红锥天然群体和栽培群体的遗传多样性研究(英文)

[目的]调查红锥天然群体和栽培群体的遗传分化状况。[方法]以广东、广西、福建、云南、海南的5个红锥天然群体和广西的3个种源的红锥栽培群体为供试材料,用筛选出的9对ISSR引物,对8个群体共计151个个体进行ISSR分析。[结果]每对ISSR引物扩增出7～20条条带,共得到122条多态带。红锥天然群体在种群水平的多态带百分率P为59.84%,Nei基因多样性指数Hpop为0.1827,Shannon多样性指数(I)为0.2856,高于红锥栽培群体(P=54.87%,HPOP=0.1366,I=0.2198)。群体特异带及群体间共有带的差异与分布揭示了群体间的遗传差异及相似性,红锥天然群体遗传多样性主要存在于群体内,群体间的遗传分化系数Gst为0.99。在红锥的3个栽培群体中发现了类似的群体遗传结构(GST=0.1275)。UPGMA聚类分析结果表明,红锥天然群体间的遗传距离有随地理距离跨度增加而递增的趋势。[结论]红锥遗传多样性偏低可能与人为干预和环境破坏导致的种群缩小及生境片段化等因素有关;红锥种群遗传结构的形成则与其自身繁育机制密切相关。     

优良红锥种质资源遗传多样性的ISSR分析与聚类

利用ISSR分子标记对来自10个不同生态地区的红锥优良种质进行基因组遗传多样性分析.从20条引物中筛选出11条具有扩增多态性的引物用于ISSR-PCR扩增,共扩增出435条带,其中多态性条带325条,占总扩增条带的74.7%,平均每个引物扩增3.95条.ISSR标记分析揭示出红锥10个优良种质的遗传相似系数介于0.473 7~0.808 1之间,平均值为0.728 7.用STATIS统计软件的欧氏可变类平均法构建类型之间的分子系统树,聚类分析结果将10个优良红锥种质分为4个类群.     

利用rbcL基因序列比对分析广西优质红锥种质资源的遗传多样性

通过PCR扩增得到10个红锥品系的rbcL基因全序列,均为1.513 kb.核苷酸序列比对结果表明,在256-1 455 bp区间10个红锥品系共有16处碱基发生变异,变异率为1%,其中在306 bp和634 bp处10个红锥品系较同属对照castanopsis lucida均发生相同的变异,可以看作属内进化信息碱基.对表达的氨基酸序列进行比对分析,发现16处碱基变异共引起8处氨基酸序列变异.     

茄子主要栽培种遗传多样性分析

为了明确我国茄子主要栽培种的遗传背景,对主要来自广西及全国部分地区的54份茄子栽培种进行表形标记和ISSR标记分析.结果表明,在37个表形性状中,表现为多态性有33个,占89.18％;从50条ISSR引物中共筛选出8条多态性明显、条带清晰、反应稳定的引物,扩增出68条谱带,平均每条引物扩增出8.5条带,多态性带58条,占85.29％;品种间两类型标记遗传相似系数均在0.04 ～1.00之间,总体平均数分别为0.51、0.60,表明个别品种间遗传差异很大,但群体整体遗传基础相对较狭窄;应用SPSS软件聚类分析,两类标记均能在欧氏距离14～15间将54个栽培种划分为6个类群,其中表形标记类群的划分与地理来源有一定关系,而分子标记类群的划分与地理来源没有明显的联系.     

羽衣甘蓝DH群体遗传多样性分析

由羽衣甘蓝基因型"名古屋-红"和基因型P3(Q2704×Q4606的F1代)通过小孢子培养获得的2个DH群体中分别抽取46个DH系和41个DH系作为试验材料,利用ISSR标记分别对2个DH群体进行遗传多样性分析。9个ISSR引物分别扩增出104和87个多态性位点,其中多态性位点各占总扩增位点的81.73%和79.31%,大小在100～2 000 bp;每个位点的有效等位基因数分别为1.225 3和1.468 9;平均多样性指数PIC分别为0.258 9和0.409 4。对ISSR结果进行聚类分析,2个DH群体各DH系间相似系数范围分别为0.61～0.97和0.56～0.91,在相似性系数为0.78处可将46个"名古屋-红"的DH系分成5组,在相似性系数0.75处可将41个P3的DH系分成5组。以上结果表明,通过小孢子培养获得的DH群体内出现较大分离,且群体内遗传多样性丰富,且在不同DH群体遗传多样性不同。     

鄂西地区青蒿遗传多样性研究

利用RAPD和ISSR分子标记技术对11份鄂西野生青蒿种质进行了遗传多样性研究.结果表明,筛选出的8条RAPD和8条ISSR引物分别产生86条和102条扩增带,其中多态性条带分别为53条和62条,分别占总数的61.63%和60.78%.用POPGENE对两种标记方法的遗传多样性进行计算.有效等位基因数分别为1.355 2和1.370 7,基因多样性为0.2110和0.214 3,Shannon信息指数为0.318 8和0.321 6.以Nei氏遗传距离矩阵按UPGMA方法聚类分析RAPD和ISSR标记的遗传距离分别为0.035 5～0.411 3和0.142 3～0.401 1,平均值各为0.228 8和0.233 8,表明青蒿种质具有比较丰富的遗传变异,同时也说明,尽管Mantel相关性检测两种标记方法相关性较低(r=0.543 9,P0..05).但都可以有效地揭示青蒿种质的遗传多样性状况.     

应用ISSR标记研究黑麦属植物遗传多样性

对黑麦属(Secale L．)4个种8个亚种共16份材料进行了ISSR标记分析。结果表明。被测材料间ISSR标记多态性较高。35个ISSR引物中。有7个引物(占20％)可扩增出清晰的且具多态性的条带。7个引物共扩增出269条带，其中229条(占85．1％)具有多态性，每个引物可扩增出17～70条多态性带．平均32．7条。ISSR标记遗传相似性系数(GS)变异范围为0．478～0．935，平均值为0．732。聚类分析表明，16份材料可聚为5类。其中S．sylvestre与其它材料问的遗传分化最大，单独聚为一类。据此认为，ISSR标记可以有效地评价黑麦属植物遗传多样性，并可为黑麦属系统学研究提供分子证据。     

西施舌不同群体遗传多样性ISSR分析

利用ISSR分子标记技术分析西施舌种群的遗传多样性和遗传分化.用17个引物对江苏赣榆(GY)、启东(QD)及福建长乐(CL)3个种群共68个个体进行扩增,共测到236个位点,其中多态位点234个,每个引物扩增条带数为8～20之间,片段长度200～3 000 bp;GY、QD和CL各种群的多态位点百分率(PPL)分别为94.92%、86.86%和90.25%;GY、QD和CL种群的Shannon's信息指数分别为:0.541 9、0.491 8和0.489 5;Nei's基因多指数分别为:0.370 0、0.336 1和0.330 1;西施舌各种群均具有较高的遗传多样性水平;聚类分析显示GY群体和QD群体先聚一起后,再与CL群体构成姐妹支.     

红菜薹种质资源遗传多样性ISSR分析

对47个红菜薹(Brassica campestris ssp. chinensis var. purpurea)种质进行了基于ISSR分子标记的遗传多样性分析。从20条随机引物中筛选出10条重复性好,条带清晰的引物,通过ISSR-PCR扩增后,共检测到83个位点,平均每引物扩增出近8个位点,其中多态性位点有80个(96.39%)。扩增产物片段大小都在100～2 000 bp,相似系数在0.47～0.90。当相似系数在0.72时,可将47份红菜薹资源分为7类。等位基因数平均多样性指数(I)为0.481 0;基因多样性0.322 2;每个位点的等位基因数1.975 9;有效等位基因数(Ne)为1.559 9。红菜薹具有丰富的遗传多样性。研究为净化红菜薹同名异种、同种异名的市场乱象,确定红菜薹种质资源相互之间的亲缘关系提供了理论支持,也为红菜薹资源的利用和育种提供了分子生物学依据。     

紫锥菊遗传多样性的SRAP分析

采用SRAP分子标记技术,对14份引种紫锥菊材料的遗传多样性进行分析。结果显示,9对SRAP引物组合扩增出171条带,多态性比率为80.7%,说明SRAP可应用于紫锥菊种内遗传多样性分析;聚类分析表明紫锥菊样品间的亲缘关系与种质来源地存在一定的相关性。     

红锥、白椎、大叶栎3个树种分子鉴定及亲缘关系的ISSR分析

[目的]进行红锥、白椎、大叶栎3个树种分子鉴定。[方法]利用ISSR-PCR方法构建红锥（Castanopsis hystrix）、白椎（Castanopsis carlesii Hayata）、大叶栎（Quercus griffithii Hook）3个树种的DNA指纹图谱,根据各个体的Nei氏遗传距离矩阵,利用UPGMA法进行聚类分析。[结果]从50个ISSR引物中筛选出6个多态性引物用于正式扩增,共扩增出86条DNA带,平均每个引物扩增的DNA带的数目为10.75条,多态性条带数目为53条,占总条带数的61.2%。其中,有5个引物扩增出差异条带和特异条带,并分别能准确地鉴定上述3个树种。应用DPS软件计算供试材料遗传距离界于0.16667～0.80952之间,平均为0.56357。[结论]ISSR-PCR方法可以解决红锥、白锥、大叶栎的鉴定问题。     

红锥、白椎、大叶栎3个树种分子鉴定及亲缘关系的ISSR分析

[目的]进行红锥、白椎、大叶栎3个树种的分子鉴定研究。[方法]利用ISSR-PCR方法构建红锥（Castanopsis hystrix）、白椎（Cas-tanopsis carlesii Hayata）、大叶栎（Quercus griffithii Hook）3个树种的DNA指纹图谱,根据各个体的Nei氏遗传距离矩阵,利用UPGMA法进行聚类分析。[结果]从50个ISSR引物中筛选出6个多态性引物用于ISSR-PCR扩增,共扩增出86条不同DNA带,平均每个引物扩增的DNA带的数目为10.75条,多态性条带数目为53条,占总条带数的61.2%。其中,有5个引物可扩增出差异条带和特异条带,能准确地鉴定上述3个树种。应用DPS软件计算供试材料的遗传距离界于0.166 67～0.809 52之间,平均为0.563 57。[结论]ISSR-PCR方法可以解决红锥、白锥、大叶栎的鉴定问题。     

福寿螺3个地理群体遗传多样性的ISSR分析

[目的]探讨我国不同地区福寿螺的遗传多样性和遗传结构。[方法]应用ISSR分子标记技术对我国江苏苏州、福建漳州、广东珠海3个不同地理群体福寿螺的遗传多样性和遗传结构进行了分析。[结果]从77个ISSR引物中筛选出3个引物对福寿螺3个群体60个样品进行扩增,得到33个清晰的扩增位点,多态位点为31个。江苏、福建和广东3个福寿螺群体的Shannon′s指数分别为0.353 6、0.424 70、.279 6,由此分析,其遗传变异主要来自于群体内个体间。福寿螺UPGMA聚类图显示,广东群体和福建群体首先聚在一起,再与江苏群体聚类。3个群体的遗传多样性处于相同水平上,且遗传多样性高低依次为福建群体>江苏群体>广东群体。[结论]3个地区福寿螺群体产生一定的遗传分化,表明福寿螺具有广适性的遗传特性。     

广西马尾松天然林古蓬和浪水种源群体遗传多样性ISSR分析

从100个ISSR引物中筛选出10个多态性引物,对广西古蓬和浪水两个种源区的马尾松天然林5个群体共85份样品进行遗传多样性分析,古蓬种源三个群体47份样品共检测到192个位点,其中多态位点数为177个,浪水两个群体共38个样品检测到168个多态位点.对两个种源区的马尾松群体ISSR分析数据采用POPgene 32软件进行分析,结果表明:古蓬马尾松天然林群体内,总的多态位点百分率(P)为94.35%.总的Shannon信息指数(I)为0.4278,Nei''s基因多样度指数(h)为0.2765;浪水种源马尾松群体内,总的多态位点百分率(P)为94.38%,总的Shannon信息指数(I)为0.5190,Nei''s基因多样度指数(h)为0.3510;这表明马尾松天然林群体内遗传多样性水平高,个体闻基因多样性变异大.古蓬马尾松群体间的基因分化系数(Gst)为0.0481,浪水的为0.0363,这表明分别有95.19%和96.37%的变异存在予群体内;古蓬3个群体的基因流为9.8877,浪水两个群体的基因流为13.2643,这表明本研究分析中的种源内群体间存在比较高的近亲交配现象,因此有必要加大对马尾松天然林的保护力度,扩大天然林的保护范围.     

广西地方玉米种质和加拿大群体的遗传多样性分析

 【目的】分析45份广西地方玉米品种和15份加拿大改良群体的遗传多样性,为更好地利用地方品种拓宽广西玉米种质的遗传基础提供理论依据。【方法】采用混合取样法（每个群体中随机提取4个混合样本,每个样本包括10个单株）和SSR分子标记技术进行研究。【结果】70对SSR引物在60个群体的240份样本中扩增出245条等位基因,每对引物检测出的等位基因数目为2～6条,平均每个位点3.5条。加拿大的15份群体和广西的45份地方品种分别聚为二大类群。加拿大的15份群体又可以分为硬粒型和马齿型两个亚群。在45份广西地方种质中,同样可以分为硬粒型和马齿型两个亚群;糯玉米没有单独聚类,而是分散在硬粒型类群当中。【结论】广西亚热带种质比温带的加拿大种质具有更大的遗传变异,研究这些材料的遗传多样性可更好地扩增广西玉米种质的遗传基础,对玉米育种中发现潜在突破性种质可能会起到一定的作用。     

12份樱桃品种遗传多样性的ISSR分析

本试验采用ISSR技术对12份樱桃种质资源的遗传多样性进行了研究。筛选出6条ISSR引物对供试材料进行扩增,共检测到48个遗传位点,包含44个多态性位点,多态性位点百分率为91.67%。材料间遗传相似系数为0.29~0.98,平均为0.65。当阈值为0.58时,供试样品可分为3个组,即组Ⅰ、组Ⅱ和组Ⅲ。遗传相似性分析结果显示材料间具有丰富的遗传多样性。     

Evaluation on Genetic Diversity of Hybrid Parents Developed in Brassic napus

Genetic diversity of 50 Brassic napus varieties including 21 sterile lines, 16 restorer lines and 13 check cultivars was estimated by SSR and ISSR. The UPGMA results showed that 50 Brassica napus varieties were divided into 4 groups. The restorer lines tested were classified into groupsⅠ-Ⅲ respectively. The sterile lines tested were classified into groupⅣ. In addition, the sterile lines could be further divided into two subgroups: except 1471AB, all genic male sterile lines were in subgroupⅠ, 1471AB and all cytoplasmic male sterile lines were in the subgroupⅡ. The UPGMA results also indicated that the restorer lines had more genetic diversity than the sterile lines.     

Genetic Diversity of Natural Myrica rubra Sieb.et Zucc Populations in Guangxi Revealed by ISSR Markers

The present study was conducted to assess the molecular characterization and genetic diversity amongst natural populations of Myrica rubra in Guangxi Zhuang Autonomous Region, China, thus to provide scientific evidence for germplasm conservation and exploitation. Using ISSR （inter-simple sequence repeats） markers, the level of genetic variation and the molecular characterization of 10 natural populations of M. rubra, originated from Guangxi Zhuang Autonomous Region in China, were performed. Based on 11 primers, 123 clear and reproducible DNA fragments were generated, of which 95 （77.24%） were polymorphic. The average value of Nei＇s gene diversity （He） was 0.268. The coefficient of genetic differentiation （Gst） was 0.341, revealing that 34.1% of the total molecular variance existed among populations. The Mantel statistical testing showed that the genetic distance was correlated to the geographic distance, but the correlation was not significant. Ten populations were divided into two big clusters according to unweighted pair group method with arithmetic mean （UPGMA） analysis. One consisted of populations of Rongxian （RX）, Hepu （HP）, Liangqing （LQ）, Marshan （MS）, Lingshan （LS） and Shansi （SS）, which originated from the southern Guangxi, while the other was composed of Guanyang （GY） and Lingui （LG） populations of northern Guangxi, Huanjiang （HJ） populations of northwestern Guangxi and Shanglin （SL） populations of southern Guangxi. The level of genetic variation in wild M. rubra population distributed in Guangxi is high. Gene drift within the population was responsible for genetic variation in wild M. rubra in Guangxi, and the effect of the genetic flow among inter-populations was not significant. Classification of wild M. rubra populations was correlated to climate and environment. The molecular characterization and diversity assessment of M. rubra is of immense value for planning conservation of its genetic resources and their exploitation for further studies.