三江黄牛Y染色体ZFY基因遗传多样性研究

三江黄牛原产于四川省阿坝藏族羌族自治州汶川县,具有躯干较长、役用性能良好、适应性强、肉质好等特点,是经长期人工选育的优良地方黄牛品种,为遗传资源宝贵基因库。试验对三江黄牛Y染色体特异ZFY基因作遗传多态性分析,发掘三江黄牛遗传起源。结果表明,ZFY基因第11外显子长度为1 090 bp,T、A、C、G平均含量分别为24.2%、34.2%、20.7%、20.9%,存在碱基偏好性;发现22个突变位点,18个转换,4个颠换,其核苷酸多样性(Pi)为0.007 61,检出16种单倍型,单倍型多样性(Hd)为0.993,说明三江黄牛群体ZFY基因遗传多样性较丰富;系统进化和遗传距离分析表明,三江黄牛优先和大额牛、瘤牛、野牛聚为一类,研究为濒危三江黄牛品种保种、选育及来源提供依据。     

徐闻黄牛和海南黄牛血液蛋白的遗传多样性

采用淀粉凝胶电泳技术和组织化学染色方法，研究徐闻黄牛、海南黄牛和荷斯坦牛血液蛋白的遗传多样性。在分析的３６种血液蛋白（酶）共计４０个遗传座位中，徐闻黄牛和海南黄牛有相同的１３个多态座位，荷斯坦牛有１１个多态座位。徐闻黄牛和海南黄牛的多态座位百分比均为Ｐ＝０．３２５，徐闻黄牛的平均杂合度Ｈ＝０．１４１，海南黄牛的平均杂合度Ｈ＝０．１３２；荷斯坦牛的多态座位百分比Ｐ＝０．２７５，平均杂合度Ｈ＝０．０９９，研究结果表明这３个品种的遗传多样性相当丰富，多态座位百分比和平均杂合度随着品种选育程度的提高而降低。研究结果为把徐闻黄牛和海南黄牛合称为雷琼黄牛的观点提供了佐证。     

鲁西黄牛遗传多样性及其系统地位的研究

 以中心产区简单随机抽样在山东省鄄城县和梁山县共抽取鲁西黄牛87头，用垂直平板聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）和水平淀粉凝胶电泳技术检测21个编码血液蛋白（酶）的结构基因座的基因频率，同时引用国内外13个群体7个相同座位的研究资料，进行聚类分析。结果表明，在所检测的21个基因座中，有9个存在多型，多态位点百分比为42.86%，群体内遗传变异水平相对较高，平均杂合度为0.1416；鲁西牛与东南亚牛种亲缘关系较近，证实了鲁西牛是由北方蒙古利亚牛系和南方瘤牛的混血种，但不可能含有巴厘牛的血统。目前应扩大保种群的数量，以维持群体内的遗传多样性。     

利用MHC遗传标记对改则县本地牦牛与半野血牦牛群体遗传多样性评估

本研究利用MHC基因区域两个遗传标记（BF1和BM1258）对西藏阿里地区改则县的本地牦牛（GZD,16头）和半野血牦牛（GZY,18头）进行遗传多样性评估。研究结果显示：BF1位点的期望杂合度（HE=0.71996）和多态信息含量（PIC=0.66063）以及等位基因数（NA=11）都要高于BM1258位点（HE=0.56773、PIC=0.45553、NA=6）,但BF1位点的观测杂合度（HO=0.30331）小于BM1258位点（HO=0.66471）。就群体而言,GZD的期望杂合度为0.6727±0.0934（HE±SD）、观测杂合度为0.5563±0.0892（HO±SD）以及PIC为0.58534,都高于GZY。GZD的近交系数（FIS=0.178）小于GZY（FIS=0.337）。通过两个微卫星位点基因型共构建了17种单倍型,GZD中含有12种单倍型,GZY中存在11 种单倍型。在单倍型水平上,GZD的期望杂合度（HE）为0.8759,观测杂合度为0.8000±0.1033,多态信息含量为0.8323,也略高于GZY相关参数两个群体之间的遗传分化指数在两个水平均显示为差异不显著（FST=-0.01370（位点水平）,FST=-0.00300（单倍型水平）。总体而言,该两个牦牛群体的MHC免疫区域遗传多样性丰富暗示其抗病性和适应性遗传基础优秀,其次来那个群体遗传差异不明显,加之半野血牦牛种群近交系数偏高,故建议对该两个群体采取混群合并保种,提高种畜利用率,防止近交系数持续增高。     

中华鲟野生群体及迁地群体的MHCⅠa基因遗传多样性变异研究

利用特异性引物MHCⅠf和MHCⅠr,分别从30尾野生中华鲟(Acipenser sinensis)、30尾中华鲟子一代和30尾中华鲟子二代的基因组DNA中扩增MHCⅠa基因的多肽结合位点(PBR)片段,扩增产物长度为127 bp。中华鲟野生群体30个样品265个有效克隆中共检测出50条特异序列(单倍型),中华鲟子一代群体30个样品的278个有效克隆中共检测出66条特异序列(单倍型),中华鲟子二代群体30个样品的257个克隆中检测出64条特异序列(单倍型)。单倍型Acsi-UAB*0101在3个群体中所占的百分比最高,分别为58.1%、38.8%和60.7%。单倍型分布及群体内遗传多样性参数分析表明,中华鲟子一代群体的MHC基因遗传多样性最丰富,野生中华鲟群体的MHCⅠa基因遗传多样性较低。中华鲟野生群体非同义替代与同义替代比率为1.33,分析表明正向选择可能是中华鲟MHCⅠa多态性的主要因素。该研究结果提供了中华鲟从野生群体到子二代群体MHCⅠa基因的部分遗传信息和遗传变异规律,为中华鲟全人工种群优化和繁殖管理提供理论依据。     

14个中外黄牛品种的遗传多样性分析

利用12对微卫星DNA标记对14个中外牛品种进行了遗传多样性分析,通过计算多态信息含量(PIC)、平均杂合度(H)、有效等位基因数(Ne)及聚类分析,评估各品种内遗传变异和各品种间遗传相关。结果表明,12个微卫星座位共检测到170个等位基因,Ne为1.194 7-11.175 2,H为0.618 9-0.782 9;12个位点均为高度多态位点,PIC为0.528 1-0.810 5。恩施黄牛与郧巴牛相聚,枣北牛与南阳牛相聚,然后二者聚为一类;湘西牛自成一类;郏县红牛与秦巴牛相聚,再与黄陂黄牛聚为一类;早胜牛与平陆山地牛聚为一类;安西牛自成一类;德国黄牛与西门塔尔牛相聚后,再与夏洛来牛聚为一类。     

部分黄牛品种(群体)遗传多样性分析

 用 4个微卫星位点分析了延边牛、南阳牛、西门塔尔牛、皮埃蒙特杂种牛和韩国牛的遗传结构。结果表明 ,4个位点平均基因多样性为 0 .5 7,IDVGA 11位点最高 ,为 0 .6 6 ;5个品种的遗传多样性平均为 0 .5 7,南阳牛达0 .6 6 ,延边牛和韩国牛的多态性相对较低 ,西门塔尔、皮埃蒙特杂种的观测多样性明显低于期望的多样性 ,反映存在选择和近交 ;延边牛和韩国牛、西门塔尔牛与皮埃蒙特杂种牛之间有很高的基因流 ,说明它们的来源相近 ,由于品种间杂交 ,延边牛和西门塔尔牛、皮埃蒙特杂种牛和南阳牛之间也有较大的基因流 ;群体间遗传距离与基因流结果相符。     

不同系统梨种质遗传多样性与分类关系的SSR分析

利用SSR分子标记技术深入探讨了梨主要栽培种白梨(Pyrus bretschneideri Rehd.)、砂梨(Pyrus pyrifolia(Burm.f.)Nakai)、秋子梨(Pyrus ussuriensis Maxim.)、西洋梨(Pyrus communis L.)、新疆梨(Pyrus sinkiangensis Yü)和野生种以及种间杂交新选育品种共150份资源的遗传多样性、亲缘关系以及系统分类地位.通过筛选出的25对SSR引物共检测到407个位点,不同引物检测位点数5-25个,其中多态性位点数390个,占检测位点的95.82%,检测位点杂合度为0.4～0.7,不同品种间的遗传多样性指数为0.67-1.00.应用NTSYS-pc2.0l软件,以非加权数据分析法(UPGMA)对获得的多态性位点进行聚类分析,系统聚类结果将150份梨种质分为2大类群,即西洋梨和东方梨类群.西洋梨类群包括了西洋梨品种及具西洋梨亲缘的种间杂交品种.东方梨类群包括了中国白梨、砂梨、秋子梨、新疆梨、野生资源以及日韩梨品种,在相似系数0.708处又分为2大组,并可细分为7个亚组.其中,中国的白梨、砂梨和秋子梨相互交错在一起,没有独自成组.中国砂梨表现出最丰富的遗传多样性;其次是中国白梨.日本梨与中国砂梨表现了高度的亲缘关系,并且没有独立成组.多数新选育品种的遗传关系表现出趋母本聚类型或趋父本聚类型.     

福建黄牛的遗传多态性及分类

用8个微卫星标记对福建黄牛的等位基因频率、多态信息含量（PIC）、遗传杂合度（日）和有效等位基因数（E）等指标进行统计分析，并在此基础上对其进行聚类分析和分类研究、结果表明：（1）8个微卫星标记在所检测的福建黄牛群体中都表现出较丰富的多态性，4个群体8个微卫星座位共有58个等位基因，每个微卫星标记平均检测到7、2个等位基因（3—11）；8个微卫星标记的PIC平均为0.6471（0.3942—0．8062），各群体的PIC差异不显著；全部群体的日为0.2930：各群体的E平均为3．37（3.03—3.84）、这显示黄牛群体的等位基因频率、PIC、H和E等指标有较好的一致性，说明福建黄牛品种内在微卫星位点上均具有丰富的遗传多样性．（2）根据Nei氏标准遗传距离进行UPGMA聚类分析的结果显示，4个群体间的遗传变异不大．福建黄牛地方品种在微卫星位点上具有丰富的遗传多样性；遗传距离及聚类分析结果表明，这些群体黄牛属于同一个地方品种．     

山东省地方黄牛品种.的遗传多样性研究

测定了山东省地方黄牛品种渤海黑牛和鲁西黄牛19头个体线粒体DNA(mtDNA)控制区(D-loop)的全序列,结合两个品种已报道的16个序列,用Lasergene、Mega 4.0和Dna SP 4.90软件对所得序列进行分析、构建进化树.结果显示:发现了29个单倍型,83个核苷酸多态性位点,转换/颠换比为4.27.山东黄牛主要有两个母系来源:欧洲牛和印度瘤牛,但受欧洲牛的影响更大一些.表明:山东地方黄牛品种具有丰富的遗传多样性和较高的进化潜力.     

南阳牛遗传多样性的RAPD分析

用RAPD技术对南阳牛种质资源的DNA进行检测,采用Popgene软件对扩增结果进行统计分析表明:筛选的16个引物共得到了236条扩增DNA片断,其中89.7%的扩增条带表现出多态性。平均每个位点有1.989 6个等位基因,有效等位基因数为1.233 3。Nei遗传多样性指数为0.159 7,Shannon's遗传多样性指数为0.270 3。种群总的遗传多样性Ht为0.163 7,种群内的遗传多样性Hs为0.130 5,种群的基因分化系数为0.202 8,种群间的基因流为1.965 3。     

利用多重荧光PCR分析秦川牛遗传多样性

[目的]分析秦川牛的遗传多样性,加强对该品种资源的保护。[方法]利用15个微卫星座位,运用多重荧光PCR技术对59头秦川牛个体的基因组DNA进行扩增,通过等位基因频率、多态信息含量、基因杂合度和有效等位基因数分析秦川牛品种的遗传多样性。[结果]结果表明:在15个座位的等位基因数为5～18个,平均等位基因数为10.3个;各座位上的杂合度都较高,平均杂合度为0.7959;平均有效等位基因数为5.3066;15个座位中多态信息含量为0.6441～0.8649,均为高度多态。[结论]通过荧光标记可用于牛品种遗传多样性的分析,并可为进一步QTL定位和标记辅助选择研究提供参考。     

DNA分子标记技术及其在小麦遗传多样性研究中的应用

研究小麦遗传多样性对其遗传育种、种质资源保护、开发及利用均具有重要的意义。概述了几种主要小麦遗传多样性研究的DNA分子标记,如RFLP、RAPD、AFLP、SSR和SRAP等技术的基本原理、特点及其优缺点等,进而探讨了这些分子标记技术在小麦遗传多样性研究中的作用和意义,为拓宽小麦遗传基础、提高小麦遗传变异育种提供理论基础。     

DNA分子标记技术在竹亚科植物遗传多样性研究中的应用

近年来,分子标记技术已经在竹亚科植物种质资源鉴定、遗传图谱构建、基因定位以及良种选育中得到较为广泛的运用。介绍了常用的分子标记技术及其在竹亚科植物遗传多样性研究中的应用,指出今后应加强分子标记技术在竹亚科植物遗传图谱构建、遗传多样性分析、种质资源的鉴定、辅助选择育种等方面的研究。     

The Genetic Diversity and Phylogenetic Status of Luxi Cattle

A total of 87 individuals of Luxi cattle from Juanchen and Liangshan counties, Shangdong Province, China, were sampled by simple random sampling in typical colony. Twenty-one blood proteins and enzymes loci were detected by polyacrylamide gel electrophoresis （PAGE） and starch gel electrophoresis （SGE）. In the meantime, the data of 7 loci of 13 cattle populations in China and other countries were collected and phylogeny relationships were studied. The results indicated that 9 out of 21 loci showed polymorphism （42.86%）; the level of genetic variation in Luxi cattle population was relatively high, the mean heterozygosity was 0.1416. The Luxi cattle have a close phylogenetic relationship with the cattle populations of east and south of Asia, and this further confirmed the fact that Luxi cattle were the cross-breed between the Bos taurus and Bos indicus in China, but it is impossible that yellow cattle contained the blood of of Bali.     

分子标记在核盘菌遗传多样性研究中的应用及展望

对核盘菌遗传多样性研究中常用的分子标记方法,如随机扩增多态性(RAPD)、限制性酶切片段长度多态性(RFLP)、微卫星DNA(SSR)、相关序列扩增多态性(SRAP),及其发展方向进行了综述,以期为核盘菌的相关研究提供参考。     

石斑鱼遗传多样性及其系统发育分析

石斑鱼不仅是重要的海水经济鱼类,而且具有重要的生态地位.但是,石斑鱼的分类、物种多样性、资源保护及其合理开发等需要对石斑鱼系统发育的分析与研究.线粒体基因是研究石斑鱼系统进化的理想分子标记,因此获得了青石斑鱼E.awoara长度为1 039bp的16S rDNA、tRNA-Leu和NA1部分序列,基于其及ND2、cyt b对石斑鱼系统发育进行了分析,结果表明石斑鱼遗传多样性与地域分布关系不大,不同系统树分析都表明同一石斑鱼物种的系统发生关系基本一致,石斑鱼种间亲缘关系较近.此外,也发现某些异种间亲缘关系比同种间亲缘关系近的现象.