军牧1号白猪肉质主效基因的多态性检测分析

猪的肉质属于数量性状,受多个主效基因和候选基因的控制。为检测军牧1号白猪肉质主效基因多态性,本试验采用RFLP技术检测了400头军牧1号白猪氟烷基因(RYR1)、心脏脂肪酸结合蛋白基因(H-FABP)和酸肉基因(RN)3个重要肉质基因的多态性。群体遗传结构分析表明,军牧1号白猪群体中RYR1基因的N基因频率为0.908 3,n基因频率为0.091 7;心脏脂肪酸结合蛋白基因的5′区的HinfⅠ位点的H基因频率为0.688 8,h基因频率为0.311 2;H-FABP基因内含子-2HaeⅢ位点D基因频率为0.478 8,d基因频率为0.521 2;H-FABP基因内含子-2MSPⅠ位点不存在多态性;RN基因也不存在多态性。     

军牧1号白猪FUT1基因M307位点多态性研究

肠毒素大肠杆菌F18是引起断奶仔猪腹泻和仔猪水肿病的主要病原菌,α-1岩藻糖转移酶基因FUT1是控制大肠杆菌F18侵染猪小肠的受体蛋白表达的候选基因。采用PCR—RFLP方法对军牧1号白猪FUTl基因M307核苷酸G／A突变位点的多态性进行分析。结果表明,军牧1号白猪FUT1基因M307位点存在3种基因型,分布趋势为AG〉AA〉GG,等位基因A的频率为0．6048,为优势等位基因。X^2适合性检验结果表明,军牧1号白猪FUT1基因在M307位点上呈Hardy—Weinberg平衡状态。研究结果揭示军牧1号白猪有抵抗肠毒素大肠杆菌F18的遗传基础,在军牧1号白猪群体中可以通过标记辅助的方法培育对大肠杆菌F18具有抗性的新品系。     

军牧1号白猪、杜洛克猪和藏猪的氟烷基因和酸肉基因多态性分布

为了研究军牧1号白猪、杜洛克猪和藏猪氟烷基因和酸肉基因的多态性分布情况,试验采用PCR-RFLP方法对61头军牧1号白猪、51头杜洛克猪和51头藏猪的氟烷基因和酸肉基因多态性进行了检测。结果表明:军牧1号白猪的氟烷基因表现为单一的NN型;杜洛克猪的氟烷基因表现为多态性,等位基因N的频率为0.196 1,基因型分布符合哈代-温伯格平衡(χ2=3.033 9,P=0.081 5);藏猪的氟烷基因表现为单一的nn型。3个猪种的酸肉基因均表现为单一的rn/rn型。     

军牧1号白猪、杜洛克猪和藏猪的H-FABP 和LPIN1基因多态性分布

为探索H-FABP和LPIN1基因在不同猪种中的多态性分布情况,应用PCR-RFLP技术检测了61头军牧1号白猪、51头杜洛克猪和51头藏猪H-FABP和LPIN1基因的多态性分布。结果发现,军牧1号白猪、杜洛克猪和藏猪在H-FABP基因的Hinf Ⅰ多态性位点上均表现为单一的HH型,而Hea Ⅲ多态性位点上均表现出多态性,等位基因D的基因频率分别为0.1475、0.2255和0.7647,Msp Ⅰ多态位点上,军牧1号白猪表现为单一的aa型,杜洛克猪和藏猪则表现为多态性,等位基因A的基因频率分别为0.6078和0.4609。在LPIN1基因的Eco88 Ⅰ多态性位点上,杜洛克猪表现为单一的AA型,军牧1号白猪和藏猪表现为多态性,等位基因A的基因频率分别为0.4262和0.2059;在Bsh1236 Ⅰ多态性位点上,杜洛克猪表现为单一的TT型,军牧1号白猪和藏猪则表现为多态性,等位基因T的基因频率分别为0.7459和0.2059。     

军牧1号白猪、杜洛克猪、西藏小型猪和大白猪ESR、FSHβ、EGF基因的多态性分布

摘要：ESR、FSHβ和EGF基因与猪繁殖性状密切相关。为检测军牧1号白猪、西藏小型猪、杜洛克猪和失白猪ESR、FSHβ和EGF基因的多态性分布情况,采用PCR和PCRRFLP的方法对61头军牧1号白猪,51头杜洛克猪,51头西藏小型猪和69头大白猪的ESR、FSHβ和EGF基因多态性进行了检测。结果显示,对于各个基因的优势等位基因,在军牧1号白猪群体中,ESR基因位点A等位基因频率为0．6393,FsHp基因的13等位基因频率高达0．9098,EGF基因的A等位基因频率仅有0．0164杜洛克猪群体中,ESR基因A等位基因频率为0．6078,FSHβ基因的B等位基因频率为0．8235,而EGF基因的八等位基因频率仅为0．0297;西藏小型猪群体中,ESR基因A等位基因频率是0．4608,FSHβ基因B等位基因频率仅为0．0687,H;F基因A等位基因频率为o．1961;大白猪群体中。ESR基因位点有频率为0．5000的有害A等位基因,而FSHβ基因和EGF基因的13等位基因频率则分别为0．8013和0．7391。所有基因型分布均符合哈代温伯格平衡（P〉0．05）。     

军牧1号白猪肉质主效基因的多态性检测

为检测军牧1号白猪的肉质主效基因多态性,应用RFLP技术分别检测了400头军牧1号白猪氟烷、酸肉以及心脏脂肪酸3个重要肉质基因的遗传变异情况。结果表明:在军牧1号白猪群中有氟烷基因存在,且3种基因型都有分布;在心脏脂肪酸基因的5′区的HfinⅠ和内含子2的HaeⅢ位点上,同样存在3种基因型的多态性;但内含子2的MSPⅠ位点和酸肉基因不存在多态性。     

6个猪种FUT1基因的多态性分析

α(1,2)岩藻糖转移酶基因1(α-1,2-Fucosyltransferase gene,FUT1)是可以调节大肠杆菌F18侵染猪小肠、并引起仔猪水肿和腹泻的一个抗性基因。采用PCR-SSCP方法,检测了FUT1基因在大白猪、长白猪、杜洛克、马身猪、山西黑猪、晋汾白猪6个猪种中的多态性。结果表明:在大白猪、长白猪和杜洛克这3个引进品种中,存在A、B、C 3种单倍型,A单倍型的平均分布频率为0.58;而在地方品种马身猪及其培育品种山西黑猪和晋汾白猪中只发现了单倍型A。经测序比对发现B单倍型第5位碱基发生了C→A的转换,第145个碱基处发生了T→C的突变;而单倍型C的第372位碱基A发生缺失。大白和杜洛克2个种群Hardy-Weinberg不平衡,FUT1基因在国外引进猪种大白、长白、杜洛克种群多态性丰富。     

军牧1号白猪、杜洛克猪、西藏小型猪和大白猪KIT毛色基因的基因型分析

毛色是猪的一个重要形态特征,KIT基因是控制猪毛色的主效基因。本研究利用PCR和PCR-SSCP方法,分析了军牧1号白猪、杜洛克猪、西藏小型猪和大白猪的KIT基因拷贝数和第17、18内含子突变位点的基因型,结果显示:军牧1号白猪和大白猪均为多拷贝,而西藏小型猪和杜洛克猪的KIT基因则为单拷贝;军牧1号白猪和大白猪的第17、18内含子突变位点上均检测到突变,而杜洛克猪和西藏小型猪均没有检测到突变。     

FUT1基因在上海地区5个猪群体内的多态性分析

仔猪腹泻和水肿病主要是由肠毒素型大肠杆菌的特定抗原F18的不同血清型引起的。α-1岩藻糖转移酶基因(FUT1)可作为F18介导的黏附呈敏感性或抗性遗传性状的一个候选基因。试验采用PCR-RFLP技术分析FUT1基因多态性,并检测其在5个猪群体:杜洛克猪(77头)、长白猪(47头)、大白猪(144头)、申农猪(72头)、梅山猪(69头)的基因型和基因频率。结果表明,FUT1基因在杜洛克猪、大白猪、申农猪群体内检测出AA、AG和GG3种基因型。在杜洛克群体内的基因型频率为AA(0.16)、AG(0.40)、GG(0.44);在大白猪群体内基因型频率为AA(0.03)、AG(0.40)、GG(0.57);在申农猪群体内基因型频率为AA(0.01)、AG(0.25)、GG(0.74);在长白猪群体内只检测出AG(0.21)和GG(0.79),没有AA抗病型;在梅山猪群体中检测的所有样品为GG型。     

猪GPX5,FUT1和PRLR基因的遗传多态性及遗传效应分析

为了分析谷胱甘肽过氧化物酶5基因(Glutathion Peroxidase 5,GPX5),岩藻糖转移酶1基因(α1-Fucosytransferase,FUT1)和催乳素受体基因(Prolactin receptor,PRLR)在野猪与大白猪杂交的F1代群体中的遗传多态性及遗传效应。采用PCR-RFLP方法检测了GPX5,FUT1和PRLR基因的多态性,分析其对初生重(LiB)和30日龄体重(Li30)的遗传效应。结果表明,除了PRLR基因外,其余2个基因的基因频率与大白猪已有研究结果基本一致;PRLR基因的AA型个体在Li30上比AB和BB型个体可显著增重1.42～1.47 kg(P0.05);GPX5和FUT1基因对这2个性状的效应均不显著。结果提示,野猪血统的引入没有显著改变现有猪群的遗传基础,PRLR基因可在生产中考虑应用。     

The possibility of positive selection for both F18(+)Escherichia coli and stress resistant pigs opens new perspectives for pig breeding

F18(+)Escherichia coli infections causing post-weaning diarrhoea and/or oedema disease are a major cause of economic losses in pig industry. To date, no preventive strategy can protect pigs from F18(+)E. coli infections. One of the most attractive approaches to eliminate F18(+)E. coli infections is the selection for pigs that are resistant to F18(+)E. coli infections. However, this strategy was not believed to be favourable because of reports of genetic association with the stress-susceptibility gene in the Swiss Landrace. To investigate this potential association more thoroughly, 131 randomly selected Belgian hybrid pigs were genotyped for both the F18(+)E. coli resistance alleles (FUT1(A)) and the stress-susceptibility alleles (RYR1(T)) and their association was investigated by determining the linkage disequilibrium. This linkage disequilibrium (LD=-0.0149) is close to zero and does not differ significantly from 0 (likelihood ratio test chi(1)(2)=1.123, P=0.29), demonstrating no association between the FUT1(A) and RYR1(T) alleles. Furthermore, only a small fraction (4.6%) of the Belgian pigs was found to be resistant to F18(+)E. coli infections. Our results suggest that selection for F18(+)E. coli resistant pigs might be an attractive approach to prevent pigs from F18(+)E. coli infections, unlike to what has previously been postulated.     

杜洛克FUT1基因多态性及其与产仔性能的关联分析

采用PCR-RFLP方法对杜洛克FUT1基因多态性进行分析。结果发现:杜洛克FUT1基因开放阅读框307位点经Hin6Ⅰ酶切后,检测到AA、AG和GG3种基因型,AA基因型的频率为0.157,A基因的频率为0.353。分析这3种基因型与杜洛克产仔性能间的关联性。结果表明:抗性纯合子AA基因型的个体1～5胎每个胎次的产仔数均值均高于AG和GG基因型,且第1胎和第4胎的产仔数均值显著高于AG和GG基因型(P<0.05),AA基因型对产仔性能而言是有益基因型。     

苏太猪抗F18+大肠杆菌病基础群FUT1基因多态性及其与生长发育的关联分析

本研究采用PCR-RFLP方法对苏太猪F18+大肠杆菌抗病育种基础群α-(1,2)岩藻糖转移酶基因1（FUT1）M307位点多态性进行了分析,并探讨了其与部分生长发育性能的相关性。苏太猪F18⁺大肠杆菌抗病育种基础群FUT1基因M307位点经Hin6Ⅰ酶切后,产生AA、AG和GG 3种基因型,频率分别为0.235、0.609和0.156,群体极显著的偏离了Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.01)。总体上AA基因型的个体生长发育优于AG和GG基因型的个体,其中AA基因型个体的60 kg体长显著高于AG和GG基因型的个体(P<0.05),断奶重显著高于GG基因型的个体(P<0.05),体高和后躯宽显著高于AG基因型的个体(P<0.05)。试验结果表明,苏太猪抗病育种基础群中FUT1基因第307位点的AA基因型不仅对仔猪断奶后水肿病和腹泻病具有抗性,而且具有较高的早期生长发育性能。     

东北民猪荷包猪抗性基因多态性及其与免疫指标的相关性研究

研究目的是检测荷包猪FUT 1和Mx1基因位点多态性及其与免疫指标的相关关系。采用PCR-RFLP技术分析基因多态性,采用ELISA方法检测免疫指标白介素-4(IL-4)、分泌型免疫球蛋白A(sIgA)、α-干扰素(IFN-α)的表达量。结果表明,荷包猪FUT 1基因和Mx1基因Hin6I点酶切位点上显示多态性,优势基因型分别为GG和AA型,在Mx1基因其他两位点处未发现多态性;荷包猪免疫指标IL-4、sIgA、IFN-α的表达量明显高于大白猪(P<0.05),但抗性基因型与免疫指标间的相关性表现不明显。     

苏太猪抗F18+大肠杆菌病基础群FUT1基因多态性及其与生长发育的关联分析

本研究采用PCR-RFLP方法对苏太猪F18+大肠杆菌抗病育种基础群α-(1,2)岩藻糖转移酶基因1（FUT1）M307位点多态性进行了分析,并探讨了其与部分生长发育性能的相关性。苏太猪F18⁺大肠杆菌抗病育种基础群FUT1基因M307位点经Hin6Ⅰ酶切后,产生AA、AG和GG 3种基因型,频率分别为0.235、0.609和0.156,群体极显著的偏离了Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.01)。总体上AA基因型的个体生长发育优于AG和GG基因型的个体,其中AA基因型个体的60 kg体长显著高于AG和GG基因型的个体(P<0.05),断奶重显著高于GG基因型的个体(P<0.05),体高和后躯宽显著高于AG基因型的个体(P<0.05)。试验结果表明,苏太猪抗病育种基础群中FUT1基因第307位点的AA基因型不仅对仔猪断奶后水肿病和腹泻病具有抗性,而且具有较高的早期生长发育性能。     

北京黑猪DKK3和CCR1基因多态性检测及其与背膘厚的关联分析

旨在探讨DKK3和CCR1基因多态性及其对北京黑猪背膘厚的影响，以期能够筛选出可用于提高北京黑猪背膘厚性状的分子标记，为北京黑猪优良性状定向选育提供依据。本研究以413头健康的北京黑猪为试验材料，对其进行DNA提取、PCR扩增、基因测序筛选候选基因的SNPs，同时利用SAS 9.2软件对突变位点的不同基因型分别与北京黑猪的六七肋背膘厚和腰荐部背膘厚进行关联分析。结果显示，在北京黑猪DKK3基因的外显子区共检测到10个SNPs，包含1个可变剪切突变、1个错义突变和8个3'UTR突变，其中有4个3'UTR突变位点均与腰荐部背膘厚显著关联(P<0.05)，分别为g.47443779 T>C、g.47444258 C>T、g.47444912 G>T和g.47445304 T>C，其余位点与六七肋背膘厚和腰荐部背膘厚均不显著关联(P>0.05)。在CCR1基因的外显子区共检测到3个SNPs，包含2个同义突变和1个错义突变，其中1个同义突变位点g.29229037 G>A与六七肋背膘厚显著关联(P<0.05)。对DKK3的10个SNPs进行连锁不平衡分析，结果显示，g.47443779 T>C和g.47443783 C>T处于完全连锁状态(D’=1)，g.47443783 C>T和g.47443858 C>T处于完全连锁状态(D’=1)，g.47444258 C>T和g.47444275 C>T呈现高度连锁状态(D’=0.98)。综上所述，DKK3和CCR1基因的SNPs分别与北京黑猪的腰荐部背膘厚和六七肋背膘厚有显著关联性，可为北京黑猪背膘厚的早期分子选育提供参考。     

苏太猪FUT1基因多态性及其与生产性能的关联分析

采用PCR-RFLP方法对苏太猪FUT1基因多态性进行分析。结果表明:苏太猪FUT1基因开放阅读框307位点经Hin6Ⅰ酶切后,产生GG型和AG型,不存在抗性纯合子AA型。分析这两种基因型与苏太猪生产性能间的相关性,结果表明:AG型个体平均生产性能均高于GG型个体,且AG型个体的1胎断奶窝重、2胎断奶窝重、3胎总产仔数和6胎断奶窝重显著(P<0.05)高于GG型个体,对一些生产性状而言,AG型是有益基因型。     

大肠杆菌刺激和LPS诱导条件下猪小肠上皮细胞FUT1和FUT2基因表达变化

本实验运用Real-time PCR方法检测分析α-(1,2)岩藻糖转移酶1(FUT1)和α-(1,2)岩藻糖转移酶2(FUT2)基因在大肠杆菌(E.coli)F18ab、F18ac感染以及内毒素(LPS)诱导小肠上皮细胞(IPEC-J2)前后的mRNA表达差异,在细胞水平上进一步验证FUT1、FUT2基因的功能并探讨其在抗E.coli F18侵染过程中的作用机制。结果表明:FUT1、FUT2基因在E.coli感染和LPS诱导细胞后的mRNA表达水平均极显著升高(P0.01),且FUT2基因的上升趋势要高于FUT1基因。由此推测,FUT1和FUT2基因的表达水平与仔猪抵抗E.coli F18感染的能力密切相关,FUT2基因可能发挥着比FUT1基因更重要的调控作用。     

RYRl基因对母猪繁殖性能的影响

用 PCR- RFL P法检测 2 2 5头大约克母猪的 RYR1(ryanodine receptor,RYR1)基因 ,它具有 NN、Nn和 nn3种基因型 ,其频率分别为 0 .76、0 .14和 0 .10 ;等位基因 N和 n的基因频率分别为 0 .83和 0 .17。该基因处于遗传不平衡状态 (P<0 .0 1)。具有 NN、Nn和 nn基因型母猪第 1胎产仔数分别为 10 .2 1、9.6 2和 8.2 2头 ;断奶仔猪数分别为9.2 1、8.13和 7.11头。等位基因 n使仔猪断奶应激效应具上升趋势 ,对增重有不利影响 ;降低母猪的产仔数和仔猪成活率 ,对繁殖性能有不良的遗传效应 ,有必要从母猪群中清除该等位基因。