3个鸡群体中4个微卫星DNA多态性及其与杂种优势的关系

利用4个微卫星标记（ADL101、MCW020、ADL183、ADL298）对玫瑰冠鸡、新罗曼鸡和安卡红鸡的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数、杂合度和遗传距离进行了遗传检测,并测定了玫瑰冠鸡与安卡红鸡及新罗曼鸡的杂交效果。结果表明,4个微卫星标记在玫瑰冠鸡、安卡红鸡和新罗曼鸡3个群体中存在多态性,可以用于鸡遗传多样性的评估;从不同的群体来看,安卡红肉鸡遗传变异程度最大,而玫瑰冠鸡的遗传变异程度相对较小;玫瑰冠鸡与安卡红鸡的遗传距离大于其与新罗曼鸡的遗传距离,玫瑰冠鸡与安卡红鸡的杂种优势高于与新罗曼鸡的杂种优势,与实际杂种优势测定结果相符。     

3个纯系商品肉鸡MHC微卫星标记的遗传多样性研究

分析了3个纯系商品肉鸡MHC和非-MHC位点的遗传多态性。用Southern杂交技术检测MHC-Ⅰ型和Ⅳ型位点，并判定RFLP的基因型。在这些肉鸡品系中，检测到4种MHC一Ⅱ型和8种Ⅳ型基因型，它们的基因频率不同。检测了各个品系的特异性MHC基因型。杂合度(59％～67％)显示这些品系的MHC位点具有高度的多态性，MHC位点至少9％的遗传变异是由品系差异引起的。为了检测非-MHC基因，对这3个品系肉鸡非MHC基因组上41微卫生位点进行研究，结果发现它们的微卫星位点存在遗传变异；每个位点等位基因数范围为1～8个。每个品系的平均等位基因数分别为3．5、2．8、3．1。座位的杂合度范围为0％～89％。通过对固定指数(Fst)的分析，发现该基因微卫星座位的遗传差异19％是品系间差异造成的。对MHC和非-MHC座位进行Hardr-Weinberg平衡定律检验，结果2个位点处于连锁不平衡。这可能是由遗传选择或非等位基因存在造成的。本研究主要阐明了商品代肉鸡的群体分子遗传特性和遗传结构。MHC和非-MHC位点的研究结果表明：肉种品系仍具有丰富的遗传多样性，可为继续提高肉鸡的生产性能提供有用的基因资源。     

皖江麻鸡三个选育品系微卫星遗传多样性分析

皖江麻鸡是我国新近培育出的优质肉鸡品种,早期生长快,饲料报酬高,抗逆性强,肉质好.本研究利用10个微卫星标记分析了3个母本品系的多态性,并利用遗传距离预测了杂种优势,为进一步更新配套系提供参考.     

基于全基因组关联分析揭示肉鸡腿病发生的遗传机制

旨在揭示肉鸡腿病发生的遗传机制以降低肉鸡腿病发生率。采用我国自主培育的“广明2号”多品系、多世代共2 331只白羽肉鸡公鸡作为试验素材,于42日龄通过X光鉴定腿部健康状况,利用“京芯一号”55K SNP芯片对全部个体进行基因分型,使用plink运用二分类性状的逻辑回归模型(logistic regression model, LR Model)对腿部健康表型进行全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)。将不同群体芯片数据合并进行质控后,保留2 330个个体(2 256只健康,74只患病)和30 414个SNPs位点用于后续分析。通过GWAS分析筛选到5个潜在SNPs位点,分布在6号和18号染色体上,分别注释到与腿病相关的3个功能候选基因TBCD、SIRT1和PBLD上。本研究为白羽肉鸡腿部健康表型提供了重要的遗传位点和候选基因,为推进肉鸡抗病育种进程提供遗传基础。     

3个蒙古犬品系8个微卫星基因座的遗传结构分析

为了在分子水平上分析蒙古犬群体结构,试验以蒙古犬3种毛色类型群体为试验动物,对其基因组中的微卫星结构进行分析,研究其群体的微卫星多态性。结果表明:8个微卫星位点在3个蒙古犬品系中均呈现高度多态,由相关公式计算的平均杂合度、群体多态信息含量分别为0.5614～0.6770和0.5030～0.6171;3个品系间的基因遗传分化系数为0.2183,群体分化程度较大;迁移率在0.4532～1.4178之间变动,平均值为1.0234。说明3个蒙古犬品系8个微卫星基因座的遗传结构存在一定程度的相似性,分析其品系间相似的遗传结构可能与品种的形成史有关。     

褐壳蛋鸡17个品系种鸡血型测试报告

对北京市畜牧局属下3个种鸡场17个品系褐壳蛋鸡的血型测试结果表明:这些鸡种的群体遗传结构明显不同,品系间血型基因频率大多差异显著(P<0.05);各品系血型基因纯合系数视血缘来源不同变化较大;各品系血型表型组合类型数普遍较多,分布众数也较低;品系间遗传距离和系统聚类结果基本上符合这些鸡种的血缘来源及其遗传相似关系.试验结果可为品系选育及配套杂交利用提供科学依据.     

黄羽肉鸡群体遗传变异的微卫星分析及其与体重杂种优势的关系

选用10对微卫星引物分析了黄羽肉鸡A、B、C3个品系的遗传结构和差异,并对微卫星标记所计算的个体间遗传距离与C×B、C×A杂交后代的初生至8周龄体重的杂种优势和杂种优势率进行了相关分析。结果表明,10个微卫星标记中有9个表现出多态性,多态信息含量(PIC)和群体杂合度(Heterozigosity)分别为0·4400和0·6811,各品系、各微卫星基因座上都表现出一定差异。利用9个多态微卫星标记计算得出的亲本个体间的遗传距离与后代杂种优势率间多数没有显著的相关(P>0·05),仅C×B组合中亲本个体间平均遗传距离与第8周龄体重杂种优势和杂种优势率间相关显著(P<0·05)。     

鸡Apo VLDLⅡ基因内含子Ⅰ的多态性研究

本研究根据鸡Apo VLDL-Ⅱ基因内含子Ⅰ的基因序列设计3对引物,分别采用PCR-RFLP、PCR-SSCP技术对文昌鸡、如皋黄鸡、丝羽乌骨鸡、安卡肉鸡及红色原鸡5个鸡种进行多态性研究。结果表明,鸡Apo VLDL-Ⅱ基因内含子Ⅰ存在4处突变,分别为:1950处G/A、2522处A/C、2705处A/C及2793处C/T。统计结果显示:安卡肉鸡基因型频率的分布与如皋黄鸡、红色原鸡存在显著差异,文昌鸡基因型频率的分布与乌骨鸡差异不显著,除安卡肉鸡外所有鸡种均处于Hardy-Weinberg平衡状态。     

家禽新品种“鲁禽1号、3号麻鸡”培育成功

科技日报讯山东省农科院以地方优质鸡种和国外高产肉鸡品系为育种素材，综合运用现代分子生物学技术和传统的育种技术，培育出了遗传稳定的两个优质肉鸡一“鲁禽1号麻鸡”和“鲁禽3号麻鸡”配套系。     

PRLR基因在5个猪种中的群体遗传特性分析

催乳素受体(PRLR)基因在动物繁殖过程中有重要生理功能,是猪繁殖性状上的一个候选基因。利用PCR-RFLP方法,以大白猪、长白猪、杜洛克猪、山西瘦肉型猪新品系(SD-III系)、大汉梅猪为试验动物,分析了PRLR基因在各群体中的遗传特性。结果发现各群体都存在AA、AB和BB 3种基因型,均处于中度多态,5个猪群体都处于遗传平衡状态。     

四川地方乌骨鸡种群遗传变异的微卫星DNA分析

利用10个微卫星标记，对四川不同地区5个乌骨鸡种群的等位基因频率、各群体的遗传杂合度、群体间的遗传距离等进行了分析，并根据遗传距离对这几个乌骨鸡种群进行了聚类分析。结果表明，各乌骨鸡群体的遗传多样性较为丰富，并具有较高的选择潜力。各乌骨鸡种群间有一定的遗传距离，UPGMA聚类分析表明，四川山地乌骨鸡黑羽系与川南山地乌骨鸡被聚为一类，草科鸡与旧院黑鸡被聚为一类。     

四川常羽乌骨鸡群体遗传多样性分析

利用选自家禽基因组的10个微卫星标记,对四川常羽乌骨鸡5个群体(四川山地乌骨鸡白羽系、黑羽系;黄忠山地乌骨鸡;黄忠山地乌骨鸡绿壳蛋系;草科乌骨鸡)的遗传多样性进行了检测,计算了各群体的群体杂合度、群体间遗传距离,并根据遗传距离进行了聚类分析。结果表明所选择的微卫星标记在各群体中表现出较高的多态性;四川5个乌骨鸡群体遗传多样性比较丰富,群体平均杂合度为0.5383到0.6659;各群体间的遗传距离有一定的差异;聚类分析将5个群体聚为三类。     

河南省4种地方品系鸡的RAPD分析

应用随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD) 技术分析河南省4个地方鸡的品系,固始鸡快羽G_K系、固始鸡慢羽G_M系、矮小型绿壳蛋鸡、黄麻羽丝毛乌骨鸡的遗传变异。用186个随机引物对4个鸡种基因组DNA池扩增筛选,40个引物产生多态性。此40个引物经重新优化反应体系后,对120个个体的基因组DNA 进行RAPD分析。40个引物共产生387种扩增片段,扩增产物片段的长度大小在100～2220 bp范围内。利用电泳分析数据分别计算4个品系群体之间的遗传相似系数和遗传距离指数,结果4个鸡种的亲缘关系与它们的引种情况基本一致。同时也证明了RAPD技术可以作为分子标记,很好地检测鸡种群内的遗传变异及区分不同鸡品系。     

Immunological and gene expression responses to a Salmonella infection in the chicken intestine

Besides infection in humans, Salmonella enteritidis can also cause serious illness in young chickens. However, the genetic and immunological parameters important for the disease in chickens are not well characterized. In this study, processes in the chicken intestine in response to a Salmonella infection were investigated in two different chicken lines. One-day-old chickens were orally infected with Salmonella. T-cell subpopulations, phagocytic properties of intestinal mononuclear cells and RNA expression levels of the jejunum were investigated. The two chicken lines differed in the amount of cfu in the liver and growth retardation after the infection. Differences in phagocytic activity of intestinal mononuclear cells were found between control and Salmonella infected chickens. The number of CD4+ T-cells of the intestine decreased after the Salmonella infection in one chicken line, while the number of CD8+ T-cells increased in both chicken lines, but the time post infection of this increase differed between the lines. In one chicken line the expression levels of the genes carboxypeptidase M and similar to ORF2 decreased after the Salmonella infection, which might be related to a decrease in the amount of macrophages. With the microarray, ten genes were found that were regulated in only one of the chicken lines, while we found six genes regulated in response to the infection in both chicken lines. So differences in genetic background of the chickens influence the intestinal host response of the Salmonella infection as observed by phagocytic activity, gene expression and changes in the number of T-cell subpopulations and macrophages.     

Evaluation of oligonucleotide probes for simple tandem repeats (STR) to produce informative DNA fingerprints of the chicken

1. DNA fingerprints of chickens from 2 commercial lines were used to identify oligonucleotide probes providing informative DNA fingerprints. 2. The oligonucleotides [CA]8, [CAC]5, [GGAT]4 and [GACA]4, producing a high number of bands of sufficient intensity and regular distribution, were chosen for further analysis out of 10 tested. 3. Analyses of banding patterns within families revealed Mendelian inheritance of the fragments detected. The DNA fingerprints obtained with the 4 chosen oligonucleotide probes showed about 40 scorable bands in total. 4. Comparison of banding patterns within and between the chicken lines for all 4 oligonucleotide probes revealed levels of bandsharing which did not differ significantly. The number of loci detected by these probes ranged from 25 to 30 each. 5. The probes [CA]8, [CAC]5, [GGAT]4 and [GACA]4 can be used to produce informative DNA fingerprints of chicken. These probes provide estimates of the genetic similarity/variability of individuals or of populations and provide a valid measure of the actual degree of genetic similarity/varibility.     

六个品系白壳蛋鸡血型及血浆蛋白质（酶）多态分析

用中国科学院遗传研究所研制的１０个抗鸡红细胞抗原单价血清（３个位点１０个等位基因），以平板凝集法以及用聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳方法，对济宁北郊种鸡场白壳蛋鸡祖代或父母代Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、Ｅ、Ｆ６个品系共３１２羽成年个体分别进行血型和血浆蛋白质（酶）多态（２个位点６个等位基因）测定，结果表明，各品系的群体遗传结构各有差异，试验结果可为杂交亲本选配提供信息。     

三个鸡品系的遗传差异与杂种优势关系的研究

采用RAPD标记分析了武定鸡快羽系、绿壳蛋系和合成系间的遗传差异,进行了三个鸡品系间的杂交试验,并应用简单的线性相关分析了遗传距离指数与杂种优势的关系。分析结果表明快羽系与绿壳蛋系间的遗传差异较小,而快羽系与合成系间的遗传差异较大。品系间遗传距离指数与F1代各性状观察值均为正相关,但相关不显著;与杂种优势率之间也均为正相关,但只与13周龄存活率、种蛋受精率有显著的相关关系。表明RAPD标记在预测杂种优势上具有一定参考价值。     

新昌宫廷黄鸡遗传多样性及遗传结构分析

为研究新昌宫廷黄鸡的遗传多样性及遗传结构,本实验利用STR分型技术对新昌宫廷黄鸡在26个微卫星位点上的遗传多样性进行检测,并分析其与仙居鸡、萧山鸡、龙游麻鸡、丝羽乌骨鸡和白耳黄鸡的遗传距离。结果显示:新昌宫廷黄鸡平均有效等位基因数为4.03个,多态信息含量变幅为0.41～0.85,平均为0.67,观察杂合度平均为0.60,期望杂合度平均为0.72,Shannon信息指数平均为1.50,表明宫廷黄鸡26个遗传位点具有高度多态性,即该群体具有较高的遗传多样性;基于遗传距离NJ系统进化树将6个不同群体聚为两大簇,其中白耳黄鸡单独成一簇,其他5个品种聚为一簇,与宫廷黄鸡遗传距离从小到大依次为丝羽乌骨鸡、龙游麻鸡、萧山鸡、仙居鸡、白耳黄鸡,基于FCA分析结果与遗传距离NJ系统进化树结果一致。     

基于全基因组SNP标记分析中国地方鸡品种的遗传多样性和种群结构

旨在对中国地方鸡品种的遗传多样性与种群结构进行分析。本研究使用Affymetrix Axiom 600K高密度鸡基因分型芯片对来自8个品种的157只地方鸡及233只商品鸡进行基因分型,以品种作为分组来计算各分组的观测杂合度、期望杂合度、次等位基因频率、近交系数及核苷酸多样性分析地方鸡群体的遗传多样性,利用进化树、主成分分析、群体结构、MDS等方法分析鸡群体的群体结构,基于状态同源(IBS)和群体分化系数(Fst)分析种群内部与种群之间的亲缘关系,利用长纯合片段(runs of homozygosity, ROH)估算得到基于ROH的近交系数。结果表明,各群体的观测杂合度均高于期望杂合度,次等位基因频率在0.175～0.236之间,近交系数在0.018～0.205之间,核苷酸多样性在0～6×10^-4之间,进化树与主成分分析表明品种间出现了明显的群体分化,地方鸡群体与商品鸡群的MDS分析发现我国地方鸡与商业肉鸡品种的遗传距离较近;IBS遗传距离在0.092 9～0.319 9之间;各品种成对Fst分析表明,群体间呈现中高分化程度(0.09～0.22);此次分析共得到了...     

Thermoregulatory capacity and muscle membrane integrity are compromised in broilers compared with layers at the same age or body weight

1. The effects of acute heat stress (2 h at 32 degrees C and 75% RH) on body temperature and indices of respiratory thermoregulation and skeletal muscle function were examined in two divergently selected male grandparent lines of broiler and layer-type chickens at two ages (35 and 63 d), or at a similar body weight (approximately 2.2 kg). 2. The two chicken lines exhibited markedly different baseline blood acid-base and skeletal muscle characteristics. At the same age or live weight, birds from the broiler line had significantly higher venous blood carbon dioxide tensions associated with lower blood pH. Plasma creatine kinase (CK) activities reflecting muscle membrane damage were also greatly elevated in the broiler line. 3. Exposure to acute heat stress caused an increase in deep body temperature, panting-induced acid-base disturbances and elevated plasma CK activity in both lines of chicken, an effect that increased with age. The extent of disturbances in acid-base regulation and heat-stress-induced myopathy were more pronounced in the broiler than the layer line at the same age or similar live weights. 4. It is suggested that genetic selection for high muscle growth in broiler lines has compromised their capacity to respond to an acute thermal challenge, leading to detrimental consequences for muscle function. This reduction in heat tolerance may have important implications for bird welfare and subsequent meat quality.