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SSR标记在玉米遗传多态性及杂种优势群划分中的应用 总被引:1,自引:2,他引:1
描述了SSR分子标记的基本概念,简述了SSR标记在玉米遗传多态性分析、杂种优势群划分以及玉米轮回选择群体的遗传多样性方面的应用,同时展望了其应用前景。 相似文献
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用SSR标记进行玉米功能基因定位及QTL分析 总被引:2,自引:1,他引:2
回顾了近年来国内外利用SSR标记研究玉米的功能基因定位及QTL分析的一些研究进展,着重评述了SSR标记在玉米产量性状基因、干旱耐受性基因、抗病抗虫基因及育性恢复基因的定位及QTL分析的主要研究结果,并对SSR标记在玉米功能基因定位及QTL分析中的应用前景进行了展望。 相似文献
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利用SSR标记RM21和田间种植调查鉴定了30份两优287杂交稻材料的纯度.并利用SSR标记1LM21对田间调查鉴定中的全部10种杂株类型的特异性进行了验证。标记检测和田间调查鉴定结果基本吻合.而且标记检测的样本数量越大,其与田间调查的结果吻合度越高.对企业两系种子的销售具有一定的指导意义。同时利用SSR标记RM21对所有杂株类型的进一步研究发现.所选择的SSR分子标记能有效地区分其中6种杂株类型.对由串粉和变异引起的4种杂株类型则不能有效地区分开。因此.利用SSR标记RM21检测两优287的纯度.必须结合杂交种子大田生产的实际情况具体分析。 相似文献
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为丰富瓠瓜分子标记库、开发瓠瓜SSR标记、寻找有效的瓠瓜种质资源鉴定方法,利用MISA软件对瓠瓜转录组测序获得的87 518条unigene序列进行筛选,共检测出11 029个SSR位点,发生频率为9.85%,分布距离为平均每8.3 kb有1个SSR 位点。其中只包含1个SSR位点的unigene 序列有6759条,其发生频率为7.72%;有1858条unigene序列含有2个及2个以上的SSR位点,发生频率为2.123%;有920条unigene序列属于混合形式的SSR标记,频率为1.051%。瓠瓜转录组中优势重复基序为单核苷酸、三核苷酸和二核苷酸,分别占总SSR位点的55.51%、25.41%和17.07%。A/T、AG/CT和AAG/CTT分别是单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸的优势重复基元,分别占总SSR重复类型的98.22%、55.39%和39.86%。用Primer 3.0共设计出8617对SSR引物,利用6对条带清晰、多态性稳定的SSR引物构建了36个品种的指纹图谱,部分位点具有高度的一致性,说明基因来源范围较小。聚类分析显示,在相似系数为0.68时将36个瓠瓜品种分为6类。其表明我国瓠瓜品种资源遗传多样性非常狭窄,利用现有瓠瓜资源开展品种选育潜力有限,应加强对野生特异种质的引进与发掘利用。利用瓠瓜转录组数据进行SSR标记开发,获得的SSR位点能为其遗传多样性分析和遗传图谱构建提供更丰富可靠的标记选择。 相似文献
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为探究盐胁迫对大麻遗传育种改良的影响,试验对盐胁迫条件下大麻转录组测序数据进行了SSR位点标记的挖掘,并对大麻转录组数据中SSR位点标记、SSR位点信息和序列分布特征等进行了分析。结果表明:共检测出84 483条Unigene序列,序列总长87.31 Mb。筛选出27 861个SSR位点,SSR标记的检出率为33.10%,即平均3.13 kb就会出现一个SSR位点,其中以单、二和三碱基重复为主,检出率分别为52.73%、23.26%和22.16%;重复基元主要为A/T、AG/CT、AT/AT和AAG/CTT,分别占52.57%、11.32%、10.25%和6.69%。通过Primer 3.0在线软件获得17 894条SSR引物序列,引物中SSR位点重复长度绝大多数集中在10~21 bp,占SSR重复总数的79.72%,其中最长重复长度为226 bp。该研究构建的盐胁迫下大麻SSR位点信息与分布特征分析,可为研究大麻分子标记辅助育种、EST-SSR标记的开发等提供信息资源。 相似文献
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SSR分子标记技术在杂交棉纯度鉴定中的应用 总被引:2,自引:0,他引:2
利用SSR(Simple sequence repeats)分子标记技术,对湖北惠民农业科技有限公司的3个品种的棉花杂种F1共计31份田间材料进行分子标记纯度鉴定。通过田间纯度鉴定与SSR分子标记纯度鉴定对比,运用相关分析和回归分析的统计方法,研究SSR分子标记纯度鉴定在杂交棉花制种中的可行性。结果表明,相关分析得出SSR分子标记鉴定纯度和田间鉴定纯度具有很强的相关性,相关系数在0.7以上;回归分析得出SSR分子标记鉴定纯度与田间鉴定纯度呈现极显著正相关,SSR分子标记鉴定纯度能够准确预测田间纯度。因此,SSR分子标记纯度鉴定能够应用于棉花杂交制种。 相似文献
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简单重复序列(SSR)是以1~6个核苷酸为单位的串联重复序列,呈孟德尔遗传,作为第二代基于PCR的一种新型DNA分子遗传标记,广泛分布于真核生物基因组。重点介绍了SSR产生的原理、特点,及近几年来油菜SSR标记的开发和SSR技术在油菜基因定位、遗传图谱的构建及品种鉴定等中的应用,并肯定了SSR在植物遗传育种领域的广阔应用前景。 相似文献
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花生SSR分子标记的开发与利用 总被引:1,自引:0,他引:1
近年来,通过基因组文库构建、EST序列开发EST-SSR、比较基因组学等方法,花生SSR分子标记取得了一定的进展。本文主要介绍了基因组SSR、EST-SSR分子标记的开发及其在花生遗传图谱的构建、花生性状及相关基因的定位、遗传多样性研究及种质资源的鉴定等方面的应用,同时对SSR标记在花生中的应用前景进行了展望,以期为花生的分子育种提供参考。 相似文献
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以69份玉米自交系为试材,利用70对SSR引物对其进行遗传多样性和群体结构分析,从42对已定位与大斑病、丝黑穗病和茎腐病3大病害抗性基因连锁的分子标记中筛选适于病害鉴定的有效SSR标记。结果表明,69份自交系划分为PA、PB、Lancaster、塘四平头和旅大红骨5个类群,采用UPGMA聚类方法和群体结构聚类划分结果基本一致;从42对相关标记中筛选出大斑病鉴定有效标记3个(umc1316、umc2212、umc1327)、丝黑穗病鉴定有效标记1个(SSR148152)和茎腐病鉴定有效标记1个(SSR58),基于上述5个有效标记能够明显地区分三大病害综合表现抗和感的材料。 相似文献
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为鉴定糙柱花草种质的遗传背景和亲缘关系,提高其利用效率,利用来自不同柱花草种中的16个SSR标记对14份糙柱花草种质进行遗传多样性和聚类分析。结果表明:在16个SSR标记中,10个SSR标记在14份糙柱花草种质间具有多态性。10个多态性SSR标记共检测到32个等位基因,每个标记可检测到2~8个等位基因,平均为3.20个;每个SSR标记的Shannon信息指数(I)和多态性信息含量(PIC)分别为0.191~0.796和0.173~0.769,平均为0.474和0.411。14份糙柱花草种质间的遗传相似系数为0.438~0.938,平均为0.733。聚类分析结果显示,在遗传相似系数为0.74处,14份供试糙柱花草种质可明显被分为3类,其中III类中的CPI 93116柱花草与其他种质遗传关系较远。 相似文献
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