抗感菜豆品种对菜豆普通花叶病毒侵染后的转录组分析

菜豆普通花叶病毒（BCMV）在世界范围内分布广泛并可造成菜豆严重减产。菜豆是BCMV的主要寄主,不同遗传背景的菜豆对BCMV侵染的响应存在显著差异,目前菜豆抗性基因功能及BCMV的致病机制鲜有报道。为了为菜豆抗性基因功能的研究以及分子抗病育种提供相关依据,利用转录组测序（RNA sequencing）技术对BCMV(C54株系)侵染感性及不同抗性的菜豆品种材料进行转录组测序,对所得数据筛选差异表达基因并进行Gene Ontology(GO)、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集以及进行Weighted correla?tion network analysis(WGCNA)分析。结果发现,不同的菜豆品种中病毒的积累量、差异表达基因的定位及一些关键通路对病毒侵染的响应存在共性和差异（如昼夜节律、光合作用、植物-病原体的相互作用和一些代谢途径相关通路等）。在接种叶上,Dubbele witte品种（DW,对BCMV侵染易感）与Redland’s greenleaf C品种（RGLC,对BCMV侵染具有抗性）差异表达的基因类型上更为相...     

普通菜豆蛋白质组学研究进展

随着质谱技术和生物信息学的快速发展,作为后基因时代生命科学技术研究的里程碑和核心内容的蛋白质组学技术在园艺植物研究中的诸多方面应用日益增多。本文综述了蛋白质组学在普通菜豆生物胁迫、非生物胁迫以及种质资源多样性等方面的研究进展,并指出了蛋白质组学在普通菜豆全基因组测序工作完成的契机下所面临的挑战和发展前景。     

普通菜豆种质资源研究现状及进展

对普通菜豆的起源、分类、种质资源利用与评价、育种方法等方面进行了综述.并特别关注了近年来国内外对普通菜豆生物和非生物胁迫的研究,以及在基因组学和蛋白质组学方面的探索,以期为普通菜豆种质资源创新创制提供参考依据.     

菜豆普通花叶病毒研究进展

菜豆普通花叶病毒是侵染豆科作物的主要病原之一，给豆类产生带来了巨大为害，日益受到人们的重视。本文主要就该病毒的普通生物学、细胞病理学、血清学、分子生物学及株系的划分等方面的最新研究进展作一综述。     

菜豆田普通细菌性疫病防治试验

经过种子处理和生长期药剂防治,可有效防除菜豆普通细菌性疫病的发生,且防治率在53.91%以上,增产率达17%。并能达到用药安全。     

重庆市普通菜豆种质资源形态聚类分析

以收集到的30份重庆市普通菜豆种质资源为研究对象,通过对各菜豆品种的10种形态标记进行调查赋值,利用平方欧氏距离和组间联接法对数据进行聚类分析,结果表明:供试材料可分为4类群,其中,Ⅰ类有7个品种,Ⅱ类有11个品种,Ⅲ类有9个品种,Ⅳ类有3个品种;Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ类群长势较强,亲缘关系较近,而Ⅳ类群长势较弱,与其它3类亲缘关系较远;各资源中平方欧氏距离最远的为15和3,最近的为120和122。     

浓核病毒基因组研究进展

综述了浓核病毒基因组结构的分类和浓核病毒基因组的转录和表达,并总结分析了浓核病毒结构蛋白和非结构蛋白保守区域,介绍了浓核病毒作为表达载体和生物防治的工具。     

番茄基因组研究进展

【目的】综述国内外相关高质量番茄基因组研究进展,比较与分析第一、二、三代测序技术的研究成果,为番茄重要性状功能基因的挖掘及新品种选育提供参考。【方法】收集查阅国内外相关官网、文献资料和现有研究前沿技术,整理汇总并进行对比,分析番茄基因组测序技术研究进展。【结果】栽培番茄S. lycopersicum Heinz 1706基因组利用一代和二代测序技术8年完成测序和组装。3个野生番茄基因组采用二代测序技术3年完成,三代测序技术缩短了测序时间,并且在二代测序技术的基础上提高了基因组的质量,提供了完整性高达96.46%的野生番茄品种潘那利的参考基因组。【结论】测序技术推动了番茄基因组研究,三代测序技术与一、二代技术相比,在测序速度、基因序列读长和准确性方面显著提高,也使基因组组装更加精确。     

菜豆普通细菌性疫病病原菌鉴定

【目的】明确中国北方地区菜豆普通细菌性疫病病原菌。【方法】应用菌落特征、油菜黄单胞菌菜豆变种诊断试剂检测、致病性测定、16S rDNA和16S-23S rDNA ITS序列分析、特异PCR检测、脂肪酸分析及生理生化反应特征对病原菌分离物进行鉴定。【结果】从病害样品和菜豆种子样品中均分离到类似黄单胞杆菌的细菌分离物,选取25个代表分离物进行致病性测定,有24个分离物在菜豆品种“英国红”上导致典型菜豆普通细菌性疫病症状。结合16S rDNA及16S-23S rDNA ITS序列比对分析、特异性PCR检测及生理生化反应的结果,24个分离物中7株被鉴定为地毯草黄单胞菌菜豆变种,17株为褐色黄单胞菌褐色亚种。【结论】中国北方地区发生的菜豆普通细菌性疫病由地毯草黄单胞菌菜豆变种或（和）褐色黄单胞菌褐色亚种引起;褐色黄单胞菌褐色亚种在中国属首次报道。     

普通菜豆SSR反应条件的优化

在作物育种中,SSR是主要农艺性状分子标记及标记辅助育种的一项重要技术。以紫花、八月绿、将军、73-8、96-9、9z622等6个普通菜豆品种为试材,采用改良的SDS法提取了高质量的基因组DNA。为建立适宜的SSR反应体系,对影响SSR-PCR扩增的模板DNA浓度、Mg~(2+)的用量、Taq DNA聚合酶浓度、dNTPs浓度、退火温度等因素进行了优化。结果表明,在25μLPCR反应体系中,DNA模板的最适浓度为0.8ng·μL~(-1),Mg~(2+)的优化浓度为1.5mmol·L~(-1),Taq DNA聚合酶的最适浓度为0.05μmol·(μL·min)~(-1),dNTPs的最适浓度为0.2mmol·L~(-1)。     

基于高通量测序的动物基因组研究进展

动物基因组学研究是进行动物遗传资源保护和利用以及分子育种的一项重要基础工作,高通量测序技术的出现为动物基因组学研究带来了革命性飞跃。文章对基于高通量测序技术的动物基因组从头测序、重测序、简化基因组测序等基因组学研究进行了综述,总结了相关的生物信息分析内容,并对不同分析工具及方法进行了比较分析。最后,讨论了当前高通量测序技术存在的问题,对该技术未来发展方向进行了展望。     

普通菜豆抗旱性品种筛选

以20份菜豆品种为试材,采用盆栽自然干旱法研究了干旱胁迫对其干鲜质量、叶面积、叶片相对含水量、叶绿素含量和光合特性等指标的影响,并通过主成分分析法对普通菜豆进行抗旱性相关指标鉴定,旨在筛选出较耐旱和较敏感的菜豆品种。结果显示,各材料之间存在明显的抗旱差异性;叶片相对含水量、叶绿素含量和光合指标与抗旱能力相关,其中,红籽压塌架抗旱性相对较强,新泰国架豆王抗旱性次之,王中王架豆抗旱性相对较弱。     

普通菜豆农艺性状相关性分析及主成分分析

本文通过对从怒江收集的20份普通菜豆资源农艺性状的研究与分析,结果表明部分性状之间有一定的相关性,并得出农艺性状的主成份。     

山西普通菜豆种质资源籽粒品质分析和评价

利用山西种质库内保存的能够代表山西省普通菜豆资源总体的149份资源,对其籽粒进行品质分析和评价。通过对149份资源籽粒品质测定,结果表明,山西省普通菜豆资源粗蛋白含量平均值高于全国平均水平,而粗淀粉和粗脂肪含量平均值低于全国平均水平;筛选到高蛋白含量资源13份、高淀粉含量资源2份、高脂肪含量资源1份和高纤维含量资源6份;聚类分析结果将149份资源划分为7组,基本明确了山西省普通菜豆的籽粒品质类型特征。     

普通菜豆种质资源形态多样性鉴定与分类研究

 对324份普通菜豆种质资源的形态多样性进行了研究。结果表明，我国普通菜豆种质资源具有丰富的形态多样性，平均多样性指数为1.632，高于国外材料（1.227）40.5%。通过多变量的主成分分析，第一主成分和第二主成分代表了普通菜豆形态多样性的44%。基于形态性状，把我国280份普通菜豆种质聚类并划分为三大组群：第一组群，生育期较短、植株较矮、籽粒较大、单株荚数和单荚粒数较少，生长习性以直立为主，主要来自东北和华北地区；第三组群，表现为生育期较长、植株较高、籽粒偏小、单株荚数和单荚粒数较多，生长习性主要以蔓生为主，主要来自于西南地区；第二组群普通菜豆的特征特性介于第一和第三组群之间，分布较广。     

云南怒江普通菜豆地方种质资源遗传多样性研究

利用从云南怒江地区收集的18份地方品种普通菜豆种质资源和从昆明收集的2份栽培品种,对20份材料采用形态学观察和RAPD分析,研究了云南怒江地区普通菜豆地方品种种质资源的遗传多样性和种内亲缘关系及其一些农艺性状,为普通菜豆种质资源优良基因发掘和优良品种选育提供科学依据。     

基于灰色关联评价的普通菜豆农艺性状对其产量的影响

为解决食用豆类高效育种与栽培问题,以普通菜豆为试验材料,采用灰色关联评价方法对黔西北主产地区的10个品种进行研究。结果显示,普通菜豆不同性状与产量的关联度大小为:X1(株高)X4(单株荚数)X2(主茎节数)X10(果实成长期)X8(生育期)X7(百粒重)X9(开花期)X5(荚长)X6(单株粒数)X3(主茎分支)。提出了在育种研究中结合相关农艺性状的主次关系选育出适合本地区的高产普通菜豆品种的建议。     

猪基因组研究进展

鉴于猪的经济重要性以及医学研究价值,许多有关猪的研究计划被先后掀起,其中猪的基因组是研究热点和重点.从猪的基因定位、基因图谱、QTL定位、候选基因分析、测序进展、功能分析和蛋白质组学研究等方面综述了猪基因组研究取得的进展,为进一步深入研究猪基因组提供理论参考.