DNA指纹技术在近交系小鼠遗传检测中的应用研究

采用生物素标记的(GGAT)4寡核苷酸探针对C57BL/6J、BALB/c和DBA/2三种近交系小鼠进行了DNA指纹图分析.结果表明:(GGAT)4寡核苷酸探针对上述3种近交系小鼠产生的DNA指纹图的图带数均为10-12条,具有良好的多态性,品系内平均DNA指纹图的相似系数在0.92~1.00的范围内,具有相同指纹图的概率均在0.40以上,极显著地高于品系间的相似系数(0.21~0.39)和相同指纹图的概率(P<3.10×10-7),说明(GGAT)4寡核苷酸探针可用于制作近交系小鼠的DNA指纹图,以对其进行遗传检测.     

用小卫星探针33.6对中华绒螯蟹遗传多态性的DNA指纹图谱研究

运用DIG标记的人源小卫得探针33.6与HaeⅢ消化的中华绒螯蟹（Eriocheir sinensis）基因组DNA杂交，进行了中华绒螯蟹种群遗传多态性的非放射性DAN图谱研究。实验表明：用人源小卫星探针33.6在中华绒螯蟹DNA指纹图谱中可检测到10个以上位点的遗传变异，这些位点均表现丰富的多态性；人源小卫星探针33.6产生的中华绒螯蟹DNA指纹图谱具有个体特异性，但未表现出中华绒螯蟹种或种群特异的分子遗传标记，长江蟹、辽河蟹与人工繁育长江触的群体内相似指数分别为0.292、0.375和0.306；长江蟹与辽河蟹、长江蟹与人工繁育长江蟹、辽河蟹与人工繁育长江蟹群体间相似指数分别为0.178、0.266和0.179。     

鸡的寡核苷酸探针DNA指纹研究

用人工合成的寡聚核苷酸（GT）10为探针产生8胪家系鸡的HaeⅢ酶切微卫星DNA指纹图谱。遗传距离分析结果表明：计算所得到的遗传距离与鸡的实际遗传背景一致，说明在缺少DNA指纹分析的小卫星探针或基因组探针的情况下，用合成容易，价格较低的寡核苷酸作为探针是可行的。     

家兔品种(配套系)审定标准(试行)

根据《中华人民共和国种畜禽管理条例》及《种畜禽管理条例实施细则》的有关规定,国家家畜禽遗传资源管理委员会于1998年7月颁布了《畜禽品种(配套系)审定标准》(试行)(以下简称“试行标准”)。自“试行标准”实施以来,在指导、规范全国畜禽品种(配套系)审定工作方面起到了积极作用。经过几年的实践,并在广泛征求种畜禽生产、培育单位和有关管理部门意见的基础上,国家畜禽品种审定委员会制定了《国家级畜禽品种(配套系)审定规程》(试行),并对“试行标准”进行了修订。现将《国家级畜禽品种(配套系)审定规程》(试行)和修订后的“试行标准”给…     

35个粳稻品种SSR指纹图谱的构建及遗传相似性分析

用68对SSR引物扩增了35个粳稻品种(系)的基因组DNA,结果有46对引物在35个品种间具有稳定多态性.有6个品种可用单一特异的SSR标记加以识别,其余29个品种则需要不同的SSR指纹组合才能识别.用12对核心引物构建的SSR指纹图谱能将35个粳稻品种逐一区别开来.35个粳稻品种间遗传相似系数的变异范围为0.27～0.98.采用类平均法进行聚类分析,在相似系数0.82处,可将35个粳稻品种分为4类.聚类分析结果基本上反映了依据系谱分析的品种间亲缘关系.     

35个粳稻品种SSR指纹图谱的构建及遗传相似性分析

用68对SSR引物扩增了35个粳稻品种(系)的基因组DNA,结果有46对引物在35个品种间具有稳定多态性.有6个品种可用单一特异的SSR标记加以识别,其余29个品种则需要不同的SSR指纹组合才能识别.用12对核心引物构建的SSR指纹图谱能将35个粳稻品种逐一区别开来.35个粳稻品种间遗传相似系数的变异范围为0.27～0.98.采用类平均法进行聚类分析,在相似系数0.82处,可将35个粳稻品种分为4类.聚类分析结果基本上反映了依据系谱分析的品种间亲缘关系.     

用生物合成的长链开环探针进行SNP分型

由于化学合成长链开环探针面临许多困难,因此需要开发一种长链开环探针的生物合成方法.该研究利用生物合成的146 bp长链开环探针进行单核苷酸多态性(SNP)分型,以验证长链开环探针生物合成的可行性.结果表明:长链开环探针能够特异地与目的DNA结合,完美配对的长链开环探针能够被DNA连接酶连接,形成环状单链DNA分子,不能...     

分子标记在蔬菜种质资源和育种上的应用

介绍了分子标记技术在蔬菜遗传图谱构建、遗传多样性和亲缘关系、品种(系)指纹图谱构建以及杂种纯度鉴定、基因定位和分子标记辅助选择等领域的应用,并探讨了其应用前景和存在的问题。     

何首乌种特异DNA探针的筛选

为筛选得到何首乌(Fallopia multiflora)种特异DNA探针,通过何首乌gDNA和其近缘植物毛脉蓼(F.multifora var.cillinerve)gDNA之间的的抑制消减杂交(Suppression subtraction hybridization,SSH)得到何首乌的差减片段,再将标记的差减片段和多物种gDNA阵列杂交筛选得到了4条何首乌DNA探针,探针通过反向斑点杂交检测,能很好地区分何首乌及其混伪品.获得的探针在中药鉴定基因芯片的制备及何首乌种质和生药鉴定方面具应用前景.     

用微卫星探针的DNA指纹技术分析9个家猪群体的遗传结构

本研究用微卫星探针（GT）10得到了9个家猪品种的DNA指纹图。1-9品种依次为：13/17罗伯逊易位纯合子猪群体、13/17罗伯逊易位杂合子猪群体、13/17罗伯逊易位杂合子猪互交所得到的正常核型猪群体（杂交0号）、丹系长白猪群体、加系双肌臀杜洛克猪群体、加系双肌臀大约克猪群体、加系双肌臀长白猪群体、丹系长白猪与13/17易位杂合子猪产生的杂交后备猪群体（杂交1号）、杜洛克猪与13/17易位杂合子猪产生的杂交后备猪群体（杂交2号）。根据指纹带型计算了每个群体的相似系数（F）、平均等位基因频率（Q）、最低平均杂合率（H）和遗传距离指数（D）。9个品种的相似系数介于0.582-0.911，根据各品种之间的遗传距离指数作出矩阵图，并据此绘制出品种间亲缘关系树状聚类图。     

果桑种质资源SRAP指纹图谱构建及遗传差异分析

为了有效区分15份果桑种质资源,利用分子标记SRAP技术进行遗传差异分析并构建DNA指纹图谱。从42对SRAP引物组合中筛选出17对引物进行PCR扩增,得到306条清晰条带,其中多态性条带253条,多态性比率为82.68%,供试材料间的遗传相似系数(GS)在0.390 9～0.811 1之间。选用2对多态性引物（Me2/Em1 和Me7/Em5）,初步构建了15份果桑种质材料的DNA指纹图谱。经过非加权组平均法(UPGMA)聚类分析,以遗传相似系数0.666为阈值,将供试材料分为3组;根据条带的有无转换为二进制编码形成数字指纹图谱,简便快速区分每份种质材料。采用SRAP分子标记建立的指纹图谱适合于果桑品种的分类和鉴定。     

POR6与MGR586同源性及其所揭示的稻瘟病菌DNA指纹特征之比较(英文)

Ｓｏｕｔｈｅｒｎｂｌｏｔ分析明确了稻瘟病菌重复序列ＰＯＲ６与ＭＧＲ５８６没有同源性．进一步以ＰＯＲ６与ＭＧＲ５８６为探针,比较分析了稻瘟病菌基因组ＤＮＡ指纹,表明两者所揭示的ＤＮＡ指纹特征不同,但依据其指纹相似性所进行的谱系分析结果却有相同的趋势,而且ＰＯＲ６－ＥｃｏＲＩ组合在５．１～１４．９ｋｂ之间比ＭＧＲ５８６－ＥｃｏＲＩ揭示的ＤＮＡ指纹更丰富,说明除了ＭＧＲ５８６外,ＰＯＲ６也是稻瘟病菌群体遗传结构研究的理想标记．     

丽穗凤梨ISSR遗传多样性分析与指纹图谱构建

【目的】探讨丽穗凤梨品种遗传多样性和亲缘关系,并建立其分子指纹图谱,为今后丽穗凤梨杂交育种和品种鉴定提供依据。【方法】利用ISSR分子标记技术研究41个丽穗凤梨品种的遗传多样性水平,并构建DNA指纹图谱。【结果】12条ISSR引物共扩增出132个清晰可辩位点,其中多态性位点125个,多态位点百分率达94.70%。41个丽穗凤梨品种平均有效等位基因数为1.5311,平均 Nei’s 基因多样性指数为0.3101,平均 Shannon信息指数为0.4668,品种间的相似系数介于0.3561～0.9394之间;基于ISSR分子标记数据建立的UPGMA亲缘关系聚类图,41个丽穗凤梨品种在相似系数0.601处被划分为两大类群;同时利用4条多态性ISSR引物构建了41个丽穗凤梨品种的分子指纹图谱。【结论】供试41个丽穗凤梨品种遗传多样性丰富,其亲缘关系与叶片横纹的有无具有一定的相关性。ISSR分子标记技术可以有效地用于丽穗凤梨品种资源评价和指纹图谱构建。     

芥菜遗传多样性的RAPD分析

随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）是一种新的分子标记技术,利用ＲＡＰＤ标记对芥菜（Ｂｒａｓｓｉｃａ ｊｕｎｃｅａ Ｃｏｓｓａ）１６个变种的遗传多样性进行了分析,从６０个１０ｂｐ随机引５物中筛选出２７个有效的,这２７个有效引物共扩增出３３６条ＤＮＡ带,其中２７５条为多态性带,占总数的８１．８５％,平均每个引物扩增出的ＤＮＡ带数为１２．４４,不同引物扩增出各自不同的ＤＮＡ指纹图谱,大部分图谱均有特征或特     

基于Seoulin研究所生命科学通用引物标记的水稻种质资源快速DNA指纹图谱分析

用两个Seoulin研究所生命科学通用引物标记即SRILS6与SRILS8,通过建立相应的指纹图谱,对菲律宾国家水稻所水稻种质资源库中265个地方品种的遗传亲缘关系进行了分析。DNA指纹图谱结果显示,两个引物在整个群体材料中共扩增出了55条多态带,每个品种平均33.3条,而平均多态带率达60.5%。根据两个引物的DNA指纹谱带数据,进行单个及合并聚类分析,计算出3个极为相似的聚类系统树图:将样品主要聚成两个大类群,类群Ⅰ与Ⅱ。聚类分析的结果表明,两个SRILS标记便能完全鉴别出所有265个品种,而且揭示了一个相对高的群体遗传多样性。3个聚类系统树图的聚类分布以及类群的组成均极为相似,有91%~95%的相似度,这说明SRILS引物扩增的基因组区域可能已经发生了一定程度的变异以至于表现出高度一致的遗传系谱。SRILS分子标记体系可成为水稻种质资源快速指纹图谱及多样性分析的理想工具,因而是水稻资源管理方面的重要助手,如进行资源鉴定、生物多样性分析以及核心种质构建等。     

杂种马褂木无性系随机扩增多态DNA指纹图谱的构建

利用随机扩增多态（RAPD）分子标记技术对31个杂种马褂木无性系的研究结果表明，23个随机引物共扩增出128条谱带，其中76条（59．38％）谱带在无性系间呈多态性，无性系间的遗传距离最小为0．0813，最大为0．3522，这说明无性系间的遗传多态性相对较小，从而认为在今后杂交工作中应注意扩大亲本的遗传基础。聚类分析的结果证明RAPD指纹图谱在一定程度上反映了无性系间的亲缘关系，因此，可用于谱系分析。利用所构建的RAPD指纹图谱成功地对各无性系进行了区分，这对于无性系鉴定和知识产权保护具有重要的意义。     

重庆稻瘟病菌群体遗传多样性分析

采用rep-PCR指纹技术,对73个重庆稻瘟病菌菌株进行了DNA指纹扩增。结果表明,菌株间显示了DNA指纹的多态性,供试菌株分别扩增出2~17条DNA带。经UPGMA聚类分析,在0.80遗传相似水平下,供试菌株分为12个遗传谱系,其中谱系L7,L9,L12为优势谱系。重庆稻瘟病菌的群体结构呈现多样性和复杂性,菌株的遗传谱系与原寄主品种和地理分布之间均表现出较明显的相关性。     

9个果蔗品种(系)遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

【目的】对9个果蔗品种(系)进行遗传多样性分析并构建其DNA指纹图谱,为果蔗品种鉴定和分子育种等提供理论依据。【方法】利用21个SSR分子标记和毛细管电泳技术对来自4个省份的9个果蔗品种(系)进行遗传多样性分析,应用NTSYS-pc 2.11计算供试材料间遗传相似系数,并运用UPGMA法进行聚类分析,同时构建其DNA指纹图谱。【结果】21对SSR引物共扩增出204条带,多态性比例为75.99%,每对引物可扩增出4~31条带,平均为9.71条。其中,17对引物含有9个果蔗品种(系)的44个特征位点,仅有5对引物鉴别能力最强,单个引物即可将其完全区分开。选择多态性高、鉴别力强且含有品种(系)特征位点的3对引物(SMC36BUQ、SMC597CS和SMC851MS)构建了9份果蔗品种(系)基于44个位点的DNA指纹图谱。9份果蔗材料的遗传相似系数为0.62~0.90,平均为0.77。UPGMA聚类结果显示,9个果蔗材料可分为三大类群,且与材料来源地无直接关系。【结论】9个果蔗品种(系)间的遗传基础差异较小,亲缘关系较近,遗传多样性并不丰富,在育种中应加大果蔗亲本遗传背景的差异,提高其遗传多样性。     

重庆稻瘟病菌不同菌株DNA指纹图谱分析

采用rep-PCR指纹技术对70个不同来源的稻瘟病菌菌株的DNA指纹图谱进行了测定。菌株间显示了DNA图像的多态性,供试菌株分别扩增出2－15条DNA带。经聚类分析,在0．80遗传相似水平下,供试菌株分为9个遗传谱系,其中第3,6,9为优势谱系。菌株的遗传谱系与菌株的原寄主和原采集地之间均表现出较明显的相关性。     

3种DNA提取方法对养殖池塘不同生境菌群PCR-DGGE分析的影响

比较3种DNA提取方法(溶菌酶法、CTAB法及珠磨法)对养殖池塘几种生境(底泥、饲料、草鱼肠道内容物及肠道壁)菌群PCR-DGGE分析的影响。结果表明,以3种提取方法获得的DNA为模板均能进行16S rDNA V3区特异性片段扩增;但不同DNA提取方法对池塘不同生境菌群DGGE指纹图谱存在显著影响。DGGE指纹图谱显示草鱼肠道内容物菌群(溶菌酶法)与肠道壁菌群(溶菌酶法)存在较高一致性,底泥菌群(CTAB法)及饲料菌群(溶菌酶法)与鱼体肠道菌群(包括内容物菌群和肠道壁菌群)则存在明显差异,但肠道菌群与底泥菌群的相似度相对更高。研究提示采用微生物分子生态学工具对养殖池塘不同生境进行菌群结构分析时,需提前优化DNA提取方法;在以投饲为主的养殖鱼塘中,草鱼肠道菌群更多源自于池塘底泥。