番茄溃疡病菌的PCR-DHPLC快速检测

根据番茄溃疡病菌ITS序列,设计并合成了PCR-DHPLC检测引物,对番茄溃疡病菌及其他病菌共10个标准菌株进行了PCR-DHPLC检测。结果表明,番茄溃疡病菌的PCR-DHPLC检测图谱出现了特异性吸收峰,而其他病菌均未在相同洗脱时间出现吸收峰,说明这种方法具有检测番茄溃疡病菌的特异性。灵敏度实验结果表明,PCR-DHPLC体系与PCR-琼脂糖凝胶电泳体系的检测灵敏度一致。研究表明,PCR-DHPLC方法是一种特异、灵敏、快速的番茄溃疡病菌检测方法。     

柑橘溃疡病菌免疫荧光和生物学检测技术研究

本研究通过对7个不同柑橘品种的离体叶片接种及致病性观察筛选出了柑橘溃疡病菌敏感寄主材料，并建立了柑橘溃疡病菌的生物学检测方法；还初次尝试建立了一种简便易行的柑橘溃疡病菌免疫荧光快速鉴定方法。柑橘离体叶片接种实验结果表明：福本、红肉脐橙、纽荷尔和枳壳对柑橘溃疡病菌表现出一定的感病性，而粗柠檬和邓肯葡萄柚未表现出明显感病迹象，反而出现了坏死性应激反应。免疫荧光试验结果显示：浓度为10^3cfu／mL的菌液在30℃下用BSA封闭2h，30℃下抗体结合1h，荧光抗体浓度为4μg,／mL，室温放置40min后镜检，就可以在荧光显微镜下清晰地看到绿色的柑橘溃疡病菌体，而用该方法检测不到水稻白叶枯病菌。用免疫荧光抗体检测柑橘溃疡病菌操作简便，仅需一台荧光显微镜，整个检测过程仅需要4h。     

PCR-DHPLC技术快速检测玉米细菌性枯萎病菌

本研究成功建立了玉米细菌性枯萎病菌的PCR检测方法.该方法根据细菌ITS序列的特异性,设计了对玉米细菌性枯萎病菌具有稳定性点突变的特异性引物及探针,并对5株玉米细菌性枯萎病菌及18种植物原性细菌的DNA进行了PCR、实时荧光PCR及PCR结合变性高效液相色谱技术(PCR-DHPLC)检测.结果表明,几种方法特异性强,检测灵敏度均为菌液浓度102 cfu/mL,PCR-DHPLC技术具有检测成本较低、高通量、自动化程度高、污染风险小及鉴定结果准确等特点,能够满足快速、准确诊断玉米细菌性枯萎病菌的要求.     

利用双重PCR-DHPLC技术检测水稻细菌性谷枯病菌的研究

本研究建立了一种应用双重PCR结合变性高效液相色谱技术(polymerase chain reaction-denatured high performanceliquid chromatography,PCR-DHPLC)检测水稻细菌性谷枯病菌的方法。根据水稻细菌性谷枯病菌ITS序列(internal tran-scribed spacer)和gyrB基因序列,设计两对特异性PCR检测引物,对水稻细菌性谷枯病菌株和非水稻细菌性谷枯病菌株分别进行PCR-DHPLC及双重PCR-DHPLC检测,同时进行检测灵敏度及阳性菌株的同源性分析。结果显示,PCR-DHPLC检测的特异性强,灵敏度为菌浓度4×102cfu/mL,7株水稻细菌性谷枯病菌PCR产物同源性一致。该方法能简便、灵敏、高特异性地对水稻细菌性谷枯病菌进行高通量的自动化检测。     

柑橘溃疡病菌EMA-PCR快速活体检测技术的建立

传统PCR方法不能诊断柑橘溃疡病菌(Xanthomonas citri subsp.citri Gabriel)的死活状态,往往导致假阳性检测结果.本研究将特异性核酸染料叠氮溴化乙锭(ethidium monoazide bromide,EMA)与PCR技术结合,旨在建立柑橘溃疡病活菌的快速检测技术.根据柑橘溃疡病菌独有的保守蛋白基因设计特异性引物扩增出278 bp的靶带,PCR反应的检测下限为25个细胞/25 μL或2.75 pg/25 μL.EMA-PCR结果表明:当卤钨灯曝光时间1 min,EMA终浓度为1.0 mg/L时,能有效抑制1.0×108 cfu/mL死菌的扩增;当EMA的浓度小于30 mg/L时,EMA对上述相同浓度活菌靶基因的扩增没有明显的抑制.EMA-PCR对死活混合菌的扩增表明,活菌数在6.875×101～6.875×105 cfu/PCR范围时,荧光强度与混合体系中活菌的对数值有线性关系.基于以上建立的EMA-PCR活体检测技术,对疑似带病柑橘材料进行检测,结果发现能降低柑橘溃疡病菌检测过程中的假阳性,有望为柑橘溃疡病的检疫检验提供更科学的技术手段.     

柑橘溃疡病菌检测方法及其在检疫中的优选

采用常规检测法、免疫斑点法、酶联免疫检测法和PCR检测法对柑橘溃疡病菌纯培养和柑橘叶片提取液进行平行测定。结果表明,对柑橘叶片提取液的检测,4种检测法检出的样品带菌率分别为11.12%、27.22%、18.69%、20.31%;对柑橘溃疡病菌纯培养的检测,4种方法检测结果一致。本实验同时比较了几种方法的灵敏度、特异性和稳定性,以及不同方法在各级检验检疫中的适应性。     

柑橘黄龙病菌核酸检测技术研究进展

候选韧皮部杆菌（Candidatus Liberibacter spp.）是一类通过虫媒传播,寄生于韧皮部的革兰氏阴性细菌,引起柑橘上的毁灭性病害——黄龙病（Huanglongbing,HLB）。柑橘感染黄龙病后在3～5年内便会衰亡或丧失结果能力,目前尚无有效防治药剂,果园若不及时在感染初期铲除病树,病害会在柑橘木虱的活动下迅速蔓延至整个果园,乃至摧毁整个地区的柑橘产业,造成不可估量的损失。培育无毒苗木、尽早发现和彻底铲除病树是防控柑橘黄龙病的关键,因此建立快速、精准的检测方法是防控黄龙病的基础。本文主要综述了柑橘黄龙病各种核酸检测方法及其优缺点,以期对建立更加灵敏、准确、高效的检测技术提供参考。     

番茄溃疡病菌PCR快速检测技术

番茄溃疡病是一种严重危害番茄生产的细菌性病害，许多国家将其列为检疫性病害。利用ITS通用引物扩增了番茄溃疡病菌（Clavibacter michiganensis subsp．michiganensis）的ITS序列，并进行克隆测序。根据序列比较结果设计了引物BT1和BT2，该引物特异性好，能专一扩增出268bp电泳条带，而马铃薯环腐病菌等不同亚种、不同属的细菌及健康的番茄材料均无扩增条带。从接种但未显症番茄苗叶片及人工模拟染菌种子上提取总DNA，以此为模板均能稳定地扩增出特异性目的条带。该方法直接对种子或植株进行检测，不需进行病原菌分离培养，快速简便，适用于出入境检验检疫及种苗健康检测领域。     

猕猴桃溃疡病菌的分子检测技术研究

 猕猴桃溃疡病是猕猴桃生产上的主要病害,为建立该病的快速诊断技术,本实验通过RAPD分析获得一条1 300 bp左右的致病菌的特异片段,对该片段进行克隆测序,在测序的基础上设计并合成一对特异引物F7/R7,优化特异引物扩增条件,并验证引物的特异性和灵敏性。利用该特异引物对包括猕猴桃溃疡病菌在内的14个菌株基因组DNA进行PCR扩增表明,只有猕猴桃溃疡病菌能扩增出1条约为950 bp的特异条带,其他菌株及对照均未扩增出特异条带。对采自果园的染病枝干组织和接种致病菌的枝干组织的检测表明,该特异引物能特异性地检测到猕猴桃溃疡病菌的存在,其在组织中的检测灵敏度为100 fg/μL。因此,利用设计合成的特异引物F7/R7,参考优化的体系和程序,结合简单的试剂盒法提取猕猴桃溃疡病菌或植物组织DNA,可以在短时间内完成对该病原菌的分子检测。     

柑橘溃疡病菌的普通LAMP及快速LAMP检测方法的建立

建立柑橘溃疡病菌的普通LAMP和快速LAMP检测方法,使其能应用于基层检验检疫部门对病害的快速检测.利用柑橘溃疡病菌基因组特有的保守区域设计LAMP引物,通过优化反应条件,建立柑橘溃疡病菌的普通LAMP检测体系;在普通LAMP引物的基础上设计一对环引物,建立柑橘溃疡病菌的快速LAMP检测体系,并以多种参比菌DNA以及健康柑橘叶片基因组DNA为模板对普通LAMP和快速LAMP检测体系的特异性进行了验证,利用柑橘溃疡病菌菌液和DNA溶液梯度稀释液对普通LAMP和快速LAMP检测体系的灵敏度进行了验证.普通LAMP检测体系菌体和DNA检测灵敏度分别达到了2.25×104 cfu和2.03×10-1 ng,快速LAMP检测体系菌体和DNA检测灵敏度分别达到了2.25 cfu和2.03×10-5ng.在特异性测试中,普通LAMP检测体系与快速LAMP检测体系均仅对柑橘溃疡病菌进行扩增,对非靶标菌和柑橘叶片基因组DNA不产生扩增,普通LAMP与快速LAMP检测体系特异性测试结果一致.快速LAMP检测体系在0.5h内就可以达到普通LAMP检测体系的扩增量,是普通LAMP检测体系反应时间的一半,大大提高了检测的效率;快速LAMP检测体系菌悬液和DNA检测灵敏度均比普通LAMP检测体系提高了10 000倍.成功地建立了柑橘溃疡病菌的普通LAMP及快速LAMP检测方法,为柑橘溃疡病菌的检测提供了一种新的简便、快速的检测手段.     

进境柠檬样品上柑桔溃疡病菌的检测

从进境柠檬样品上分离到一株疑似柑桔溃疡病菌的分离物X206,对分离物进行了菌落形态学特征观察、16S r RNA序列测定、PCR检测、Biolog测定及致病性测试。试验结果表明分离物X206在NA培养基上形成黄色,有光泽,圆形,全缘,微隆起,粘稠状的菌落。特异引物Xac01/Xac02扩增分离物X206的DNA得到582bp的预期产物,产物序列与柑桔溃疡病菌序列的相似性为100%。其16S r RNA序列与柑桔溃疡病菌的序列完全一致。Biolog测定将分离物X206和柑桔溃疡病菌阳性菌株FZ01均鉴定为Xanthomonas campestris pv.dieffenbachiae。致病性测试显示分离物X206能导致柑桔叶片产生明显的溃疡病斑。根据试验结果将分离物X206鉴定为柑桔溃疡病菌(Xanthomonas axonopodis pv.citri)。     

HrpG regulates type II secretory proteins in Xanthomonas axonopodis pv. citri

HrpG, a two-component response regulator-like protein, is a key regulator of the type III secretion system (T3SS) in Xanthomonas spp. In X. campestris pv. vesicatoria, HrpG with a single amino acid substitution (HrpG*) gains the ability to induce the expression of T3SS-related genes even under nutrient-rich conditions. In this study, we investigated the role of HrpG in the synthesis of the secretory protein using HrpG* in strain NA-1 of X. axonopodis pv. citri (Xac NA-1), a causal agent of citrus canker. Eleven proteins secreted via a type II secretion system (T2SS) were induced by HrpG*. In proteomic analyses, six of the 11 proteins were identified as extracellular enzymes, and the others as a fimbrial biogenesis-related protein, a type IV-related protein, two hypothetical proteins, and a conserved hypothetical protein. Further analysis of these proteins revealed that the genes coding all 11 proteins were upregulated by HrpG*, even though they had different expression patterns for HrpXct-dependency. The data indicated that HrpG, a key regulator of T3SS, also acts as a positive regulator of certain proteins secreted via a T2SS in Xac NA-1.     

Characterization of phenotypically distinct strains of Xanthomonas axonopodis pv. citri from Southwest Asia

Strains of Xanthomonas axonopodis pv. citri were isolated from Mexican lime (Citrus aurantifolia) trees in several countries in southwest Asia. These strains produced typical erumpent bacterial canker lesions on Mexican lime but not on grapefruit (C. paradisi). Lesions on grapefruit were watersoaked and blister-like in contrast to the typical erumpent lesions seen after artificial inoculation with all described pathotypes of X. axonopodis pv. citri. This group of strains hydrolysed gelatin and casein and grew in the presence of 3% NaCl as is typical of X. axonopodis pv. citri pathotype A. RFLP analyses and DNA probe hybridization assays also gave results consistent with X. axonopodis pv. citri pathotype A. Metabolic fingerprints prepared with the Biolog® system showed similarities as well as differences to X. axonopodis pv. citri pathotype A. In spite of the physiological and genetic similarities to pathotype A of X. axonopodis pv. citri, these strains had no or very little affinity for polyclonal antiserum prepared against any of the reference strains of X. axonopodis pv. citri and also did not react with monoclonal antibody A1, an antibody that detects all strains of pathotype A of X. axonopodis pv. citri. These strains were also insensitive to bacteriophage Cp3 like X. axonopodis pv. citri pathotype A and unlike X. axonopodis pv. citri pathotype B. We conclude that these strains, designated Xcc-A*, represent a variant of X. axonopodis pv. citri pathotype-A with pathogenicity limited to C. aurantifolia. The existence of extensive genotypic and phenotypic variation within pathotype A of X. axonopodis pv. citri was unexpected and further complicates the systematics of this species.     

柑桔溃疡病菌存活期的研究

本文对鄂东南地区生态条件下柑桔溃疡病菌在不同场所的存活期进行了研究 ,并对其能否作为侵染源进行了评价。证实在病株病斑内的病菌存活时间可达一年以上 ,是此病发生最主要的侵染源。病菌在田间条件下的土壤、落叶、落果、果皮及自然水中的存活期均相当有限 ;其中以冬季病落叶中的病菌存活期最长 ,也不超过 3个月 ;故年前存在于这些场所的病菌均不能成为第 2年的初侵染源