苹果茎沟病毒外壳蛋白基因的克隆、表达及其生物信息学分析

从中国苹果寄主上分离苹果茎沟病毒(Apple Stem Grooving Virus,ASGV),克隆并表达外壳蛋白(Coat Protein, CP)基因,并进行生物信息学分析。利用RT-PCR从苹果寄主上克隆了苹果茎沟病毒外壳蛋白基因,序列测定后构建了原核表达载体pET30a(+),转化大肠杆菌(Escherichia coli)进行原核表达。分析比较苹果茎沟病毒外壳蛋白基因核酸序列,分析并预测苹果茎沟病毒外壳蛋白的结构和性质。克隆,表达了苹果茎沟病毒外壳蛋白基因。序列分析显示本研究ASGV CP开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)全长714个核苷酸,与其他分离物CP基因核酸同源率为88.80%～91.90%,与来自日本苹果的P-209进化关系最近。ASGV CP是由237个氨基酸残基组成的27.13 kD蛋白,等电点PI为7.67的疏水性,非跨膜蛋白。二级结构由7个α-螺旋,5个β-片层和无规则卷曲构成。三级结构由于缺少同源蛋白而无法预测。本研究成功诱导表达了ASGV-CP蛋白,分析了ASGV-CP的核酸序列和进化关系,蛋白性质和蛋白结构,为进一步的功能研究和检测应用奠定了基础。     

苹果茎沟病毒RT-PCR检测技术

用苹果的叶片作为材料,研究比较了两种提取苹果总RNA方法的效果,确定了较好的提取方法。根据苹果茎沟病毒外壳蛋白基因设计引物,通过RT-PCR扩增在苹果叶片总RNA样品中获得了524 bp的特异片断,通过对该片段的序列分析与苹果茎沟病毒外壳蛋白基因源序列比较,其同源性高达93%。通过多次重复实验验证,该方法能很好地检测苹果茎沟病毒。     

苹果茎沟病毒外壳蛋白抗体制备与应用

从苹果寄主上分离得到了苹果茎沟病毒(Apple stem grooving virus,ASGV)中国株系。经基因克隆,测序后发现苹果茎沟病毒中国株系外壳蛋白基因(coat protein,CP)含有714个核苷酸,编码表达由237氨基酸残基组成的27 ku蛋白。通过构建含有ASGV-CP基因的重组表达载体pECASGV-CP,在大肠杆菌BL21 (DE3)中成功表达ASGV-CP蛋白。SDS-PAGE显示其分子质量与预计大小一致。利用纯化的重组蛋白制备多克隆抗体。该抗体可用于Western blot和DAS-ELISA检测技术。基于血清学检测,发现陕西苹果主产区ASGV发生普遍。     

基于高通量测序的技术检测梨树病毒

【目的】 研究运用基于高通量测序的技术检测梨树病毒,为梨树病毒的检测提供新方法。【方法】 于2014年、2017年、2018年4月中旬采集库尔勒香梨花朵若干,分别进行转录组测序,将得到的序列经过转录本拼接、层次聚类和基因功能注释,筛选出注释为植物病毒的序列作为候选病毒序列。利用RT-PCR方法检测随机采集的香梨枝条样品,验证高通量测序结果的可靠性。【结果】 根据3组转录组测序数据的生物信息学分析结果,分别对注释为来源于植物病毒的66、202和921条基因序列进行分析。3种梨树中已报道的病毒,分别是苹果茎痘病毒、苹果茎沟病毒和苹果褪绿叶斑病毒,以及梨树中未报道的芸薹黄化病毒。采用设计的特异性引物,通过RT-PCR技术对筛选出的4种病毒进行扩增验证,结果扩增出苹果茎痘病毒和苹果茎沟病毒的目的片段。【结论】 高通量测序技术可作为检测梨树病毒的一种快速、有效手段。     

3种苹果潜隐性病毒一步多重RT-PCR检测体系的优化

为建立更为快速准确的苹果潜隐性病毒检测方法,以携带苹果茎沟病毒(ASGV)、苹果褪绿叶斑病毒(ACLSV)和苹果茎痘病毒(ASPV)的田间苹果成龄树为试材,设计合成了扩增目的片段为273 bp(ASGV)、358bp(ACLSV)和432 bp(ASPV)的3对特异性引物,并对影响RT-PCR体系的主要参数进行试验优化.结果表明:建立的一步多重RT-PCR体系可以实现对3种主要潜隐性病毒的特异性检测;通过对田间多个样品的检测验证,表明该方法的准确性和灵敏度都很高,并缩短了单个样品的检测时间,极大地提高了工作效率.     

我国苹果病毒病的研究现状

我国从1978年开始对苹果病毒病进行系统研究,目前初步明确了我国苹果主产区主要病毒病的种类及特性,在病毒检测方面也取得了很大进展。介绍了我国苹果上主要病毒的特性,这些病毒包括苹果花叶病毒（ApMV）、苹果锈果类病毒（ASSVd）、苹果绿皱果病毒（AgrCV）、苹果褪绿叶斑病毒（ACLSV）、苹果茎痘病毒（ASPV）和苹果茎沟病毒（ASGV）;阐述了这些苹果病毒病所采用的技术,包括指示植物、电子显微镜技术、血清学方法、分子生物学技术等。     

北京地区梨树主要病毒和类病毒检测

为了评估北京地区梨园健康状况并明确梨树感染病毒和类病毒的主要种类,本研究利用RT-PCR对北京市重要梨果生产区的157份样品进行苹果茎沟病毒(apple stem grooving virus,ASGV)、苹果茎痘病毒(apple stem pitting virus,ASPV)、苹果褪绿叶斑病毒(apple chlorotic leaf spot virus,ACLSV)和苹果锈果类病毒(apple scar skin viroid,ASSVd)的检测。RT-PCR的结果表明,ASGV的检出率最高,高达91.1%,其次为ASPV和ASSVd,检出率分别为59.2%和54.8%,ACLSV的检出率相对较低,为35.7%。统计分析发现,84.7%的梨树样品表现出复合侵染,其中受到ASGV+ASPV+ASSVd复合侵染的样品数量最多,占所检样品数的25.5%;受到ASGV+ASPV或ASGV+ACLSV侵染的样品各占11.5%。同一果园中不同‘京白梨’植株所感染的病毒种类也不尽相同。本研究明确了北京地区梨园感染病毒和类病毒的主要种类,为梨病毒病防控提供了理论依据。     

两种苹果潜隐病毒脱毒技术研究

该文应用热处理、热处理加茎尖组织培养以及在培养基中加入抗病毒药剂等方法，脱除了苹果优系短枝富士的苹果褪绿叶斑病毒（ＣＬＳＶ）和苹果茎沟病毒（ＳＧＶ），从而获得无潜隐病毒苗木。     

苹果无病毒母本树的培育技术研究

 1990～1994年，采用3种方法对26个苹果品种和3个矮化砧木进行了脱毒试验，获得24个苹果品种、2个矮化砧木共51株无病毒原种母本树。脱毒株率分别为：单纯热处理26.5%、单纯茎尖培养35.0%、热处理与茎尖培养并用脱毒66.7%。在未脱除的病毒中，苹果褪绿叶斑病毒（ACLSV）占20.9%、苹果茎痘病毒（ASPV）占29.3%、苹果茎沟病毒（ASGV）占49.8%。     

苹果病毒病发生与防治

正目前,苹果病毒病有6种,分别为褪绿叶斑病毒、茎痘病毒、茎沟病毒、锈果类病毒、花叶病毒和绿皱果病毒,其中前3种为潜隐性病毒,后3种属显性病毒。1发生与传播1.1褪绿叶斑病毒通过机械接种和嫁接传播。一般栽培品种感染褪绿叶斑病毒后无明显症状,叶片上产生黄色斑驳,或呈环斑或线纹斑。苹果褪绿叶斑病毒在木本寄主上可经嫁接传染。苹果花瓣中的病毒比叶片多,病毒在不同枝条上的分     

苹果茎沟病毒的RT-PCR检测及其在我国苹果产区的分布

为开发苹果茎沟病毒(Apple stem grooving virus,ASGV)田间样本RT-PCR检测方法以及揭示我国AS-GV的发生情况,本研究以染病的苹果组培苗为试材,对ASGV RT-PCR检测方法进行了优化并利用优化的检测体系对我国苹果产区ASGV的发生情况进行了检测。结果表明:引物ASGVS特异性最好,优化的RT-PCR检测体系能够在4,7和11月份检测果树树皮组织的带毒情况,灵敏度达到能够检测2.5×10-2μg新鲜样本,适于苹果ASGV田间样本检测。通过对我国苹果产区ASGV的检测发现,被检测的13个省(市/区)苹果上几乎都有ASGV发生,只有甘肃省泾川样本未检测到该病毒,采集的327个样本带毒率达73.7%。     

梨病毒病及无病毒化栽培概述

概述了中国梨的几种重要病毒病:梨环纹花叶病毒病(PRPMV)、梨脉黄病毒病(PVYV)、榅桲矮化病毒病(QSV)、苹果茎沟病毒病(ASGV)、梨石痘病毒病(PSPV)及其危害性,较全面地介绍了目前梨病毒病的几种检测方法。现在研究认为,以PCR技术和核酸分子杂交技术为基础的分子生物学方法结合较成熟的ELISA检测以及电镜观察能比较准确、快速地检测出中国梨的病毒病;热处理、茎尖培养、微体嫁接、化学制剂处理及其联合应用为梨病毒的脱毒提供了有效途径;并根据梨无毒苗的生长特点提出了梨无病毒化栽培的管理技术。     

不同来源苹果茎沟病毒分离物部分序列分子特性研究

[目的]明确为害新疆不同品种梨的苹果茎沟病毒(Apple Stem Grooving Virus,ASGV)侵染状况,并对获得的病毒基因序列进行分子鉴定.[方法]采用生物学和分子生物学方法对来源于新疆梨、砂梨及红梨上的ASGV进行检测,将获得基因序列进行比对分析.[结果]从10份新疆梨、2份砂梨及3份云南红梨样品上扩增到预期大小为500 by的ASGV扩增产物.对扩增产物进行克隆和测序,序列分析的结果显示,15个ASGV分离物的CP基因核昔酸及其编码的氨基酸序列相似性分别为88.2;-100;和95.6;-100;,CP基因核苷酸序列构建系统发育树显示,来源于库尔勒香梨分离物KII-3、KII-5、KII-7和新梨7号的分离物XII-5、XII -6,与早期已报道的库尔勒香梨分离物KRL-1及砂梨分离物P-6-1-17亲缘关系较近,聚集成簇.此外,库尔勒香梨的分离物KII-10、KII-14及新粱7号的分离物XII-10与云南红梨上2个分离物YN-2和YN-4聚集成簇,遗传距离较近.[结论]CP基因核昔酸序列系统发育树显示,来源于新获不同品种梨的8个ASGV 分离物及红梨上3个ASGV分离物位于两个不同的组群,存在复杂遗传变异现象.     

非洲大蜗牛螺壳标准样品的研制

本文通过非洲大蜗牛的采集,鉴定,饲养,螺壳制作,样品检验,定值等多个环节,梳理了该样品的制作环节。最终制备的标准样品均匀性和稳定性均达到了国家标准样品的技术要求,可用于非洲大蜗牛的标准质控品。该产品有利于检测质量控制、能力验证、文字标准的执行,也有利于结果的溯源,同时达到全国鉴定一致的作用。     

胡萝卜片微波干燥均匀性研究

干燥均匀性是影响产品干燥质量的重要指标之一。通过分散微波和使物料在微波腔中运动,研究不同情况下胡萝卜切片的干燥均匀性,并开展单因素实验研究微波搅拌器扇片转速、物料转盘转速、微波功率、胡萝卜质量对干燥均匀性的影响。结果发现:增加微波搅拌扇片转速和物料转盘转速都可以降低干燥不均匀性;微波功率增大会加剧干燥不均匀程度,并会影响最终产品质量;相同形状下不同物料质量会影响干燥均匀性。研究结果为改善胡萝卜片微波干燥均匀性提供了操作工艺参数依据。     

Complete genome sequence analysis of two Citrus tatter leaf virus(CTLV) isolates from China

In order to understand molecular characterization of Citrus tatter leaf virus(CTLV) isolated from China,full-length cDNAs of CTLV-MTH and CTLV-XHC from Citrus reticulata and Citrus sinensis were cloned and sequenced based on whole-genome amplification by RT-PCR.The complete nucleotide sequences of CTLV-MTH and CTLV-XHC were determined to be 6497 nucleotides in length and shared 79.9-91.0%and 78.8-98.0%nucleotide sequence identity,respectively,with other Apple stem grooving virus(ASGV) or CTLV strains available in GenBank.Unexpectedly,CTLV-MTH showed the highest nucleotide sequence identity(91%) with an apple isolate of ASGV,followed by 86.5%with ASGV-HH and 85.7%with ASGV-CHN.Furthermore,CTLV-MTH and three ASGV strains were grouped to a separate cluster in the phylogenetic tree,suggesting it has a closer relationship to ASGV than to CTLV.Therefore,it can be concluded roughly that CTLV may be not a distinct strains of ASGV.We proposed that Citrus tatter leaf virus should be renamed Apple stem grooving virus.     

Apple stem grooving virus is associated with leaf yellow mottle mosaic disease on Citrus grandis cv. Huangjinmiyou in China

Although it is usually latent on citrus, apple, and pear, apple stem grooving virus(ASGV) poses a great risk to many sensitive cultivars. Since severe leaf yellow mottle mosaic(LYMM) symptoms have been observed on Huangjinmiyou(HJY) pummelos(Citrus grandis cv. Huangjinmiyou), a commercial variety that is widely cultivated in South China, high throughput sequencing(HTS) was used to find potential pathogens and only three divergent ASGV variants were identified. The three ASGV variants shared 81.0...     

悬浮种衣剂中壳聚糖黄腐酸复配成膜剂应用效果研究

研究天然高分子材料（壳聚糖共混）,克服单一高分子成膜剂的缺点,通过壳聚糖和黄腐酸不同结构成膜剂的复配,改善悬浮种衣剂附着在种子表面包膜牢度,控制和调节悬浮种衣剂在膜内活性成分释放速率。采用恒重法测定速干性、玻板成膜法测定成膜性等测试方法,测试高分子复配成膜剂影响悬浮种衣剂中的理化测试指标如成膜性、脱落率、均匀度、发芽率等。试验证明：1.0%壳聚糖和3.0%黄腐酸复配成膜剂效果俱佳,通过复配高分子成膜剂改善悬浮种衣剂的理化性能指标,优于单一成膜剂的包衣效果,很好地发挥协同效应,得到更加稳定的应用性能。     

用于转基因植物及其产品检测的标准物质概述

就国内外转基因及其产品检测用标准物质进行概述,重点介绍了核酸、蛋白质检测用标准物质,其中质粒标准物质的研究是今后转基因植物及其产品检测用标准物质研究的方向。