非损伤性取样提取动物DNA方法探讨

近年来,随着分子生物学技术的发展,非损伤性取样逐渐成为野生动物分子生物学研究中获取试验材料的主要方法.文章主要通过介绍当前非损伤取样提取动物DNA的方法,比较各种方法的优缺点和局限性,并分析了各种方法的研究特点和应用前景,以期对下一步研究提供有价值的参考.     

珍稀濒危鸟类微量取样及DNA提取的研究

为解决珍稀濒危鸟类分子生物学研究中存在的取样局限性,采用非伤害性取样和非损伤性取样,对大鸨10~70μL的血液和羽毛的不同部位(羽根、羽髓、羽鞘、实心羽茎和羽毛上脐周围绒羽)的DNA提取进行了研究。结果表明,鸟类血液样本与哺乳动物样本极为不同,两者相同体积的血液中,鸟类样本DNA含量是哺乳动物样本的几百倍,研究发现,大鸨可以从微量的血液中(10μL)提取出较多的DNA(45.75μg)。对于羽毛的不同部位,羽髓、羽鞘和羽根可以提出一定纯度的核DNA和mtDNA;实心羽茎可以提出一定纯度的mtD-NA。因此该研究将拓宽珍稀濒危鸟类采样的范围,为珍稀濒危鸟类的分子生物学研究提供了更广阔的样品来源。     

山羊绒毛干中线粒体DNA和核DNA的提取与PCR扩增

本研究以PCR缓冲液、MgCl2溶液和蛋白酶K为裂解提取液,建立了一种从山羊绒毛干中快速提取DNA的方法。结果表明,该方法不仅能从山羊绒毛干中提取出线粒体DNA和核DNA,而且能够有效地进行线粒体基因和核基因组基因的PCR扩增,为拓展羊绒样品在个体识别、遗传资源评价、分子进化和分子标记辅助育种等研究领域中的应用奠定基础。     

水貂Mustla Vison微量血DNA的提取与纯化

作者通过采取活体水貂少量血液 ( 5 0 μL) ,利用蛋白酶K消化 ,酚、氯仿法抽取DNA ,结果测量获得的数据和曲线表明 :用 5 0～ 5 0 0 μL冻存血可以获得具有一定纯度和数量的DNA ,完全可以满足RAPD分析的PCR反应所需     

猪耳组织DNA的快速提取

采用一步法提取的猪基因组DNA,可直接用于PCR扩增、单链构象多态性(SSCP)分析及测序。操作步骤为:采取新鲜猪耳组织2～10mg,蛋白酶K消化,55℃1h,滤纸过滤消化产物。取孔径为1.2mm的滤纸(含有足量的DNA)作为模板进行PCR扩增。结果表明,提取的基因组DNA质量较高,PCR扩增产物经琼脂糖凝胶电泳和SSCP分析后可见清晰的条带,可进一步用于克隆测序。滤纸上的DNA干燥后可常温保存。该方法简单、快速,成本低,效率高,适用于大批量的基因分型,也可用于提取不同组织的基因组DNA。     

动物产品的DNA提取方法

采用以异硫氰酸胍法为基础的提取方法分别提取牛肉、山羊肉、鸡肉、猪肉干、鱼粉、牛奶粉、牛奶、鱼油以及牛油中的DNA,18S rDNA片段的PCR扩增结果表明各样品已提取到DNA,且DNA中不含抑制PCR的物质。牛肉、牛奶粉、牛奶、加入牛肉DNA的鱼油和牛油的牛源性成分PCR检测结果为阳性;山羊肉和加入山羊肉DNA的鱼油的羊源性成分PCR检测结果为阳性;牛、羊源性成分PCR产物经酶切鉴定为非假阳性。这些结果显示本研究建立的动物产品DNA提取方法是可行的。     

从动物毛发中提取DNA进行RAPD扩增的研究

经实验改进了一种快速,简便提取动物毛囊细胞中ＤＮＡ的方法,电泳检测,ＤＮＡ带型整齐集中清晰,无拖尾现象;进行ＲＡＰＤ扩增,扩增带多而清晰,证明改进后的方法简便可行。     

从猪血中提取高质量基因组DNA的研究

经研究改进 ,建立了一种从猪血中提取高纯度全基因组DNA的有效方法。经 2 %琼脂糖凝胶电泳检测 ,DNA带型整齐集中 ,无拖尾现象 ,证明DNA分子片段完整 ,没有降解。紫外分光光度计检测 ,DNA的OD2 60 /OD2 80 达 1.75± 0 .0 5 ,证明所提DNA质量较好 ,用于PCR扩增 ,可以得到满意的扩增效果 ,且避免了用苯酚等剧毒试剂 ,是一种理想的DNA提取法     

六种试剂盒提取血液基因组DNA效果比较

为筛选一种高效、快捷的血液基因组DNA提取试剂盒,采集24份新鲜西藏绵羊血液样本,选用6种市售商业化试剂盒（LifeFeng柱式试剂盒DK601和非柱式试剂盒DK602,康为世纪非柱式试剂盒CW0544和柱式试剂盒CW0546,上海生工非柱式试剂盒SK8224和柱式试剂盒SK8254）,比较所提DNA的浓度、纯度、得率以及对嗜吞噬细胞无形体16S rRNA进行巢式PCR扩增,综合评价不同试剂盒DNA提取效果.结果表明,应用LifeFeng柱式试剂盒DK601提取的DNA浓度和纯度均最高,得率较高,分别达到75.63 ng/μL、1.894（OD260/OD280）、18.91 ng/μL;且嗜吞噬细胞无形体16S rRNA基因的PCR扩增条带清晰度最优.因此,LifeFeng DK601可作为提取绵羊血液基因组DNA及嗜吞噬细胞无形体（Anaplasma phagocytophilum）病原鉴定的首选试剂盒.     

从绵羊全血提取DNA的改进方法

以小尾寒羊冷冻全血为材料，介绍了提取DNA的改进方法。试验表明，提取的DNA纯度高，产量在正常范围之内，PCR扩增效果良好，可以用于分子遗传学实验。     

人工饲养褐马鸡的管理和防疫措施

人工饲养褐马鸡历年来死亡严重，１９８６～１９９１年经过死因普查，反复研究制定出行之有效的７条措施，效果很好，可供人工饲养褐马鸣借鉴。     

犊牛盲肠微生物总DNA的提取方法

采用反复冻融法、玻璃珠法和超声波+反复珠磨的方法提取犊牛盲肠的微生物总DNA,并对以上三种方法进行比较,从中确定最佳的方法,以实现普通实验条件下成功提取符合PCR扩增要求的DNA.经紫外分光光度分析表明,超声波+反复珠磨的方法所得的DNA的A<,260>/A<,280>的比值为1.81,0.8%琼脂糖凝胶电泳结果显示,所提DNA片段分子量大于20 kb,适于酶解和PCR扩增要求.以提取的DNA样品为模板,利用细菌通用引物,对其16S rDNA进行PCR扩增,获得了1.7 kb大小特异性很好的预期条带.这是研究犊牛盲肠微生物的关键一步.     

3种提取基因组DNA方法的比较分析

分别采用3种不同的方法提取基因组DNA，比较所提取的DNA的质量以及提取所需时间、费用，以期选择一种高效、简洁快速、价格合理的提取方法。结果发现这3种方法提取的质量都能达到相关分子生物学试验的要求，但在操作步骤、时间、价格等方面存在差异，具体比较结果可为分子生物学试验选择提取方法提供依据。     

微波加热快速提取芽孢杆菌与乳酸菌DNA

试验旨在研究快速、简单、高效提取芽孢杆菌与乳酸菌DNA的方法。在微波炉额定功率800 W下,对芽孢杆菌和乳酸菌进行微波处理40~150 s,离心获取上清,收获细菌DNA,将样本DNA PCR扩增后进行琼脂糖凝胶电泳验证,测定其纯度和产量后测序。结果显示,在微波炉功率800 W条件下加热40~150 s均可有效提取芽孢杆菌与乳酸菌DNA。所得DNA质量较好（D_{260 nm}/D_{280 nm}在1.8~2.1之间）。DNA浓度符合PCR检测要求,目的条带清晰,所得测序结果满足常规分子生物学研究。该微波提取方法具有简单、快速、高效的特点,且具有广泛的实用性,为乳酸菌与芽孢杆菌快速分子检测提供了简便手段。     

Rapid Extraction of Bacillus and Lactobacillus DNA by Microwave Heating

The assay was aimed to investigate a fast,simple and efficient method with microwave heating for extracting DNA of Bacillus and Lactobacillus.Treated in a microwave oven at rated power (800 W) for a certain time (40 to 150 s),then centrifuged for supernatant.The supernatant was transferred to a sterile tube for PCR testing and agarose gel electrophoresis.Sequencing was carried out after determining the purity and yield.The results showed that heating for 40 to 150 s at 800 W microwave power conditions could effectively extract DNA of Bacillus and Lactobacillus.The obtained DNA quality was good (D_{260 nm}/D_{280 nm} was 1.8 to 2.1).The DNA concentration in line with the PCR testing requirements;Sequencing results was satisfied with the routine molecular biological research.The microwave extraction method had simple,fast and efficient features,and a wide range of practical,which provided a simple means for rapid molecular assay.     

An efficient protocol for genomic DNA extraction from formalin-fixed paraffin-embedded tissues

Formalin-fixed paraffin-embedded tissues (FFPET) represent the largest source of archival biological material available for genomic studies. In this work we present an advanced protocol for extraction of high quality DNA from FFPET that can be applied in several molecular studies. Although cat mammary tumours (CMT) are the third most frequent tumour in cats the recovery of significant number of samples for molecular studies are in some way restricted to FFPET samples. We were able to obtain high quality DNA from FFPET of thirty six CMT that were subjected to pre-fixation and fixation processes routinely used in the veterinary hospitals. The quality of DNA obtained was tested by PCR amplification using six sets of primers that amplify single-copy fragments. The DNA fragments obtained were further sequenced. This protocol was able to provide FFPET gDNA that can be amplified and sequenced for larger fragments up to 1182bp.