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大麻RAPD分子标记的引物筛选 总被引:9,自引:1,他引:9
利用RAPD分析技术对野生型大麻Ym43及栽培品种大麻Ym36的基因组DNA进行分析,优化了大麻总DNA的提取方法和PCR扩增条件,从Operon公司的OP系列280个随机引物中筛选出42个扩增效果良好的引物,为以后RAPD技术应用于大麻的遗传研究奠定了基础。 相似文献
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为了建立显性多子房小麦RAPD反应的最佳体系,保证反应结果的稳定性和可靠性,降低反应成本,在相同PCR扩增程序(94℃预变性5min,94℃变性1min,36℃退火1min,72℃延伸2min,45个循环,72℃延伸10min,4℃保存)下,对多子房小麦基因组DNA的RAPD扩增体系各参数进行比较筛选,创建其最佳反应体系为:25μl反应体系中,模板DNA50ng,10×PCR缓冲液2.5μl,dNTPs0.2mmol/L,Taq酶1u,Mg2+浓度为2.0mmol/L,ddH2O12.17μl,随机引物10ng。 相似文献
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本实验采用国家鉴定茶树品种丹桂自然杂交F1代12个新品(株)系DNA为模板,对60对茶树SSR分子标记引物进行筛选,其中12对引物PCR产物电泳结果较为理想,条带清晰、多态性丰富。其他48对引物没有多态性,或者条带模糊无法统计,或者扩增不出任何条带。从已筛选出的多态性引物中随机挑选2对引物D02、D08,对丹桂自然杂交FI代59个新品(株)系做PCR扩增,电泳检测能获得条带清晰、多态性丰富的胶图,说明筛选获得的12对多态性SSR引物可用于遗传多样性或亲缘关系等分子生物学实验。 相似文献
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为了筛选出适合甜菜分子标记的InDel引物以及利用InDel引物构建能够扩增多重InDelPCR反应的引物,以提高甜菜InDel-PCR扩增的效率,利用8个甜菜品种的DNA对300对甜菜InDel引物进行筛选,结果筛选出多态性较好、条带清晰、易于识别的甜菜InDel引物44对,这44对引物共扩增出总条带116条,其中多态性条带109条,多态性比率为94%;其中有37对引物扩增的总条带为2或3条,可以作为将来多重InDel引物的首选;又从中筛选出7对多重InDel引物:ND228、ND31、ND267、ND229、ND66、ND231、ND22。 相似文献
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甘薯RAPD标记的遗传连锁 总被引:3,自引:0,他引:3
人们对甘薯遗传分离和连锁知识的了解十分有限。一方面是由于甘薯自交不亲和性和杂交高度不亲和性(Martin1965,1970)。不亲和性和杂交结实率低的双重障碍,导致难以获得遗传研究所需的杂交种子。自交不亲和性还引起异交,从而增加了遗传杂合性。此外对大... 相似文献
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苎麻不同基因型亲缘关系的RAPD分析 总被引:3,自引:0,他引:3
对苎麻栽培种6个抗旱性较强的基因型及6个抗旱性较弱的基因型,选用25个随机引物,对总DNA进行了随机扩增。有12个引物扩增得到了稳定的RAPD图谱;扩增出的片段的分子量在0.6Kb-5.15Kb之间;随机引物扩增出的条带数在3-15条之间,共扩增出90个条带;采用系统聚类法中的中间距离法,对12个基因型两两相似系数聚类分析生成树状图谱,将12个基因型聚成两类三组,直观地揭示了苎麻基因型间亲缘关系。 相似文献
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海南主栽芒果品种基因组DNA的RAPD分析 总被引:18,自引:5,他引:18
采用6个随机引物对海南岛主栽的10个芒果品种进行RAPD研究,共扩增出325个DNA片段,其中清晰可辨,重复的有201条,占61%;检测出不同品种的RAPD标记,计算了各品种间的相似系数;初步确立了RAPD技术进行芒果DNA指纹图谱构建的研究体系。 相似文献
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盐对柚幼苗的胁迫效应分析 总被引:4,自引:0,他引:4
以坪山柚为材料,研究了盐对坪山柚幼苗的胁迫效应。结果表明:40mmol/LNaCl胁迫30d,坪山柚幼苗受害症状轻,幼苗生长受影响小;80~200mmol/LNaCl胁迫30d,随NaCl浓度提高,坪山柚幼苗受害症状逐渐加重,幼苗株高、叶面积、地上部干重和根部干重明显降低。不同浓度NaCl胁迫20d,坪山柚幼苗根及地上部Na+,Cl-,甜菜碱质量分数增加,K+质量分数及K+/Na+质量比下降。NaCl胁迫影响坪山柚幼苗生长与Na+和Cl-大量积累有关。NaCl胁迫下,维持相对稳定的根与冠干重比、保持根K+与Na+质量比>1及根部具有较高的甜菜碱含量,是坪山柚幼苗耐盐胁迫的一种适应。 相似文献
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利用9条10碱基的随机引物,在分子水平上对来自海南、云南、广东的16株橡胶树炭疽病菌菌株的遗传变异程度进行RAPD指纹分析。结果表明,16株菌株被聚为3个RAPD指纹组;RAPD指纹组与菌株的地理来源有明显的相关性;而将病原菌接种于橡胶树品系PR107,所得到的病情指数与其RAPD指纹聚类组间没有明显的相关性。 相似文献
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65份枇杷种质资源的RAPD分析 总被引:12,自引:0,他引:12
利用RAPD技术对65份有代表性的枇杷种质资源进行了遗传亲缘关系及分类研究。从所筛选的Sangon引物中选取16个10个碱基的随机引物对65份枇杷种质资源的基因组DNA进行扩增,共产生210条谱带,其中多态性谱带为210条(100%),表明65份种质资源具有丰富的多态性。各种质间的遗传距离为0.046~1.000,并根据遗传距离,利用UPGMA构建了亲缘关系树状图。在当D=0.847时,65份种质资源可分为两大组第1组为非栽培品种,包括7号(栎叶枇杷)、1号(贵州野生)、5号(台湾枇杷)和8号(海南野生),第2组为栽培品种,这与传统分类法是一致的;但在栽培组中,各分组的聚类结果,与传统的中国枇杷品种常用的分类方法有所不同。 相似文献
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应用RAPD分子标记分析“晚绿”品种的杂交亲本 总被引:33,自引:6,他引:33
应用随机扩增多态性DNA (RAPD)技术对茶树无性系品种“晚绿”进行亲子关系分析。所用 10 8条随机引物中的 93条引物对日本静冈和枕畸两地取样的 6个无性系茶树品种的 8份材料的基因组DNA分别扩增出 1- 8条谱带 ,平均每条引物 3 5条。其中 19条引物扩增出“晚绿”与其母本“数北”不同的RAPD分子标记 30个。从中选择 6条引物对 8份供试材料的基因组DNA鉴定表明 ,其中 4个RAPD分子标记显示出“晚绿”品种特异性 ,说明包括“静在 16”在内的 4个供试品种都不是“晚绿”的真正父本。本文还证明 ,不同生态条件下生长的同一无性系茶树品种的基因组DNA具有遗传保守性 相似文献
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影响小麦RAPD稳定性的试验技术研究 总被引:8,自引:1,他引:8
随着PCR和PAPD技术在生物学业领域的广泛应用,人们在实验中遇到的问题也越来越多,其中PAPD的可重复性差是最主要的一个问题,也是该技术最难克服的特点。作者在利用RAPD技术标记进行小麦的抗病毒基因研究中,对影响扩增结果的模板、底物、引物和扩增程序等进行了实验探索,结果表明:模板的浓度、dNRP浓度、引物浓度及反应程序均对RAPD扩增结果有明显影响。 相似文献
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叶用甜菜随机扩增多态DNA(RAPD)分析 总被引:8,自引:0,他引:8
利用RAPD技术,对30(1份糖甜菜,对照)份Beta属叶用甜菜种质资源材料的总DNA进行RAPD分析,并利用UPGMA法绘制聚类分析图谱。结果表明:1)29份叶用甜菜样品和1份糖甜菜样品护增多态性高,12个引物共扩增出110条带,公共带9条,多态性频率高达91.81%,平均每个引物扩弱9.17条带,特有带6条;2)30个材料间遗传距离变异范围为0.1500~0.6712,亲缘关系最近的是BC004和BC005(0.1500),最远的是BC027和甜研7号(0.6712);3)来源于希腊、土耳其的叶用甜菜与中国叶用甜菜种质间存在一定的种内遗传变异,一部分与中国叶用甜菜亲缘关系更近一些。本研究首次建立了以叶用甜菜聚类在一起,尤其是与中国叶用甜菜亲缘关系更近一些。本研究首次建立了以叶用甜菜嫩花蕾为试材,采用略有改进 相似文献
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苎麻属植物RAPD反应体系影响因子的研究 总被引:12,自引:0,他引:12
以苎麻属植物中的4个种为材料,用SDS和CTAB2种方法提取基因组DNA并比较其RAPD分析的效果;对RAPD反应体系中的一些重要参数进行了优化,建立了适合苎麻属植物RAPD分析的反应体系。即在25μL的反应总体积中Mg^2 浓度为1.5mmol/L,dNTPs浓度为0.20mmol/L,40ng模板DNA,Taq酶1.0单位;反应程序为95℃预变性5min;前5个循环为94℃变性1min,36℃结合1min,72℃延伸2min;后40个循环为94℃30s,℃36℃1min,72℃2min(最后1个循环为10min);共45个循环。该反应体系具有良好的稳定性和重复性。 相似文献