SSR标记技术在种子纯度鉴定中的研究进展

种子纯度在种子生产中的地位日益提高,以往的形态鉴定等方法难以满足种子强度鉴定的要求。分子标记技术越来越多地被应用到种子纯度鉴定中。本文介绍了SSR分子标记技术的基本原理和特点,简要叙述了SSR标记技术在农作物种子纯度鉴定上的研究进展,并就其在杂交种纯度方面的应用潜力进行了探讨。     

甘蓝型油菜 ‘西农18’ 种子纯度的SSR鉴定

为了建立有效的SSR分子标记方法鉴定甘蓝型油菜‘西农18’品种纯度,以提高‘西农18’大田制种纯度提供分子辅助工具.以甘蓝型油菜杂交种‘西农18’及其父母本为材料,利用SSR分子标记方法对材料进行差异性分析.结果表明,在200对SSR引物中,发现引物BRAS023在杂交种和父母本之间存在显著差异且条带清晰可辨,差异性以杂交种带有父母本的特异带型存在.利用该引物对150株杂交种进行纯度鉴定,结果为86%,与大田杂交种纯度鉴定结果89%相比,SSR标记与大田种植鉴定结果基本一致.这个结果证明,引物BRAS023可用于‘西农18’的纯度鉴定.     

SSR标记对宁单11种子纯度的鉴定

采用SSR分子标记方法,选用24对引物,以杂交玉米宁单11杂交种子及其父母本为实验材料,对宁单11种子纯度进行鉴定。通过带型分析,筛选出在杂交种中呈现清晰且双亲互补带型的特异性引物,并依据特异性引物的筛选标记结果对抽样批次的宁单11种子样本进行纯度鉴定。结果表明:phi034、phi080、umc1638、bnlg439、bnlg1792五对SSR引物可用于玉米杂交种宁单11种子纯度鉴定。     

利用SSR分子标记鉴定玉米杂交种‘吉祥1号’纯度

纯度是种子质量的重要指标。‘吉祥1号’玉米杂交种是在甘肃省选育并大面积栽培的主推玉米品种。为鉴定该品种的纯度,本研究开展了‘吉祥1号’纯度鉴定SSR标记方法研究。通过比较快速提取法和改良CTAB法2种DNA提取方法在SSR分子标记纯度鉴定中的应用,结果表明:2种方法提取的DNA均适用于SSR分子标记纯度检测,但快速提取法具有简单、快速的特点,更适用于分子标记纯度鉴定。从20对SSR引物中筛选出2个标记bnlg2291k4和bnlg2305k4,用于‘吉祥1号’品种的纯度鉴定,2个标记均能明显的区分亲本和杂交种。在‘吉祥1号’杂交种中人为混入双亲,采用本研究确定的方法可准确鉴定出混入的自交系。     

冬瓜杂种种子纯度鉴定的SSR分析

种子纯度是种子质量的核心指标,目前冬瓜、节瓜杂种优势已被广泛地应用于生产。探索出一种快速、准确的冬瓜、节瓜品种纯度鉴定方法是确保种子质量的技术保证,也是品种纯度检测实现商业化的前提。本研究以‘绿优’冬瓜和‘梅花8号’节瓜及其各自亲本为试验材料,利用SSR分子标记技术对亲本及杂种之间的多态性进行分析。结果显示,从200对SSR引物中筛选出2对多态性引物scaffold4775和scaffold5674,用于‘绿优’冬瓜和‘梅花8号’节瓜杂种种子纯度的鉴定。其扩增片段电泳条带清晰可辨,杂交种中呈现双亲的互补带型,SSR标记表现出稳定的显性和共显性,能将‘绿优’冬瓜和‘梅花8号’节瓜与其父母本区分开来。分子检测平均纯度均为98%,田间纯度鉴定分别为98%和99%,结果基本一致,表明引物scaffold4775和scaffold5674可用于‘绿优’冬瓜和‘梅花8号’节瓜的纯度鉴定。SSR分子标记呈现出经济快速、准确等特点,在冬瓜、节瓜品种纯度鉴定上其应用前景十分广泛。     

利用SSR标记鉴定掖单13号种子纯度

以掖单13号玉米杂交种及其亲本自交系为材料,对15对SSR引物进行筛选,选出适合该杂交种纯度鉴定的SSR位点引物;建立了利用SSR分子标记技术检测掖单系列玉米杂交种纯度鉴定的方法。该操作程序简单、快速、对仪器设备要求较低,易于推广。     

SSR标记对甜瓜杂交种‘玉贵人’纯度的鉴定

为了精准快速地筛选出鉴定甜瓜杂交种纯度的SSR引物,本研究利用18对甜瓜SSR核心引物对甜瓜杂交种‘玉贵人’及其亲本进行引物筛选和种子纯度鉴定。结果筛选出2对引物(CmS57和CmS59)在子代中兼具双亲条带并且在亲本间具有多态性,且条带清晰,间隔明显,并利用这2对引物在杂交群体中进行验证,纯度鉴定结果为97.8%和100.0%;SSR分子标记的鉴定结果与田间调查结果的误差为1.1%。表明本研究筛选出的引物CmS57和CmS59能够作为特异引物对甜瓜杂交种‘玉贵人’进行种子纯度检测,也说明应用SSR分子标记技术对甜瓜种子的纯度鉴定是可行的。     

花生新品种汕油21种子纯度SSR标记鉴定体系的建立和应用

为探索花生品种纯度的分子标记鉴定方法,采用SSR标记构建不同花生品种的指纹图谱。结果表明:利用3对SSR标记引物构建20个花生品种的指纹图谱,该图谱可以将汕油21与其它19个花生品种进行区分,这些品种包括汕油162、汕油212、汕油31、汕油33、汕油71、粤油5号、粤油7号、粤油29、粤油32、汕油27、汕油523、粤油9号、粤油13、粤油14、粤油79、粤油114、J11、仲恺花1号和泉608等;以3对SSR引物对汕油21繁育种子60个样品进行种子纯度检测,共有2对标记引物检测到3个杂株样品,该种子批的纯度为95.0%。因此,利用SSR标记构建花生品种指纹图谱并应用于汕油21品种纯度鉴定是可行的。     

利用SSR标记快速鉴定玉米杂交种农大108和豫玉27的种子纯度

本文利用SSR标记技术分别筛选出玉米杂交种农大108和豫玉27的特异性引物,结合单籽粒DNA快速提取方法,建立了两个品种的种子纯度鉴定试剂盒.实验表明,应用此试剂盒可快速、有效地鉴定两个杂交种的种子纯度.     

棉花杂交种种子纯度的SSR分子标记鉴定方法

种子的纯度是影响杂交棉发挥其杂种优势的重要原因。本研究基于不同棉花品系之间的遗传变异,筛选出杂交种亲本间具有多态性,且为共显性的SSR核心引物,用于杂交种种子纯度鉴定。通过统计每个检测引物扩增带型的差异或一致性,综合得出杂交种的种子纯度。利用该方法,对4个棉花杂交种种子的纯度进行SSR分子标记鉴定,为棉花杂交种纯度鉴定提供参考。     

利用SSR鉴定水稻杂交种子纯度的研究

为发展DNA标记技术在种子纯度鉴定上的应用，对12个目前在生产上大面积推广的水稻杂交种进行了SSR纯度鉴定。筛选出一批在常用亲本上具有较高多态性的SSR引物，并与田间纯度鉴定结果进行比较研究。结果表明：SSR鉴定的平均纯度与田间鉴定结果无显著差异，SSR可以用于杂交水稻种子纯度鉴定。     

SSR技术对杂交稻种冈优188的纯度鉴定

运用SSR分子标记,以冈46 A和乐恢188为材料,从463对引物中,筛选出4对在双亲间有特异多态性条带的引物:RM6、RM252、RM263和RM 526。利用该4对特异性引物,对2家市售的冈优188杂交种进行纯度鉴定,其纯度分别为98.01%和98.65%,其田间纯度鉴定结果分别为97.89%和98.38%,二者结果无显著差异。因此,可利用该4对特异性SSR多态性引物对冈优188进行纯度鉴定。     

棉花常规种种子纯度的SSR分子标记鉴定

棉花是新疆重要的经济作物,寻找一种有效的棉花品种(系)纯度检测方法是解决目前市场上棉花品种多、乱、杂问题的有效途径.本研究选取新疆棉花品种(系)中的41个常规种为试验材料,利用简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)分子标记技术筛选出15对条带清晰、多态性高的核心引物,对41份试验材料进行...     

‘北斗75’青萝卜杂交种纯度SSR分子标记鉴定

品种纯度是衡量种子质量的关键指标之一。为高效、准确鉴定‘北斗75’青萝卜杂交种纯度,本研究筛选确定了一个条带清晰、多态性高的引物P26,在‘北斗75’青萝卜亲本及F1代间有共显性差异,并进一步利用引物P26对‘北斗75’青萝卜杂交种纯度进行鉴定。结果表明,与形态学鉴定进行比较,两种鉴定方法结果偏差≤2.00%,其方差分析显示两种方法差异不显著;纯度鉴定结果显示,所有样品种子纯度结果均>98%,说明该引物对于‘北斗75’青萝卜杂交种的纯度鉴定方法稳定可靠;利用该引物对13个青萝卜商品种进行检测,结果在其他品种中扩增出不同的条带,说明引物P26具有很高的特异性,可以特异性区分‘北斗75’青萝卜商品种,具有一定的研究价值。     

应用SSR标记技术鉴定马铃薯杂交实生种子的纯度

以昆明市农科所提供的2003年收获的B16、B19、B20及其亲本CIP004（♂）、CIP008（B16♀）、CIP009（B19♀）、CIP010（B20♀）为材料,利用9对SSR引物对其进行分析,筛选出适合用于马铃薯杂交实生种子纯度鉴定的SSR位点引物并初步测定其纯度。分析结果表明,STM002和STM009引物的扩增产物呈现双亲互补的特征谱带,易于区分杂交种和亲本自交系,并初步确定B、B和B纯度分别为86%、90%和85%。     

关于两系杂交稻种子纯度SSR分子检测方法与田间种植鉴定方法的对比试验

为找到SSR分子检测两系杂交稻种子纯度与田间种植鉴定种子纯度两种方法的相关性及验证两种检测方法鉴定结果的一致性,构建了3个两系杂交稻群体各500株,分别对其种子纯度进行了室内SSR分子检测与田间正季种植鉴定,同时对两种检测方法的单株鉴定结果进行一一对比.结果表明,两种检测方法无明显差异,鉴定结果较一致,但对于田间的非不育系杂株,SSR分子检测不能有效地检测出来.     

鉴定甘蓝型油菜杂交种种子纯度的SSR分子标记引物筛选

为了建立一套快速可靠的甘蓝型油菜杂交种纯度的鉴定方法,选择具有代表性的6份油菜品种(组合),采用20对SSR甘蓝型油菜首选核心引物对供试材料进行引物筛选,并将筛选出的引物应用于杂交种的种子纯度鉴定.目前已为其中每个杂交种(组合)平均筛选出1～3对引物,经大田验证可用于杂交种的真假鉴定和纯度鉴定,应用前景十分广阔.     

利用SSR标记鉴定两系杂交稻种子纯度

利用SSR标记RM21和田间种植调查鉴定了30份两优287杂交稻材料的纯度．并利用SSR标记1LM21对田间调查鉴定中的全部10种杂株类型的特异性进行了验证。标记检测和田间调查鉴定结果基本吻合．而且标记检测的样本数量越大,其与田间调查的结果吻合度越高．对企业两系种子的销售具有一定的指导意义。同时利用SSR标记RM21对所有杂株类型的进一步研究发现．所选择的SSR分子标记能有效地区分其中6种杂株类型．对由串粉和变异引起的4种杂株类型则不能有效地区分开。因此．利用SSR标记RM21检测两优287的纯度．必须结合杂交种子大田生产的实际情况具体分析。