抗黑胫病地方烟草品种遗传多样性分析与评价

为了拓宽黑胫病抗性育种亲本材料的遗传背景以及充分发掘和利用地方品种的抗病基因资源,本研究利用筛选获得的25对SSR引物对35份抗黑胫病地方烟草品种进行了亲缘关系聚类分析和遗传多样性分析。结果表明:(1) 25对SSR引物共检测到85个多态性位点,聚类分析结果表明35份地方烟草品种的遗传相似性系数分布范围为0.57~0.87;(2)在遗传相似性系数为0.57时,可以将35份抗黑胫病地方烟草品种分成两个类群,A类包括20份烤烟品种,B类包括15份晒烟品种。在遗传相似系数0.62烤烟分为2个类群,晒烟分为3分类群;(3)在抗黑胫病地方烟草品种中观测等位基因数的平均值为3.32个;有效等位基因数的平均值为2.651;观测杂合度的平均值为0.395;期望杂合度的平均值为0.596。平均Nei’s基因多样性指数(H)为0.558,平均Shannon’s指数(I)为1.020。不同地方的抗黑胫病烟草品种间具有一定的遗传差异,品种之间具有较高的遗传多样性,且品种间的亲缘关系和品种的地理来源之间具有一定的相关性。     

国外甘蓝型油菜种质资源农艺性状和品质性状的聚类分析

利用系统聚类法,对117份国外甘蓝型油菜种质资源的10个农艺性状和4个品质性状进行聚类分析,研究其遗传亲缘关系,合理利用品种资源.结果表明:117份材料分为2个类群,分别包括71个和46个品种(系).第Ⅰ、Ⅱ类群又分别分为6个和7个亚类群,第Ⅰ-1、Ⅰ-2亚类群各再分为7个品种群,第Ⅱ-2、Ⅱ-6亚类群分别再分为5个和3个品种群.第Ⅰ类群的品质较好,芥酸含量平均为4.3%,6个亚类群间农艺性状有较大差异,而第Ⅱ类群品质较差,7个亚类群闻差异较小.从中发现了长英、大粒、早熟和角密等特异材料.     

甘蓝型油菜种质资源的农艺性状聚类分析

利用系统聚类法,对84份国内甘蓝型油菜种质资源的10个农艺性状进行聚类分析,研究其遗传亲缘关系,合理利用品种资源,结果表明:84份材料分为4个类群,其中,第Ⅱ类群有75个品种(系),又可分为2个亚群,第Ⅱ-1、2亚群可再分为3个和4个品种(系)组.4个类群的农艺性状有较大差异,第Ⅱ-2亚类群生育期较短,但单株产量最高.从中发现了长荚、大粒、早熟和角密等特异材料.     

地方甘薯资源的形态聚类分析

根据通用的甘薯鉴定性状及其生长期记载标准,利用系统聚类法,对省内收集的15个甘薯品种(系)进行27项形态标记记载并聚类分析,研究其遗传亲缘关系,以合理利用品种资源.结果表明:所有供试材料分成两个类群,品种群Ⅰ包括13个品种,分成两个亚群;品种群Ⅱ可包括2个品种,分成两个亚群.     

湖北省水稻区试两系不育系指纹图谱构建及遗传相似性分析

为评价2015年湖北省水稻区试两系不育系材料的遗传相似性并构建其指纹图谱,利用48个SSR分子标记对15份参试品种及6个代表性对照品种进行分析,筛选出12对扩增稳定、多态性好并分布均匀的SSR引物,共检测到47个等位基因(Na),每个标记平均检测到3.9个,每标记多态性信息含量(PIC)平均值为0.64,利用这12个引物为核心标记构建了供试材料的指纹图谱;聚类分析结果表明,15份参试品种与6个对照品种在相似系数0.66左右分为6个类群,其中6个品种与广占63-4S均归于三类群,占参试品种的40%,此外,四类群的3个品种还与三类群同属一个亚类群;其余6个品种分别与Y58S、农垦58S以及珍汕97A归于同一类群。因此,聚类分析结果表明参试品种表现出了背景来源单一、亲缘关系较近的趋势。本研究结果有助于湖北省水稻两系不育系资源利用、创新与引进,持续提高水稻育种水平。     

应用SRAP与ISSR分析烟草种质资源遗传多样性及遗传演化关系

应用ISSR与SRAP两种分子标记,研究国内外96份烟草种质的遗传多样性及不同栽培类型种质的遗传演化关系。表明烟属种间具有丰富的遗传多样性,种间的遗传相似性(GS)在0.28~0.58之间,遗传分化系数(Gst)为0.83。普通栽培种品种间遗传多样性水平较低,品种间的遗传相似性在0.61~0.99之间,栽培种内的遗传多样性为烤烟>晒晾烟>白肋烟>香料烟。当相似系数在0.67作切割线时,基于2种标记的96份烟草种质资源的聚类结果为,(1)普通烟草栽培品种材料91份聚在同一大类,而黄花烟、黏烟草、浅波烟草、哥西氏烟草、香甜烟草5个种也分别为单独的个类,同普通烟草栽培种类群完全区别开来;(2)从进化上看,烤烟和晒晾烟间的遗传进化关系最近,香料烟和黄花烟之间的亲缘关系较远;普通烟草栽培种中国内外来源的烟草品种亲缘关系极其相近,遗传分化现象甚微;(3)2种分子标记虽然原理不同,但分析结果趋势相近(r=0.68,P=1.000)。     

利用RAPD分析云南野生荞麦资源的多样性和亲缘关系

利用筛选出的19个随机引物对云南荞麦资源的9个种、1个变种、2个亚种的26份材料进行RAPD扩增反应,共获得162条DNA扩增带,其中多态性带153条,多态性带的比率平均为94．8％。Nei氏相似性系数的分析结果,荞麦种间平均相似系数为0．411,种内平均相似系数为0．786,表明云南荞麦资源种间比种内具有更丰富的多样性;聚类分析的结果,26份供试资源聚为3大类群：第Ⅰ大类群是小粒种类群,第Ⅱ大类群是甜荞类群,第Ⅲ大类群是苦荞类群,结合3大类群的特点,可以认为F．cymosum与F．esculentum的亲缘关系比与F．tataricum的更近;F．tataricum和F．tataricum ssp．potanini与供试的其它荞麦资源之间的亲缘关系比较远;红花F．urophyllum与白花F．urophyllum之间的亲缘关系也比较远,红花F．urophyllum很可能是一个新的生态类型。     

无核葡萄种质亲缘关系的SRAP研究

为充分了解及更合理地利用无核葡萄的种质资源,辅助无核葡萄育种,本研究采用SRAP分子标记技术,对23 个国内外主流无核葡萄品种的种质亲缘关系进行分析。结果表明：从45 对SRAP引物中筛选出38 对多态性引物,共扩增出236 条谱带,其中171 条为多态性谱带,多态性谱带百分率为72.4%。遗传相似分析显示,供试材料间遗传相似系数的变化范围为0.58~0.90,遗传距离在1.0313~4.9643 范围内变化。在遗传相似系数为0.61 处,可将供试材料分为2 个大类群,在相似系数为0.66 处,Ⅰ类群和Ⅱ类群均可分为2个亚群。说明23个品种总体来讲亲缘关系较远,特别欧美杂种具有较高的遗传多样性,部分欧亚种品种间亲缘关系较近,杂交育种时应注意亲本选择。     

烟草种质资源黑胫病抗性鉴定及亲缘关系SSR分析

黑胫病是烟草大田生产的主要病害之一。烟草种质资源抗病性的筛选、鉴定和亲缘关系分析是抗病育种的基础。利用黑胫病1号生理小种对49份种质资源进行了抗病性鉴定,并利用SSR分子标记进行了遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明:24份材料表现为抗黑胫病,其中大叶永烟、G80、E9、MS212-8的抗性比较好;7份材料表现为中抗黑胫病;中感黑胫病和高感黑胫病材料共6份;12份材料表现为感黑胫病。49份烟草种质资源的平均有效等位基因数为3.06(1.31),平均Shannon’s信息指数为1.18(0.36)。23对SSR引物在遗传相似系数为0.66时将49份材料分为4个类群,第Ⅰ类群为抗病材料K326;第Ⅱ类群包括6份材料;第Ⅲ类群为4份感病材料;第Ⅳ类群包括38份材料。抗病材料主要集中在第Ⅳ类群,其遗传背景狭窄。     

33份烤烟品种亲缘关系的SSR分析

本研究利用分布于烟草全基因组24条连锁群上的48对SSR引物,并对33份烤烟品种的亲缘关系进行分析。结果显示:在48个SSR基因座位上共检测获得302个等位基因,每个SSR标记可检测的等位基因数为2~13个,平均6.29个;引物的多态信息含量(PIC)为0.401~0.738,平均0.549,鉴别能力较好;33份烤烟品种间遗传相似性系数(GS)变化范围为0.84~0.96,平均为0.90,表明33份烤烟品种间的遗传差异较小,亲缘关系相对较近。SSR聚类分析表明:在GS分别为0.894和0.910时可清晰地将美国引进及合作选育的27份品种与国内主栽品种区分开,其中,NC-YATAS-7与红花大金元之间及NCT8、NC-YATAS-8与云烟85、云烟87之间的遗传差异性较小,其他24份品种与国内主栽品种间存在一定的遗传差异性。10份合作选育品种和14份引进品种对丰富国内烤烟新选育品种和种质资源的遗传多样性具有重要意义。