侵染云南烟草的粉虱传双生病毒卫星分子基因组结构特征

对侵染云南烟草的粉虱传双生病毒致病性相关分子DNA β进行PCR扩增和克隆.对9份采自不同时间和地区的样品中的DNA β分子的全基因组序列分析发现,9个DNA β都具有典型双生病毒DNA β卫星分子的基因组结构特征:在互补链上编码1个大小约为118个氨基酸的βC1蛋白,含有1个卫星分子保守区(Satellite conserved region,SCR)和1个A富含区.核苷酸同源性分析显示,9个分离物的DNA β分子中,7个分离物的DNA β属于TYLCCNV伴随的DNA β分子,1个属于MYVYNV伴随的DNA β分子,2个属于TYLCTHV伴随的DNA β分子,1个属于TbCSV伴随的DNA β分子.系统进化分析发现,这些DNA β卫星分子具有明显的种类和地理分布差异,但没有因寄主和采集时间的不同而表现出明显的差异.     

畜禽基因组拷贝数变异的研究进展

拷贝数变异(Copy number variation,CNV)是一种重要的基因组结构变异,主要指从几kb到数个Mb范围内DNA的多态,包括片段插入、缺失、重复等,它是研究基因组进化和表型差异的重要因素。CNV最早在人类基因组上发现,近几年,在鼠、猪、牛等动物基因组上的研究也取得了明显成效。文章阐述了生物遗传变异的2种方式CNV和单核苷酸多态性,对CNV的形成机制和检测方法进行了分析,重点介绍了畜禽基因组CNV的研究现状,并就CNV未来的研究重点和需要解决的问题进行了展望。     

上海地区番茄烟粉虱传双生病毒PCR检测

番茄黄化曲叶病毒属于双生病毒,根据其基因序列设计引物COPR、AV494和COPR、COPL,进行PCR检测,结果发现:从感病的DNA中扩增出了356 bp和570 bp目的片段,而健康植株和抗原材料DNA中无此扩增带,表明上海地区番茄黄化曲叶病毒属于烟粉虱传双生病毒。     

香料烟粉虱传双生病毒的分子检测

发生在保山香料烟生产区粉虱传双生病毒病,已严重影响到了香料烟的品质和产量。本研究利用PCR技术快速检测香料烟植株及田间其它植物如胜红蓟、赛葵及菜豆等、以及病毒介体的带毒情况。对部分样品的PCR检测及序列分析表明,感染香料烟双生病毒有中国番茄黄曲叶病毒、番茄黄曲叶病毒、云南烟草曲茎病毒、烟草曲茎病毒以及云南烟草曲叶病毒等,且一些样品存在复合侵染现象。本研究为掌握病害发生流行的基本规律,监控病害在香料烟上的发生流行提供了依据。     

烟草转GroEL基因抗双生病毒的研究

双生病毒是全球性的重要植物病毒,为提高植物对此病毒的抗性,分离了烟粉虱体内GroEL基因,将其连接到棉花韧皮部特异启动子PGHNBS下游,构建到植物表达载体PBI121上,采用农杆菌介导法转化烟草,获得抗性苗.对抗性植株进行PCR、RT-PCR和病毒侵染检测,结果表明:GroEL基因已经整合到烟草基因组中,并且在转录水平上表达.病毒侵染检测结果显示转基因烟草植株中没有检测到病毒,证明韧皮部特异表达GroEL基因抗双生病毒是可行的.     

粉虱传双生病毒在云南的发生分布

粉虱传双生病毒 (ｗｈｉｔｅｆｌｙｔｒａｍｓｍｉｔｔｅｄ ,Ｇｅｍｉ ｎｉｖｉｒｕｓＷＴＧ)属于双生病毒科 (Ｇｅｍｉｎｉｖｉｒｉｄａｅ)菜豆金色花叶病毒属 (Ｂｅｇｏｍｏｖｉｒｕｓ) ,是单链环状ＤＮＡ病毒 ,基因组有 2个组份 ,即ＤＮＡ -Ａ和ＤＮＡ - β .该属病毒在热带和亚热带地区为害多种作物 ,引起烟草、番茄等曲叶病 ,辣椒和甜椒曲叶皱缩病 ,葫芦科植物花叶病等。由于ＷＴＧ株系变异快 ,易发生突变和重组 ,造成病毒病的突发流行 ,近年来 ,本项目对云南的ＷＴＧ发生和分布开展了研究。1　材料与方法1 1　病害调查与样品采集根据…     

海南菜豆上粉虱传双生病毒的分子检测

为了解粉虱传双生病毒在海南的发生情况,从海南儋州采集了3个菜豆病样,症状表现为花叶、皱缩、叶背部叶脉突起,根据粉虱传双生病毒基因组DNA基因间隔区及外壳蛋白基因保守序列设计的简并引物,对这3个样品进行了PCR检测,从其中两个样品中扩增到预期大小为522 bp的DNA片段。PCR产物经克隆后进行序列测定,BLAST分析结果表明,该序列与与印度绿豆黄花叶病毒豇豆分离物(GenBank登录号:AF481865)的同源性最高,为65.9%,说明海南菜豆中存在着粉虱传双生病毒的侵染。     

猪繁殖与呼吸综合征病毒基因组遗传变异研究进展

猪繁殖与呼吸综合征是目前严重危害养猪业的一种传染病，呈世界性流行，该病的病原为猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV），不同PRRSV分离株核苷酸序列存在广泛而明显的变异，这给PRRS的准确检测和有效控制带来困难，本文综述了近年来国内外关于该病毒不同分离株的遗传和变异情况，从基因组水平阐述了与病毒致病性关系较大的结构域，其中5'UTR,OIRF1中的Nsp2及ORF3和ORF5为变异较大的区域。     

杨柳科植物叶绿体基因组结构及变异分析

【目的】获取杨柳科叶绿体基因组的结构及序列特征,揭示杨柳科植物的系统发育关系。【方法】利用Excel和本地Blast,分析统计杨柳科已公布的23种植物叶绿体基因组大小、结构组成、基因数量、排列顺序及内含子等信息;同时基于55个共有单拷贝蛋白编码基因,采用NJ法进行系统发育分析。【结果】杨柳科23种植物叶绿体基因组大小在155～159 kb,主要由大单拷贝区(LSC)长度差异引起。各物种基因排列顺序基本一致,均为2个IRs和2个SCs的典型四元组合结构,4个边界主要位于rpl22、ycf1、rps19基因处。psbZ、ycf15、lhbA、infA、trnK、trnG、trnL、trnV、trnI、trnA等基因存在缺失现象,引起基因数量差异。内含子在细胞色素复合物(petB)基因、RNA聚合酶(rpoC2)基因和核糖体蛋白(rpl2)基因等内发生结构变异,引起基因长度差异。系统进化分析结果表明,杨树聚类为4个高支持率进化支,钻天柳等7种柳树分为2个进化支。【结论】叶绿体基因组支持杨属、柳属独立进化,为杨柳科系统分类和系统发育提供了分子证据。     

2008年侵染江苏省番茄的粉虱传双生病毒发生分布

2007年底在江苏省兴化市保护地栽培番茄上发生了一种危害异常严重的病毒病,其病原初步鉴定为粉虱传双生病毒(Whitefly-transmitted geminivirus,WTG),为明确其在江苏省的发生情况及危害程度,2008年作者在省内各地展开调查,共采集病样115份并对其进行了分子鉴定.检测结果表明:2008年该病在南京、苏州、常州、徐州、泰州和盐城等地均有发生,已遍布于苏南、苏中、苏北;与2007年的发生情况相比,呈明显的蔓延态势.对其中17份代表性分离物的部分序列进行了序列测定,序列分析结果显示这些分离物的序列之间有着98.2%～100.0%的同源性,BLAST分析显示其与番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)同源性最高(超过99.0%). 发生情况及危害程度,2008年作者在省内各地展开调查,共采集病样115份并对其进行了分子鉴定.检测结果表明:2008年该病在南京、苏州、常州、徐州、泰州和盐城等地均有发生,已遍布于苏南、苏中、苏北;与2007年的发生情况相比,呈明显的蔓延态势.对其中17份代表性分离物的部分序列进行了序列测定,序列分析结果显示这 分离物的序列之间有着98.2%～100.0%的同源性,BLAST分析显示其与番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf     

菜豆金色花叶病毒属病毒的研究进展

Begomovirus病毒属双生病毒科、菜豆金色花叶病毒属,在热带和亚热带地区已成为植物病毒最具破坏力的种群,其流行的主要原因是农业的集约化及其传播介体——粉虱种群的增加。综合前人的研究,报道了Begomovirus病毒在其进化、危害及对其控制方面所取得的一些进展。     

利用体细胞无性系变异改良药用植物的研究进展

简介了植物体细胞变异、产生的可能机理及其特点。论述了药用植物诱发产生体细胞变异的有效途径及其取得的成就,探讨了其存在的问题和发展前景。     

苦荞的蔗糖含量变异研究

[目的]明确不同苦荞资源间蔗糖含量的差异,筛选出低蔗糖含量的苦荞材料。[方法]测定了不同产地的35份苦荞籽粒中的蔗糖含量。[结果]35份苦荞资源的蔗糖含量变化幅度为0．0077％-0．2089％,平均值为0．0518％;不同产地苦荞的蔗糖含量存在差异,以贵州赫章地区的较高,贵州纳雍地区的较低。[结论]苦荞中蔗糖含量较低,可作为低糖粮食作物进行推广利用。     

猕猴桃基因组DNA提取的研究

[目的]探讨猕猴桃属基因组总DNA的提取方法。[方法]以富含多糖和多酚次生代谢产物的猕猴桃为材料,比较不同品种在不同方法下的基因组DNA抽提效果,并对不同材料部位、抗氧化剂以及DNA纯化方法等对基因组DNA的获得进行研究。[结论]结果表明,以猕猴桃组培苗的茎部为材料,通过CTAB法,在裂解液中加入1％β巯基乙醇,以及在异丙醇沉淀前加入1／2体积的5mol／LNaCl,所得到的猕猴桃基因组DNA的质量较佳。[结论]该研究为今后猕猴桃分子生物学和基因工程研究奠定基础。     

苦荞基因型间的蔗糖含量变异研究（摘要）

[目的]明确不同苦荞资源间蔗糖含量的差异,筛选出低蔗糖含量的苦荞材料。[方法]测定了以不同产地的35份苦荞籽粒中的蔗糖含量。[结果]35份苦荞资源的蔗糖含量变化幅度为0.0077%-0.2089%,平均值为0.0518%;不同产地苦荞的蔗糖含量存在差异,以贵州赫章地区较高,贵州纳雍地区较低。[结论]苦荞中蔗糖含量较低,可作为低糖粮食作物进行推广利用。     

基因组印记的研究进展

基因组印记(genomic imprinting),又称遗传印记(genetic imprinting),是基因表达的一种调控机制,属于表观遗传学,包括DNA甲基化修饰和组蛋白甲基化修饰.阐述了印记基因的基本特征(可逆性、成簇分布、时空性、组织特异性和保守性),其可能的形成机制,为研究动、植物遗传育种奠定了分子基础.     

德州地区大气能见度变化特征分析

利用德州市气象局PWD20能见度仪观测的2009年的资料,分析了德州地区大气能见度的变化特征。结果表明,全年能见度日均值为8.55 km,最低值出现在07:00,最高值出现在16:00;四季能见度日变化总体趋势比较明显,冬季能见度最好,春季次之,夏季最差;能见度的季节变化特征是夏季最差,秋季次之,春季最好。低能见度主要发生在后半夜至凌晨,10:00以后出现概率明显减少,16:00以后又开始增加;低能见度日在夏、秋季出现较多,春季最少;夏、秋季以低能见度持续6 h以下的次数最多,冬季以持续8 h以上最多。     

双元细菌人工染色体基因组文库研究进展

酵母人工染色体(YAC)、细菌人工染色体(BAC)是伴随着人类基因组计划的实施而产生的,这些大片段基因克隆载体的应用推动了分子生物学、遗传学等学科的快速发展。以农杆菌介导的直接转化植物为代表的双元细菌人工染色体(BIBAC)载体的发展,加速植物基因组的研究,成为植物基因组分析、基因功能鉴定、染色体结构与功能关系研究的重要工具。介绍了人工染色体文库的发展史,根据建库经验,着重阐述了BIBAC文库的构建、鉴定与应用。     

基因芯片技术研究进展

主要就基因芯片的概念、技术原理、分类、主要技术流程、应用及其存在的问题和应用前景作了综述.