微卫星标记及其在家畜育种的应用

微卫星DNA作为一种分子标记，具有数量大、分布广且均匀、多态信息含量高等特点。本文将简要概述微卫星标记的发展概况、特点，并重点阐述其在家畜育种中的应用。     

微卫星DNA分子标记及其在动物遗传育种中的应用

微卫星DNA以其独特的优点和特点而成为当前动物遗传育种研究中颇受欢迎的一种分子标记技术。本文主要介绍了微卫星DNA分子标记的研究简史、原理、流程及其分子标记的优点和在动物育种中的应用。     

高邮鸭微卫星DNA标记遗传多样性的研究

利用9个微卫星标记分析了高邮鸭群体遗传多样性。结果9个微卫星座位共检出42个等位基因，基因频率分布在0．0135—0．6216之间，平均每对引物可检测4.7个等位基因，9个微卫星座位的平均杂合度为0．7375，平均多态性含量为0．6707，表明高邮鸭群体遗传变异大，遗传多样性丰富。     

微卫星DNA标记在川渝山羊品种遗传多样性研究中的应用

微卫星,又称短串联重复序列（Short Tandem Repeat,STR）或简单重复序列（Simple Sequences Repeat,SSR）,是20世纪80年代末期发展起来的一种新型DNA标记。常用于检测个体基因型,统计群体中微卫星位点等位基因的数目和频率,并结合分子遗传学和数量分类学原理,计算各个品种的遗传变异程度、生存稳定性,初步评估品种的遗传多样性及品种间的亲缘关系与分化关系。论述了遗传多样性的研究进展及微卫星在遗传多样性研究中的应用,并以川渝山羊品种（类群）为重点进行了系统讨论,以期为今后的相关研究提供理论基础。     

微卫星DNA在猪育种中的应用

微卫星DNA是上个世纪80年代末、90年代初发展起来的新型分子遗传标记。由于它的多态性高且稳定，被广泛应用于动物育种中。随着研究的深入，利用微卫星标记已经构建了鸡、牛、猪等家畜的遗传图谱，并且定位了一些与经济性状有关的基因。科学家已经应用微卫星对猪进行了大量的研究，并取得了一定的成绩。     

微卫星标记及其在家畜遗传育种中的应用

微卫星DNA（Microsatellite DNA）是指以少数几个核苷酸（多数2～4个）为单位多次串连重复的DNA序列, 也称简单重复序列（simple sequence repeat, SSR）、短串联重复（short tandem repeat, STR）或简单序列长度多态性（simple sequence length polymorphism）.早在上世纪70年代初, Skinner在寄居蟹的DNA中发现了一类简单串联重复序列, 1980年Singh等人又在蛇W染色体的性别特意性卫星DNA中发现了一类GATA和GACA的简单重复序列, 1982年Singh等人在人心肌肌动蛋白（Ha-25）的内含子中发现了一个重复25次的（dT-dG）序列,同时指出这一序列在人及其它真核生物的基因组中广泛存在,并与Z-DNA的形成有关.     

犬微卫星DNA遗传标记及其在犬繁育中的应用

遗传标记是指可追踪染色体、染色体某一节段、某个基因座在家系中传递的任何一种遗传特性。它具有两个基本特征,一是可遗传性,二是可识别性。因此,生物的任何有差异的突变型均可作为遗传标记。遗传标记主要包括形态标记、细胞学标记、生化标记和DNA分子标记四类,本文对犬微卫星     

微卫星标记及其在家畜遗传育种中的应用

本文阐述了微卫星的结构、遗传特性以及微卫星标记在家畜个体亲缘关系鉴定、构建基因图谱、标记辅助选择、评估遗传多样性等四方面的作用。认为微卫星标记是动物遗传育种的一种非常理想的分子遗传标记,但由于已知的微卫星位点较少,加之分析成本较高,微卫星扩增产物在检测过程中常出现各种误判因素等原因而存在应用缺陷,为了更好地利用微卫星,使其成为一种简捷、灵敏、低廉的重要遗传分析方法,必须对其进行更深入地研究。     

微卫星DNA标记的研究与应用

阐述了微卫星DNA标记的结构、特点,较之其他标记的优点。简要介绍了其在构建基因图谱,标记辅助选择（MAS）,遗传多样性研究,定位QTL,预测杂种优势等方面的应用。     

昆山麻鸭微卫星DNA标记监测选种效果的研究

利用12个微卫星标记分析了昆山麻鸭高产系F0代和F1代遗传多样性,监测选种效果。结果表明12个微卫星座位共检出83个等位基因,基因频率分布在0.0077～0.5859,平均每对引物扩增出8.3个等位基因。F0代微卫星的平均杂合度为0.7489,平均多态性含量0.7125;F1代为0.7668和0.6901。表明昆山麻鸭种群的群体遗传变异已趋于稳定。     

边鸡微卫星DNA标记遗传多样性的研究

利用鸡基因组中5个微卫星标记,检测了边鸡群体的遗传多样性,并以大骨鸡做了比较分析。同时探讨了边鸡在国内5个地方鸡种中的系统地位。结果表明,5个微卫星位点共检测到38个等位基因,其中ADL0146位点的等位基因数最少(5个),而ADL0136和ADL0185两个位点的等位基因数最多(9个),平均等位基因数为7.6个.边鸡群体内比大骨鸡群体有更丰富的遗传多样性。聚类分析结果显示,边鸡与大骨鸡亲缘关系最近。而与鲁西斗鸡亲缘关系最远。     

四个微卫星标记在苏钟猪中的多态性分析

微卫星标记是近年来发展起来的一种检测基因DNA多态性的新型DNA标记,因其数量多、分布广、多态性丰富及检测方便等优点而倍受推崇。本文利用四个微卫星标记分析其在苏钟猪中的遗传多样性。结果表明,四个微卫星座位在苏钟猪中均存在较高的遗传多样性,基因杂合度为0．5962～0．8823;多态信息含量为0．5146～0．8709;有效等位基因数为2．4768～8．4935。以上结果表明,本研究采用的四个微卫星标记可以作为苏钟猪的遗传多样性的标记辅助选择。     

利用微卫星分析中国家兔的遗传多样性

利用10个微卫星DNA标记对七个家兔品种进行了遗传检测。利用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测微卫星的PCR扩增产物,计算了七个家兔品种（9个家兔群体）样本在10个微卫星基因座上的等位基因频率、微卫星的多态信息含量（PIC）、各群体遗传杂合度、群体间的遗传距离、并根据遗传距离对这几个群体进行了聚类分析。结果表明：所选择的10个微卫星位点在所检测群体中均表现了较好的多态性,平均多态信息含量为0．569905。平均杂舍度范围在0．5885～0．6826。表明所研究的家兔品种的遗传多样性较丰富,还可以做进一步的选择利用。根据遗传距离所做的聚类分析图表明吉戎-Ⅰ系和吉戎-Ⅱ系、哈尔滨大白兔、塞北兔的亲缘关系依次较近,与它们的培育历史相吻合。     

10个云南地方猪种微卫星遗传多样性分析

为阐明保山猪、迪庆藏猪、高贡黎山猪、丽江猪、明光小耳猪、滇南小耳猪、撒坝猪、大河猪、昭通猪、大河乌猪10个云南省优良地方猪种的群体遗传多样性和遗传结构,本试验参考ArkDB数据库中家猪14条染色体上的15对微卫星引物,对549个云南地方猪个体的耳组织样品进行了检测分析,计算各微卫星座位等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、Shannon's信息指数（I）、表观杂合度（Ho）、期望杂合度（He）、F-统计量（Fis、Fit、Fst）、基因流（Nm）、群体遗传距离等相关参数及多态信息含量（PIC）,采用NTsys 2.10软件构建聚类树,并采用STRUCTRUE 2.3.3软件评估群体遗传结构。结果显示：15个微卫星座位共检测到293个等位基因,各座位等位基因数在5~38个之间,平均等位基因数为19个,平均有效等位基因数8.3682个;10个云南地方猪群体的Shannon多样性、表观杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别在1.4374~2.0317、0.6389~0.7756、0.7021~0.8281和0.6647~0.7993之间。各座位单个群体内近交系数（Fis）、总群体近交系数（Fit）、群体间遗传分化系数（Fst）的变化范围分别为-0.0678~0.4594、0.0618~0.5567和0.0713~0.1801;群体间Fst平均值为0.1101,处于中度遗传分化状态,有11.01%的遗传变异来自于群体间,大部分遗传变异来自于群体内;每个座位基因流程度较高,变化范围在1.6392~3.2551之间,平均值为2.0214。基于Nei氏遗传距离构建UPGMA系统发生树显示,高黎贡山猪与迪庆藏猪聚为一支,并与丽江猪、保山猪和明光小耳猪聚为一大支,其结果得到了STRUCTURE分析的验证。综上所述,10个云南地方猪种遗传多样性丰富,群体内有近交现象,群体间处于中度遗传分化,存在着一定的基因交流。     

利用微卫星分析中国家兔的遗传多样性

利用10个微卫星DNA标记对7个家兔品种(9个群体)进行了遗传检测。结果表明:所选择的10个微卫星位点在所检测群体中均表现了较好的多态性,平均多态信息含量为0.569905。平均杂合度范围在0.5885～0.6826。表明所研究的家兔品种的遗传多样性较丰富,还可以做进一步的选择利用。根据遗传距离所做的聚类分析图表明,吉戎-Ⅰ系和吉戎-Ⅱ系、哈尔滨大白兔、塞北兔的亲缘关系依次较近,与它们的培育历史相吻合。     

福安水牛的分子遗传多样性研究

福安水牛是福建省地方优良品种之一,为了进一步阐明其群体遗传结构和遗传多样性,采用8对微卫星引物对福建福安、闽清、古田及南靖等4个福安水牛群体,共计130头样本进行检测分析。结果表明:福安水牛4个群体8个微卫星座位共有78个等位基因,其中4个群体共享的等位基因为50个,非共享等位基因28个。各等位基因频率介于0.015 2~0.527 8之间;共检测到基因型6~29种;4个群体的平均多态信息含量、杂合度、有效等位基因数分别为0.817 2±0.023 0、0.820 4±0.029 4和5.85±0.84;根据奈氏标准遗传距离进行UPGMA聚类分析,结果表明:遗传距离最远的是闽清群体与南靖群体(0.351 8),遗传距离最近的是福安群体与闽清群体(0.183 2)。     

微卫星DNA的分离方法及其在猪遗传育种中的应用

本文综述了微卫星DNA标记的特点、形成机制、作用及分离方法。分析了其在猪构建基因图谱，QTL定位，标记辅助选择(MAS)，揭示群内遗传多样性，研究品种间的分化关系，预测杂种优势等方面的作用，并指出其研究中存在的问题。     

利用微卫星DNA多态性预测半番鸭的杂种优势

为探究微卫星DNA多态性与鸭肉用性能杂种优势的相关关系,选取10对微卫星标记对金定鸭、樱桃谷鸭、F1(樱桃谷鸭×金定鸭)和番鸭进行遗传多样性检测。利用ONEDscan、GENEPOP、Mstools软件对目的基因进行分型,计算遗传多样性参数以及群体间标准遗传距离,并测定半番鸭各杂交组合F1代体重杂种优势。结果表明:在4个鸭群体共检测到52个等位基因,金定鸭、F1(樱桃谷鸭×金定鸭)、樱桃谷鸭与番鸭群体间标准遗传距离分别为0.57678、0.52220、0.46356,樱桃谷鸭与金定鸭遗传距离为0.38949。并根据遗传距离,采用对数曲线模型对半番鸭体重杂种优势进行了预测,χ2检验结果显示,预测结果与实验测定结果无显著性差异,表明本研究建立的根据微卫星DNA多态性预测半番鸭部分生长阶段体重杂种优势是可行的。