莱芜猪与大白猪杂交一代甲基化程度差异分析

在真核生物中DNA甲基化是一种重要的表观遗传学修饰方法,其对基因的表达调控起到非常重要的作用.本研究以高肌间脂肪含量猪地方品种菜芜猪与大白猪的正反杂交后代为研究对象,利用F-MSAP技术,应用筛选的16对引物扩增,检测其肌肉组织的全甲基化程度,揭示不同品种肌肉组织间基因组全甲基化水平差异.结果表明以莱芜猪为父本,大白猪为母本的正交一代找到2 031个甲基化位点,以大白猪为母本,莱芜猪为父本的反交一代检测到1 905个甲基化位点,总甲基化水平分别为57.20％、53.5％.并且反交一代半甲基化水平显著高于正交一代(P＜0.05),正交一代全甲基化水平极显著高于反交一代(P＜0.01).     

马身猪和大白猪不同组织DECR1基因的表达

旨在研究DECR1基因在猪不同组织和品种中mRNA和蛋白水平的表达规律,探讨该基因与脂肪代谢的关系。以山西马身猪与大白猪为试验材料,提取肝脏、心脏、肾脏、脾脏、肺脏、胃、小肠、皮下脂肪和背最长肌组织的总RNA和总蛋白,应用实时荧光定量PCR技术检测DECR1基因在2个品种各组织中mRNA的相对表达量,采用Western blot技术对各组织中DECR1蛋白进行半定量分析。实时荧光定量PCR结果显示:DECR1基因在各组织中均有表达,组织之间的表达量存在极显著差异(P<0.01),DECR1基因在肝脏、皮下脂肪与心脏中为高丰度表达;在不同品种的皮下脂肪组织中,大白猪DECR1的mRNA表达极显著高于马身猪(P<0.01)。Western blot检测结果显示:DECR1在各组织中均有表达,不同组织的表达量存在极显著差异(P<0.01),在皮下脂肪、肝脏与小肠中高表达;不同品种的皮下脂肪组织中,大白猪DECR1蛋白的表达显著高于马身猪(P<0.05)。猪DECR1基因在不同组织的表达差异可能与脂肪代谢和脂肪沉积有关。     

CAPN3基因在草原红牛不同组织中的表达差异

钙激活中性蛋白酶(CAPN3)参与哺乳动物体内多种重要的生理生化过程,但是有关它的确切生理功能和作用机制研究较少.本研究采用实时荧光定量PCR技术检测CAPN3基因在草原红牛多种组织中的表达水平差异情况.试验结果表明,CAPN3基因在所检测草原红牛的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、十二指肠、瘤胃和背最长肌8种组织中均有表达,且在不同组织中的表达水平有所不同.草原红牛脾脏中的CAPN3基因表达量显著高于其他组织,十二指肠和瘤胃中的CAPN3基因表达量显著高于心脏、肝脏、肺脏、肾脏和背最长肌.本试验为肉牛肉质性状的改良提供了分子遗传学依据,并为深入研究草原红牛体内CAPN3基因的生物学作用及作用机制奠定了基础.     

脂肪酸合成酶基因mRNA在马身猪和大白猪3种组织中的发育性表达研究

为探究脂肪酸合成酶(fatty acid synthase,FAS)基因在猪不同组织中的发育性表达规律,本研究采用实时荧光定量PCR技术检测马身猪和大白猪7个阶段(初生、30、60、90、120、150和180日龄)肝脏、背最长肌和背部皮下脂肪3种组织中FAS基因mRNA的相对表达量。结果表明,品种间比较,FAS基因mRNA在马身猪和大白猪肝脏、背最长肌和背部皮下脂肪组织各生长发育阶段中的表达差异均达到显著或极显著(除肝脏组织初生阶段和背部皮下脂肪组织120日龄阶段)(P<0.05;P<0.01)。FAS基因mRNA在大白猪组织间的表达差异与生长发育相关,150和180日龄阶段,背部皮下脂肪组织中表达量极显著高于肝脏和背最长肌组织(P<0.01),初生、30日龄和90日龄阶段,背最长肌中的表达量极显著高于肝脏和背部皮下脂肪组织(初生阶段无脂肪组织样)(P<0.01);而马身猪整个发育过程中,背最长肌组织表现为优势组织,极显著高于其他2种组织(除120日龄阶段外)(P<0.01),脂肪组织表达量次之,肝脏组织中表达量较少。品种、日龄、组织及品种与日龄、组织与日龄的互作效应对FAS基因mRNA的相对表达量均有极显著影响(P<0.01)。FAS基因直接参与脂肪酸的合成,对猪肉质性状的遗传改良具有重要意义。     

ESR和RYR1基因的多态性在监利猪、大白猪及杂交大监猪群中分布特征的探讨

采用PCR-RFLP技术测定了ESR基因和RYR1基因在监利猪、大监猪和大白猪3个猪群中的多态性分布,并将基因型频率和基因频率进行了对比分析。结果表明：ESR基因在监利、大白和大监猪中都具有多态性,同前人的研究相似,国内地方品种监利和大监猪都具有较高的B等位基因频率,分别为0．571和0757。RYR1基因在大白猪中存在多态,而在监利猪、大监猪中只含有等位基因N。监利猪、大监猪携带较高频率有利于产仔数提高的基因型B,及抗应激等位基因N。     

THBS3基因在长白猪和通城猪不同组织和不同时期骨骼肌中的表达分析

本研究主要探究血小板反应蛋白3 (thrombospondin-3,THBS3)基因在不同组织及不同时期骨骼肌生长发育过程中的表达规律。利用实时荧光定量PCR方法对THBS3基因在长白猪和通城猪中的组织表达谱,以及在胚胎期(33、45、65、70和90 d)和出生后阶段(0、9、30、60、120和160 d)骨骼肌中的差异表达进行了比较分析。结果表明,THBS3基因广泛表达于长白猪和通城猪各个组织器官,除胃和肠中的表达存在差异外,其在两个猪种中的组织表达谱基本一致,在肺脏中表达量最高。THBS3基因在长白猪和通城猪胚胎期骨骼肌中的表达水平均显著高于出生后阶段(P<0.05),但胚胎期骨骼肌中的表达模式在两个猪种间存在一定差异,THBS3基因表达峰值出现在长白猪胚胎期45 d,而其在通城猪中表达峰值出现在胚胎期65 d。结果提示,THBS3基因参与了猪骨骼肌生长发育过程及不同类型猪种骨骼肌生长发育异步性的调控。     

不同日龄大白猪视黄酸β基因的表达研究

研究采用RT-PCR方法对大白猪的RARβ基因在1日龄、90日龄、180日龄、270日龄和360日龄的心脏、肝脏、胃、脾脏、肾脏、肺脏、大肠、小肠、肌肉、子宫、卵巢共11个组织中的表达情况进行了研究.结果表明:RARβ mRNA在大白猪的心脏、肾脏、大肠、子宫和卵巢中持续表达,其中大肠、子宫和卵巢持续高表达;在1日龄和360日龄所检的11个组织中均表达该基因,且表达量较高.     

杜洛克猪和大白猪作终端父本的杂交效果比较研究

为比较杜洛克和大白猪作终端父本的杂交效果，进行了杜×长大、大×长大、长×大的比较试验，测定了不同组合的生长速度、饲料转化率、胴体品质和肉质。采用综合评定指数评定结果表明，大×长大组的主要经济性状优于杜×长大组。根据本次试验和国内外大量试验结果，作者论述了利用大白猪，特别近几年从英国引进的大白猪作终端父本生产商品瘦肉猪，逐步替代传统的杜×长大组合的可能性     

CAPN3基因在草原红牛不同组织中的表达差异

钙激活中性蛋白酶（CAPN3）参与哺乳动物体内多种重要的生理生化过程,但是有关它的确切生理功能和作用机制研究较少。本研究采用实时荧光定量PCR技术检测CAPN3基因在草原红牛多种组织中的表达水平差异情况。试验结果表明,CAPN3基因在所检测草原红牛的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、十二指肠、瘤胃和背最长肌8种组织中均有表达,且在不同组织中的表达水平有所不同。草原红牛脾脏中的CAPN3基因表达量显著高于其他组织,十二指肠和瘤胃中的CAPN3基因表达量显著高于心脏、肝脏、肺脏、肾脏和背最长肌。本试验为肉牛肉质性状的改良提供了分子遗传学依据,并为深入研究草原红牛体内CAPN3基因的生物学作用及作用机制奠定了基础。     

鸡NFATc3基因在不同表型肌肉中表达差异的研究

为探讨NFATc3在生长速度差异较大的2个品种鸡生长发育早期不同表型肌肉中的表达规律,利用实时荧光定量PCR技术检测清远麻鸡(慢生型)和隐性白羽鸡(速生型)三种表型肌肉(腓肠肌外侧头、比目鱼肌和趾长伸肌)NFATc3 mRNA在0、1、3、5、7、9周龄时的表达情况。结果发现:2个鸡品种中三种表型肌肉均呈现先下降后上升再下降的趋势,除隐性白羽鸡的腓肠肌外侧头、比目鱼肌外,2个鸡品种中其他表型肌肉的表达量均在2周龄最低;趾长伸肌和比目鱼肌NFATc3 mRNA的表达峰值在清远麻鸡中出现在3周龄,而在隐性白羽鸡中三种表型肌肉的表达峰值均出现在0周龄;总体而言,NFATc3 mRNA在比目鱼肌中的表达量要低于其在趾长伸肌和腓肠肌外侧头中的表达量;品种间比较发现,NFATc3 mRNA在清远麻鸡三种表型肌肉的表达量在3周龄时高于隐性白羽鸡。研究结果提示,鸡肌肉NFATc3表达发育模式具有品种、年龄和表型特异性,并可能与鸡肉品质存在关联。     

双肌臀大约克种猪的应激敏感基因净化研究

应用PCR RFLPs技术对双肌臀大约克 (Ⅰ系 )、普通大约克 (Ⅱ系 )和Ⅰ系与Ⅱ系系间繁殖后代 (Ⅲ系 ) 3个选育群体的全部种猪普检应激敏感基因 (RYR1基因 )。Ⅰ系和Ⅲ系全部为阴性纯合体 ,Ⅱ系检出阳性纯合体和杂合体分别为 1头和 1 5头 ,阳性率为 1 4 2 %。对Ⅱ系的阳性个体和相同数量的阴性个体进行复检 ,其检测结果复重率达 1 0 0 %。经过系统选育 ,培育成了无RYR1基因的双肌臀大约克种猪Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ系 1 1 7、 97和 49头的育种核心群。     

大白猪TLR4基因外显子1遗传变异及其与细胞因子水平的关系

本实验运用PCR-SSCP技术对大白猪TLR4基因外显子1遗传变异进行分析,同时利用ELISA方法对外周血重要细胞因子(IL-2、IL-4、IL-6、IFN-Beta、IL-10、IL-12)的水平进行测定,旨在分析大白猪TLR4基因外显子1多态性及其与重要细胞因子水平间的关系,探讨将其作为抗F18大肠杆菌病遗传标记的可行性。结果表明:大白猪TLR4基因外显子1存在G93C同义突变位点,共检测到3种基因型,分别定义为BB、BC和CC;关联分析结果表明,大白猪TLR4外显子1变异位点对机体重要细胞因子水平没有显著影响(P>0.05),表明基于该位点的分子选育不会对机体免疫应答和一般抗病力产生不利影响。结果提示,有必要将TLR4基因外显子1的变异位点作为抗大肠杆菌病的重要遗传标记进行深入研究。     

莱芜猪ACSL4和H-FABP基因的多态性及育种应用

选取了106头莱芜猪核心群及部分后备猪,用PCR-RFLP的方法分别检测了酰基辅酶A合成酶长链4（Acly-CoA synthetase long chain family 4,ACSL4）基因的SNP G2645A位点和心脏型脂肪酸结合蛋白（Heart fatty acid-binding protein,H-FABP）基因的HinfⅠ及MspⅠ位点的多态性。结果显示,在ACSL4的SNP G2645A位点共检测到AG和GG 2种基因型,没有检测到AA基因型;G等位基因是优势等位基因;莱芜猪该位点呈高度多态。在H-FABP的HinfⅠ位点共检测到HH、Hh和hh 3种基因型,莱芜猪在该位点呈中度多态。莱芜猪在上述2个位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。经测序验证,莱芜猪H-FABP基因HinfⅠ位点的多态性是1 324位点T的插入、缺失所造成的。莱芜猪在H-FABP的MspⅠ位点没有多态性。在莱芜猪本品种选育中,可以顺序选择ACSL4G2645A位点GG基因型纯合个体和H-FABP HinfⅠ位点HH基因型纯合个体,提高莱芜猪IMF性状的均一性,将进一步促进莱芜猪种质的保护和利用。     

大白猪胎盘效率遗传规律的初步研究

本文分析了 77头纯种大白母猪的 469头初生仔猪的胎盘效率、胎盘面积、胎盘长度、胎盘重及初生重等性状资料 ,估计了各性状间的简单相关系数 ,应用非求导约束最大似然法 (MTDFREML)估计大白猪胎盘效率、胎盘面积、胎盘长度、胎盘重及初生重的遗传力 ,估计结果分别为0 46 ,0 2 5 ,0 1 1 ,0 1 4和 0 2 9     

长白山野猪与莱芜猪杂交一代猪的肉品品质

为了利用野猪和地方品种猪的优良种质资源,生产安全优质绿色猪肉,以长白山野猪与山东省优良地方品种莱芜猪的杂交1代猪（简称野莱F1代猪）和长×大白猪（各18头,公母各半）为研究对象,利用不含任何添加剂的绿色玉米、豆粕、麦麸组成的日粮,在舍饲＋放牧的条件下饲养至90kg左右时屠宰,对试验猪的肌肉组织学性状、氨基酸、肌苷酸、矿物质和微量元素含量及氨基酸评分进行了比较全面的测定分析。结果表明：野菜F1代猪的肌纤维比长×大白猪细,肌小节比长×大白猪长（P〈0.01）;除脯氨酸外,F1代猪的其他17种氨基酸含量、氨基酸总量、必需＋半必需氨基酸含量,鲜味氨基酸和肌苷酸含量及氨基酸评分,均显著或极显著高于长×大白猪（P〈0.05或P〈0.01）;F1代猪肉的矿物质和微量元素含量较丰富,除K显著低于长×大白猪外,Ca、P、Fe、Zn、Mg和Cu的含量都显著或极显著高于长×大白猪（P〈0.05或P〈0.01）。结果提示：野莱F1代猪肉的肉品品质和营养价值比长×大白猪好,可以作为生产安全优质绿色猪肉的原料猪用。     

山羊HABP4基因的克隆、序列分析及功能预测

旨在克隆简州山羊HABP4基因,鉴定与HABP4互作蛋白的mRNA表达水平并分析其相关性,为进一步探讨HABP4基因在调控山羊细胞凋亡中的作用奠定基础。于四川省简阳大哥大牧业有限公司随机选取10月龄左右,体重为55 kg左右的健康简州大耳羊公羊（16只）,清晨空腹屠宰后迅速采集各山羊心、肝、脾、肺、肾、小肠、大肠、瘤胃和胰腺9个组织样本,TRIzol法提取组织总RNA,并反转录cDNA。RT-PCR技术克隆山羊HABP4基因cDNA序列,利用在线软件进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR （RT-qPCR）技术检测HABP4基因在不同组织中的表达量（n=16）以及分析在胰腺（n=16）组织中与该HABP4蛋白可能存在相互作用的10个蛋白的mRNA表达特性及其相关性。结果,成功扩增山羊HABP4基因1 496 bp,包含5'UTR 61 bp,CDS区1 254 bp,3'UTR 181 bp,编码417个氨基酸残基。HABP4 mRNA在山羊各组织中均有表达,在胰腺中表达水平最高,且与UAB52呈极显著正相关,和RPL32、RPS9呈显著正相关,推测其在细胞定位、新陈代谢、多生物过程及生物过程负调节以及翻译起始、核糖体转录、细胞质代谢等方面发挥着重要作用。本研究成功克隆山羊HABP4基因cDNA全长1 496 bp,其可能与UAB52、RPL32和RPS9呈显著正相关。这些结果也为进一步探讨HABP4在调控细胞凋亡过程中的作用提供了参考数据。     

不同类群大白猪窝产仔数的遗传分析

对双肌臀大白猪和普通大白猪组成的 561窝产仔数的资料进行了遗传分析。结果表明 :公猪和胎次均对母猪产仔数 (总产仔数和活产仔数 )具有极显著影响 (P <0 .0 0 1 ) ,季节和类群均对母猪产仔数 (总产仔数和活产仔数 )具有显著影响 (P <0 .0 5)。大白猪产仔数的平均值随胎次增长而增加。夏季分娩的大白猪具有最高的产仔数 ,依次为春季和冬季 ,秋季最低。大白猪总产仔数和活产仔数的遗传力分别为0 .0 9和 0 .1 0 ,属低遗传力 ,直接选择窝产仔数几乎没有效果 ;它们之间的遗传相关为 0 .80 ,表型相关为0 .85,环境相关为 0 .90 ,它们之间的协遗传力为 0 .0 8。这些参数表明总产仔数和活产仔数是两个不同的性状 ,在生产实践中单独记录它们是有理由的、必要的。     

大白猪MC4R、CDC16基因多态性及其与生长性状的关联分析

本研究旨在利用高分辨率熔解曲线(high resolution melt,HRM)分型方法检测大白猪黑素皮质素受体(melanocortin-4 receptor,MC4R)和细胞分裂周期蛋白16(cell division cycle 16,CDC16)基因的多态性,并对其与大白猪的生长性状进行关联性分析。试验共采集246头大白猪的耳组织样提取基因组DNA,对小群体样本进行PCR扩增后,通过测序方法寻找两个基因在该群体中的多态性位点,针对已发现的多态性位点设计HRM专用引物,利用HRM方法对大群体进行多态性检测,将所得结果与大白猪生长性状进行关联性分析。结果表明,在MC4R基因序列中检测到1个突变位点2207A>G,2个等位基因:A和G,3个基因型:AA、AG和GG;在CDC16基因第18外显子上检测到了1个突变位点837T>C,2个等位基因:T和C,2种基因型:TT和CT。χ~2适合性检验结果显示,2个基因的基因型频率和等位基因频率在2个种群中分布差异不显著,符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。多态信息含量(PIC)分析显示,MC4R基因在2个群体中均处于中度多态(0.25相似文献   

Genetic analysis for sow stayability at different parities in purebred Landrace and Large White pigs

Genetic parameters for sow stayability were estimated from farrowing records of 10,295 Landrace sows and 8192 Large White sows. The record for sow stayability from parity k to parity k + 1 (k = 1, …, 6) was 0 when a sow had a farrowing record at parity k but not at parity k + 1, and 1 when a sow had both records. Heritability was estimated by using single-trait linear and threshold animal models. Genetic correlations among parities were estimated by using two-trait linear–linear and single-trait random regression linear animal models. Genetic correlations with litter traits at birth were estimated by using a two-trait linear–linear animal model. Heritability estimates by linear model analysis were low (0.065–0.119 in Landrace & 0.061–0.157 in Large White); those by threshold model analysis were higher (0.136–0.200 & 0.110–0.283). Genetic correlations among parities differed between breeds and models. Genetic correlation between sow stayability and number born alive was positive in many cases, implying that selection for number born alive does not reduce sow stayability. The results seem to be affected by decisions on culling made by farmers.     

Cloning,Expression and Functional Analysis of Osteopontin Gene in Large White Pig

<正>The full-length cDNA of 909 bp of the osteopontin gene(OPN) was isolated from of Large White Pig and analyzed with bioinformatics methods.The results showed high proportions of Asp,Glu and Ser and verified presence of the special sequence Arg-Gly-Asp(RGD) in the primary structure of OPN.There were high proportions of alpha helices and strong hydrophilicity in the secondary structure. The signature sequence of OPN([KQ]-x-[TA]-x(2)-[GA]-S-S-E-E-K) was located in the first region of high homology.Two phylogenetic trees were constructed,based on the entire OPN protein sequence and the conserved signature sequence,and showed that the relationship between pig and cow was the closest, but farthest between pig and chicken.OPN mRNA was expressed in many tissues of the pig:higher in the stomach,kidney,lung,small intestine and ovary,and lower in the heart,spleen and large intestine.The OPN protein size differed in different tissues:70 kDa in liver and muscle,70 and 45 kDa in stomach,small intestines and kidney,70,45 and 24 kDa in lung,heart and uterus.