扬州鹅PRL基因5'调控区SNP检测及其与产蛋性状的相关分析

催乳素(Prolactin,PRL)是影响禽类就巢性和产蛋性能的重要候选基因,本试验以扬州鹅为研究素材,采用PCR-SSCP方法检测催乳素基因5′调控区序列的SNP位点并分析其与扬州鹅产蛋性状的相关性,以期为扬州鹅产蛋性状标记的辅助选择提供一定的理论依据。结果表明,在试验群体中检测到CC、DD两种基因型,未检测到CD型;对不同基因型个体测序分析发现,在外显子1上游﹢11处发现了一个G→T突变;等位基因C和D的频率分别为0.7692和0.2308。供试群体在5′调控区检测位点上处于Hardy-Weinberg不平衡状态。PRL基因5′调控区的碱基突变对扬州鹅的产蛋量和开产日龄有极显著的影响,CC型群体在一个产蛋周期内的平均产蛋量极显著高于DD型(P0.01);开产日龄也是CC型极显著早于DD型(P0.01)。     

高邮鸭GNRHR基因克隆及卵巢中mRNA表达分析

为了探究GNRHR基因在双黄蛋形成过程中的作用,本研究以高邮鸭为试验素材,应用克隆测序技术获得了高邮鸭促性腺激素释放激素(GNRHR)基因的全序列,并分析该基因的结构;采用荧光定量技术检测258日龄和330日龄高、低产双黄蛋鸭卵巢组织GNRHR基因mRNA的表达量,并分析了两者之间的差异。结果表明,鸭GNRHR基因序列全长为1 944 bp,共有3个外显子和2个内含子;258日龄和330日龄,高产双黄蛋鸭卵巢GNRHR基因mRNA的表达量高于低产双黄蛋鸭的表达量(P0.05)。     

鸭催乳素基因内含子1单核苷酸多态性分析

研究通过PCR-SSCP和测序的方法检测我国8个地方鸭种共476个个体的PRL基因内含子1的单核苷酸多态性,分析不同群体的等位基因频率和基因型频率并对其遗传特性进行统计分析。结果表明:所检测的8个地方鸭种均呈现多态,比较测序结果发现,多态性是由位于PRL基因内含子1一个核苷酸碱基由A到C的突变造成的。除连城白鸭以外,其他各群体中等位基因A为优势等位基因。除连城白鸭和绍兴鸭外,其他各群体在该位点的基因频率均处于Hardy-Weinberg平衡(P0.05)。     

高邮鸭主要血浆生化指标与产蛋性状的相关分析

通过对200日龄产蛋早期的78只高邮鸭血浆总蛋白(TP)、白蛋白(ALB)、天门冬氨酸氨基转移酶(AST)、丙氨酸氨基转移酶(ALT)、碱性磷酸酶(ALP)、乳酸脱氢酶(LDH)、α-淀粉酶(AMY)、总胆固醇(CHO)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)和无机磷(P)共11项生化指标进行测定,研究其与产蛋性状的相关性.结果显示TP(58.25±7.83)g/L,ALB(18.16 4.23)g/L,AST(25.83±9.35)U/L,ALT(55.07±36.25)U/L,ALP(332.2±153.1)U/L,LDH(319.46±99.61)U/L,AMY(554.3±168.8)U/L,HDL-C(1.19 0.65)mmol/L,CHO(3.19±0.83)mmol/L,LDL-C(1.72 0.96)mmol/L,P(0.29 0.12)mg/mL;AST活性与开产体重呈强负相关(P＜0.01).     

基于RNA-Seq测序的高、低产双黄蛋高邮鸭卵巢组织SNP筛选分析

试验旨在进一步完善高邮鸭基因组结构信息,探索高邮鸭双黄蛋产蛋性能的调控机制。通过高通量测序技术对高邮鸭双黄蛋高、低产组卵巢组织转录组进行RNA-Seq测序,对测序数据进行质控和注释,筛选与高邮鸭双黄蛋产蛋性能相关的SNP位点。测序获得的初始数据（raw reads）进行系列质控筛选,6个高邮鸭卵巢组织分别获得84 540 140~87 479 660个有效数据（clean data）,70.79%以上的测序数据被已注释的鸭基因组数据覆盖;在所覆盖的基因组数据中,检测到位于基因外显子区域的108 260~116 478个SNP位点（转换和颠换类型）,转换类型总数极显著高于颠换类型总数（P<0.01）。利用KEGG数据库对筛选出的SNP位点所在基因进行信号通路分析,筛选出前20条信号通路,其中包括核糖体信号通路、碳代谢信号通路和氨基酸生物合成信号通路等。试验对双黄蛋高、低产组高邮鸭的卵巢进行了RNA-Seq测序分析,为发掘高邮鸭双黄蛋产蛋性能相关SNP位点提供了基础,为进一步研究高邮鸭双黄蛋产蛋性能的调控机制提供了新的数据支撑。     

高邮鸭与金定鸭GnRHR2基因组织表达差异分析

克隆鸭GnRHR基因序列,并研究其对产蛋性能的调节作用.采用RT-PCR技术从鸭生殖轴组织总RNA中克隆GnRHR基因cDNA序列,并利用Real-time PCR技术分析GnRHR基因在不同产蛋期高邮鸭和金定鸭生殖轴组织中的表达.序列分析结果表明克隆序列长度约500 bp,属Ⅱ型GnRHR基因序列,与家鸡cGnRHR...     

笼养高邮鸭常规蛋品质测定与分析

本试验中选取了230日龄笼养高邮鸭所产鸭蛋50只,测定其蛋重、蛋形指数、蛋壳强度、哈氏单位、鸭蛋比重、蛋壳厚度和蛋黄颜色等,其值分别为76．5g,1．36,5．0kg／cm^2,73．8,1．091g／cm^3,0．43mm,8．60,显示其具有较好的品质。结果显示：从蛋品质方面考虑,蛋鸭笼养是可行的。     

高邮鸭及其杂交组合产蛋性能和蛋品质的比较分析

为探索高邮鸭产蛋性能的有效组合,试验对高邮鸭及其与金定鸭、绍鸭大蛋系、绍鸭高产系正反交的后代进行产蛋性能和蛋品质的比较,通过对7个组合结果的分析研究,结果表明:不同杂交组合之间的产蛋性能和蛋品质存在一定差异.综合各指标,高邮鸭♂×金定鸭♀为较理想的杂交组合.     

五龙鹅PRL基因的SNP检测及其与产蛋性状的相关分析

试验采用PCR-SSCP方法检测五龙鹅催乳素基因(PRL)内含子2上的SNP位点,并分析其与产蛋性状的相关性.研究表明,五龙鹅PRL基因由于内含子2的第38和39位点上GA碱基的插入/缺失产生3种基因型CC、CD、DD;CC型、CD型、DD型的开产日龄、开产蛋重、平均蛋重之间差异不显著(P＞0.05),CD型、DD型的产蛋数要显著高于CC型(P＜0.05).研究表明,该突变位点对五龙鹅的产蛋量起着重要作用,可以为五龙鹅产蛋性状的分子标记辅助选择提供一定的依据.     

百宜黑鸡PRL基因多态性与产蛋性能关联分析

为了探究PRL基因多态性与鸡产蛋性能的相关性,试验以95只百宜黑鸡为研究对象,利用PCR扩增技术结合直接测序方法对鸡PRL基因SNP位点进行筛选.结果:在试验群体中找到4个SNPs,分别为g.6171 C>T、g.6232 C>G、g.6306 C>T、g.6440 T>C,且4个SNPs均处于第5外显子,g.6171 C>T和g.6232 C>G位点之间属于完全连锁平衡;χ2检验发现,该基因座的位点并不处于Hardy-Weinberg平衡状态;遗传参数分析发现,除了g.6306 C>T属于低度多态,其余位点均属于中度多态;关联分析表明,各SNP位点与产蛋性能之间不存在显著相关关系(P>0.05).     

高、低产双黄蛋高邮鸭卵巢组织差异分析

本试验以高邮鸭为研究对象,选择双黄蛋高、低产组高邮鸭各6只,颈动脉放血致死后立即采集下丘脑、垂体、肝脏、输卵管及卵巢组织,将采集的卵巢组织通过组织切片、HE染色观察卵巢形态结构,并对双黄蛋高、低产组高邮鸭卵巢中等级卵泡进行统计对比;进行特异性标记蛋白卵泡刺激素受体（FSHR）免疫组化染色,观察两组高邮鸭卵巢阳性细胞表达情况及卵巢颗粒细胞分布;同时提取下丘脑、垂体、肝脏、输卵管及卵巢组织RNA,采用实时荧光定量PCR技术检测FSHR基因的表达。结果显示,双黄蛋高产和低产组高邮鸭卵巢在组织结构及卵泡发育上存在明显差异,高产组卵巢上的卵泡繁密且发育良好,密布着众多小黄卵泡、大白卵泡及小白卵泡,各级卵泡大小差异明显;而低产组卵巢上的卵泡稀疏且发育较为迟缓,小黄卵泡、大白卵泡及小白卵泡数量较少。实时荧光定量PCR检测结果表明,高产组高邮鸭下丘脑、垂体、肝脏及输卵管中的FSHR基因表达量极显著高于低产组（P<0.01）,而卵巢中FSHR基因表达量在两组中差异不显著（P>0.05）。本试验结果表明,双黄蛋高、低产组高邮鸭的卵巢结构及卵泡发育存在显著差异,卵巢上的微环境可能是影响高邮鸭双黄蛋产蛋性能的影响因素。     

石歧杂鸡催乳素基因外显子2的SNP检测与产蛋就巢性状的关联分析

利用PCR-SSCP技术对石歧杂鸡的催乳素(prolactin,PRL)基因外显子2进行SNP检测和测序分析,并对该基因与石歧杂鸡产蛋、就巢性状的相关性进行了研究。结果表明,PRL基因外显子2存在多态性位点,该位点由于在3838位点发生C→T的碱基突变,产生了AA、AB和BB3种基因型,并导致氨基酸的改变,由亮氨酸变为苯丙氨酸。基因型AA和等位基因A的频率最高;BB基因型个体首次就巢时间显著晚于AA和AB基因型(P0.01);BB基因型的就巢次数显著多于AA和AB基因型(P0.05);3种基因型与产蛋性状相关性不显著。     

汶上芦花鸡催乳素基因外显子2的遗传变异及其与繁殖性状的相关性分析

本研究以汶上芦花鸡为研究对象,利用PCR-SSCP技术对催乳素（prolactin,PRL）基因外显子2进行SNP检测和测序分析,并对该基因与汶上芦花鸡繁殖性状的相关性进行了分析。结果表明,PRL基因外显子2存在1个多态性位点,该位点由于在3838 bp发生C→T的碱基突变,产生了AA、AB和BB 3种基因型,并导致氨基酸发生改变,由亮氨酸变为苯丙氨酸。BB基因型和等位基因B的频率最高;3种基因型（AA、AB和BB）在开产日龄、开产蛋重、开产体重、300日龄体重、300日龄蛋重的繁殖性状指标上均未达到差异显著性水平（P>0.05）。表明PRL基因外显子2多态性与汶上芦花鸡繁殖性状无明显相关性。     

牛CTSB基因第6内含子SNP与经济性状的关联分析

以174头西门塔尔牛和鲁西黄牛的杂交后代作为试验动物,利用PCR-RFLP方法对组织蛋白酶B基因(cathepsin B,CTSB)内含子6进行多态性检测,并应用SAS软件采用最小二乘法拟合线性模型,对不同基因型与牛部分经济性状进行关联分析。结果表明,CTSB基因内含子6的T5357C位点与大理石纹和活重2个经济性状显著相关,其中AA型大理石纹评分显著地高于BB型(P<0.05),BB型活重显著高于AA型(P<0.05)。上述结果为T5357C作为肉牛部分经济性状的分子标记提供了一定的理论依据。     

高邮鸭蛋壳超微结构观察

高邮鸭蛋壳的扫描电镜观察表明,由内向外可将蛋壳分为壳膜层、乳锥层、柱状层、表面晶体层和表层。青壳蛋与白壳蛋在超微结构上存在显著差异,从而导致青壳蛋的蛋壳强度明显高于白壳蛋。     

半番鸭MC1R基因SNP位点的发现和PCR-RFLP多态性分析

为了检测半番鸭MC1R基因的多态性,并分析其多态性与半番鸭羽色性状的相关性,以羽色表型极端的黑白羽半番鸭为研究对象,首先采用克隆测序的方法寻找MC1R基因编码区的SNP突变位点,结果发现MC1R.基因编码区存在7个SNP,其中同义突变A399G位点为限制性内酶切Hin61的识别位点.其次针对酶切位点,利用PCR-RFLP方法鉴定A399G位点的基因多态性,结果显示,白羽半番鸭存在AG和GG两种基因型,而黑羽半番鸭只表现出1种基因型AG.最后经卡方独立性检验分析,表明A399G位点的基因型与半番鸭羽色无显著相关(P＞0.05),这可能与该突变位点未引起蛋白质相应部位的氨基酸发生改变有关.基因型GG是否为白羽半番鸭特有,尚需加大样本进一步分析验证.     

黑番鸭VIPR-1基因第12内含子SNP与就巢性状关联分析

VIPR-1基因是研究家禽就巢性状的重要候选基因,以就巢期黑番鸭和非就巢期黑番鸭为研究对象,通过PCR-RFLP和测序的方法,对VIPR-1基因内含子12进行多态性检测,并进行相关性分析.结果表明,VIPR-1基因内含子12存在一个StuI酶切位点,该位点由于在内含子988 bp处发生了A→G的碱基突变,产生了AA、AG、GG三种基因型.其中就巢黑番鸭只表现为AG（1.0）一种基因型,而非就巢黑番鸭表现为AG（0.4167）、AA（0.1666）、GG（0.4167）三种基因型,就巢期黑番鸭与非就巢期黑番鸭两者之间基因型的分布差异极显著（P＜0.01）.试验表明黑番鸭VIPR-1基因第12内含子A988G突变与黑番鸭的就巢性状显著相关,为利用分子遗传标记辅助选择来降低或消除黑番鸭的就巢性,最大程度上提高黑番鸭的产蛋性能提供了新的依据.