宣和猪FGF14基因多态性及其对生长性状的影响

为了探讨宣和猪FGF14基因外显子4的多态性及其对猪群生长性状的影响,通过PCR产物直接测序对366头宣和猪FGF14基因外显子4区域的SNP位点进行检测,结合宣和猪的生长性状记录,分析了单个位点基因型及两个位点单倍型组合对7个生长性状的影响.结果表明:在宣和猪外显子4上检测到T493A和A589G这两个紧密连锁的位点...     

猪肌肉糖原酵解潜能及其组分与肉质、脂肪沉积和血液性状的相关性

利用白色杜洛克×二花脸资源家系中测定的F2代个体表型数据,分析肌肉糖原酵解潜能(GP)及其组分与肉质、脂肪沉积和血液性状的相关性.结果表明:背最长肌GP与pH24 h值(r=-0.39,P<0.001)、b*值(r=0.36,P<0.001)和L*值(r=0.13,P<0.001)相关,提示GP越高,则肉的终pH值趋向更低,肉色更加苍白.乳酸含量与pH45 min (r=-0.59,P<0.001)、T45 min(r=0.24,P<0.001)、L*值(r=0.34,P<0.001)和总色素含量(r=0.32,P<0.001)相关,提示宰时乳酸含量高,pH值初始下降速度快,肉温度偏高、肉色偏白.乳酸和GP与脂肪沉积性状显著正相关,而GP及其组分与血液性状各组分相关系数普遍低或者不显著.这表明肌糖原含量及组分是影响肉质的重要因素,并与脂肪沉积有一定相关,但与血液指标无关.     

IGF2基因多态性检测与生长性状相关性分析

采集395头核心群的种猪耳样,采用PCR-SNaPshot方法检测长白猪和大白猪胰岛素样生长因子2(IGF2)基因内含子3的位点多态性,并分析各基因型与生长性状的相关性.结果表明,长白和大白猪中均存在3种基因型,大白猪3种基因型分布为:AA＞GA＞GG,长白猪3种基因型分布为:GA ＞AA＞GG.大白和长白猪的A等位基...     

二花脸猪obese基因3714位点多态性与产仔性状的相关性

利用Bi PASA技术检测了二花脸猪OB基因的多态性 ,并且分析了其与母猪产仔性能的相关性。结果显示 ,OB基因在第 371 4碱基处存在G/T替换 ,经Bi PASA检测后分别定义为等位基因G和T。在二花脸母猪群中 ,等位基因G和T的频率分别为 0 339和 0 6 6 1。方差分析发现 ,G/G基因型个体的头胎产仔数以及平均产仔数略低于G/T型和T/T型个体 ,但相互之间无显著差异 ;在最高产仔数性状上 ,G/G型个体显著低于G/T型和T/T型个体 (P <0 0 5 )。表明G/G型个体的产仔潜力显著偏低     

鹌鹑MyoD基因多态性与生长性状的相关性分析

[目的]研究MyoD基因与鹌鹑生长性状的相关性。[方法]以朝鲜鹌鹑为研究对象,应用HRM技术检测群体中MyoD基因的多态性,测定其生长性状,并进行关联分析;qPCR检测3种基因型胚胎肌肉组织中MyoD基因的表达量。[结果]MyoD基因在群体中存在AA、Aa和aa 3种基因型,AA和Aa基因型个体的胸围显著高于aa基因型(P<0.05)。胚胎发育的7～15 d均能检测到MyoD基因表达,MyoD基因的表达量从11 d开始升高,15 d达到峰值。AA和Aa基因型MyoD基因表达量提高速度高于aa基因型。[结论]MyoD基因A等位基因为朝鲜鹌鹑胚胎生长发育的优势基因,可用于生长发育快的个体基因型育种选择。     

猪血清转铁蛋白含量遗传力估测及与生长性状相关性分析

用总铁结合量法测定二花脸、长白、大约克、大二、长大仔猪血清转铁蛋白含量 ,并用SAS分析处理数据。结果显示 :仔猪血清转铁蛋白含量与猪的品种有关 ,血清转铁蛋白含量与体重、日增重等生长性状间表型相关显著 ,遗传相关、遗传力为中等程度     

PLIN1第2、4外显子多态性与猪脂肪沉积性状的相关性分析

为探索编码脂滴包被蛋白的PLIN1基因对猪脂肪沉积的作用,随机选择190头杜×长×大三元商品杂交猪屠宰,采用常规方法测定部分脂肪沉积性状,同时采集样品提取DNA;运用PCR-SSCP技术对猪PLIN1基因第2、4外显子进行SNP筛查;采用一般线性模型分析所得基因型对各脂肪沉积性状的影响作用.在猪PLIN1基因第2、4外显子分别发现一处碱基替换突变.第2外显子的AA型背膘厚高于AB和BB型(P＜0.01),AA型剪切力值低于AB型和BB型(P＜0.01);第4外显子的CD型背膘厚高于CC型(P＜0.05),CD型肌内脂肪含量高于CC型(P＜0.01).结果表明,PLIN1基因的第2、4外显子SNP对猪脂肪沉积相关性状有显著作用.     

猪ARID5B基因多态性及其与脂肪沉积性状的相关性分析

为探究猪ARID5B基因多态性及其与脂肪沉积性状的相关性,在DNA水平上对藏猪、大白猪ARID5B(AT-rich interaction domain 5B)基因5′侧翼区进行了单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点筛选;在mRNA水平上对两猪种的肝脏、背脂和背最长肌组织中的ARID5B基因表达量进行了RT-qPCR检测;并对两猪种的背膘厚和背最长肌组织中IMF(Intramuscular fat)含量进行测定。结果表明:在ARID5B基因5’侧翼区,存在T-2 216C和In-2 029Del缺失2个连锁突变位点,藏猪与大白猪呈极显著差异(P0.01);在相同组织不同品种间,ARID5B基因在肝脏、背脂和背最长肌中mRNA相对表达量趋势完全一致,且藏猪ARID5B基因表达量均极显著低于大白猪(P0.01);藏猪背膘厚和IMF含量均极显著高于大白猪(P0.01);经DNA、mRNA水平、背膘厚和IMF含量相关性分析发现,ARID5B基因mRNA相对表达量与背膘厚和IMF含量呈显著负相关(P0.05)。     

脂肪酸转运蛋白4(SLC27A4)基因内含子8多态性研究

脂肪酸转运蛋白4(SLC27A4)是主要的极长链脂肪酰基辅酶A合成酶,在脂质代谢中起着重要作用。本文利用PCR-RFLP方法分析了6个猪种的SLC27A4基因内含子8的多态性。结果表明,在长白猪群体中检测到AA、AG和GG 3种基因型;在莱芜猪和大约克检测到AG和GG 2种基因型;其余猪种只检测到GG 1种基因型。在6个猪群中G均为优势等位基因,GG为优势基因型。χ2检验显示,基因型分布在莱芜猪、大约克和长白猪群均达到了哈代—温伯格平衡(P0.05);不同基因型在群体间的分布差异极显著(P0.01)。群体遗传特性结果表明,有效等位基因数在1.000~1.2914之间。多态信息含量(PIC)介于0.0000~0.2002之间,为低度多态。     

不同猪种IGF2基因PCR-RFLP多态性与部分生长性状相关性分析

以IGF2基因作为控制猪生长性状主基因的候选基因,采用PCR-RFLP方法对7个品种/群体共528头猪进行了NciⅠ酶切位点基因型检测,计算了该位点的基因频率与基因型频率,并对品种间基因型频率进行了x2差异性检验.结合生长性能记录,运用SAS软件分析了IGF2不同基因型对生长性状的遗传效应.结果表明:在杜洛克、长白、大白中,AA基因型比BB基因型生长速率快,生长性能指数高4.06%～8.31%,等位基因A对猪的生长具有正效应.     

猪PGC1基因多态性与肉质性状的相关性分析

通过PCR-RFLP方法,检测外来品种大约克猪和江苏地方品种梅山猪、二花脸猪、姜曲海猪以及培育品种苏钟猪共144头,结果表明PGC1基因第8外显子序列经Alu I酶切后存在AA、AT和TT 3种基因型,其中大约克猪中AA基因型占优势,A等位基因频率为0.7,而江苏地方品种猪中,TT占绝对优势。分析PGC1基因型与肉质性状相关发现,AA基因型猪的肉色L、失水率均极显著低于TT基因型(P<0.01);TT基因型猪的蒸煮损失、剪切力和肌纤维直径均极显著低于AA基因型(P<0.01)。     

猪MYOG基因遗传多态性与胴体及肉质性状的相关性

通过测定约180日龄的8个群体(梅山、大白、长白、大白×梅山F1代、梅山×大白F1代、长白×大白F1代、大白×长白F1代以及大白×梅山F2代)459头猪胴体性状、肉质性状以及肌细胞生成素基因(MYOG)多态性,分析MYOG在猪群体中的遗传效应。结果表明：MYOG在猪群体中呈现3种基因型,即AA、AB、BB;群体瘦肉率的提高与BB基因型显著相关,相较于AA与AB基因型,其提高幅度分别为3.57%和3.28%;在大白×梅山F2代群体中,MYOG的基因型与背最长肌pH值、股二头肌pH值呈显著相关;在大白×梅山F1代群体中,MYOG基因型与股二头肌大理石纹MM2呈显著相关。     

中国西门塔尔太行类群牛肉质性状与SLC27A1基因多态性关联分析

为探索SLC27A1基因对牛肉质性状的影响,选取中国西门塔尔牛太行类群牛公牛、阉牛各20头为研究对象,采用PCR法分析SLC27A1的基因遗传多态性。检测到SNP位点为S5650:TC,该位点存在有3种基因型,其中CC基因型频率较高(62.5%),TT基因型频率最低(12.5%)。采用GLM对肉质相关性状与SLC27A1基因进行关联分析,结果表明,剪切力、肉色a、肉色b表型中,CC与TT及CT与TT差异均极显著(P0.01),其他性状间差异不显著(P0.05),阉牛与公牛间对肉质的弹性与咀嚼性差异显著(P0.05)。采用Real-time PCR分析,CC基因型在肌肉与脂肪中的表达量比基因型CT与TT差异显著(P0.05),阉牛与公牛之间的表达量在肌肉中差异极显著(P0.01)。SLC27A1基因S5650:TC位点突变对中国西门塔尔牛太行类群肉质性状存在一定的遗传效应。     

撒坝猪血清酯酶多态性及其与部分生长性状的关系

 本研究采用垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳法(PAGE)检测了115头撒坝猪的血清酯酶(ES)多态性,计算了该位点的基因型频率、基因频率以及遗传多样性指数(h),并用普通方差分析和二因素(酯酶基因型、性别)有互作模型的最小二乘分析法,对撒坝猪血清酯酶3种基因型与几个阶段体重的关系进行了分析。结果表明,撒坝猪血清酯酶3种基因型AA,AB和BB的频率分别为0.2696,0.5826和0.1478,2个等位基因A和B的基因频率分别为0.5609和0.4391,该位点的遗传多样性指数为0.4926.在3种基因型中,BB型个体的6月龄体重与2～6月龄日增重均显着地高于其它两种类型,酯酶基因型与性别之间的互作效应明显,显示了猪的血清酯酶多态性作为6月龄体重和2～6月龄日增重两个性状的遗传标记以进行标记辅助选择的可能性。     

牦牛PPARδ基因多态性与生长性状的相关性

【目的】揭示牦牛PPARδ基因的遗传变异特征,发现与牦牛生长性状显著相关的候选分子标记,为牦牛分子育种积累基础资料.【方法】以96头牦牛血样为材料,运用DNA池测序和PCR-HRM等技术检测PPARδ基因的序列变异.【结果】检测到牦牛PPARδ基因内含子中2个SNPs.遗传变异特征分析显示,SNP1(g.10045A/G)和SNP2(g.10226A/G)位点属于中度多态性.连锁不平衡和单倍型分析表明,牦牛PPARδ基因2个多态位点之间为弱连锁,单倍型AA属于优势单倍型(频率为42.2%).方差分析表明,单个的SNP与牦牛生长性状有着显著或极显著的关联.【结论】牦牛PPARδ基因的2个SNPs与其生长性状显著相关,此结果可以应用于牦牛的分子育种实践.     

栝楼生长性状与产量相关性研究

【目的】调查研究栝楼生长性状与单株产量的关系,用以指导栝楼的农业生产。【方法】田间观察记录栝楼的出芽时间、开花时间、成熟期、叶片数、单株结果数等生长指标,通过相关性分析法、主因素分析法,筛选主因素并分析各生长因素的相互作用。【结果】各生长性状指标种质内变异系数均较小,种质间的变异系数比较大;影响单株产量的因素主要是单株结果数、分蘖数、主茎粗、叶片数、株高;影响栝楼单株产量的主要生长性状大小顺序为株高>分蘖数>叶片数>单株结果数>主茎粗>成熟期>出芽时间>开花时间。【结论】单株结果数越高,分蘖数越多,主茎越粗,叶片数越多,株高越高,栝楼的单株产量就越高。通过比较各生长因素的重要性可以有针对性地指导农业生产管理,更加科学地施肥。     

信阳水牛GH基因多态性与部分生长性状的相关性

本研究采用PCR-SSCP及DNA测序技术,以106头信阳水牛为材料,采集血样,提取基因组DNA,以GenBank公布的牛GH基因序列(NC_007317)为参照序列,设计PCR引物,对GH基因的第2、3外显子及部分内含子进行了遗传变异检测,并将其多态性与部分生长性状进行了相关分析。结果表明:每个位点的PCR产物经SSCP分析均出现不同的带型,第2外显子存在1处SNP(G413A),第2内含子存在4处SNPs(G495C,A523C,A541G,G699A),信阳水牛GH基因的GH-P3位点的多态性与部分生长性状没有显著相关性。     

DNAJB6等五个基因的多态性与鸡生长和体组成性状的关联研究

根据鸡腹脂性状的全基因组关联分析研究筛选出五个与鸡腹脂重和腹脂率极显著相关的突变位点:rs16426347、GGaluGA262866、rs16425708、rs14087994和rs14135995,这些位点分别位于SRD5A3,SGCZ,DLC1,GALNT9和DNAJB6基因上。针对这些位点,以东北农业大学高、低脂系肉鸡第14世代群体和AA随机群体为试验材料,进行多态性与鸡生长和体组成性状的相关分析。结果表明,除了rs14087994位点,其余位点的多态性与第两个群体的VLDL存在显著或极显著相关;rs16426347位点与14世代群体的睾丸重极显著相关;GGaluGA262866与14世代群体的1、3周龄体重以及心脏重显著相关;rs16425708与14世代群体的7周龄体重和屠体重显著相关。研究表明,五个位点所在的基因可能影响鸡脂肪沉积,与其他体组成性状相关的位点需进一步验证。     

大白猪MUC13基因多态性与生长、肉质性状的相关性

选择对仔猪腹泻有显著影响的产肠毒索大肠杆菌（ETEC）F4ac的受体基因MUC13为研究对象,采用PCR-SNaPshot判型与常规育种技术相结合的方法,对544头大白猪核心育种群进行基因判定及基因型与生长、肉质性状相关性的研究．结果表明,大白猪MUC13基因型分布大小为：腹泻易感杂合基因型GA〉腹泻抗性纯合基因型GG〉腹泻易感纯合基因型从,腹泻抗性有利基因G的等位基因频率为0．669,腹泻易感不利基因A的等位基因频率为O．331．3种基因型个体达100kg日龄及其估计育种值（EBV）、达100kg背膘厚及其EBV的大小为：从〉GA〉GG;眼肌面积、肌内脂肪含量和估计瘦肉率的大小为：GG〉GA〉AA,差异不显著（P〉0．05）．可见,在种猪选育上,逐代选择带有G等位基因的个体,建立抗性纯合GG基因型个体的种猪核心群,即可降低仔猪腹泻率,又不影响生长和肉质的性状．     

猪GHR基因两个SNPs位点多态性与生长性状的关联分析

[目的]探讨猪GHR基因两个SNPs位点多态性与其生长性状的相关性,为保护广西巴马小型猪的遗传资源及推进猪分子标记辅助育种技术的发展奠定基础.[方法]采用PCR-RFLP和错配PCR-RFLP(CRS-PCR-RFLP)检测巴马小型猪×长白猪杂交F2代(简称巴×长F2代)资源家系中猪GHR基因G1248A和A1801G两个SNPs位点的多态性,并对其相关生长性状进行关联分析.[结果]猪GHR基因G1248A和A1801G两个SNPs位点在巴×长F2代资源家系中均表现出AA、AG和GG 3种基因型.G1248A位点对巴×长F2代生长性状的影响表现为:除2月龄GG基因型个体的胸围尺寸显著大于AA、AG基因型个体(P<0.05,下同),4月龄GG基因型个体的体重显著高于AA、AG基因型个体外,其他月龄的相关生长性状在不同基因型个体间差异均不显著(P>0.05,下同).A1801G位点对巴×长F2代生长性状的影响表现为:除1和6月龄GG基因型个体的体高显著低于AA、AG基因型个体,3和6月龄GG基因型个体的胸围尺寸显著大于AA、AG基因型个体外,其他月龄的相关生长性状在不同基因型个体间差异也不显著.[结论]猪GHR基因G1248A位点的G等位基因对个体体重、胸围有正选择作用,而A1801G位点的G等位基因对个体体高有负选择作用,对个体胸围有正选择作用,均可作为猪分子标记辅助育种的遗传选择标记.