绵羊QTL的研究进展

绵羊许多重要经济性状都受数量性状位点(QTL)控制的。本文综述了QTL定位的群体设计、标记的选择、绵羊遗传连锁图谱及QTL定位的研究现状。     

绵羊QTL的研究进展

绵羊许多重要经济性状都受数量性状位点（QTL）控制的。本文综述了QTL定位的群体设计、标记的选择、绵羊遗传连锁图谱及QTL定位的研究现状。     

红三叶白粉病危害损失通径分析及经济阈值的数学模型

本文在红三叶白粉(Erysiphe Polygoni DC.)病情田间调查的基础上,分析了发病率、严重度、病情指数与产量损失之间线性关系,并由此建立了红三叶白粉病防治的经济阈值模型。这一模型可为当地红三叶白粉病的防治提供参考。     

鸡QTL定位的研究进展

近年来,对鸡的染色体上QTL定位工作有了迅猛的发展,成为动物基因定位工作中一个异常活跃的领域。对鸡数量性状的研究也已发展为直接将研究目标指向各个数量性状位点,借助各种遗传标记,构建遗传连锁图谱,通过一定的统计分析方法,从而将影响数量性状的多个基因剖分开来,将其定位于特定的染色体区域。作者重点介绍了QTL定位的方法及鸡QTL定位的现状。     

红三叶AFLP体系的建立及优化

采用正交设计和单因素试验相结合的方法,以红三叶(Trifolium pratense)高感白粉病品种岷山红三叶与抗白粉病新品系(甘农PR1)杂交产生F1代作为试验材料,对红三叶AFLP反应中7个因素(DNA浓度,酶切时间,两酶(EcoRI,MseI)浓度,预扩增产物稀释倍数,2×PCR Master Mix用量,引物组合)进行优化试验。建立了适合红三叶稳定且多态性高的最佳AFLP反应体系:90ng/μL DNA模板、5h酶切、8UEcoRI、6UMseI、30倍稀释预扩增产物、10μL 2×PCR Master Mix。优化的AFLP反应体系在红三叶的验证中表现出良好的稳定性和重复性,为进一步进行红三叶种质鉴定、遗传图谱构建、基因定位和遗传多样性的分析奠定了技术基础。     

甜樱桃遗传图谱的构建及果皮红色性状QTL分析

据《园艺学报》2012年第1期《甜樱桃遗传图谱的构建及果皮红色性状QTL分析》（作者高平等）报道,以甜樱桃Prunusavium L．黄红皮品种“雷尼”为母本,红皮品种“8—100”为父本杂交获得的90株F,代群体为试材,利用RAPD、ISSR和SSR分子标记进行遗传分析,     

紫花苜蓿QTL与全基因组选择研究进展及其应用

四倍体紫花苜蓿是重要的豆科牧草之一,由于其复杂的遗传背景与二倍体作物相比遗传作图与重要性状数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)定位研究相对滞后。然而,二倍体苜蓿的相关研究起步较早,已经建立了高密度遗传图谱和物理图谱,这些研究为四倍体苜蓿遗传作图与QTL定位奠定了基础。随着第三代分子标记与测序技术的快速发展,极大地促进了四倍体苜蓿的高密度遗传图谱构建与QTL定位研究,并借助分子标记辅助育种技术对提高苜蓿选育效率,加速育种进程具有重要意义。本文对苜蓿遗传图谱构建与QTL定位研究及发展趋势进行了总结,并对苜蓿关联作图与全基因组选择的研究进展及应用前景加以概述,旨在为读者就相关研究领域有较全面的了解。     

高丹草遗传图谱构建及农艺性状基因定位研究

本文以高丹草(So rghumSudan grass)(314A×ZKSD)的F_2:3家系作为构图群体, 构建了高丹草AFLP和RAPD遗传图谱。将248个F_2:3家系按随机区组重复3次的田间设计在两个试验点种植, 考察了包括产量在内的10个重要农艺性状。利用复合区间作图法分析10个性状的数量性状基因座位(QTL)以及基因效应值和基因作用方式, 并采用遗传分离分析法进行多世代联合分析, 主要结果如下。     

引进红三叶种质资源遗传多样性的ISSR分析

为了分析从俄罗斯、美国和加拿大引进的31份红三叶(Trifolium pratense)种质资源的遗传多样性,为其进一步利用提供参考,本文采用ISSR分子标记技术对其进行了遗传多样性研究。从20条ISSR引物中筛选出多态性明显、重复性好的5条引物进行扩增,共扩增出61条谱带,其中多态性条带58条,多态性比率(PPB)高达95.08%。POPGENE分析结果表明,红三叶种质间遗传相似系数(GS)变化范围在0.5902~0.9344之间,平均Shannon信息指数(I)为0.3427,平均Nei’s基因多样性指数(H)为0.2092,平均有效等位基因数(Ne)1.3162,表现出丰富的遗传多样性。利用UPGMA聚类分析,可将31份红三叶种质分为5大类,其中来自加拿大的24号种质材料与其他材料间遗传分化最大,单独聚为一类。本文还比较了ISSR标记的聚类结果与基于形态特征的聚类结果之间的异同。     

基于SRAP分子标记构建的菊苣遗传连锁图谱

基于SRAP标记,以遗传关系和表型差异大的菊苣亲本PI 651947和PI 652007杂交获得的84个F₁单株为作图群体,进行连锁图谱的构建。采用Map Manager QTX b20软件进行连锁分析,分别构建了PI 651947和PI 652007的分子连锁框架图,共获得77个SRAP标记,其中父本遗传图谱涉及4个连锁群,包含19个标记,图谱总长为450.9 cM,标记间平均图距为23.7 cM。母本遗传图谱涉及13个连锁群,包含58个标记,图谱总长为1404.8 cM,标记间平均图距为24.2 cM。研究结果可为菊苣重要农艺性状QTL定位奠定基础,为菊苣分子育种研究提供了基础信息。     

红三叶对白粉病抗性机理研究

研究了岷山红三叶抗病单株扦插1代中不同抗病性植株接种白粉病后的生理生化特性.结果表明,免疫植株超氧化物歧化酶(SOD)活性最高,是高感植株的2.75倍,随着抗病性减弱,SOD活性逐渐降低;随着抗病性减弱过氧化物酶(POD)和L-苯丙氨酸解氨酶(PAL)活性逐渐降低,但降幅比较缓和,免疫植株活性是高感植株的1.13和1....     

种植区环境对燕麦种质成株期白粉病抗性的影响

为探究种植区环境对燕麦种质成株期白粉病抗性的影响,利用相对抗病指数分别对种植在甘肃省半干旱区(甘肃农业大学兰州牧草试验站)和二阴地区(通渭县华家岭镇)的28份燕麦资源在田间自然感病条件的白粉病成株期抗性进行了鉴定和评价。结果表明:28份材料中4641和99AS207在两个试验点均表现为高抗,4607、Rigdon、DA92-3F4、青永久252、青永久9和青永久98等6份材料在两个试验点均表现为中抗,但4628、伽利略和青永久307在牧草站表现高抗白粉病,在华家岭表现高感,而709、青永久316、青永久49在牧草站高感白粉病,在华家岭表现高抗;所有参试材料中以4628的相对抗病指数变化最大,在华家岭和牧草站分别为0和0.92。结果表明种植区环境对燕麦白粉病抗性有显著影响,参试材料在半干旱地区的病害平均严重度高于二阴地区。     

利用SSR分子标记构建四倍体杂交冰草的遗传连锁图谱

为构建四倍体杂交冰草分子遗传连锁图谱,对深入开展冰草产量、抗性等重要性状的QTL定位及分子标记辅助育种提供依据,以四倍体杂种F₂分离群体的347个单株及亲本蒙古冰草和航道冰草为材料,采用SSR分子标记技术和Joinmap 4.0软件进行了遗传作图研究。试验从256对SSR引物中筛选出条带清晰稳定、多态性丰富的适宜引物30对,PCR扩增得到224个SSR标记位点,平均每对引物扩增出7.47个位点,其中多态性标记位点185个,占82.6%。偏分离分析显示,在185个SSR多态性标记位点中有24个标记产生偏分离,占13.0%,符合植物遗传作图时通常偏分离标记比率<30%的要求,可用于遗传作图。构建了1张四倍体杂交冰草的分子遗传连锁框架图谱,该图谱包含14个连锁群、185个标记,其长度范围在123.0~202.6 cM之间,连锁群LG4最长、LG12最短,各连锁群的平均长度167.32 cM,覆盖基因组总长度2342.5 cM,标记间的平均距离12.66 cM。     

内生真菌对醉马草白粉病抗性的影响

为研究内生真菌对醉马草白粉病抗性的影响,在温室条件下,对自然发生不同程度白粉病(健康、轻度感病和重度感病植株)的带内生真菌(E+)和不带内生真菌(E-)的醉马草植株的发病率、病叶率、病情指数及各项生理生化指标进行测定。结果表明,E+醉马草的发病率48%显著低于E-醉马草的发病率97%(P0.05),E+的病叶率60%显著低于E-醉马草病叶率86%(P0.05),E+醉马草的病情指数为50.76,E-醉马草的病情指数为82.49;通过各项生理生化指标的测定发现与健康植株相比,在轻度和重度发病植株中,内生真菌的存在可以显著(P0.05)提高醉马草叶片的叶绿素含量和脯氨酸含量,E+醉马草的SOD酶活性和POD酶活性也显著高于E-醉马草,同时内生真菌显著地降低了醉马草叶片中丙二醛(MDA)的含量。据此说明内生真菌的存在能够提高醉马草抗白粉病的能力。     

AMV和WCMV在转基因红三叶中的基因累集

随着转基因技术的发展及其在植物育种中的应用，出现了一大批表现优良、经济效益高的转基因植物，但生产实践要求一种植物同时具有多个优良的转基因性状。目前解决这一问题的方法主要是基因累集(Gene pyramiding)，就是将多个基因集中到同一植株，可以将已经转入1个基因的植株做原材料，用农杆菌介导或基因枪等方法将另一基因转进去。也可以采用人工杂交，在不同转基因植株之间进行人工授粉，从后代中筛选出所需要的基因型。本研究对抗苜蓿花叶病毒(AMV)的转基因红三叶和抗白三叶花叶病毒(WCMV)的转基因红三叶进行了人工杂交，以期获得兼有2个基因、同时抵抗2种病毒的新植株，为下一步的育种打好基础。几乎所有的杂交组合都结了种子，杂交一代的发芽率随杂交亲本转基因拷贝数的不同而有所变化，只有1个转基因拷贝的亲本其杂种发芽率最高。对所有幼苗先用PCR进行检测，从中挑出较理想的基因型作进一步的分子生物学分析。Southern和Northern印迹分析结果表明，有些杂交一代的转入基因多于1个拷贝，有一部分同时兼有2种抗病基因，并且得到了表达。为进一步检测其抗病性，对它们进行了温室接种和田间评估，结果显示，尽管有的个体Northern分析呈阳性，但在田间仍然对病毒敏感，不过其感病程度都比对照有显著降低。大多数兼有2种转入基因的植株都能同时抵抗2种病毒，可以作为免疫个体供下一步育种之用。与遗传转化相比，人工杂交以其操作简单、省时省力、预见性强和准确率高而具有明显优势，是常规育种方法在分子育种中的具体体现。     

玉米持绿相关ＱＴＬ整合图谱构建及一致性ＱＴＬ区域内候选基因发掘

 以玉米高密度遗传连锁图谱ＩＢＭ２２００８Ｎｅｉｇｈｂｏｒｓ为参考图谱,收集来自不同实验中的１７３个玉米持绿相关数量性状位点（ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅｔｒａｉｔｌｏｃｕｓ,ＱＴＬ）信息,利用ＢｉｏＭｅｒｃａｔｏｒ２．１软件,构建出玉米持绿相关ＱＴＬ 整合图谱;采用元分析技术,在１,４,５,９号染色体上发掘出５个持绿“一致性”ＱＴＬ 区间。根据“一致性”ＱＴＬ 区间两端标记在玉米物理图谱Ｂ７３ＲｅｆＧｅｎ＿ｖ２上的位置,将“一致性”ＱＴＬ 区间进行物理图谱定位,利用ＰｌａｎｔＧＤＢ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｐｌａｎｔｇｄｂ．ｏｒｇ／）在线区段批量下载工具（ｄｏｗｎｌｏａｄｒｅｇｉｏｎｄａｔａ）下载“一致性”区间的１４４５个预测基因序列并进行生物信息学分析,发现预测基因主要参与具体的细胞过程,执行结合功能,催化、转移酶活性和氧化还原酶活性等分子功能。根据“一致性”ＱＴＬ 区间的基因位点名称,在ＮＣＢＩ中下载相关基因序列,与所在“一致性”ＱＴＬ 区 间所有预测基因保守结构域进行比对,在５个“一致性”持绿ＱＴＬ 区间内初步确定８个持绿相关候选基因。利用ＧＲＡＭＥＮＥ 网站（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｇｒａｍｅｎｅ．ｏｒｇ／）的Ｃｍａｐ功能,将水稻持绿基因狊犵狉（ｓｔａｙｇｒｅｅｎ）转定位于玉米物理图谱Ｂ７３ＲｅｆＧｅｎ＿ｖ２上,找到与其同源的玉米候选基因ＧＲＭＺＭ２Ｇ０９１８３７＿Ｔ０１,其序列与已发表的玉米衰老诱导叶绿体持绿蛋白基因狊犵狉１序列一致。     

国外引进红三叶种质在甘肃中部地区的生长特性及生产性能初步评价

为丰富我国红三叶种质资源,给红三叶品种选育提供优异材料,探讨国外引进资源在甘肃中部地区的综合表现,本文以来自俄罗斯、加拿大和美国的31份红三叶种质为供试材料,对其形态特征、农艺性状、生产性能等方面的14个指标进行了测定,发现其在生育期、株高、分枝数、叶面积、茎叶比、再生速度和干草产量等指标上差异非常显著。来源地对供试材料的形态特征和生产性能也有影响。个别种质材料在单一性状上表现优异,可直接应用于生产。通过主成分分析,选取方差累计贡献率达78.94%的前5个主成分对供试材料进行综合评价,结果表明,31份种质中,来自俄罗斯的ZXY2008P-4996综合得分最高,表现最优,其次是来自美国的Scarlett和Star fireⅡ;ZXY2008P-5419综合得分最低,适应性最差。依据主成分向量可将31份红三叶种质聚为4类。     

紫花苜蓿开花性状的遗传特性分析与QTL定位

通过构建紫花苜蓿杂交F1代遗传分离群体,研究紫花苜蓿早熟性状的遗传特性,确定始花期性状的最适遗传模型,同时定位始花期相关的QTL位点。以低产早熟紫花苜蓿(父本)和高产晚熟紫花苜蓿(母本)为亲本构建杂交群体,以亲本和二者杂交产生的152个F1代单株为研究对象。于2015和2016年调查始花期性状,运用主多基因遗传模型分析始花期性状的最适遗传模型。通过GBS测序技术对154个单株进行基因分型,利用测序产生的SNP标记构建连锁图谱,同时结合表型数据进行QTL定位。结果表明:2MG-A为始花期性状的最适遗传模型,2015年的主基因遗传率为99%,2016年的主基因遗传率为98.5%。父本连锁图覆盖图距为1386cM,平均标记密度3.2cM;母本连锁图覆盖图距为798.73cM,平均标记密度8.07cM。对两年的数据进行QTL定位分析得到2个主效QTL位点,表型贡献率分别为12.1334%和11.0157%。表明始花期主要受两对主效基因控制,同时具有加性作用。始花期性状主要由2个QTL位点控制。     

白三叶种质资源形态变异与地理起源的关系

分析了原产于1.02°~55.8° N,87.12° E~8.9° W,海拔2～2 804 m,分属于29个国家的68份白三叶（Trifolium repens）种质资源的形态特征变异及其与地理起源的关系。结果表明,1）供试白三叶叶片大小变异最大,其次是单位面积花序数和株高,而生殖枝高度和每花序小花数变异较小;2）Mantel检验表明,株高、单位面积花序数、每花序小花数3个性状变化存在显著（P＜0.05）的空间关联性,而生殖枝高度和叶面积与空间的相关性不显著;3）聚类分析显示,白三叶形态变异与地理起源呈较密切的相关性,而不同起源的白三叶亦出现了相似的遗传分化,原产欧洲的白三叶形态朝不同方向的进化趋势明显。