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DNA标记及其在家禽遗传育种中的应用 总被引:9,自引:0,他引:9
DNA标记及其在家禽遗传育种中的应用戴茹娟,吴常信,李宁(中国农业大学动物科技学院北京100094)(中国农业大学国家农业生物技术重点实验室北京100094)长期以来,研究者希望能够利用遗传标记来分析数量性状位点(Quantitativetraitl... 相似文献
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为了建立一种对近交系大鼠遗传物质进行精确可靠、快速简便的监测方法,利用DNA指纹技术对国内6个品系8个近交系大鼠群体进行了DNA多态性的分析,并与PCR扩增微卫星DNA技术进行了比较。其结束显示:(1)不同品系之间DNA指纹图差异较大,同一群体不同个体间DNA指纹图带的相似系数和共有带率除SHR(哈)和WKY(哈)小于0.7外,其他均大于0.9。不同地区同一SHR间和WKY间DNA指纹图也存在差异,相同DNA不同次制作的DNA指纹图谱基本一致。(2)不同品系个体间微卫星DNA具有显著多态性;同一群体不同个体之间除SHR(哈)的SMST位点和WKY(哈)的AGT位点出现一定的差异外,其他均没有差异。DNA指纹图能更精确可靠地反映出动物个体间的遗传背景,而微卫星DNA遗传监测方法比较简便快捷。 相似文献
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藏系绵羊随机扩增多态性DNA最佳反应体系的研究 总被引:2,自引:1,他引:1
以高原型藏羊的基因组DNA为模板,通过对RAPD反应体系中的各种参数进行优化试验,建立了适宜于藏系绵羊RAPD分析的最佳反应体系:在PE2400型DNA扩增仪的25μL反应体系中,模板DNA的量为60-120ng,引物量为4-8pmol,Mg^2 浓度为2.0mM,Taq DNA聚合酶为1-2.5U,dNTP浓度为150-200μM;94℃预变性3分钟后35次循环的参数设定为:94℃1分钟,36℃1分钟,72℃2.5分钟,最后72℃延伸10分钟,利用这些条件对藏系绵羊的基因组DNA进行RAPD分析,其结果的重复性和可靠性大为提高。 相似文献
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畜禽DNA分子标记及其研究进展(下) 总被引:3,自引:0,他引:3
3畜禽DNA标记的研究进展畜禽DNA标记的研究包括各畜种新的DNA标记的发现,DNA标记技术的改进及自动化技术的发展,畜禽DNA标记按用途可分为:用于QTL标记和MAS标记、亲缘关系分析的标记等。继Jefreys之后,Burke和Bruford(19... 相似文献
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动物线粒体DNA特性及其多态性研究进展 总被引:2,自引:1,他引:1
本文在线粒体DNA基因组特点的基础上,综述了mtDNA多态性分析在动物起源进化、分类和育种等方面的研究进展,并给以简要的评述。 相似文献
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旨在构建我国部分马、驴细胞色素b(CYTB)基因的DNA条形码数据库,并研究其遗传多样性。以全国不同区域的8个马和3个驴品种共计149例样本为研究对象,以CYTB为候选基因,构建DNA条形码数据库,并与前期获得的细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)和16S rRNA(16S)基因的DNA条形码进行对比,对我国部分马、驴品种进行遗传多样性分析。本研究共生成了CYTB DNA条形码1 271条,经分析,CYTB、COⅠ和16S的GC含量范围分别为44.4%~47.0%、38.3%~47.0%和40.9%~42.6%。对比后发现CYTB基因拥有最多的单倍型序列,在3个基因中表现出更多的多态性位点数,且单倍型多样性更高。编码蛋白的CYTB和COⅠ基因的第3位密码子突变率更高,保守性最小,而非编码蛋白16S基因中3位密码子突变率没有显著差异。CYTB和COⅠ蛋白序列的氨基酸含量不同,CYTB中含量最多的3个氨基酸为亮氨酸、异亮氨酸和苏氨酸,COⅠ为亮氨酸、甘氨酸和丙氨酸。在CYTB和16S条形码中,无论是在物种水平上还是在亚种水平上,种内和种间距离都出现重合现象,而马和驴的COⅠDNA条形码在种内/种间遗... 相似文献
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家畜线粒体DNA(mtDNA)的研究 总被引:11,自引:2,他引:9
本文概述了家畜特别是牛和猪线粒体DNA研究的概况和取得的成果,介绍了家畜线粒体DNA的一些特征,限制性酶及限制性酶分析以及线粒体DNA在家畜种间和品种间的多态性,并讨论了这种多态性,作为一个重要的母性遗传标记在考查家畜种及品种起源和演化上的意义。 相似文献
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牛微卫星DNA的特征天空及其在遗传育种中的应用 总被引:1,自引:0,他引:1
本文在对微卫星DNA的遗传结构与特性概述的基础上,与目前主要几种遗传标记的特性进行比较,并对微卫星DNA多态性分析技术在牛遗传育种中研究与应用进行了搪塞。 相似文献
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Analysis of genetic diversity and phylogenetic relationship of red deer subspecies in XinJiang,China
Bin JIA Ren‐Yan LI Zong‐Sheng ZHAO Gen‐Qiang YAN Ji‐Feng XI Hugh T. BLAIR Da‐Quan LI Jian‐Xin ZHANG Xi‐Tang ZHAO 《Animal Science Journal》2011,82(4):517-522
Polymorphisms for seven microsatellite loci in three red deer subspecies (9 populations) found in XinJiang were detected by polymerase chain reaction (PCR), 12% nondenaturation polyacrylamide gel electrophoresis and the Sanguinetti silver staining method. Numbers of alleles, average effective numbers of alleles (E) and the average rate of homozygosity, allelic frequencies of seven microsatellite loci, polymorphism information content (PIC), mean heterozygosity (H) and genetic distances among the populations were calculated for each population. Dendrograms were constructed based on genetic distances by the neighbor‐joining method (NJ), utilizing molecular evolutionary genetics analysis software PHYLIP (3.6). The phylogenetic tree was constructed based on allelic frequencies using maximum likelihood (ML); the bootstrap value was estimated by bootstrap test in the tree. Lastly, phylogenesis was analyzed. The results showed that four of the seven microsatellite loci were highly polymorphic, but BMS2508 and Celjp0023 showed no polymorphism and BM5004 was a neutral polymorphism. It is our conclusion that the four microsatellite loci are effective DNA markers for the analysis of genetic diversity and phylogenetic relationships among the three red deer subspecies. The mean PIC, H and E‐values across the microsatellite loci were 0.5393, 0.5736 and 2.64, which showed that these microsatellite loci are effective DNA markers for the genetic analysis of red deer. C.e. songaricus populations from Regiment 104, 151 and Hami are clustered together. C.e. yarkandensis populations from Regiment 35, Xaya and Alaer are clustered together. These two clusters also cluster together. Lastly, C.e. sibiricus populations from Burqin, Regiment 188 and the first two clusters were clustered together. The phylogenetic relationship among different red deer populations is consistent with the known origin, history of breeding and geographic distributions of populations. 相似文献
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桑树叶绿体基因组DNA的提取及部分序列分析 总被引:4,自引:1,他引:3
改进Milligan法 ,提取了桑树叶绿体基因组DNA(cpDNA)。利用特异性引物 ,从cpDNA基因组扩增出tRNL tRNF基因。再用随机引物对同一种桑基因组DNA及cpDNA进行RAPD分析 ,表明提取的DNA是具有相当纯度的cpDNA。进一步用XbaⅠ和HindⅢ进行了cpDNA的酶切和克隆。通过酶切鉴定 ,已克隆到 5个片段 ,对其中 1个片段的 70 0bp序列进行了分析 ,推测克隆的片段可能为trnK基因的内含子。 相似文献
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基于RAPD和SSR分子标记的家蚕部分实用品种多态性及其亲缘关系分析 总被引:2,自引:0,他引:2
分子标记是生物系统进化和亲缘关系分析的重要手段。利用RAPD和SSR标记对12个家蚕实用品种的基因组DNA进行多态性分析和聚类分析。采用21条RAPD引物对12个品种的基因组DNA扩增产生的清晰稳定条带数为196条,其中多态性片段143条,多态位点比例72.96%,品种间的遗传距离在0.157~0.352之间。采用32条SSR引物对12个品种的基因组DNA扩增产生的片段数为86条,其中多态性带80条,多态性位点比例93.02%,遗传距离在0.214~0.600之间。对12个家蚕品种的2种分子标记的单独聚类结果表现出一定差异,但均把12个品种分为中系、日系两大类,其中7532和湘晖、871和57B的亲缘关系较近,而传统分类于中系品种东34却聚类于日系,但又独立于其余6个日系品种。结合RAPD标记和SSR标记的12个品种间的遗传距离与聚类结果,更能准确地从分子水平上反映品种间的亲缘关系及其来源,是家蚕杂交育种亲本选择的依据。 相似文献
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D.M. Collins 《New Zealand veterinary journal》2013,61(6):207-209
Aim. To investigate isolates of Mycobacterium bovis from the Castlepoint area of the Wairarapa using three different methods of DNA typing. Methods. Isolates of M. bovis, obtained from animals in the Castlepoint area between 1982–l998, were characterised by restriction endonuclease analysis. An isolate representing each restriction type was characterised by two newer DNA typing methods based on the polymorphic GC-rich repetitive sequence (PGRS) and spoligotyping. Results. Over 300 isolates were distinguished into 26 restriction types.The 24 available restriction types were differentiated into 11 PGRS types and 7 spoligotypes. The three most common restriction types had the same PGRS type and the same spoligotype. Conclusions. The relatively large number of restriction types found, indicated that restriction endonuclease analysis was well suited for detailed epidemiological studies at Castlepoint. Spoligotyping was less discriminatory than PGRS typing but both methods could be used to group isolates with different restriction types. 相似文献
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为优化猪精子载体法技术参数,利用荧光定量PCR、荧光显微镜检测和精液常规检测方法,分析不同DNA转染剂、不同孵育温度和不同形态DNA对猪精子转染外源DNA的影响。结果表明,PEI和TransFast转染剂能极显著提高猪精子转染效果,且PEI优于TransFast,而NanoFect转染剂包裹DNA不能转染精子。随着转染温度的升高,精子的活力和活率均明显下降,而转染率和内化外源DNA量基本保持稳定,而吸附外源DNA量呈下降趋势。环状DNA和线性化DNA在与精子共孵育后,两者的精子活力、活率、转染率和内化外源DNA量差异均不显著,精子吸附线性化DNA量极显著高于环状DNA量。综合分析表明,外源DNA形态对猪精子转染效果无显著影响;PEI和TransFast能够显著提高猪精子转染效果;共孵育温度以17℃为最佳,本结果为开展精子载体法制备转基因猪研究提供了基础试验依据。 相似文献
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