秋播区蚕豆资源明显不同,浙江和四川的资源形成独立的组群,明显不同于其他省份,其遗传背景独特,有待进一步研究。中国蚕豆种质资源遗传多样性差异和遗传关系与其生长习性、生态分布及地理来源密切相关。 相似文献
15.
16.
贵州野生半夏资源遗传多样性的ISSR分析 总被引:1,自引:0,他引:1
采用ISSR标记对来自贵州省及周边省区的60份野生半夏(Pinellia ternate(Thunb.)Breit.)遗传多样性进行分析.从100条引物中筛选出16条多态性丰富,条带清晰的引物,共扩增出150条谱带,其中119条显示多态性,总多态百分率为79.33%,平均每个引物能扩增出9.4条;贵州省不同样品间的遗传差异性较大,多态百分率为38.0%~60.3%.高于55%的样品占全部贵州省样品的2/5,分布于全省各个地州市;样品间相似系数分布在0.63~0.93之间.UPGMA法将60份样品分为6类,样品的聚类存在一定的地域性. 相似文献
17.
18.
19.
利用ISSR标记研究鹅观草属种质资源的遗传多样性 总被引:5,自引:0,他引:5
为进一步了解鹅观草属种质资源的遗传背景和拓宽牧草育种的遗传基础,科学指导鹅观草属种质资源的收集、评价和利用,利用ISSR(Inter simple sequence repeat marker)标记对鹅观草属20个种,6个变种,共60份材料进行了遗传多样性检测。结果发现,被测材料间ISSR标记的多态性较高,在20个引物中,有16个引物可扩增出清晰且重复性好的DNA片段,共产生125条DNA片段,其中104条具有多态性,多态性比率为83.20%;每个引物可扩增出6~10条DNA片段,平均7.81条,材料间遗传相似系数GS变幅为0.188~0.879,平均值为0.375;聚类分析表明,在遗传相似系数为0.441的水平上,60份材料可以聚为5类,属于同种、同组、同系的不同材料首先聚在一起,然后再与其他种的材料聚在一起,此外,材料的聚类还表现出一定的地域性规律。 相似文献