辣椒自交系间亲缘关系的SRAP标记分析

利用SRAP标记技术对34份辣椒材料进行了基因组多态性分析,采用30对引物组合进行扩增,其中有28个引物组合可以获得多态性扩增,28个引物组合共扩增出356条带,其中多态性条带298条,多态性条带比例83.7%。通过聚类结果分析发现,在遗传相异系数为0.39处,可将辣椒的2个变种分开,即长角椒(C.f.var.longum Sent)和灯笼椒(C.f.var.grossum Sent),这与自交系间系谱关系相似;遗传相异系数在0.33处将34份辣椒自交系材料分成4个类群,运用SRAP分子标记是可以基本区分本套辣椒自交系材料的基本类型的。     

十二份杧果种质亲缘关系的SRAP分析

以12份杧果种质为试材,利用SRAP分子标记技术对其进行遗传多样性研究。结果表明:从36对引物中筛选出22对多态性好的引物,共扩增出251条DNA条带,其中多态性谱带181条,平均每对引物扩增得到15.08条多态性谱带,多态性比率为72.11%。UPGMA聚类表明,所有供试品种(系)之间的亲缘关系都比较近,相似系数在0.77~0.89;如果以相似系数0.78为标准,可将供试的12个品种(系)分为3类。表明利用SRAP技术能较好的区分杧果的亲缘关系;SRAP分子标记适合杧果的DNA遗传多样性分析,可作为杧果种质鉴定依据之一。     

耧斗菜园艺品种与野生华北耧斗菜亲缘关系的SRAP分析

以采自山西省沁水县历山等8处植物多样性丰富的山区10个华北耧斗菜材料和5个耧斗菜园艺品种为试材,采用SRAP(sequence-related amplified polymorphism)分子标记技术进行了亲缘关系分析。结果表明:从88对引物中筛选出17对多态性丰富的引物组合用于PCR扩增,得到扩增条带352条,其中多态性条带307条,多态性比率为87.2%。利用NTSYSpc-2.0软件进行UPGMA聚类分析,分别得出15个供试材料与10个华北耧斗菜材料间的亲缘关系树状图。15个供试材料的相似系数为0.6416~0.8571,聚类结果遵循植物学分类。10个华北耧斗菜材料的相似系数为0.7218~0.8571,生境是影响华北耧斗菜聚类结果的主要因素,地理分布为次要因素。     

芍药属SRAP反应体系优化与亲缘关系分析

以牡丹芍药杂交种‘东方金’和牡丹品种‘灰鹤’为试材,对SRAP-PCR反应体系和反应程序进行了优化,并利用优化的体系对芍药属65个品种进行了亲缘关系分析,以期建立稳定的芍药属植物SRAP分子标记技术体系。结果表明:芍药属植物的SRAP-PCR最佳程序为94℃预变性3 min;94℃变性30 s,37℃退火30 s,72℃延伸90 s,退火温度每个循环增加1℃,8个循环;94℃变性30 s,50℃退火30 s,72℃延伸90 s,32个循环;最后72℃延伸7 min。20μL反应体系中各成分的最佳浓度依次为Mg~(2+) 2.5 mmol·L~(-1),dNTPs 0.2 mmol·L~(-1),Taq酶1 U、引物浓度0.3μmol·L~(-1)。16对引物对65份材料进行PCR扩增共扩增出了1 229个条带,均为多态性条带,多态性高达100%,芍药和杂种聚为一类,牡丹聚为一类,说明杂种与芍药亲缘关系更近。该研究建立的芍药属SRAP-PCR体系重复性好、稳定性强,适合芍药属植物SRAP的研究,为进一步研究芍药属植物种质资源遗传多样性、品种鉴定、分子标记辅助育种等方面奠定基础。     

利用RAPD分析部分茄子品种的亲缘关系

茄子 (ＳｏｌａｎｕｍｍｅｌｏｎｇｅｎａＬ .)在植物学上可分为3个变种 :圆茄、长茄和矮茄〔1〕。本研究借助ＲＡＰＤ技术 ,对不同地区茄子材料间亲缘关系进行鉴定 ,为茄子种质资源的进一步评价提供依据。1　材料与方法1.1　材料　本试验共用 35份材料 ,其中包括中国农业科学院蔬菜花卉研究所资源库内来自 14个省市的 30份材料 ,亚洲蔬菜研究与发展中心来自两个不同国家的 5份材料。1.2　ＤＮＡ提取　ＤＮＡ提取参照Ｍｕｒｒａｙ〔2〕和Ｓａｇｈａｉ ｍａｒｏｏｔ〔3〕的方法。1.3　引物选择　均用Ｏｐｅｒｏｎ公司产 10ｂｐ随机引物 ,筛选…     

砂梨变异的SRAP初步鉴定及亲缘关系分析

为了鉴定砂梨变异类型在DNA水平上是否发生遗传变异,以砂梨的两个变异单株及25个梨代表品种为试材,通过正交试验设计优化了SRAP扩增体系,并从88对SRAP引物中筛选出22对适宜的引物进行TPCR扩增,找出差异性片段,并应用系统聚类法,     

猕猴桃SRAP-PCR体系的建立及品种资源亲缘关系研究

以猕猴桃属（Actinidia Lindl.）不同种幼嫩叶片为材料,建立了基因组DNA提取的改良SDS法,在此基础上采用正交试验设计和单因素分析相结合的方法,建立了适合猕猴桃SRAP分析的优化体系,即在20 μL总的反应体系中包括：DNA（40 ng ? μL-1）1 μL、Taq DNA酶（5 U ? μL-1）0.2 μL、dNTPs（2.5 mmol ? L-1) 1.4 μL、引物（10 μmol ? L-1）各1.5 μL、Mg2+（25 mmol ? L-1）2.0 μL、10× 缓冲液2.5 μL、ddH2O 9.9 μL。利用该体系对32份猕猴桃品种资源进行遗传多样性和亲缘关系分析,结果表明14条引物共扩增出275个多态性位点,多态性百分率为100%,SRAP可以作为猕猴桃资源亲缘关系研究的有效标记;在遗传相似系数0.73水平处,供试材料可区分为4组,分别是中华猕猴桃、美味猕猴桃、黑蕊猕猴桃和毛花猕猴桃组。聚类结果表明中华猕猴桃与美味猕猴桃有着非常近的亲缘关系,毛花猕猴桃与中华猕猴桃之间的亲缘关系较远,黑蕊猕猴桃与美味猕猴桃之间亲缘关系可能较近。     

利用RAPD标记研究部分葡萄品种的亲缘关系

对47个葡萄品种进行RAPD分析。从100条随机引物中筛选出30个多态性引物用于DNA扩增,共扩出216条DNA带,121条具有多态性,多态性比例为56.01%。通过聚类分析结果表明,供试品种分成5大类,巨峰、红瑞宝、龙宝等巨峰系品种聚为一类。其中龙宝和红瑞宝优先聚在一起。表明葡萄品种间的遗传多样性有明显差异,即使父母本相同的品种,利用RAPD技术也可以分开。聚类图显示,品种间遗传一致度与品种的遗传背景有关,如高妻与红井川,红瑞宝与龙宝优先聚在一起;有的品种虽属同一杂交组合却未能表现最大遗传一致度,如京玉与奥古斯特,在聚类图中处于相邻的位置,说明无性繁殖的葡萄在双亲基因型杂合条件下,有性杂交通过基因重组,杂种后代也可呈现出有较大遗传差异。     

矮牵牛育种发展及品种应用

对国内外矮牵牛育种历史、育种方法及品种应用进行评述,并介绍了矮牵牛的品种类型及园林应用。     

荔枝品种亲缘关系的AFLP分析

 应用AFLP技术，对39个荔枝品种进行了遗传多样性分析及分类研究。筛选出适于荔枝AFLP分析的最佳引物组合3对，分别为EcoRI AAC+MseI CTG，EcoPd AGC+MseI CAT，EcoRI ACC+Msel CAT。在分子水平上，荔枝品种的遗传多样性并非形态学性状所体现的那样丰富。AFLP分析将39个荔枝品种分成了6组，与传统的以果皮龟裂片隆起类型为分类标准的分类没有一致性。初步建立起荔枝主要栽培品种的分子标记标准图谱。应用AFLP技术对来自两个不同地方的两个荔枝品种(桂味、妃子笑)进行了鉴别。     

基于SRAP标记的百合部分种及品种遗传结构分析

 筛选了15对SRAP（Sequence-related Amplified Polymorphism）标记引物,对80个百合种及品种组成的样本进行标记,以所获的144个多态性位点和杂交试验获得的胚数,采用Pritchard分类方法对80个样本进行遗传结构分群分析。将试验样本划分为4个群,群体S1以亚洲百合杂种系的品种及原生种为主,群体S2以铁炮百合系的品种为主,群体S3以东方百合系的品种及原生种为主,群体S4则以OT杂交品种及原生种（S4）为主组成群,分群结果与传统百合杂种系的分类有一定的一致性;以S3群内部分样本杂交获得的胚数量作为亲和性指标与双亲群组分差异相关分析显示：群内双亲群组分差异绝对值与杂交获得胚的数量呈显著相关,表明分群及其组分能够比传统分类更好地体现出各样本间的主成分组成和遗传关系。据此,在百合杂交育种中可将分群以及组分作为亲本选配参考。     

万寿菊杂交一代遗传多态性的SRAP标记分析

 应用SRAP (Sequence-Related Amplified Polymorphism) 分子标记对当前市场上推广的48个万寿菊杂交一代品种进行遗传多态性研究,用60个引物组合进行扩增,从中筛选到20个多态性引物组合,共产生289个多态性条带,平均每个引物组合产生14.45个多态性条带,显示了较高的多态性比率。聚类分析20个引物组合的扩增结果,48份材料分为两大类,Jaccard's相似系数在0.25～0.91之间。     

SRAP对东北区骨干甜菜单胚品系的遗传多样性分析

为了探明东北区甜菜单胚不育系的遗传基础和类群划分,使用SRAP分子标记技术对48份东北区甜菜单胚品系骨干材料的遗传多样性进行分析。筛选出21对多态性较高的引物组合对供试材料进行PCR扩增,共扩增出366条带,其中196条是多态性带,平均多态性条带比率是53.6%。平均遗传距离是0.3945,平均遗传相似系数是0.6740。利用MEGA3.1软件,在遗传距离0.20处,供试材料被分为5个类群。结果表明,东北区48份甜菜单胚品系骨干材料的遗传多样性较为丰富,利用各类不育系做亲本,将可获得杂交优势好的杂交组合。     

西瓜杂交种遗传多态性的SRAP标记分析

 利用新型分子标记SRAP ( Sequence2Related Amp lified Polymorphism) 进行西瓜杂交种遗传多态性的研究, 利用25个引物组合对当前生产上推广的20个西瓜杂交种进行扩增, 从中筛选得到20个多态性引物组合, 共产生135个多态性条带, 平均每个引物组合产生71.1个多态性条带, 显示了较高的多态性比率。聚类分析20个引物组合的扩增结果, 20份材料分为3大类, Jaccardps相似系数在0.29～0.86之间。     

SRAP在葱栽培品种遗传多样性研究中的适用性分析

为评价SRAP技术对葱品种进行鉴定和遗传关系分析的适用性, 对20个葱栽培品种的表型特征进行了观察记载, 利用256个SRAP引物组合对其进行了遗传多样性研究。结果表明: (1) 256个SRAP引物组合中有161个引物组合产生多态性条带, 占所用引物组合数的62.9%。161个引物组合共产生336条多态性条带, 不同引物组合产生的多态性条带数为1～6个, 平均2.1个。20个葱栽培品种遗传相似系数变幅为0.464～0.938, 平均0.703。(2) 依据SRAP进行聚类分析的分类结果与依据表型特征分类的结果一致。上述结果说明SRAP标记可以在葱栽培品种的鉴定和遗传多样性研究中应用。     

仁用杏品种SRAP遗传多样性分析及指纹检索系统的开发

利用SRAP标记对24份仁用杏品种进行了遗传多样性分析。15对引物共扩增出280条带,其中241条为多态性谱带,多态性比率为85.34%;每个引物组合扩增谱带数在13 ~ 24条之间,平均为18.7条;多态性信息含量（PIC）在0.28 ~ 0.65之间,平均为0.51。基于引物Me4-Em4扩增的多态性谱带,构建的指纹检索系统可以区分24个仁用杏品种。根据SRAP扩增结果,利用UPGMA法构建树状聚类图,在相似系数为0.70处可将24个仁用杏品种分为4组,聚类结果与形态分类基本一致。     

萱草部分野生种和栽培品种亲缘关系的AFLP分析

 借助AFLP标记对35份萱草野生种和栽培品种进行亲缘关系研究, 结果表明, 7对引物组合对萱草共扩增出条带380条, 其中多态性条带357条, 平均多态性达到93.39% , 单对引物扩增条带19～85条, 平均每对引物组合扩增多态性条带51条。7对引物扩增出的多态性条带均超过90.0%。种质资源相似系数为0.3822～0.9656, 平均相似系数为0.7039。UPGMA聚类结果将供试材料分为3类, 即早花、中花和晚花类, 同一产地的品种基本能聚在一起。AFLP标记技术能较好地从分子水平揭示萱草种质资源的亲缘关系。     

黑穗醋栗品种亲缘关系的ISSR分析

 采用ISSR标记技术对39个黑穗醋栗品种的亲缘关系进行分析。结果表明：13条ISSR引物扩增的总带数（A）从3到11条不等,平均扩增出6.77条带,平均多态性带百分比（P）为64.37%。聚类分析显示,在相似性系数为0.8496处将39个黑穗醋栗品种分为5组。第Ⅰ组包含8个起源国家的品种,说明世界各国之间基因交流较为频繁。‘Ben Lomond’和‘Kantata’同其他品种的遗传距离较远,两者又有诸多优良农艺性状,可作为黑穗醋栗的优良育种材料。     

白术种质资源遗传多样性的SRAP分析

以湖北咸丰、湖南平江、安徽亳州等8个白术主产地的52份不同株型(紧凑型、中间型、松散型)白术种质资源为试材,采用SRAP分子标记法,研究了其遗传多样性,以期为白术种质资源有效利用及品种选育提供参考依据。结果表明:14对SRAP多态性引物共检测到184个位点,多态性百分率为88.6%,Nei′s基因多样性指数(H)平均值为0.2313,Shannon多样性指数(I)平均值为0.3629,基因流(N_m)为1.2137。52份种质间遗传相似系数为0.5272~0.9728,平均值为0.7985。紧凑型和松散型白术遗传多样性指数较为接近,且整体低于中间型,松散型与紧凑型白术遗传差异最大,而与中间型遗传差异最小。在遗传相似系数为0.80时,可将52份白术种质划分为九大类,聚类结果与地理分布无明显相关性,紧凑型主要聚在第一和第三大类,而松散型和中间型分散在各大类中。52份白术种质资源具有较丰富的遗传多样性,其中中间型和松散型种质遗传多样性较紧凑型丰富,可通过进一步研究筛选白术理想株型,为白术良种选育提供基础。