三倍体湘云鲫及其亲本线粒体DNA的比较研究

用人工选育的异源四倍体鲫鲤（♂）与白鲫（♀）杂交获得具有明显生长优势的三倍体湘云鲫。采用差速离心和核酸酶处理等方法，从三倍体、白鲫和异源四倍体鲫鲤肝组织中提取线粒体DNA，并用9种限制性内切酶进行单酶酶切分析。经琼脂糖凝胶电泳后计算出各酶切片段的大小，测得三倍体、白鲫和异源四倍体鲫鲤mtDNA的分子大小分别为16．24kb、16．60kb和16．20kb。根据各单倍型间的酶切片段共享度，估算出3个群体间的遗传距离，说明了mtDNA母系遗传的特性。     

异源四倍体鲫鲤及亲本ApoE的克隆及组织表达分析

载脂蛋白E(Apolipoprotein E,ApoE)作为胆固醇代谢过程中的关键因子,参与脂蛋白转运和性腺发育。为进一步了解该基因的作用,本实验克隆并测序了异源四倍体鲫鲤及其父母本ApoE基因的全长序列。异源四倍体鲫鲤、红鲫和鲤的ApoE全长分别为1393 bp、1384 bp和1396 bp,均编码281个氨基酸。序列对比表明,异源四倍体鲫鲤ApoE与父本鲤更为相似。另外有2个氨基酸位点发生了与父母本均不同的变异,证明异源四倍体鲫鲤除了有杂交特征外也产生了变异。通过Mega软件构建的哺乳动物ApoE进化树与系统分类相一致:鲤科鱼类的ApoE聚类在一起而分离于其它物种。Real time PCR分析表明,ApoE基因在3种鱼中的组织表达模式基本一致,所有组织均有表达,而在脾脏中表达最高。     

异源四倍体鲫鲤及其原始亲本遗传变异的RAPD分析

在优化RAPD检测条件的基础上，从100个随机引物中筛选出60个扩增较好的引物对异源四倍体鲫鲤及其原始亲本红鲫和湘江野鲤相互间扩增DNA片段的异同性进行比较研究。结果显示，60个引物共产生1554条带，单一引物扩增的DNA片段数在6～20条之间，片段大小在200～3500bp之间。遗传相似率分析表明，异源四倍体鲫鲤与其原始母本红鲫的相似率为69．41％，与其原始父本野鲤的相似率为64．47％，说明异源四倍体鲫鲤接受原始母本红鲫的遗传物质要多一些；而红鲫和野鲤之间的相似率为42．18％，说明两者的基因组成有较大的相似性，从分子水平证实了红鲫和野鲤的远缘杂交具有较大的亲和性。在分析中，还发现异源四倍体鲫鲤有4条非亲本带，非亲本带谱率达0．72％，这些非亲本带可以作为异源四倍体鲫鲤特异性的分子标记。     

东昌湖野生鲤的线粒体DNA RFLP分析

利用差速离心法及RNase消化法制备并纯化了采自山东东昌湖野生鲤（Cyprinus carpio haematopterus）的肝脏及性腺线粒体DNA,用7种限制性内切酶对其mtDNA进行酶解,经琼脂糖凝胶电泳分离酶解片段,用Gel-5000凝胶图像分析系统进行采集和分析。结果显示,东昌湖野生鲤的mtDNA分子大小为（16.62±0.15）kb,BglⅠ、BglⅡ、EcoRⅠ、HindⅢ、PstⅠ、KpnⅠ和BamHⅠ的酶切点分别为3或2、1、3或4、4、1、0、3;其中,BglⅠ、EcoRⅠ和BamHⅠ     

不同倍性鲫鲤MeCP2基因分子克隆及时空表达分析

为了探寻不同倍性鱼生殖育性的表观遗传调控规律,实验基于不同倍性鲫鲤精巢的转录本信息库设计引物克隆了不同倍性鲫鲤的MeCP2基因。序列比对结果发现,在远缘杂交的过程中基因组发生了遗传重组和变异。基于序列公共部分设计引物,通过半定量PCR和实时定量PCR的方法分析了MeCP2基因在不同倍性鱼发育过程中的时空表达特征。结果还发现,MeCP2基因在所有组织中都有表达,但在脑组织中的表达量最高;纵向对比性腺的发育过程,MeCP2基因的表达量会随着性腺发育成熟而下降;横向对比不同倍性鱼的性腺发育,MeCP2基因在三倍体鱼卵巢中的表达量明显高于二倍体和四倍体鱼,但在精巢中的表达量随鱼的倍性增加而增加。研究表明,MeCP2基因的表达与不同倍性鱼的卵巢发育密切相关,这为研究鱼类生殖不育的分子机理及其在水产育种上的应用奠定了坚实的基础。     

异源三倍体鲫的引进养殖试验

异源三倍体鲫是由浙江宁波大学采用细胞和有性杂交高新技术获得异源二倍体受精卯，然后对其进行处理得到异源四倍体鲫个体，经多代自然繁育，遗传性状稳定，具有正常生殖能力，把它们与普通的二倍体鲫进行正常人工授精培育出三倍体鲫。2004年我们在兖州市新充镇薛庙渔场开展了异源三倍体鲫的引进繁育和养殖试验，获得成功，现将试验情况总结如下：     

鲇鱼线粒体DNA的酶切图谱

采用差速离心法及ＤＮａｓｅⅠ、ＲＮａｓｅ消化法制备并纯化了鲇（Ｓｉｌｕｒｕｓａｓｏｔｕｓ）肝脏线粒体ＤＮＡ（ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＤＮＡ，ｍｔＤＮＡ）。用８种限制性内切酶对ｍｔＤＮＡ进行了分析。ＢｇⅡ、ＥｃｏｒⅠ、ＰｓｔⅠ、ＢｇｌⅠ、ＢａｍＨⅠ、ＸｂａⅠ、ＨｉｎｄⅢ、ＸｈｏⅠ在鲇ｍｔＤＮＡ分子上分别具１、１、１、２、２、７、７和０个切点。ｍｔＤＮＡ分子量约１０．８４×１０￣６道尔顿，大小为１７．５４ｋｉｌｏｂａｓｅｐａｉｒｓ。根据单酶和双酶解片段的数目和分子量，建立了鲇ｍｔＤＮＡ的限制性酶切图谱。     

红鲫(♀)×湘江野鲤(♂)F_2和F_3的染色体研究

采用血细胞培养制片法和肾脏细胞直接制片法对红鲫 (♀ )×湘江野鲤 (♂ )杂交种F2 和F3 代的染色体数目和核型进行了比较分析 ,得出F2 代染色体数目为 10 0条 ,染色体组型为 :2 2m 34sm 2 2st 2 2t ,NF =156;F3代染色体数目为 4n =2 0 0 ,染色体组型为 :4 4m 68sm 44st 44t ,NF =312。为证明红鲫×湘江野鲤杂交后代由异源二倍体转变为异源四倍体发生于F2 与F3代之间提供了直接证据。     

我国六个地区银鲫种群线粒体DNA多态性的研究

本文用一对引物对我国６个地区银鲫进行ｍｔＤＮＡ－ＮＤ５／６片段的ＰＣＲ扩增,扩增产物用６种限制性内切酶进行限制生片段长度多态性分析。共获得１１种图谱和７种限制性类型。根据各群体间的遗传距离构建了ＵＰＧ聚类关系图。结果表明,６个银鲫种群中,云南群体与贵州群体的关系以及黑龙江与安徽群体之间的关系最近,它们分别归为一个群体;河南群体相对独立,它与黑龙江和安徽群体的遗传关系较近,江西群体与各群体间的亲缘关     

方正银鲫、白鲫与鲫线粒体DNA限制性内切酶酶切比较

用 Bam HI、Eco RI、Dra I、Hinf I、Hind III、Hpa II、Msp I、Pst I、Sau 3AI、Sma I、Xba I、Xho I和 Sal I等十三种限制性内切酶对方正银鲫(Carassius aur-atus gibelio)、白鲫(Carassius auratus cuvieri)和鲫(Carassius auratus auratus)的线粒体 DNA(mt DNA)进行单酶酶切以及其中八种识别六碱基对序列的限制性内切酶的双酶酶切,经琼脂糖凝胶电泳后,分析且计算出各酶切片断大小,得出三种鲫鱼的 mt DNA分子大小:方正银鲫为 15990±90碱基对(bp);白鲫为 16600±130碱基对(bP);鲫为 15540±140碱基对(bp),并且分别建立了方正银鲫、白鲫和鲫 mt DNA由 Bam HI、Pst I、Eco RI 及 Xba I等四种限制性内切酶构建的酶切图谱。     

条纹斑竹浙江省鲨线粒体DNA的研究

用６种限制性内切酶分析了４条条纹斑竹鲨的线粒体ＤＮＡ，ＰｓｔＩ，ＨｐａＩ，ＸｂａＩ，ＥｃｏＲＩ，ＥｃｏＲＶ，ＢｇｌⅡ在条纹斑竹鲨ｍｔＤＮＡ分子上分别具有０至２个切点，ｍｔＤＮＡ分子大小为１６．６ｋｂ，根据单酶和双酶完全酶解片段的大小，构建了条纹斑竹浙江省ｍｔＤＮＡ的限制性酶切图谱。     

鲇（Silurus asotus L．）线粒体DNA的初步研究

实验共用13种限制酶分别对鲇mtDNA作酶切分析。其中，酶BamHI、Bgll和Sacl在鲇mtDNA分子上产生2个切点；BglⅡ、EcoRⅠ、PstⅠ和ScaⅠ都产生1个切点；HindⅢ和PvuⅡ分别产生5个和3个切点；XbaⅠ的切点多于5个，而ClaⅠ、DraⅠ和KpnⅠ没有切点。根据酶解结果计算出鲇mtDNA的大小     

红鲫(♀)×湘江野鲤(♂)F2和F3的染色体研究

采用血细胞培养制片法和肾脏细胞直接制片法对红鲫(♀)×湘江野鲤(♂)杂交种F2和F3代的染色体数目和核型进行了比较分析，得出F2代染色体数目为100条，染色体组型为22m＋34sm＋22st＋22t，NF＝156；F3代染色体数目为4n＝200，染色体组型为44m＋68sm＋44st＋44t，NF＝312。为证明红鲫×湘江野鲤杂交后代由异源二倍体转变为异源四倍体发生于F2与F3代之间提供了直接证据。     

东昌湖野生鲤鱼线粒体DNA RFLP分析

利用差速离心法及RNase消化法制备并纯化了采自山东东昌湖野生鲤(Cyprinus carpio haematopterus)的肝脏及性腺线粒体DNA,用7种限制性内切酶对其mtDNA进行酶解,经琼脂糖凝胶电泳分离酶解片段,用Gel-5000凝胶图像分析系统进行采集和分析。结果显示,东昌湖野生鲤的mtDNA分子大小为(16.62±0.15)kb,BglⅠ、BglⅡ、EcoRⅠ、HindⅢ、PstⅠ、KpnⅠ和BamHⅠ的酶切点分别为3或2、1、3或4、4、1、0、3;其中,BglⅠ、EcoRⅠ和BamHⅠ内切酶具有限制性多态性,多态酶比例为42.86%,并检测出12个限制性态型,可归并为5种单倍型,各单倍型间的遗传距离0.0075～0.0365,揭示了东昌湖野生鲤存在较高的种内多态性。试验结果与以前报道的其他地区鲤属线粒体DNA酶切结果相比较,表明鲤属mtDNA在限制性酶切位点数量及其长度上存在地域差异。     

条纹斑竹鲨线粒体DNA的研究

用6种限制性内切酶分析了4条条纹斑竹鲨(Chiloscyllium plagiosum)的线粒体DNA(mtDNA)。PstI、HpaI、XbaI、EcoRI、EcoRV、BaI Ⅱ在条纹斑竹鲨mtDNA分子上分别具有0至2个切点,mtDNA分子大小为16.6kb,根据单酶和双酶完全酶解片段的大小,构建了条纹斑竹鲨mtDNA的限制性酶切图谱。     

尼罗非鲫和奥利亚非鲫线粒体DNA遗传差异的研究

以酶切MitochondrialDNA（mtDNA）技术检测了尼罗非鲫和奥利亚非鲫的mtDNA。测得两种鱼线粒体基因组的大小都约为16．83kb。在使用的6种酶中，只有PvuⅡ在所检测的15尾尼罗非鲫mtDNA上产生了多态片段，3尾鱼的mtDNA产生了4个片段，12尾鱼的mtDNA产生3个片段。而6种酶在所有15尾奥利亚非鲫中均未检到多态片段。比较两种鱼的mtDNA酶切片段，仅PvuⅡ的酶切结果有所不同，尼罗非鲫mtDNA上有3个或4个PvuⅡ位点，但奥利亚非鲫mtDNA上有5个位点，因此，PvuⅡ的酶切位点可作为鉴别它们的分子遗传标记。     

尼罗非鲫和奥利亚非卿线粒体DNA遗传差异的研究

以酶切Ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ ＤＮＡ技术检测了尼罗非鲫和奥利亚非鲫的ｍｔＤＮＡ。测得两种鱼线粒体基因组的大小都约为１６．８３ｋｂ。在使用的６种酶中，只有ＰｕⅡ在所检测的１５尾尼罗非鲫ｍｔＤＮＡ上产生了多态片段，３尾鱼的ｍｔＤＮＡ产生了４个片段，１２尾鱼的ｍｔＤＮＡ产生３个片段。     

乌鳢线粒体DNA限制性内切酶酶切分析

用BamHⅠ,EcoRⅠ,HindⅡ,HinfⅠ,MspⅠ,PstⅠ,SmalⅠ,XhoⅠ,DraⅠ,SalⅠ等十种限制内切酶对纯化后的乌鳢(Ophiocephalus argus)线粒体DNA(mtDNA)进行酶切,然后用电泳技术分离酶切片段。结果表明,十种限制性内切酶只有DraⅠ,SalⅠ两种限制性内切酶有多个酶切位点,且计算出乌鳢mtDNA大小约由17200个碱基对组成。     

草鱼线粒体DNA限制性内切酶分析

本文报道了用ＢａｍＨⅠ，ＢｇｌⅠ，ＢｇｌⅡ，ＣｌａＩ，ＥｃｏＲＩ，ＨｉｎｄⅢ，ＰｖｕⅡ，ＳａｃⅠ，ＸｂａⅠ，ＸｈｏⅠ等十种限制性内切酶酶切草鱼线粒体ＤＮＡ，计算出各酶切片段长度及草鱼ｍｔＤＮＡ大小。其中六种酶有多个切点，在所检测的样品中未发现碱基替换。