菜豆R2R3-MYB基因家族鉴定及其在BCMV侵染后的表达分析

为了明确菜豆R2R3-MYB基因家族的成员及受到BCMV侵染后的表达情况，利用生物信息学方法对菜豆R2R3-MYB基因家族成员进行鉴定和系统分析，同时利用BCMV侵染菜豆后在显症期的转录组数据筛选可能与BCMV侵染调控相关的R2R3-MYB基因家族成员，并对这些基因在病毒侵染不同阶段的表达模式进行实时荧光定量PCR分析。结果表明，菜豆R2R3-MYB基因家族共有159个成员，不均匀分布于菜豆11条染色体上，多含有2个内含子，编码184～554个氨基酸，均为亲水性蛋白。系统进化关系将菜豆R2R3-MYB基因家族成员分为32个亚组（P1～P32），同一亚组成员具有高度保守的基因结构和基序。菜豆基因组内共线性分析表明，片段复制事件和串联复制事件均进行了纯化选择。转录组数据显示，BCMV侵染前后菜豆接种叶和系统叶分别有20、33个差异表达基因；qRT-PCR分析表明，这些基因在病毒侵染后表达均有变化，其中，PvMYB18、PvMYB33、PvMYB92、PvMYB93在侵染早期和显症期均呈现先升高后降低的趋势，而PvMYB29、PvMYB97、PvMYB124、PvMYB128、PvMYB13...     

山东菜豆病毒病的发生与病原鉴定

山东菜豆病毒病发病率为14～37％。对采自九个地(市)的90份标样,根据寄主范围、汁液稳定性、传毒介体、病毒粒体的形态和血清学,鉴定出侵染菜豆的病毒有黄瓜花叶病毒(CMV)、菜豆普通花叶病毒(BCMV)、花生丛簇病毒(PCV)、蚕豆萎蔫病毒(BBWV)和三叶草黄脉病毒(CYVV)。主要毒原是CMV,各地均有分布,分离频率为53.3％,与其它四种病毒的复合侵染率为15.6％;BCMV分布也较广,分离频率为19.9％;PCV、BBWV和CYVV只分布在局部地区,分离频率分别为11.1％、10.0％和4.4％。本文还讨论了田间有翅蚜数量与病毒发生的关系。     

侵染菜豆的三叶草黄脉病毒的鉴定

菜豆(Phaseolus vulgaris)是人们喜爱的一种豆科蔬菜。菜豆病毒病发生相当普遍,是影响产量的重要因素。已报道的侵染菜豆的病毒种类很多,其中以菜豆普通花叶病毒(BCMV)、黄瓜花叶病毒(CMV)和菜豆黄花叶病毒(BYMV)最为普遍。1987年7月我们从泰安郊区菜豆上分离到一个分离物T-20,并对它进行了研究鉴定,结果如下。1.材料与方法     

低温胁迫对菜豆种子吸胀期间生理特性和发芽能力的影响

研究目的：为了探讨了菜豆种子在低温胁迫下吸胀期间的生理及发芽能力;以12个菜豆品种的种子为试验材料,设置常温对照（CK）和4℃低温处（LT）,测定低温胁迫对菜豆种子吸胀期间的生理特性和发芽能力的影响。结果表明：与常温对照相比,低温处理的十二菜豆的发芽率均有所降低,根系活力在不同的品种中表现不同;低温处理与对照处理相比较,十二个菜豆品种种子超氧化物歧化酶(SOD)活性大部分降低,过氧化氢酶(CAT)活性降低,过氧化物酶(POD)活性在四个品种中显著升高;丙二醛(MDA)和可溶性蛋白含量在不同的品种变化不同,但两者之间呈现负相关的关系;电解质渗漏率在四个品种中增高。结论：不同菜豆品种的种子对吸涨冷害的响应模式存在很多大的差异,解析高抗型和敏感型菜豆种子响应吸涨冷害的生理生化变化,可为进一步筛选抗吸胀冷害的菜豆品种提供理论基础。     

南京郊区菜豆普通花叶病毒株系的研究

从南京郊区菜豆(Phaseolus vulgaris)上表现花叶、皱缩花叶、叶脉坏死症状的病株上得到的病毒分离物,它们的寄主范围较窄。能够通过桃蚜(Myzus per-sicae)、豆蚜(Aphis craccivora)进行非持久性传播。菜豆病株的花器、种子带毒并通过种子传毒。失活温度为50～65℃,稀释限点为10~(-2)～10~(-5),体外存活期为24～96小时。粒体为线状,平均长度为T83nm。根据上述特性鉴定为菜豆普通花叶病毒(BCMV)。选择保留的三个BCMV分离物(NBV-4、NBV-5、NBV-6)在部分菜豆品种上致病力有显著而稳定的差异。用NBV-6的抗血清做免疫双扩散试验,三个分离物均呈阳性反应,沉淀线交界处完全融合,它们被定名为BCMV的三个株系BCMVa,BCMVb,BCMVc。用指示植物和抗血清测定,沪宁沿线均有BCMV分布,BCMV占所测样本28.7％,BCMV样本中以BCMVa占多数。     

哈尔滨郊区菜豆花叶病的调查

本文介绍了用已鉴定的菜豆普通花叶病毒毒株 BCMV(V-5)制备出效价为512—1024的抗血清。1985～1986年在哈市郊区采集具有花叶、皱缩、疱叶症状的病毒病标样200余份。对1985年采集的140份标样,取其中具有代表性的标样进行了生物学特性的测定,病毒粒体的观察以及 BCMV(NL-5)抗血清琼脂双扩散测定。其结果表明:80%的标样为菜豆普通花叶病毒。1986年以自制抗血清对61份标样进行琼脂双扩散测定,其中41份进行了反向间接血凝测定,结果表明:菜豆普通花叶病毒占1986年所测标样的50～73%,说明哈尔滨郊区菜豆普通花叶病毒所占比例较高。     

菜豆叶比重研究

】对２３２份菜豆品种（材料）结荚初期中上部叶片检测表明，叶比重为４０～６０ｇ／ｍ２，并筛选出小于４０ｇ／ｍ２（多为蔓生）和大于６０ｇ／ｍ２（多为矮生）叶比重的品种及材料。７６份矮生品种叶比重（加权）平均值为５３．６３ｇ／ｍ２，大于１５６份蔓生或半蔓生品种的平均值（４６．７５ｇ／ｍ２）。不同生育期菜豆叶比重变化很大。     

昆明地区软荚菜豆品种对花叶病抗性鉴定研究

 建立了软荚菜豆花叶病的病情分级标准和抗性评价标准。对昆明地区生产上主要应用的13个软荚菜豆品种对花叶病抗性进行了鉴定。结果为:在13个品种中有2个高抗品种、4个中抗品种,其余品种为感、中感或高感品种。在13个品种中,电镜观察到其中11个品种叶片内含有线状病毒粒子。     

甘肃省河西地区菜豆病毒病分子检测

以采集自甘肃省河西地区表现病毒病症状的菜豆病株叶组织总RNA为模板,进行RT-PCR扩增,鉴定出苜蓿花叶病毒、小西葫芦黄花叶病毒、菜叶普通花叶病毒、黑眼豇豆花叶病毒4种病毒.对预期大小的扩增产物进行直接测序.结果表明:该地区菜豆病毒病的发生以苜蓿花叶病毒、黑眼豇豆花叶病毒和小西葫芦黄花叶病毒复合侵染为主.     

转录组学分析揭示高粱对麦二叉蚜抗性的响应机制

[目的]麦二叉蚜是高粱生产过程中引起蚜害的主要优势种群之一,前期研究发现高粱抗蚜种质PI550607在苗期和成株期均抗麦二叉蚜,本研究通过转录组测序技术研究PI550607抗蚜相关基因的调控机制和代谢通路,为高粱蚜虫防控技术研究与抗蚜品种选育提供理论指导。[方法]以抗蚜品种PI550607为试验材料,室内培养出苗后2周进行人工接蚜,进行对照组0、12 h以及接蚜后12 h采样,提取RNA,进行转录组测序,对测序数据进行生物信息学分析,筛选差异基因,根据差异基因进行基因功能及代谢通路分析。同时,采用qRT-PCR方法对测序结果进行验证。[结果]PI550607对麦二叉蚜表现出较好的抗性。在蚜虫取食12 h后受蚜虫取食诱导的差异表达基因200个,其中上调基因188个,下调基因12个。基因功能注释显示上调表达的基因主要为植物激素代谢途径、苯丙烷类生物合成、类黄酮生物合成、谷胱甘肽代谢相关的基因以及WRKY转录因子,细胞色素P450等基因。GO富集分析显示在188个上调表达基因中有178个基因获得注释,分布于35个注释条目中,其中与植物抗虫相关的过程主要有苯丙烷类生物合成过程、响应生物胁迫以及...     

菜豆抗炭疽病育种抗病基因分析初报

对5组菜豆抗炭疽病育种抗源品种与感病且园艺性状优良的品种及其杂交后代,进行苗期接种抗性鉴定,结果显示各组合F2代抗病株与感病株分离比例均为3∶1,符合孟德尔的遗传法则,即菜豆炭疽病抗病性是受一对显性基因控制的。     

菜豆品种比较试验

为了筛选适宜浙江省秋季露地栽培的菜豆品种,选择了目前在浙江省有一定栽培面积的8个菜豆品种进行品比试验。从生长、抗性、产量及商品特性方面考查比较,红花黑籽四季豆、红花黄褐籽四季豆、浙芸4号、杭州高温架豆和浙芸3号品种表现突出。     

菜豆光合特性研究

本研究测定了６个菜豆品种单个壮龄叶片及３个菜豆品种群体的光合速率与光照强度、ＣＯ２浓度及土壤水分含量之间关系。结果表明蔓生类型的菜豆单个壮龄叶片的光合速率均高于矮生类型，而且光合速率日变化呈双峰曲线型，有明显的光合“午休现象”。矮生类型菜豆单个壮龄叶片光合速率低且光合速率日变化呈单峰曲线型。两种类型菜豆群体光合速率差异不显著，这可能是由于两种类型菜豆的株形、群体结构不同造成截获光能多少不同所致。提     

矮生型菜豆引种试验

食用菜豆是人们日常生活中常见的蔬菜品种之一,原产南美洲,后传入亚洲,我国南北方均宜栽培.食用菜豆含有丰富的营养物质,约含6%的蛋白质,并含维生素C、胡萝卜素、纤维素及糖等,同时菜豆又是罐藏及干制的良好原料.目前我国北方菜豆的栽培品种较单一,抗病性较差,尤其矮生型早熟品种产量低、品质差.由于我国北方地处高寒地带,蔬菜季节性强,故研究高产量、高品质及抗逆性强的矮生型早熟菜豆是当前迫切需要解决的课题.近年来,黑龙江农垦林业学校菜豆课题组从南方及国外引进一些新品种,经综合评价,筛选出适合我国北方寒区栽培的品种,现将试验情况介绍如下,供参考.     

PvEG261对普通菜豆镰孢菌枯萎病抗性和抗旱性的影响

【目的】分析普通菜豆PvEG261的序列及表达模式特征,并研究其抗枯萎病和抗旱功能,为普通菜豆镰孢菌枯萎病抗病和抗旱信号调控网络解析及分子育种奠定基础。【方法】对PvEG261开放读码框(open reading frame,ORF)进行生物信息学分析,预测该基因编码蛋白质的理化性质、二级结构、信号肽序列,在NCBI中通过BLASTP检索高同源性蛋白序列进行序列比对并构建系统发育进化树;利用qRT-PCR技术分析PvEG261组织表达特异性及响应枯萎病原菌、干旱胁迫的表达模式;构建PvEG261过表达载体,转化发根农杆菌K599菌株,诱导普通菜豆产生转基因不定根系,同时构建PvEG261沉默载体,其体外转录产物接种普通菜豆,干扰PvEG261的表达,通过接种镰孢菌枯萎病原菌和干旱处理,观察对照、过表达和基因沉默菜豆植株的表型,进行抗病性和抗旱性鉴定,并测定过氧化氢(H₂O₂)含量、丙二醛(MDA)含量、超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化物酶(POD)活性等生理生化指标。【结果】PvEG261的cDNA序列长471 bp,编码156个氨基酸组成的...     

菜豆品种抗炭疽病对比试验

人工室内对来源于山西省各地的8个常见菜豆品种接种菜豆炭疽病菌进行抗性鉴定。结果表明,泰国架豆王表现中抗,芸丰架豆王、九粒白与双丰三号表现中感,双丰二号、双青玉豆、赤裕三号、春丰四号感病。     

菜豆几丁质酶基因转化马铃薯及后代表达

通过农杆菌侵染和原生质体直接转化法把菜豆几丁质酶基因导入到马铃薯加工品种大西洋中,获得了13株转化后代,经过PCR分析和Southernblot分析,在5株后代中扩增出900bp目标带,说明菜豆几丁质酶基因已整合到马铃薯四倍体基因组中。RT-PCR分析结果表明,其中的3株叶片中有菜豆几丁质酶基因的表达,而且抗病试验进一步证明了该基因在叶片中有较强的表达强度,转基因植株的抗病性比对照提高了30%以上。     

基于转录组测序番茄抗南方根结线虫相关基因的挖掘

[目的]筛选番茄抗南方根结线虫侵染相关基因,为其克隆及番茄抗病育种提供参考依据.[方法]用Illumina HiSeqTM4000对南方根结线虫侵染和未侵染番茄抗性材料F5样本的转录组进行测序,基于差异表达基因本位数据库(G0)和Pathway显著性富集(KEGG)分析,挖掘参与抗南方根结线虫的相关基因.[结果]筛选到...     

水稻MAPK家族基因对纹枯病菌和激素的响应特征研究

MAPK (mitogen-activated protein kinase)信号级联系统在调节植物生长发育和逆境胁迫中具有重要作用。以不同抗感纹枯病水平的水稻品种为材料,分析OsMPKs类基因对水稻纹枯病菌的侵染响应特征,发现供检测的17个OsMPKs基因对纹枯病菌处理后均有不同程度的表达响应,且在抗病、感病品种间存在一定差异。通过茉莉酸、水杨酸和乙烯处理,发现OsMPKs基因至少受到1种激素的诱导表达,且对不同激素的处理响应存在差异。组织表达分析显示,OsMPK3、OsMPK6等6个OsMPKs基因在纹枯病菌主要侵染部位叶鞘和叶片中有较强表达。综合比较不同表达分析结果,发现一些可能参与调控水稻对纹枯病抗性的OsMPKs基因。     

抗氟苯虫酰胺小菜蛾差异表达基因及其通路

【目的】随着氟苯虫酰胺等双酰胺类杀虫剂的广泛应用,小菜蛾（Plutella xylostella）对该类药剂的抗性愈发突出。研究旨在从转录组水平研究小菜蛾对氟苯虫酰胺的抗性机制,明确小菜蛾对氟苯虫酰胺产生抗性的关键基因及通路,为揭示小菜蛾对氟苯虫酰胺的抗性机制打下基础。【方法】以室内筛选的小菜蛾抗氟苯虫酰胺品系（Rh28）、田间抗性种群（Rz36）和敏感品系（S）为材料,通过转录组测序技术（RNA-Seq）,获得抗性小菜蛾品系/种群在转录水平上的差异表达基因及抗性显著上调表达基因,采用基因本体（GO）显著性富集分析及京都基因与基因组百科全书数据库（KEGG）富集分析,确定差异表达基因具有的主要生物学功能及其参与的主要生化代谢和信号转导途径。【结果】通过将不同抗性品系/种群与敏感品系的RNA-Seq数据对比,获得数量不等的差异表达基因。将差异基因富集的生物学过程（biological process）和信号通路（pathway）进行GO分析,发现其主要集中于对刺激物的反应（response to stimulus）、催化活性（catalytic activity）和代谢过程（metabolic process）等条目中;而KEGG分析发现,差异基因主要集中于代谢通路（metabolic pathway）中,基因数量占比最高,为17.84%。通过统计分析进一步获得了抗性显著上调表达基因,并对其中218个基因开展了GO分析,其仍然主要集中在代谢过程、对刺激物的反应和生物调节（biological regulation）等条目中;通过对抗性显著上调基因进行KEGG分析,发现其仍主要集中在代谢通路中,其中谷胱甘肽-S-转移酶、细胞色素P450解毒酶及参与昆虫多种生理反应的热激蛋白（Hsp）超基因家族等基因的表达量均显著上调。通过聚类热图分析发现,显著表达上调的基因较多集中在内质网上蛋白质的加工（protein processing in endoplasmic reticulum）、酪氨酸代谢（tyrosine metabolism）、咖啡因代谢（caffeine metabolism）和Wnt信号通路（Wnt signaling pathway）中。【结论】获得了小菜蛾抗氟苯虫酰胺差异表达基因及抗性显著上调表达基因,其主要富集于代谢过程、应激反应及对刺激物的反应等条目中,这些基因的相互协同调控是小菜蛾对氟苯虫酰胺产生抗性的重要机制。