大豆疫霉菌与其它几种疫霉菌同工酶电泳比较研究

本对大豆疫霉菌（Phytophthora sojae）的15个菌株及其它7种疫霉的8个菌株进行了4种同工梅电泳比较研究。结果表明，大豆疫霉菌种内菌株间4种同工酶基本一致。疫霉属种间酯酶（EST）和超氧化物歧化酶（SOD）酶谱存在明显差异，表现为酶带的多少和Rf值的不同；淀粉酶（DIA）和过氧化氢酶（CAT）同工酶酶谱差异不很明显，与某些疫霉种酶谱相似，只表现为酶带强度上的差异。本首次报道了大豆疫霉菌的SOD、CAT和DIA同工酶，并指出EST和SOD同工酶在P.sojae种的鉴定上具有重要意义，在P.sojae种的鉴定提供一个辅助性手段。     

利用RAPD对中国热带地区疫霉菌分类的初步研究

以来自中国热带地区的2个疫霉种(柑桔褐腐疫霉P.citrophthora和芋疫霉P.colocasiae)16个菌株的菌丝体的总DNA为模板,使用5种随机引物进行PCR扩增,获得随机扩增多态性DNA(RAP- D),分析与各菌株相对应的RAPD的相似性。结果表明,RAPD 不但能辨别这2个疫霉种间的差异,而且可以辨别种内的分类单元。初步肯定了RAPD可以用于中国热带地区疫霉菌的分类鉴定     

黑龙江省土壤中大豆疫霉菌（Phytophthora sojae）的多样性

为探究不同类型土壤中大豆疫霉菌(Phytophthora sojae)的多样性,以分离自5种不同类型土壤的176株P. sojae为研究对象,利用基因推导法和AFLP分子标记技术进行多样性分析。结果表明,不同类型土壤中P. sojae无毒基因型、无毒基因种类、无毒基因组合和群体致病力均表现出差异性,其中黑土、白浆土和草甸土中的P. sojae无毒基因型、无毒基因种类和无毒基因组合多样性相对丰富,群体致病力中等偏弱;盐碱土中的P. sojae无毒基因型、无毒基因种类和无毒基因组合多样性丰富度较低,群体致病力相对较强;风沙土中没有分离到P. sojae。聚类分析表明,以0.76为阈值时,可将176株P. sojae划分为6个组,其中黑土和白浆土中的P. sojae呈现丰富的遗传多样性;草甸土和盐碱土中的P. sojae遗传多样性丰富度较低。综合分析表明,黑龙江省P. sojae群体无毒基因和遗传多样性丰富,并与土壤类型存在一定的相关性。     

橡胶树抗寒种质遗传多样性分析

应用RAPD和ISSR技术对20份橡胶树抗寒种质进行遗传多样性分析。结果表明，16个RAPD引物和12个ISSR引物分别扩增出条带113和101条，多态性条带指数(PPB)分别为61.1%和63.4%。据Nei-Li相似系数，ISSR标记在相似系数约0.74处，可将20份材料分为野生种质和栽培种质两大类；RAPD标记在相似系数约0.70处，也可将供试材料分为野生种质和栽培种质两类，但只有XJ002420为野生种质。对2种标记的分析结果进行相关分析，结果表明，RAPD和ISSR所检测的遗传相似系数呈极显著正相关，相关系数为0.672。以上结论表明，RAPD和ISSR标记可用于橡胶树种质资源的遗传多样性研究，但鉴于ISSR较RAPD有更强的多态性检出能力，ISSR技术应作为遗传多样性研究的首选单引物标记。     

橡胶树尖孢炭疽菌分子检测及遗传多态性分析

根据GeneBank中Colletotrichum属的20个种的ITS序列,比较设计出1对引物CAF53/CAR356(CAF53 5’-GGG CAG GGG AAG CCT CTC G-3’;CAR356 5’-AGC GGT GCT TGA GGG TTG-3’);该引物可以扩增出1条303 bp的尖孢炭疽菌特异性DNA条带。并利用ISSR和RAPD分子标记技术对从海南、广东、广西和云南等垦区橡胶树上收集的21个尖孢炭疽菌株进行遗传多态性分析,以杧果上分离的尖孢作为参照菌株进行了聚类分析。结果表明,RAPD的平均遗传相似系数为0.8,ISSR的平均遗传相似系数为0.7,2种分子标记的平均遗传相似系数基本一致,均可揭示尖孢炭疽病菌的遗传多态性;2种分子标记产生的聚类分析结果存在一定差异;ISSR和RAPD类群与菌株的地理来源均不存在相关性。     

利用醇溶蛋白、盐溶蛋白和RAPD标记划分玉米自交系类群的比较研究

利用醇溶蛋白、盐溶蛋白和RAPD分子标记研究了16个玉米自交系的遗传多样性,并对这16个自交系进行聚类分析。结果显示,在供试材料中筛选到多态性、重复性均比较好的随机引物13个,检测到醇溶蛋白、盐溶蛋白和RAPD标记的多态性条带分别为30条、34条和112条,分别占总带数的83.3%、85.0%和86.8%。3种标记所得遗传相似系数的相关性均达到了极显著水平,所得平均遗传相似系数(0.597、0.541、0.554)基本一致,RAPD标记的遗传相似系数标准差最小(0.080),相对较可靠。依据醇溶蛋白、盐溶蛋白和RAPD分子标记分别将16个供试自交系划分为3类、3类和4类,聚类分析结果都与系谱分析大体相似,同时也存在与所知系谱不符的现象。     

利用ISSR和EST-SSR标记分析茶树遗传多样性的比较

为了比较EST-SSR和ISSR 2种标记在茶树遗传多样性分析上的适用性,应用这2种技术分析了33份茶树资源的遗传多样性.12个ISSR引物共扩增出248条谱带,多态性比率为91.94%,平均多态信息量(PIC)为0.318.30对EST-SSR引物每个位点平均等位基因数为4.9个,平均多态信息量(PIC)为0.499.2种标记都能揭示茶树资源较高的遗传多样性,但从信息量上比较,ISSR标记比EST-SSR标记有较高的分析效率.ISSR和EST-SSR揭示的茶树遗传相似系数分别为0.709和0.734,二者接近.聚类分析表明二者有一定差异,遗传相似系数矩阵相关性分析结果表明2种标记间存在一定的正相关性(r=0.817,P<0.01).因此,这2种标记均可适用于茶树遗传多样性分析.     

黄淮地区大豆种质对疫霉根腐病的抗性分析

由大豆疫霉菌引起的大豆疫霉根腐病是严重影响大豆生产的毁灭性病害之一,防治该病唯一经济、有效和环境安全的方法是利用抗病品种.利用7个具有不同毒力公式的大豆疫霉菌株,对黄淮夏大豆产区的96个大豆品种(系)进行接种鉴定,96个大豆品种(系)对7个大豆疫霉菌株共产生38种反应型,有4种反应型分别与单个抗病基因的反应型一致,有10种反应型与2个已知基因组合的反应型相同.有5种反应型与3个已知基因组合的反应型相同,其它反应型为新的类型.根据"基因对基因"学说,抗病基因的推导结果有7个品种可能含有Rps3a,有4个品种可能含有Rps3b,有1个品种可能含有Rps3c,有5个品种可能含有Rps7,有一些品种可能含有国际上尚未命名的新的抗病基因.聚类分析结果表明,在以相似系数0.691聚类,96个大豆品种可以分成8类.研究结果为大豆抗病育种选择亲本和利用品种布局进行大豆疫霉根腐病生态控制提供了依据.     

利用ISSR标记评价黑龙江和吉林小粒大豆品种遗传多样性

为评价黑龙江省和吉林省小粒大豆品种的遗传多样性,从100个ISSR引物中筛选出多态性好的引物10个,对来自吉林省与黑龙江省的24份小粒大豆品种进行遗传多样性分析。结果表明:10个ISSR引物多态性信息含量为0.211 2~0.310 3,平均为0.249 6。ISSR标记指数为1.093 8~4.954 9,平均为2.890 3。24份小粒大豆的DICE相似系数为0.666 7~0.926 2,整体平均相似系数为0.794 3。吉林省小粒大豆品种之间的遗传相似系数范围(0.690 7~0.926 0)大于黑龙江小粒大豆品种之间的遗传相似系数范围(0.744 2~0.925 0)。聚类分析将供试材料分为4个类群,类群Ⅰ和类群Ⅱ均为吉林省小粒大豆品种,类群Ⅲ可以分为2个亚群。主坐标分析与聚类分析的结果基本一致。本研究结果可为小粒大豆遗传改良提供参考。     

东北地区玉米弯孢菌的致病性分化与RAPD分析

在东北三省15个地区采集分离26个玉米弯孢菌菌株,通过鉴别寄主技术与RAPD分子标记技术进行致病性与遗传分化的研究。结果表明,东北地区玉米弯孢菌在致病性与遗传上都存在明显的变异,二者有一定的相关性,未发现变异程度与菌株地理来源有明显的直接关系。26个菌株的致病性分为5种类型,其中中等致病类型分布遍及东北三省,为优势致病类群;强致病类型分布在吉林省的白城市;弱致病类型主要分布在吉林省的白山和梨树。用8个引物对供试菌株进行RAPD扩增,共获得77个RAPD标记,其中多态性标记71个,多态性比例92.2%。供试菌株在相似系数约0.71处共聚为4组,大多数致病性较强的菌株聚在一起,而弱致病株在相似系数相对较低时和其他菌株聚在一起。     

大豆疫霉根腐病分子生物学研究进展

大豆疫霉根腐病是严重威胁世界大豆生产的重要病害,选育和利用抗病品种是防治大豆疫霉根腐病最有效的措施,本文就和品种合理布局密切相关大豆疫霉根腐病菌遗传多样性、无毒基因标记及克隆、抗病基因的定位和抗性资源的分子鉴定等最近研究进展作一综述.     

The correlation of genetic diversity and geographic distribution of Fusarium graminearum in North part of Iran

Fusarium Head Blight (FHB), caused mainly by Fusarium graminearum, is one of the most notorious diseases in North part of Iran. Due to lack of sufficient information regarding genetic diversity of FHB, the correlation between genetic diversity and geographic distribution of 52 isolates that collected from infected wheat kernels from four main grown region of North part of Iran were analyzed with 10 simple Sequence Repeat (SSR) primers and 15 Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) primers. The un-weighed pair group method using arithmetic means (UPGMA) was used and a dendrogram was constructed based on Jaccard's similarity coefficient. Principal Component Analysis (PCA) of SSR and RAPD markers revealed that the first two factors accounted for 51 and 41% of the total variance, respectively. SSR and RAPD data classified isolates into four and seven groups, respectively. SSR analysis showed that there was a correlation between genetic clusters of isolates and geographical origin in F. graminearum. However, results of cluster analysis using RAPD data didn't show any relation with geographical distribution but the results of this analysis confirmed a genetic variation among all isolates.     

橡胶树多主棒孢病菌遗传多态性分析

利用ISSR（简单序列重复区间扩增多态性）和RAPD（随机扩增多态DNA）技术对供试的18个多主棒孢菌株进行了遗传多态性分析,研究结果表明,2种分子标记技术均能揭示橡胶多主棒孢病菌的遗传多态性。同时利用P距离模型构建了18个多主棒孢菌株的UPGMA聚类分析树状图,根据2种技术构建的UPG—MA聚类树状图可将供试菌株分为3个主要类群。ISSR类群和RAPD类群与地理来源均不存在明显的关系。     

黑龙江省链格孢属病原菌的RAPD分析

利用RAPD技术分别对分离自黑龙江省各地区的90株链格孢属病原菌进行了遗传多样性分析。利用NTSYS 2.0进行链格孢属病原菌的聚类分析。RAPD分析结果表明,引物OPE-19扩增后产生的各个群体间相似性系数分布在0.60¹.00。在68.0%相似性水平上可划分为3个主要RAPD组群和8个次要RAPD组群。聚类分析结果表明,黑龙江省链格孢属病原菌RAPD组群与寄主植物和分离地区之间没有相关性。     

利用RAPD、ISSR分子标记分析野牡丹属亲缘关系

采用ISSR和RAPD分子标记技术对9个种44份野牡丹属种质资源进行了亲缘关系分析。结果表明:11条ISSR引物共扩增出91条谱带,其中多态性条带90条,多态性条带的比率为98.9%;16条RAPD引物共扩增出113条谱带,其中101条多态性条带,多态性比率为89.38%。2种分子标记相比较,ISSR分子标记检测出的多态性比率更高。44份野牡丹属种质明显聚为2组,种质资源遗传相似系数在0.61~0.88,平均相似系数0.75。基于不同引物的条带组合构建了供试的44份野牡丹属种质资源的ISSR和RAPD指纹图谱,采用这2种指纹图谱可对供试的所有野牡丹属种质资源进行鉴定。     

Races of Phytophthora sojae in Iran

Phytophthora root and stem rot of soybean is a destructive disease of soybean in Iran. Races 1 and 3 of pathogen have already been reported from two major growing regions of the crop, Lorestan and Golestan provinces. In a survey during 2004-2005, 142 isolates of P. sojae were recovered from infected plants and naturally infested soil samples using selective media and soybean leaf baiting technique. The majority of tested isolates (110 isolates) belonged to race one of P. sojae and 32 isolates belonged to race 3. ITS region of 23 isolates were amplified with specific primers Ps1 and Ps2. Sequences of this regions were similar to other gene banks sequences except two isolates from China. This survey showed low diversity in Iranian population of P. sojae.     

Relationships between pathotypes and RAPDs, Gpi-allozyme patterns, mating types, and resistance to metalaxyl ofPhytophthora infestans in Canada in 1997

Relationships between pathotypes and other markers such as mating types, metalaxyl resistance, Gpi-allozyme and random amplified polymorphic DNA (RAPD) patterns, were investigated among 33 isolates ofPhytophthora infestans obtained from both potato and tomato across Canada in 1997. Pathogenicity testings, based on virulence against potato differentials carrying single-resistance genes and the size of lesions on leaves, revealed higher pathogenic diversity in 1997 than in the few past years, with more pathotypes and more race-complex isolates. A higher pathogenic diversity was observed within A2 (US-8) than within A1 (US-11) isolates. There was no correlation between the level of resistance to metalaxyl of an isolate and its pathogenicity. Nevertheless, when grouped into metalaxyl-sensitive (MS), -intermediate (MI), and -resistant (MR) classes, both average pathotype complexity and average lesion size were lowest for MS group. RAPD data revealed a good distinction between A1 (US-11) and A2 (US-8) mating type groups, and between isolates from British Columbia and those from other provinces. The detection in the last few years of both A1 and A2 mating types in Canada and the occurrence in 1997 of some isolates sharing different characteristics of both of these two groups suggest that sexual reproduction may have occurred locally.     

红掌细菌性疫病病原菌遗传多样性的 RAPD 和 Rep-PCR分析

由地毯草黄单胞菌花叶万年青致病变种引起的细菌性疫病是红掌生产中最具破坏性的病害。本研究对来自全国 8 个省市主产区的 93 个红掌细菌性疫病菌株，采用 RAPD 和 Rep-PCR（ERIC、BOX、REP）分子标记进行了遗传多样性分析。筛选出的 13 个 RAPD 引物共扩增出 131 个清晰、重复性好的条带，而 Rep-PCR 共扩增出65 个条带，所有位点多态性比率为 100%。基于 RAPD 和 Rep-PCR 结果计算的群体遗传距离显著相关，综合 2 种标记类型的分型结果进行 UPGMA 聚类分析，表明我国红掌细菌性疫病具有高度的遗传多样性，在遗传相似性系数范围 0.519 1~0.984 7，在 0.63 水平时可以将所有菌株划分为 3 个组群，分别包括 58、28、7 个个体，病菌群体的遗传多样性与其寄主品种、地理来源没有明显相关性。本研究为红掌细菌性疫病监测和抗病育种提供了科学依据。