白及根际土壤真菌群落结构与土壤因子相关性

以种植白及2年的砂质壤土和砂质粘土为试材,采用高通量测序技术和生物信息学分析方法,研究根际真菌群落结构特征,测定土壤理化因子,分析土壤理化因子与真菌群落的相关性,以期为白及根际土壤微生物改良及优质高产栽培提供参考依据。结果表明：共得到43 651条真菌基因优化序列,2种根际土壤真菌存在差异,砂质壤土和砂质粘土特有真菌OTU数分别占总数的33.50%、33.60%;α多样性分析表明,砂质壤土中真菌属丰富度高于砂质粘土;群落结构分析表明,除未分类的真菌属之外,镰刀菌属(Fusarium)和被孢霉属(Mortierella)在2种白及根际土壤中均为优势真菌属,砂质壤土中显著富集附球霉属(Epicoccum)、土赤壳属(Ilyonectria)、Knufia,而砂质粘土中显著富集外瓶柄霉属(Exophiala)、原隐球菌属(Saitozyma);土壤有效磷对白及根际土壤真菌群落的α多样性有显著影响,有机质、pH、有效磷、有效镁、有效钙对土壤真菌群落具有显著影响。种植白及的砂质壤土和砂质粘土真菌群落结构存在差异,土壤理化因子对根际真菌具有一定影响,其中有效磷最为显著。     

不同树龄南丰蜜橘根际土壤微生物群落多样性分析

采用磷脂脂肪酸（PLFA）生物标记法,分析了树龄（嫁接后）1年、8年、15年和20年的南丰蜜橘根际土壤微生物多样性。结果表明,不同树龄南丰蜜橘根际土壤PLFA标记含量存在差异,呈现出不同的变化趋势,细菌、硫酸盐还原菌、嗜热解氢杆菌、放线菌等一些参与土壤物质循环的微生物类群的数量在下降,真菌、伯克霍尔德菌等一些适应于贫瘠土壤、代谢能力低的类群数量增加。8年树龄的南丰蜜橘根际土壤PLFA总量最大,细菌、放线菌PLFA含量高于其它土壤样品;20年树龄的南丰蜜橘根际土壤PLFA总量最小,其真菌PLFA含量高于其它土壤样品,表明土壤微生物量与土壤的肥沃程度相关,真菌比细菌更能适应养分贫瘠的条件。采用多样性指数分析,显示8年树龄的南丰蜜橘根际土壤微生物多样性指数最高,20年树龄的最低,表明随着南丰蜜橘树龄增长,微生物群落多样性与均匀程度皆出现了一定程度的下降。土壤酶活性分析结果表明,与8年树龄相比,20年树龄的南丰蜜橘根际土壤脲酶、酸性磷酸单酯酶与过氧化物酶活性较低,蔗糖酶活性较高。通过相关性分析发现,不同树龄南丰蜜橘土壤细菌、放线菌、真菌、原生动物各总PLFA与酶活性、土壤肥力因子之间存在相关性。由此可见,随着南丰蜜橘种植年限的增加,南丰蜜橘根际土壤的微生物群落多样性降低,根际土壤质量和一些关键酶活性出现较大幅度下降。     

不同时期油菜根际土壤微生物群落结构多样性及其差异

以陕西汉中油菜种植基地种植最广的油菜品种“邡油777”的油菜花期和果期的根际土壤样品为试材,采用高通量扩增子的试验方法,对样品根际微生物群落结构进行分析和比较,以期为后续油菜根际促生菌的筛选及油菜-根际土壤-微生物的相互作用关系研究提供参考依据。结果表明：不同时期油菜根际土壤微生物群落结构存在显著性差异,油菜花期土壤样品微生物多样性和丰富度较果期高。群落结构组成中占比大于1%的细菌门10种,占比大于1%的细菌属6种,变形菌门和酸杆菌门是其共有优势菌群;占比大于1%的真菌门7种,占比大于1%的真菌属7种。被孢霉门是油菜根际真菌群落的绝对优势菌群。油菜的不同生长时期是影响油菜根际微生物群落结构和多样性的重要原因。     

猕猴桃根腐病根际土壤酶活性及真菌群落组成研究

分析猕猴桃根腐病感病植株和未感病植株根际土壤真菌群落差异,可为研究猕猴桃根腐病发生机制及其调控技术提供依据。在浙江省天台县街头镇的“红阳”猕猴桃种植基地,以树龄9年的猕猴桃根腐病感病植株和未感病植株根际土壤真菌为研究对象,对菌群ITS序列进行高通量测序注释后,对比分析了真菌群落结构与多样性指数的差异,并测定分析了根际土壤脲酶、蔗糖酶和酸性磷酸酶的活性。结果表明,猕猴桃根腐病的发生极显著地降低了根际土壤脲酶、蔗糖酶和磷酸酶的活性(p<0.01)。感病植株根际土壤真菌群落丰富度指数(Chao1)显著低于未感病植株根际土壤(p<0.05)。在门分类水平上,感病植株根际土壤真菌中相对丰度降低的有担子菌门、未分类真菌和接合菌门,其差异均为极显著(p<0.01);相对丰度升高的为子囊菌门,其差异达极显著水平(p<0.01)。在属分类水平上,感病植株根际土壤真菌相对丰度增加的有赤霉菌属、丛赤壳属、镰刀菌属、假裸囊菌属和肉座菌属,其差异均达极显著水平(p<0.01);相对丰度降低的有未分类伞菌纲、枝鼻菌属、粗糙孔菌属、线虫草属、支顶孢属、粪盘菌属、木霉属和被孢霉属,其差异...     

木霉P3.9菌株对枇杷根际细菌多样性及其群落组成的影响

前期研究表明,木霉P3.9菌株Trichoderma atroviride对土传真菌引起的枇杷根腐病有较好盆栽防治效果,为了明确木霉P3.9菌株对枇杷根际细菌多样性及群落组成的影响,采用其菌株孢子悬浮液1×106 cfu/mL灌根后,不同时间采集枇杷根际土壤,通过Illumina平台高通量测序,比较木霉P3.9菌株处理...     

榨菜根肿病不同发病程度田根际土壤真菌群落多样性研究

以榨菜根肿病发病程度不同的根际土壤为分离对象,采用454焦磷酸高通量测序方法,研究了榨菜根肿病对根际土壤真菌群落的影响,并对榨菜根际土壤真菌的18SrDNA序列进行大规模测序,揭示根肿病不同程度发病田根际土壤真菌群落的变化特征。结果表明:土壤中子囊菌为优势真菌类群,其次为担子菌;重病田土壤中植物病原真菌数量高于其它发病田;重病田土壤真菌群落的Shannon和Simpson多样性指数、OTU数量和属的数量均低于其它发病田;表明榨菜根肿病在一定程度上影响根际土壤真菌群落的结构,这可能与根肿菌造成榨菜根系破坏后,其根系分泌物旺盛有关。     

高粱绿肥对设施黄瓜根际土壤理化性质及真菌群落的影响

以设施黄瓜"津春改良2号"为试验材料,通过在黄瓜定植前设施土壤中分别播撒240、120、60kg·hm^-2的高粱种子,在黄瓜定植前作为绿肥翻入土壤,研究黄瓜结果期土壤理化性质、酶活性以及真菌群落的变化规律,阐明高粱绿肥对黄瓜根际土壤理化性质和根际菌群结构变化的影响,以期为绿肥在设施生产应用上提供参考依据和实践指导。结果表明:高粱种植密度120kg·hm^-2可显著提高结果期黄瓜根际土壤速效磷含量18.44%、速效钾含量45.12%、碱解氮含量7.96%、有机质含量18.36%;高密度高粱绿肥处理可降低根际土壤中粪壳菌目、石蒜科比例,提高毛霉目、肉座菌目、伞菌目、小子囊菌目、阿太菌目、伞形科、毛壳菌科、丛赤壳科、阿太菌科、小囊科和粉锈菌科比例,改变真菌群落结构。绿肥对改良设施土壤条件和优化设施土壤微生物环境具有巨大潜力。     

大兴安岭火烧迹地土壤真菌群落结构及多样性研究

以大兴安岭火烧迹地在不同火烧年和不同火烧程度的土样为研究对象,揭示大兴安岭火烧迹地恢复过程中土壤真菌的多样性与群落变化特征,为火烧后森林生态系统的科学管理和森林更新提供理论依据。用PCR-DGGE法对土壤真菌进行了分析,采用Quantity one软件分析其多样性,通过序列的同源性比较构建系统发育树,真菌结构主成分分析采用Canoco等软件。结果表明:每个样品真菌种类丰富,不同样品有相同的真菌菌属也有不同的真菌菌属,17个优势条带测序所得菌属与黏滑菇属(Hebeloma)、蜡伞属(Hygrophorus)、蜡壳菌属(Sebacima)、管柄囊霉属(Funneliformis)亲缘关系最近,其中还有一些不可培养的真菌。不同火烧年和火烧程度之间土样真菌香农指数、丰富度、均匀度均达到显著差异(P0.05)。不同火烧程度、不同火烧年均能影响土壤真菌的群落结构。     

不同地区桃树根际土壤微生物群落结构及多样性分析

植物根际土壤微生物群落能够加速根际营养元素的循环,调节土壤肥力。分析桃树根际土壤微生态结构,可以为桃树种植土壤改良提供依据。利用高通量测序技术对临沂市李官、汤头、沂水3个地区桃园根际土壤微生物多样性和群落组成进行分析。经筛选和去除嵌合体后,得到了425 267条优质序列,这些序列的长度主要集中在400～450bp。在3个地区的样品中共鉴定出4 175个操作性分类单元（OTU）。物种分类结果显示,细菌包括25个门、54个纲、145个目、272个科、497个属和577个物种。在临沂不同地区的桃树根际土壤样品中,细菌群落组成和结构存在一定差异,细菌丰富度和多样性的顺序为汤头>沂水>李官。细菌群落中,线菌门和变形菌门的丰度之和达到50.37%～66.07%,属于绝对优势菌门。根据COG功能分类统计,土壤细菌的功能基因主要集中在新陈代谢、遗传信息和细胞信号传导等方面。总体而言,桃根际土壤的细菌多样性和群落组成在不同地区之间存在差异。     

土壤深度对凤丹根际细菌群落组成和多样性影响

为探究凤丹不同土层根际细菌群落组成及结构的垂直分布规律,采用高通量测序技术,分析了凤丹根际不同土层(0～20、20～40、40～60 cm)中细菌群落组成和多样性的变化。测序结果表明,所有土壤样品共获得3 588个OTUs,分属于20门,60纲、100目、110科、98属。0～20 cm深度土壤中的根际细菌丰富度显著高于20～40 cm和40～60 cm,不同土壤深度间根际细菌组成存在一定的差异,且随着土壤深度的增加根际细菌多样性逐渐减少。其中,3种土层间主要的差异细菌门为酸杆菌门、厚壁菌门、放线菌门,酸杆菌门在0～20 cm土层中占比18.7%,而在40～60 cm土层中酸杆菌门丰度达到34.5%;主要的差异细菌纲为酸杆菌纲、放线菌纲以及芽胞杆菌纲,酸杆菌纲在0～20 cm和20～40 cm土层中丰度分别达到18.7%和21.8%,而在40～60 cm土层中为34.5%,是前二者占比的1.58～1.84倍。放线细菌纲(Actinobacteria)在0～20 cm土层中仅占比6.5%,在20～40、40～60 cm土层中分别达到34.8%和20.7%。芽胞杆菌纲(Bacilli)在0...     

生物炭添加对马铃薯根际土壤真菌多样性和产量的影响

以马铃薯品种克新1 号为试材,在土壤中分别添加10、20、40 t·hm^-2 玉米秸秆生物炭,利用ITS 高通量测序技术, 研究不同生物炭添加量对马铃薯根际土壤真菌多样性和产量的影响。结果表明：各生物炭处理均降低了土壤真菌丰度,其中 以T3 处理（添加生物炭20 t·hm^-2）丰度最低。马铃薯根际土壤真菌主要包括5 个门、25 个纲、62 个目、120 个科、201 个 属和345 个种,在门分类水平上优势真菌群落为子囊菌门,相对丰度为86.86%～95.86%。添加生物炭处理有利于提高子囊 菌门的丰度,降低担子菌门和接合菌门的丰度;在科分类水平上,添加生物炭处理提高了粪壳菌目Incertae sedis 23、小子囊 菌科、毛壳菌科、丛赤壳科的丰度,降低了子囊菌科、粪壳菌科、粪壳菌目Incertae sedis 的丰度。添加生物炭处理提高了马 铃薯单株产量、单株结薯数和商品薯率,其中T3 处理效果最显著。综合产量指标和真菌多样性分析,T3 处理最有利于马铃 薯产量提高和土壤改良。     

盐胁迫对黄瓜根际土壤细菌群落结构和生长发育的影响

以耐盐性不同的两个黄瓜品种‘津春5号’(耐盐)和‘津优1号’(盐敏感)为研究对象,设置4个NaCl浓度处理(0、100、200、300 mmol · L-1),采用PCR-DGGE技术研究整个生长时期根际土壤细菌群落结构的变化。结果表明：盐胁迫能显著降低根际土壤细菌群落的丰富度(P＜0.05),低盐处理下,盐敏感品种根际细菌的丰富度较高;高盐胁迫下,耐盐品种根际细菌群落的丰富度较高。高盐胁迫对盐敏感品种根际细菌群落结构组成影响较大。各时期DGGE图谱差异条带的序列片段经测序比对,推测为4大细菌类群：Firmicutes、Proteobacteria、Gemmatimonadetes和Bacteroidetes,且大多属于Proteobacteria(变形菌门)的α–变形菌纲和γ–变形菌纲。随着盐浓度的增加黄瓜的株高和单株产量依次降低。     

不同猕猴桃品种根际AM真菌多样性与土壤养分相关性分析

【目的】探明不同猕猴桃品种根际AM真菌的多样性、空间分布规律以及土壤养分的生态功能。【方法】于2014年7月在贵州省猕猴桃产学研基地采集4个猕猴桃品种(‘海沃德’‘红阳’‘金艳’‘黄金果’)根际0~10、10~20、20~40 cm 3个土层的土样和根样,采用碱解离-酸性品红染色法与湿筛-倾析-蔗糖离心法分别测定菌根侵染率、AM真菌孢子密度,并对AM真菌孢子进行形态学鉴定,研究AM真菌的侵染特性、物种多样性以及与土壤养分的相关性。【结果】‘海沃德’侵染率最高,为34.3%;‘黄金果’侵染率最低,为14.9%。共分离鉴定出AM真菌4属69种,其中球囊霉属(Glomus)39种,无梗囊霉属(Acaulospora)24种,盾巨孢囊霉属(Scutellospora)4种,内养囊霉属(Entrophospora)2种,优势种枫香球囊霉(Glomus liquidambaris)在4个猕猴桃品种各土层中均有分布;AM真菌孢子主要分布于10~20 cm土层,孢子密度与土层和速效磷呈显著正相关、与全氮呈极显著负相关、与p H呈显著负相关,种丰度的分布变化规律与孢子密度一样,0~20 cm土层AM真菌平均多样性指数最高。【结论】4个猕猴桃品种根系均能被AM真菌侵染,但侵染率较低,不同品种猕猴桃根际具有较丰富的AM真菌资源,AM真菌物种多样性具有明显的空间异质性,并与土壤养分密切相关,这为进一步筛选和接种优势AM真菌,促进猕猴桃引种栽培及产业化发展具有重要意义。     

不同蔬菜根际细菌群落多样性及轮作效应

以设施内常用的黄瓜、菜豆、番茄和芹菜为试材,采用PCR-DGGE技术,研究了7种轮作栽培模式对其土壤细菌群落结构多样性的影响。结果表明:第1茬3种蔬菜中番茄和黄瓜的根际土壤细菌群落结构多样性差异不显著,都极显著高于菜豆(P0.01);第2茬轮作处理后,番茄、菜豆、黄瓜3种蔬菜与芹菜轮作均可较大程度地提高根际土壤细菌群做结构多样性指数和均匀度指数。     

北京地区梨园土壤线虫群落组成与多样性研究

对北京市大兴区梨园主栽品种丰水梨和黄金梨根围土壤进行线虫群落组成和多样性的研究。共鉴定出土壤线虫27个属,其中以食细菌线虫营养类群为优势类群,其他营养类群均较少;丰水梨和黄金梨根围土壤中的线虫优势属各不相同;梨园0～20 cm土壤比20～40 cm土壤的线虫数量多;丰水梨丰富度指数显著高于黄金梨;梨园0～20 cm土壤的WI值显著高于20～40 cm土壤的WI值,而土壤的植物寄生线虫所占比率在20～40 cm土壤显著高于0～20 cm土壤,说明植物寄生线虫所占比率是影响土壤健康的关键因素之一。     

不同种植年限蕉柑根际土壤线虫群落及营养类群结构特征

【目的】分析种植年限对蕉柑根际土壤线虫群落组成与结构特征的影响,探明不同种植年限的蕉柑根际土壤线虫群落多样性与营养类群分布差异的成因。【方法】五点采样法采取土样,浅盘法分离提取线虫,运用生态学指数和主分量分析的PCA排序相结合的方法处理数据。【结果】(1)小树龄蕉柑根际土壤线虫群落的个体密度、属数、多样性指数和丰富度指数均显著高于大树龄蕉柑样地(P0.05)。(2)PCA排序分析表明,食真菌线虫和大多数食细菌、捕食性/杂食性线虫主要分布在小树龄蕉柑样地,植食性线虫主要分布在大树龄蕉柑样地。(3)相关性分析表明,蕉柑种植年限与土壤环境因子、线虫总密度、线虫属数、生态学指数及食细菌和食真菌线虫、捕食/杂食性线虫密度呈极显著或者显著负相关,与植食性线虫密度呈显著正相关。(4)大树龄蕉柑根际土壤线虫的PPI值和PPI/MI指数显著高于小树龄蕉柑样地(P0.05)。WI和NCR指数表明,小树龄蕉柑样地土壤健康程度优于种植年限长的大树龄蕉柑样地,小树龄蕉柑样地土壤有机质的分解途径以细菌为主。【结论】果树种植年限的延长会改变土壤的养分与结构,从而降低蕉柑根际土壤线虫密度和群落的多样性,对蕉柑根际土壤线虫各营养类群的结构及分布产生趋向性影响。     

黄瓜根际土壤细菌群落的16S rDNA-PCR-DGGE分析

采用PCR-DGGE技术分析了接种枯萎病菌后黄瓜根际土壤细菌群落的动态变化。对黄瓜种植前、接菌前、接菌后发病、接菌后未发病以及接种清水(对照)共5份土壤样品直接提取其总DNA,用F338-GC/R518引物扩增16Sr DNA基因的V3可变区,结合DGGE电泳条带分析样品的细菌群落组成及变化趋势。结果显示,接种枯萎病菌后,会引起黄瓜根际土壤中细菌数量及种类发生较大的变化,其中,接种枯萎病菌后Rhodococcus phenolicus(E1)、Clostridiumsp.(E3、E6)以及3种未培养细菌(E2、E4、E5)数量增加,另外2种未培养细菌(A1、A2)数量减少。     

大连地区樱桃园根际土壤细菌群落功能多样性分析

利用Biolog生态微平板法,分析了大连地区黏土、沙壤土、粗骨土3种不同质地土壤樱桃园微生物代谢活性及其功能多样性。结果表明,土壤微生物的数量、群落代谢活性、底物碳源利用数（S）、多样性指数（H）及均匀度指数（J）均为黏土〉沙壤土〉粗骨土,3种质地的土壤细菌碳源均以利用碳水化合物为主,而对芳香化合物和胺类化合物的利用喜...     

新疆阿拉尔垦区红枣黑斑病发病规律

红枣黑斑病是枣果成熟期的主要病害,为了调查该病害在新疆阿拉尔垦区的发病规律,以骏枣和灰枣为试材,应用孢子捕捉技术和多元逐步回归法分析阿拉尔垦区红枣黑斑病的初侵染源、病菌孢子扩散与田间病情的关系以及影响病害流行的主要因素。结果表明:上一年的枣树病残体是红枣黑斑病初侵染源。分生孢子在5月中下旬开始出现,7月中旬至8月中旬为高峰期,随后进入消退期。分生孢子通常在枣树冠层附近分布较多,全天24h内都可捕到分生孢子,但一般12:00左右捕捉量最多。分生孢子的扩散与温度、降雨量和累积降雨量呈正相关,而且与病害的发生关系较为密切。骏枣抗病性较弱,采用漫灌方式的枣园黑斑病发生较重;9月降雨是影响黑斑病流行程度的重要因子。因此,菌量、品种、灌水、温度和降雨等因素共同影响黑斑病的发生与流行。