重庆养殖中华鳖群体遗传多样性的RAPD分析

[目的]利用RAPD标记技术对重庆4个养殖地区中华鳖的遗传多样性进行分析。[方法]选取(潼南、永川、江津、长寿)4个地区养殖中华鳖样本,运用RAPD方法对4个地区的中华鳖遗传多样性与其遗传距离进行了分析。[结果]用20个随机扩增引物得到142个扩增片段,多态片段数量为95个,4个地区的多态位点比例范围为50.78%～64.54%,总多态位点比例为66.90%,总基因多样性为0.227,种群内基因多样性为0.135,遗传分化系数为0.307,基因流为1.127。4个养殖中华鳖群体的遗传距离为0.049～0.151。[结论]重庆4个地区养殖中华鳖遗传多样性较高,且大部分遗传变异存在于种群内,个体间亲缘关系较近,遗传变异度较小。     

中华鳖两个地理种群遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术对中华鳖2个不同地理种群(淮河群体、台湾群体)的群体遗传多样性进行分析研究。从32个ISSR引物中筛选出8个引物对2个中华鳖群体37个个体进行扩增,获得77个重复性好且谱带清晰的扩增位点,其中多态性位点47个,多态位点百分率为61.04%;2个群体的多态位点比例分别为59.57%和51.06%。Nei基因多样性分别为0.165 7和0.152 4,Shannon信息指数分别为0.216 4和0.197 7。淮河群体的遗传多样性略高于台湾群体,群体间遗传距离为0.083 7。UPGMA聚类分析显示37个个体聚成两个类群。分析结果表明2个中华鳖群体的遗传多样性相对贫乏,2个养殖群体经过较多世代的人工选育与繁殖可能形成了趋于稳定的独立遗传结构。     

柴松遗传多样性的RAPD分析

以柴松现存2个居群各50个个体为样本,利用随机扩增多态DNA(RAPD)标记研究了其遗传多样性。50条引物共扩增出349个位点,其中多态位点为321个。用POPGEN32版软件对数据进行了分析,结果表明:(1)柴松的遗传多样性水平很高。在物种水平上,多态位点百分率(PPB)为92.51%,Nei’s基因多样度指数(H)为0.317 3,Shannon多样性信息指数(I)为0.478 2,总基因多样度(Ht)为0.317 4。在居群水平上,平均多态位点百分率为89.92%,H和I平均值分别为0.302 5和0.456 6;(2)居群间的遗传分化较低。居群间遗传分化系数(Gst)为0.046 7,基因流(Nm)为10.201 8,Shannon’s居群分化系数((Isp-Ipop)/Isp)为0.045 2。表明柴松的遗传变异主要存在于居群内,占总变异的95%以上,居群间的遗传变异不足5%。并根据柴松的遗传多样性现状提出了相应的保护策略和措施。     

我国杂交粳稻恢复系的遗传多样性

对我国杂交粳稻38个恢复系进行了亲缘系数分析,并探讨了其遗传多样性.结果表明:约12％的材料间的亲缘系数(COP)值为0,COP值变异范围为0～0.75,平均值仅为0.09.经COP聚类分析供试材料可聚为4个类群:第一类群共有24个恢复系,核心亲本为C57;第二类群共有4个恢复系,都是IR8的衍生系;第三类群只有超优1...     

基于ISSR分子标记的中华鳖种群遗传多样性分析

利用简单重复序列间扩增(inter simple sequence repeat, ISSR)分子标记技术对5种中华鳖(Pelodiscus sinensis)种群的遗传多样性以及亲缘关系进行分析。结果显示：采用筛选出的10条ISSR引物对来自5个种群的中华鳖个体样本的基因组DNA进行PCR扩增,共获得123条清晰的扩增位点,平均多态性条带(PPB)比例为73.417%。5个居群的等位基因数(N_a)、有效等位基因数(N_e)、Nei’s基因多样性指数(H)、Shannon多样性指数(I)分别为1.748 0、1.417 7、0.245 5、0.370 4,其中乌鳖群体的遗传多样性水平高于其他中华鳖,淮河鳖群体的变异程度最小。5个居群总遗传多样性指数(H_t)=0.240 0±0.037 1,居群内遗传多样性指数(H_s)=0.174 7±0.021 6,基因分化系数(G_st)=0.271 9,基因流(N_m)=1.339 0。总遗传变异结果显示：有27.19%的变...     

保康野生紫薇的遗传多样性研究

利用RAPD分子标记技术对湖北保康野生紫薇的遗传多样性进行分析,结果表明,保康野生紫薇具有较丰富的遗传多样性,其平均有效等位基因数为1．7257,平均基因多样度为0．4089,平均shannon信息指数为0．5952。     

花椰菜种质资源遗传多样性分析

利用随机扩增多态性DNA标记(RAPD)技术对61份花椰菜品种进行了遗传多样性分析。从200个随机引物中筛选出10个引物,10个引物扩增的总位点数为69个,多态性位点数为44个,多态性达63.77%。UPGMA聚类分析揭示了各品种间的亲缘关系。RAPD标记说明花椰菜品种间有相同的遗传背景,但相互之间又存在一定差异。     

辣椒遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD标记对从国内外收集的灯笼椒、长椒、圆锥椒和簇生椒等1年生辣椒(CapsicumannuumL.)自交系和杂交组合的遗传多样性进行了研究.采用14个随机引物、22个参试材料共扩增出1258条带,其中多态条带比率(PPB)接近50%,表明供试辣椒之间的遗传基础较窄.D=0.69时,聚类分析将供试材料分为3类:灯笼椒,圆锥椒,第三类包括簇生椒(朝天椒)和长辣椒(牛角椒);D=0.75时,供试材料分成4类,将簇生椒和长辣椒区分开来;D=0.77时,进一步区分长椒的杂种一代和自交系.聚类分析结果表明,4个辣椒变种中,簇生椒与长椒亲缘关系较近,与圆锥椒次之,与灯笼椒最远.     

福建建瓯茅栗遗传多样性分析

利用RAPDDNA标记技术，研究了福建建瓯茅栗野生群体的遗传多样性。结果表明：茅栗多态位点百分率为53．7％，有效等位基因数目、基因多样度和Shannon多样性信息指数分别为1．6112、0．3481和0．5287。与其它植物相比，福建建瓯茅栗显示出较高的遗传多样性。     

杂交兰种质资源遗传多样性的SRAP分析

采用SRAP技术对24份杂交兰种质资源的遗传多样性进行分析。筛选出的11对引物组合共扩增出119条谱带,其中102条为多态带,多态性比率86.1%,平均每对引物组合产生9.3个多态性位点。各种质之间的相似系数变化范围为0.43~0.98,平均为0.67。UPGMA聚类分析表明:在遗传相似系数0.69处将24份供试材料划分为5个类群,较好地揭示了杂交兰种质间的遗传多样性与亲缘关系,可为杂交兰种质资源利用、杂交育种亲本选择及杂种后代鉴定提供科学依据。     

芸薹种蔬菜遗传多样性的RAPD初步分析

本文对芸薹种蔬菜基因组ＤＮＡ进行了ＲＡＰＤ初步分析,并就ＲＡＰＤ－ＰＣＲ反应条件的优化进行了探讨。结果表明：各个亚种或变种的品种之间存在着丰富的遗传多样性。     

杂交粳稻不育系的遗传多样性

为探讨粳稻遗传多样性,为粳稻不育系的改良提供依据,对我国杂交粳稻中的40个不育系进行亲缘系数分析。结果表明,约60%不育系间的亲缘系数(COP)值为0,COP值变异范围为0.00~0.75,平均值仅为0.03,大多数不育系在系谱上的遗传关系很小或无遗传关系。通过COP聚类分析,供试不育系聚为6个类群,第1个类群共有10个不育系,核心亲本为农垦58;第2个类群共有20个不育系,初步系谱分析表明,他们都是藤板5号的衍生系;第3个类群共有7个不育系,均为农垦57的后代;第4、5、6类群均仅有1个不育系,这些不育系之间以及与其他类群之间的不育系没有共同的祖先亲本。认为,粳稻不育系间系谱上的遗传差异较大,遗传多样性较高。     

中国杂交籼稻遗传多样性演变及其分析

对1981~2002年中国生产上利用的杂交籼稻组合进行分析,结果表明,1990年以后杂交籼稻的遗传多样性逐步提高,每年种植组合中的恢复系数量平均为不育系数量的2.5倍,恢复系的遗传多样性大于不育系的遗传多样性,两系杂交水稻的大面积推广丰富了杂交籼稻的遗传基础。对国内生产上利用的骨干亲本亲缘系数(COP)的分析结果显示:尽管生产上杂交籼稻的组合数量不断增加,遗传基础有所扩大,但年种植面积大于3.3×105hm2组合的亲本仍然是几个骨干不育系和恢复系,这些材料的遗传背景仍然比较单一。因此,加强籼稻种质的发掘和利用,特别是加大不育系的创新力度,对于实现杂交籼稻的可持续发展具有重要意义。     

基于RAPD的风信子遗传多样性分析

利用RAPD分子标记法,对20个风信子品种的遗传多样性以及亲缘关系进行研究。结果表明,筛选出的12条随机引物共扩增出93条指纹谱带,其中多态性条带67条,占扩增条带总数的72.0%;使用NTSYS-pc2.10对扩增出的条带进行统计分析,得到20个风信子品种的遗传相似系数及亲缘关系树状图,以遗传相似系数0.83为分界线将20个风信子品种分为2个大类,发现各品种间亲缘关系相对较近;相同色系的品种在聚类中基本聚为一类。风信子在引进栽培过程中,在环境的驯化作用下产生了一些芽变品种,这些品种提高了风信子种群遗传多样性的丰富程度。本研究通过RAPD技术对风信子种质资源进行研究,为风信子进一步创新种质资源提供了基础。     

太湖蓝藻水华污染对黄颡鱼遗传多样性的影响

利用随机扩增多态性DNA分子标记技术,对江苏太湖和安徽升金湖共4个区域的黄颡鱼种群中共192条个体进行遗传多样性的比较,并分析太湖蓝藻水华产生的藻毒素及其衍生污染物的复合污染对种群遗传结构的影响.在试验的引物中筛选出6条在PCR扩增时能得到清晰、稳定性和重复性好条带的引物,各引物扩增得到的总位点数为8～18个,多态位点比率为50.00％ ～ 100.00％,其中胥口湾黄颡鱼的多态位点比率呈现最高(86.46％),而梅梁湾黄颡鱼最低(67.71％).4个黄颡鱼种群的Shannon指数和Nei基因多样性指数大小都表现出和多态位点比率一致的趋势,即胥口湾黄颡鱼＞升金湖黄颡鱼＞东太湖黄颡鱼＞梅梁湾黄颡鱼.由此可见,即使实际距离相隔不远,不同水质环境下黄颡鱼种群的多样性已经表现出一定程度的差异,并且随着水环境污染的严重,黄颡鱼的多样性也随之降低.在水质最佳的胥口湾区域,多样性呈现最高,作为对照区域的升金湖区域,其种群多样性同样也高于污染严重区域的梅梁湾地区.总体来看,近年来太湖蓝藻水华产生的环境污染在一定程度上影响着生物多样性,因此改善环境,保护生物多样性刻不容缓.     

领春木的遗传多样性分析

利用RA PD标记对重庆5个县的濒危植物领春木居群作遗传多样性分析,扩增出总多态位点百分率为87.18％,经Shannon指数和Nei指数估算的这5个居群的遗传多样性排列次序从大到小依次为城口、南川、开县、巫溪、万盛,其大部分的遗传分化存在于居群之内,均达到80％以上．遗传矩阵和聚类分析的结果显示遗传距离的大小和地理距离的远近一致．     

领春木的遗传多样性分析

利用RAPD标记对重庆5个县的濒危植物领春木居群作遗传多样性分析,扩增出总多态位点百分率为 87.18%,经Shannon指数和Nei指数估算的这5个居群的遗传多样性排列次序从大到小依次为城口、南川、开县、 巫溪、万盛,其大部分的遗传分化存在于居群之内,均达到80%以上.遗传矩阵和聚类分析的结果显示遗传距离的 大小和地理距离的远近一致.     

生物遗传多样性和系统学研究中的RAPD分析

论述了物种遗传多样性的概念,并对随机扩增多态性ＤＮＡ分析方法的原理,特点以及应用范围进行了介绍,并对其优点和缺点进行了评论,总结了国内外这方面的研究进展,认为随机扩增多态性ＤＡＮ技术是研究生物遗传多样性的重要方法。     

5种食用菌遗传多样性的RAPD分子标记

为了探讨RAPD在食用菌遗传多样性鉴定中的应用,用RAPD方法对5种食用菌子实体和菌丝体进行研究,RAPD可在一次试验中同时观察到大量的DNA多态性片段,该方法具有简单、快速、成本低等优点。电泳分析结果表明,RAPD很明显地区分了这5种食用菌。说明RAPD不仅对食用菌遗传多样性和系统发育研究的应用前景广阔,而且在食用菌的菌株鉴定上具有很大意义。     

2个鲤鱼群体遗传多样性的RAPD分析

从50条随机引物中筛选出10条有效引物,采用RAPD技术对蒙自响水河和草坝的2个鲤鱼群体进行遗传多样性分析。结果表明:在2个群体中分别检测到47、53个位点,多态位点分别为44、51个,平均多态位点比例分别为93.61%和96.23%;利用Popgene version1.32软件分析获得2个鲤鱼群体Shannon信息指数(I)分别为0.479 9和0.455 7,Nei's基因多样性指数(H)分别为0.328 7和0.298 4,等位基因观察数(Na)分别为1.821 4和1.910 7,有效等位基因数(Ne)分别为1.584 3和1.487 9,群体间的遗传相似性系数为0.958 1,遗传距离为0.041 9。2个鲤鱼群体间的遗传分化系数Gst为0.082 4,表明群体间的遗传变异占总的遗传变异的8.24%,群体内的遗传变异占总变异的91.76%。