水貂阿留申病毒部分VP2基因的原核表达及免疫学分析

利用PCR技术扩增出水貂阿留申病毒(ADV)含有VP2抗原表位区的基因片段,将其克隆到原核表达载体pGEX-4T-1中,构建出重组质粒pGEX-4T-VP2,并转化入大肠杆菌BL21中,用IPTG法进行诱导表达。经SDS-PAGE凝胶电泳和免疫印迹分析显示有目的条带,并且在诱导6 h后表达量达到最高,随时间的延长表达量降低。本研究成功构建了pGEX-4T-VP2重组质粒,确定了VP2基因的优化表达条件,为阿留申病的免疫学诊断和疫苗研制奠定基础。     

水貂阿留申病病毒分子生物学研究进展

水貂阿留申病病毒是一种在水貂中广泛存在的重要病原体.该病毒属阿留申病毒属,主要编码4种蛋白(结构蛋白VP1、VP2和非结构蛋白NS1、NS2).VP1蛋白在协助病毒产生感染性方面起着重要作用;VP2蛋白是该病毒的主要免疫原性抗原,能体外中和病毒;NS1和NS2对病毒在宿主细胞中的复制起重要的调节作用.该病毒的分子生物学诊断技术主要有核酸杂交技术、PCR和基因芯片检测技术.     

水貂阿留申病毒环介导等温扩增（LAMP）检测方法的建立

为建立一种简便、快速、特异的水貂阿留申病毒（ADV）检测方法,根据GenBank中已登录的ADV基因组序列,选择水貂阿留申病毒VP2基因作为靶基因,设计并合成5套环介导等温扩增（LAMP）反应所需的引物,通过试验筛选出最佳引物,并进行最佳引物的特异性及敏感性试验,建立了LAMP快速检测方法。试验结果表明,该方法比普通PCR方法灵敏性高10倍,与其他的水貂源病毒不发生非特异性反应,并且具有良好的重复性。利用建立的LAMP检测方法对30份临床样品的阳性检出率为6.7%。该方法简便快速,为水貂阿留申病的检测提供了新的发展方向,有望成为简易的常规检测手段,尤其适用于基层应用。     

水貂阿留申病毒纳米PCR检测方法的建立与初步应用

为建立便捷、灵敏的水貂阿留申病病毒(AMDV)纳米PCR检测方法,根据AMDV NS1基因的保守序列设计一对特异性引物,对纳米PCR反应的退火温度、胶体金浓度进行了优化;测序检测扩增基因是否发生变异;对特异性和灵敏度进行了评估。结果表明,此纳米PCR的最佳退火温度为51℃,普通PCR为55℃;加入胶体金最佳浓度在0.2~0.8nmol·L-1,纳米PCR与普通PCR产物测序相似性大于99%。特异性检测表明该纳米PCR方法只扩增AMDV而不能扩增犬瘟热病毒和水貂肠炎细小病毒。在粪尿样品检测中该纳米PCR敏感性比普通PCR高10倍。检测40份临床样品,结果表明该方法比对流免疫电泳检测敏感性提高,从而为用粪、尿等低病毒样品检测水貂阿留申病提供了一种新的有效方法。     

水貂阿留申病基因工程诊断抗原的制备

本研究旨在建立一种生产水貂阿留申病(Aleutian disease,AD)诊断抗原的新方法。试验提取水貂阿留申病毒(Aleutian disease virus,ADV)的基因组,PCR扩增ADV核衣壳蛋白VP2基因,构建重组表达质粒Bacmid-VP2,脂质体介导其转染昆虫细胞Sf9获得重组杆状病毒AcMVPV-VP2。电镜下观察表达的VP2蛋白,Western blotting检测目的蛋白的反应原性。以传统接毒方法生产的AD诊断抗原作对照,通过对流免疫电泳试验检测表达蛋白的生物学活性。结果表明,表达的重组VP2蛋白在电镜下组装成病毒样颗粒且能与ADV阳性血清发生反应。与商业诊断抗原相比,重组抗原诊断AD的阴阳性的符合率为100%。该方法可成为生产AD诊断抗原的替代方法。     

水貂阿留申病毒VP2基因高变区的多变性分析

为了了解青岛地区水貂阿留申病毒(ADV)VP2基因高变区的变异情况,试验参考基因库中ADV VP2基因设计1对引物,利用PCR技术扩增VP2基因高变区序列,应用DNAMAN进行序列分析和同源性比较。结果表明:扩增的6株ADV VP2基因高变区碱基长度均为226 bp,与预期目的条带大小一致。6株ADV VP2基因高变区核苷酸同源性为92.9%~100%,与已知国内外12株ADV VP2基因高变区相比核苷酸同源性为86.7%~97.3%。其中除2株基因序列完全相同外,其他4株都有很大的突变,与国内外毒株也有较大的差异,表明ADV VP2基因具有多变性。     

犬猫3种冠状病毒基因克隆的构建与芯片检测技术

蔗糖密度梯度离心纯化浓缩犬冠状病毒(CCV)、猫冠状病毒(FCV)和猫传染性腹膜炎病毒(FIPV)的细胞培养物,分别设计7、17、11对引物,对病毒RNA进行反转录和PCR扩增,回收PCR产物连接pGEM-T载体并转化大肠杆菌TGI,构建35个基因片段的克隆。煮沸裂解法制备质粒DNA,回收PCR扩增产物,点制冠状病毒基因芯片。抽提病毒总RNA,利用Cy3-dCTP随机渗入反转录PCR标记,与芯片进行杂交检测,淘汰交叉的克隆片段,每种病毒只选择其4对引物克隆的基因片段。将特异克隆扩增片段重新点制基因芯片,与病毒样品PCR扩增产物杂交,未发现交叉现象。基因芯片检测比传统PCR敏感1000倍,可有效应用于3种病毒的检测与区分。     

犬常见传染病诊断基因芯片的研究与应用

根据PCR技术扩增出犬腺病毒（CAV）ORF1（p-Ⅷ）基因、犬细小病毒（CPV）VP2基因、鸡血红蛋白的珠蛋白基因（GLOBc）各保守基因片段；采用RT—PCR扩增出犬冠状病毒（CCV）纤突蛋白（S）基因、犬瘟热病毒（cDV）融合蛋白（F）基因、犬副流感病毒（CPIV）核衣壳结构蛋白（NP）基因、狂犬病病毒（RV）核蛋白（N）基因的各一段保守序列，克隆荻取质粒。通过微量点样技术将这些质粒作为探针点在硝酸纤维素膜上，产生二维DNA探针阵列，制作成诊断基因芯片。对360份待检样品匀浆后提取核酸作为模板，扩增相应保守基因片段。通过生物素标记PCR（RT—PCR）技术，将所获得的扩增产物与诊断基因芯片进行特异性的逆向点杂交，然后用扫描仪对芯片进行扫描分析、判断。结果表明，此方法比病毒分离、HI、PCR或RT—PCR方法灵敏度高、特异性强，平均检出率要高20％以上，并可同时对犬多种疫病进行快速诊断。     

水貂阿留申病PCR检测方法的建立及应用

为了对水貂阿留申病毒(ADV)进行快速、准确地鉴定,试验根据基因库中ADV的NS1基因核苷酸序列,设计合成了一对特异性引物,经过反应条件的优化,建立了水貂阿留申病的PCR检测方法,对阳性病料进行特异性核酸扩增及产物测序,并对水貂肠炎细小病毒(MEV)、犬瘟热病毒(CDV)等病原核酸进行扩增检测该方法的特异性;用10倍系列稀释的ADV进行扩增检测敏感性;用该方法检测临床样品并与对流免疫电泳法进行了比较。结果表明:ADV阳性样品有明显目的条带(365 bp)出现,MEV、CDV均无特异条带出现,最低能检测到的病毒核酸量为2.53 ng/μL;临床样品检测表明PCR检出率为90%,对流免疫电泳法检出率为83%。     

番鸭细小病毒强毒株（MDPV—Q）VP2基因的序列分析

应用PCR技术扩增了MDPV－Q株的VP2蛋白基因片段。将扩增后的VP2基因重组到pMD18－T质粒载体上，并对插入片段进行序列测定。将测序结果及由该结果推的氨基酸序列分别与MDPV、GPV进行了同源性比较及分析。结果表明，我国分离的MDPV－株其VP2基因序列外分离株具有很高的同源性。而与GPV的同源性较低。     

禽白血病病毒B、E和J亚群基因芯片检测方法的建立

目的基于多重PCR技术,建立禽白血病病毒(ALV)的B、E、J亚群的基因芯片分型和检测方法。方法根据NCBI已收录的ALV三个亚群的参考毒株cDNA序列,在各亚群特异性基因突变区两端选取其保守区域,设计合成三个亚群的通用上游引物1条,以及B、E亚群的通用下游引物和J亚群下游引物各1条,将上述引物用Cy3标记,建立多重PCR体系;参考靶序列内部的三个亚群各自的保守区域,选择亚群之间基因突变位点多的区域,设计合成5条寡核苷酸探针,制作寡核苷酸探针基因检测芯片;以寄主细胞DF-1中提取传代ALV的cDNA,以及合成NCBI收录的各亚群参考毒株的cDNA序列作为检测模板;利用Cy3标记的PCR扩增产物,与基因芯片进行杂交反应,扫描结果。结果芯片准确检测并分型三个亚群的参考毒株,其检测灵敏度能够达到102个基因拷贝,且与禽类常见的四种病毒均无交叉反应。结论本研究结果证明,基因芯片技术是一种ALV的B、E和J亚群进行检测和分型的有效方法,且具有较高的特异性和灵敏度,为今后在临床应用中快速鉴别诊断ALV等免疫抑制病提供可行性。     

对虾黄头病液相基因芯片检测技术研究

 
为获得一种快速特异灵敏的检测对虾黄头病的方法,本研究通过RT PCR得到需要的DNA片段,选择两种高效的荧光编码微球,建立对虾黄头病（Yellow head disease, YHV）液相基因芯片检测体系并对病毒的GP116基因进行检测。通过对检测结果的分析,从试验检测的灵敏度和特异性方面证明这种技术在对虾黄头病的检测中是可行的。     

毛皮动物大肠杆菌对氟喹诺酮类药物及中药的耐药性研究

本试验旨在了解毛皮动物源大肠杆菌的耐药性,有效控制毛皮动物细菌病的发生.针对14株分离自毛皮动物的大肠杆菌,采用PCR方法检测氟喹诺酮类耐药基因gyrA的携带情况,并对扩增得到的gyrA基因进行克隆测序和同源性分析;进一步针对gyrA基因制备地高辛标记的核酸探针,使用斑点杂交检测大肠杆菌对氟喹诺酮类药物的耐药情况;使用牛津杯法检测了大肠杆菌分离株对复方中药的敏感性.结果显示,PCR检出gyrA基因的阳性携带率为57.1%,斑点杂交检出耐氟喹诺酮类大肠杆菌的阳性率为50.0%,对复方中药的耐药率为28.6%.结果表明,毛皮动物对氟喹诺酮类药物的耐药性非常严重,对中药表现较高的敏感性,研究结果将为临床毛皮动物大肠杆菌病的防制提供依据.     

Resistance of E.coli from Fur-bearing Animals to Fluoroquinolones and Compound Chinese Medicine

The aim of this study was to investigate the resistance to fluoroquinolones and compound Chinese medicine, and control colibacillosis in fur-bearing animals.14 E.coli strains isolated from diseased fur-bearing animals were detected by PCR for the fluoroquinolone-resistant gyrA gene,and then the PCR fragment of gyrA gene was cloned,sequenced and analyzed for homology.Afterwards,the fragment was labeled with digoxigenin as DNA probe for dot-blot hybridization detection.The resistance to compound Chinese medicine was detected by Oxford-cup tests.The results demonstrated that the positive rates of PCR and dot-blot hybridization were 57.1% and 50.0%,respectively.Only 28.6% of the E.coli strains were resistant to compound Chinese medicine.The results indicated that the resistance to fluoroquinolones in E.coli strains from fur-bearing animals was severe,however,the isolates were much more sensitive to compound Chinese medicine.The results would provide basis for control of colibacillosis of fur-bearing animals.     

猪链球菌精氨酸脱亚氨酸酶序列分析及其PCR检测

对9株猪链球菌2型重庆分离株的精氨酸脱亚氨酸酶基因进行克隆测序,结果表明该基因长度为1231bp,与Genbank发表的该基因序列相比,核苷酸同源性高于99%,推导的氨基酸同源性高于96%。根据精氨酸脱亚氨酸酶基因的测序结果建立扩增片段长度为237bp的PCR检测方法,35株猪链球菌致病株中,30株精氨酸脱亚氨酸酶基因的PCR检测阳性,有5株精氨酸脱亚氨酸酶基因的PCR检测阴性;14株正常猪扁桃体分离株中,11株为精氨酸脱亚氨酸酶基因的PCR检测阳性,3株为精氨酸脱亚氨酸酶基因的PCR检测阴性;猪链球菌1型、7型、9型、13型、1/2型各一株,均能扩增出精氨酸脱亚氨酸酶基因的片段。     

几种主要禽疫病诊断基因芯片的制备及初步应用

进行了几种主要禽疫病诊断基因芯片制备及其初步应用研究。试验分别设计和克隆鉴定了NDV、IBV、AIV和IBDV的靶基因重组质粒。以克隆的靶基因重组质粒为模板。分别进行PCR扩增制备靶基因并纯化，以基因芯片点样仪将制备的靶基因点制在氨基化的基片上，经干燥、水合、紫外线交联和洗涤后，成功制备了NDV-IBV-AIV-IBDV诊断基因芯片。试验应用CY3荧光标记制备的探针进行芯片的检验，结果表明制备的NDV-IBV-AIV-IBDV诊断基因芯片质量好，可对NDV、IBV、AIV和IBDV进行诊断检测，具有检测灵敏性好，特异性高和芯片可重复检测的优点。试验对30个临床样品进行初步应用检测，结果表明该诊断基因芯片技术与RT—PCR检测技术检出率基本一致，并具有同步诊断检测多种疫病的优点。     

PCR扩增TK基因检测鸡传染性喉气管炎病毒的研究

根据已发表序列设计一对包含鸡传染性喉气管炎病毒（ILTV）TK基因全长核苷酸的1259bp引物，对2株ILTV强毒和1株ILTV疫苗毒进行PCR扩增，均能扩增出预期大小的目的片段，酶切分析证实了目的片段的特异性，而其它禽病原体的扩增均为阴性。PCR检测ILTV DNA的最小检测量为75pg。此方法检测人工接种鸡的气管棉拭样品，均能检测到ILTV，因此可用于临诊样品鸡传染性喉气管炎病的检测和诊断。     

环形泰勒虫裂殖体表面蛋白基因PCR诊断方法的建立简

为寻求一种快速灵敏的环形泰勒虫病PCR检测方法,基于环形泰勒虫裂殖体表面蛋白（Theirelia annulata surface protein,TaSP）基因序列保守区设计特异性引物,通过PCR技术扩增出该基因长为393 bp的高免疫原性区片段。用该引物对环形泰勒虫、中华泰勒虫、瑟式泰勒虫、尤氏泰勒虫、吕氏泰勒虫、绵羊泰勒虫、马泰勒虫、驽巴贝斯虫、牛巴贝斯虫基因组模板进行特异性试验,对环形泰勒虫基因组模板进行梯度稀释后扩增,以确定试验的敏感性,同时用本试验建立的方法与常规显微镜镜检方法对150份血清样品进行检测。特异性试验结果显示,在被检测的9个样本中,只有环形泰勒虫基因组模板中扩增出了符合大小的特异核苷酸片段;敏感性试验结果表明,PCR对环形泰勒虫的扩增效率可达到10^-10;通过对150份血清样品的检测,并与血涂片方法进行比较,结果显示PCR方法具有特异性强、敏感度高等特点,适用于牛环形泰勒虫病的检测。     

小尾寒羊雌激素受体基因外显子4的克隆与序列分析

根据GenBank发表的人、鸡、大鼠雌激素受体(estrogen receptor,ESR)基因外显子4的序列设计1对引物,采用PCR 技术扩增出小尾寒羊ESR基因外显子4的DNA片段,将该片段克隆到pGEM-T Easy 质粒中,重组质粒用PCR 扩增进行阳性克隆鉴定,然后测定其核苷酸序列并推导氨基酸序列,同时将测定的小尾寒羊ESR基因外显子4序列与人、牛、猪、大鼠、鸡的外显子4序列进行比较。结果表明：克隆测序所得的核苷酸和翻译后的氨基酸序列与人、牛、猪、大鼠、鸡相比,同源性分别为77.68%～97.28%和71.82%～98.18%,显示了很强的保守性;小尾寒羊的核苷酸序列与人、牛、猪、大鼠、鸡相比存在1处特有变异,氨基酸序列23～36存在高变异区。     

应用PCR检测鸡传染性喉气管炎病毒

根据传染性喉气管炎病毒(ILTV)TK基因序列，设计、合成1对引物，应用PCR技术对ILTV以色列疫苗株、河南分离株（ILTV-CG和ILTV-XY）进行PCR扩增，均能扩增出预期大小的目的片段，测序分析和酶切分析证实了PCR产物的特异性，而对其它禽病原体的扩增均为阴性。PCR检测ILTV DNA的最小检测量为21 pg。应用PCR检测人工接种后不同〖JP2〗天数采集的鸡的结膜拭子，接种后第2~5 d均能检测到ILTV。该方法可用于鸡传染性喉气管炎病的诊断和临诊样品检测。