古茶树种质资源遗传多样性ISSR分析

为了解贵州三都水族自治县古茶树的遗传多样性,本实验采用ISSR分子标记对145份古茶树的遗传多样性和亲缘关系进行分析.从100条ISSR通用引物中共筛选得到15条多态性好、可重复、扩增清晰的引物,利用筛选到的引物对供试的古茶树基因组DNA进行扩增.结果表明,15条引物共扩增出116条带,其中多态性条带有110条,平均多...     

黄瓜种质资源遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR技术对46份黄瓜材料分析,结果表明,8个ISSR引物在46份黄瓜种质中共扩增出42条带,多态性带的比例为85.71%.由Jaccard方法计算遗传相似系数可知,这些材料间的遗传相似系数的变化范围是0.3030～0.8750,其中23(ZN1)和42(四川寸金子)的遗传距离最小(0.3030),其遗传距离最远,34(Edipse)与43(杨泾黄瓜)之间的遗传相似系数最高(0.8750),其遗传距离最近.由聚类分析结果表明,若以相似性系数为0.52为阈值时,可将46份黄瓜品种聚为两类,一类以较强的雌性表现为特征,另一类则多表现为普通性型.若以0.54的相似系数为阈值,46份黄瓜材料可以被分为四大类,虽然不能完全按照生态型将现有黄瓜资源完全聚类,但总体而言,来自于同一生态型的多数资源可以聚在不同的类或亚类中.     

洋葱种质资源遗传多样性的ISSR分析

应用ISSR标记对32份洋葱种质资源的遗传多样性进行了分析。从31个ISSR引物中筛选出4条扩增产物条带清晰、多态性高的引物,在32份资源样品中共扩增出39条带,其中31条带为多态性位点,平均每个引物扩增的多态带数为7.75条,多态性条带比率（PPB）为79.48%。资源间的遗传相似系数在0.552~0.960之间,具有较为丰富的遗传多样性。ISSR聚类分析表明,在L取值为D=0.68时,可将32份洋葱资源分成5类：第一类包括18份种质资源,主要以Yellow Sweet Spanish系统为主;第二类包括1份种质资源,为Bejo Daytona;第三类包括3份种质资源,为Yellow Globe系统;第四类包括9份种质资源,为Yellow globe danvers系统;第五类包括1份种质资源,为Yellow Danvers system系统。较好地揭示了洋葱种质资源间的遗传多样性与亲缘关系,可为洋葱遗传育种和杂交亲本选择提供科学依据。     

富贵竹种质资源遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术对10份富贵竹(Dracaena sanderiana)材料进行了遗传多样性研究。从 36个引物中筛选出 8个有效引物,共扩增出125条带,其中多态性条带为69条,多态性比率为55.2%,遗传相似性系数范围在0.64～0.95之间。根据ISSR标记的结果,采用UPGMA聚类分析方法,可将供试材料分为3大类群。研究结果表明, 供试富贵竹材料的遗传多样性相对较低,迫切需要拓宽富贵竹的遗传基础。     

丝瓜种质资源遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术对60份丝瓜种质资源进行遗传多样性分析,100对ISSR引物中筛选出12对引物,共扩增条带154条,平均每个引物扩增条带14条,多态性条带143条,非多态性条带11条。各个引物的多态性比例范围为50%~100%,多态性比例92.9%。结果表明,丝瓜种质资源遗传多样性较高,同时也表明了ISSR分子标记能够很好的检测丝瓜种质资源的遗传多样性。通过聚类分析将60份丝瓜分为2大类,普通丝瓜和棱丝瓜。分别以0.646和0.718处为阈值,普通丝瓜和有棱根据瓜形分为短圆筒普通丝瓜、长圆筒普通丝瓜、短棍棒有棱丝瓜和长棍棒有棱丝瓜。     

东南亚茄子种质资源ISSR遗传多样性分析

为探讨东南亚和中国华南地区茄子育种资源的遗传差异,研究采用ISSR分子标记对来自泰国和马来西亚的10份茄子材料及中国和南美的8份材料进行遗传多样性分析。结果表明,17条ISSR引物共扩增出433条谱带,其中多态性条带390条,平均多态率为92%。17条引物在18份材料中的平均观测等位基因数、平均有效等位基因数、平均Nei’s基因多样度和平均香农信息指数分别为1.8971、1.4778、0.2850、0.4336,18份材料间的遗传相似系数GS在0.55~0.81之间。运用NTSYSpc2.10软件的UPGMA方法进行聚类分析,结果表明在遗传相似系数0.67时18份材料可分为2个类群,其中来自于东南亚的10份材料在第1类群,来自于南美的3份材料在第2类群。研究结果表明,东南亚茄子材料与中国和南美茄子材料间遗传多样性丰富,可为茄子种质资源的进一步研究和利用提供理论依据。     

茶树种质资源遗传多样性的RAPD分析

用随机扩增多态DNA（RAPD）标记对来自全国产茶省的31份种质资源、福建地区的10份种质资源以及湖南安化云台山种有性后代居群的30个单株的遗传多样性进行了检测。不同生态条件下的31份不同种质资源中,21个RAPD引物扩增出188条谱带,多态性比率为90.43%;福建10份种质资源,21个RAPD引物共扩增出154条谱带,多态性比率为81.81     

贵州桂花种质资源遗传多样性的ISSR分析

通过ISSR分子标记,对贵州不同地区的54份桂花种质进行了遗传多样性研究.选取11条多态性引物用于正式扩增,获得清晰、重复性好的DNA谱带93条,多态位性谱带80条,占总扩增带的86％,平均每个引物扩增8.45条;应用810和830的引物组合,构建了桂花种质的ISSR指纹图谱,可以有效区分所有供试材料;利用NTSYS和POPGENE 32进行数据分析,计算出相似系数与遗传距离,构建了54个样本的聚类树状图;以遗传相似系数0.69为阈值把54份供试桂花材料分为4类,聚类结果与地域及海拔具有一定相关性.因此,ISSR技术能够有效地用于桂花种质资源的鉴别及遗传关系的解析.     

新疆薰衣草种质资源遗传多样性的ISSR分析

本研究应用ISSR标记对19份薰衣草种质的遗传多样性进行分析。结果显示:从100条引物中筛选出9条多态性明显的引物,19份材料DNA共扩增出94条谱带,其中多态性谱带40条,多态性比率为42.6%,平均每个引物扩增条带数为10.4条;9条ISSR引物可将所有样品完全分开,当遗传相似阈值为0.69时,可将样品分为3个类群:第Ⅰ类群13个品种(系)可分为2个亚类,第Ⅱ类群5个品种(系)可分为2个亚类,第Ⅲ类群1个品种(系)。样品间的遗传相似性系数为0.325~0.975(平均0.737)。群体的有效等位基因数、基因多样度、Shannon信息指数分别为1.454 0、0.280 5和0.435 4。研究结果表明,19个新疆薰衣草种质资源遗传多样性水平处于较高。     

云南椰子种质资源遗传多样性的ISSR分析

为摸清云南椰子种质资源遗传多样性现状,促进资源的有效利用,以在云南收集的60份椰子种质为试材,利用ISSR分子标记技术对其遗传多样性进行了分析。结果表明：27条ISSR引物共扩增出272个位点,其中230个为多态性位点,多态性比率为84.56%,引物多态性指数为0.85,SM遗传相似系数平均值为0.664。根据各种质的SM,运用NTSYSpc2.10e软件的UPGMA方法构建了种质的系统聚类图,60份椰子被聚为3个类群(A、B、C)。其中,A类群为全部由本地种质组成的一个独立类群;C类群既包括部分本地种质,也包括来源于本地以外的其他种质。研究结果显示出云南椰子种质具有较高的遗传多样性;这些种质与外地种质具有独立性和关联性的特点。该研究结果可为云南椰子种质资源的进一步研究和利用提供参考。     

红托竹荪种质资源遗传多样性ISSR分析

利用ISSR分子标记对29个红托竹荪菌株进行遗传多样性分析。结果表明,利用TM值(溶解温度)差异对78条ISSR引物进行筛选,获得34条多态性丰富的引物,其片段大小为100～2 000 bp;各种质间Nei’s遗传距离(GD)值0.131 2～0.997 4之间,遗传相似性系数(GS)在0.401 6～0.877 0之间变化,聚类分析将29个红托竹荪菌株分为三类,Z 8(重庆市石柱县)与Z 10(四川省青川县)菌株间亲缘关系最近,Z 5(兴义市)和Z 2(织金县)菌株间亲缘关系最远,29个红托竹荪菌株具有较大的遗传差异性,遗传信息丰富。     

贵州甘薯地方种质资源ISSR遗传多样性分析

甘薯是贵州省重要的旱地作物之一,长期栽培形成了丰富的甘薯种质资源.本研究对收集到的45份贵州甘薯地方品种资源进行ISSR遗传多样性分析.结果表明,45份贵州甘薯地方种质资源的变异系数在0.07～0.81之间,平均为0.4,表明45份贵州甘薯地方种质资源的亲缘关系较近,思南黄皮桔红心和石阡紫皮黄心的最大,为0.81,瓮安白皮白心和铜仁黄皮桔红心的最小,为0.07.通过ISSR分子标记明晰贵州甘薯地方品种间的亲缘关系,以期为贵州甘薯杂交育种提供一定的理论依据.     

中国蚕豆种质资源ISSR标记遗传多样性分析

利用ISSR标记对中国18个省(区)的527份春播区和秋播区蚕豆资源的遗传多样性与亲缘关系进行分析。结果表明,11个ISSR引物共扩增出278条清晰的条带,其中多态性条带268条(占96%)。不同地理来源蚕豆资源群间的基因多样性指数在0.1267~0.2509之间,平均为0.1716;Shannon指数范围为0.1932~0.3767,平均为0.2608。两指数均以内蒙古资源群最高,云南和甘肃资源群次之,江西资源群体最低。非加权配对算术平均法(UPGMA)的聚类分析和二维主成分分析(PCA)结果表明,中国春播区和秋播区蚕豆资源明显不同,浙江和四川的资源形成独立的组群,明显不同于其他省份,其遗传背景独特,有待进一步研究。中国蚕豆种质资源遗传多样性差异和遗传关系与其生长习性、生态分布及地理来源密切相关。     

云南茶树资源遗传多样性与亲缘关系的ISSR分析

以8个种群134份云南茶树资源为材料,应用ISSR标记方法,进行了遗传多样性与亲缘关系分析。结果表明,18个多态性ISSR引物对全部试验材料进行PCR扩增,共获得475条稳定的谱带,其中多态性谱带470条(占98.9%),遗传多样性丰富;应用Nei-Li相似系数法估算了134个材料间的相似系数为0.445~0.819,平均为0.512,说明茶树资源间的遗传基础较宽;对134份茶树资源的分子系统聚类分析(UPGMA)将资源分为3大组,聚类结果与地理距离没有明显的相关性;主成分分析(PCA)表明主成分分析的结果与系统聚类基本一致,但是主成分分析更加直观清晰地显示各个材料间的亲缘关系;大厂茶等8个种群间的遗传相似系数于0.850~0.987间,平均为0.92,表明不同种群间的遗传差异较小。     

贵州金荞麦种质资源遗传多样性ISSR研究

应用ISSR分子标记方法,以来源于11个不同地域的金荞麦种质为材料,进行遗传多样性与亲缘关系分析。从40条通用引物中筛选出条带清晰、多态性丰富、重复性好的11个引物PCR扩增共获得103条稳定的条带,其中75个位点具有多态性,其多态性位点百分率(PPB)为72.8%。应用Nei-Li相似系数法对11份不同来源的金荞麦品种间遗传相似系数(GS)进行了估算,其GS为0.48~0.90,遗传多样性较丰富,11种金荞麦品种间遗传距离GD在0.10~0.52,平均为0.27,种间遗传差异较小。聚类分析表明:11个品种被分为2大类,在第一大类中,大方和水城最先聚在一起,二者亲缘关系较近,而贵阳与另外5个地区金荞麦亲缘关系较远则单独聚类;第二大类中,罗甸和独山最先聚为一类,且遗传距离短,二者亲缘关系近。本研究可为金荞麦的亲本利用及开展金荞麦遗传连锁图的构建和核心种质指纹图谱的绘制提供参考。     

斑茅野生种质资源遗传多样性的ISSR分析

斑茅具有抗病、抗虫、抗逆等有利基因,是甘蔗遗传改良的重要种质资源,为了对斑茅的遗传多样性进行鉴定,本研究运用ISSR分子标记的方法对24份斑茅无性系材料的遗传多样性进行鉴定,结果表明:14个ISSR引物共扩增出210条带,其中多态性条带为201条,多态性百分率为95.71%;24份材料的Nei指数(h)介于0.30~0.79,遗传相似系数集中在0.3~0.5之间;基于UPGMA聚类分析,在遗传距离0.77处,可以将24个材料分成5个类群,在24份材料中找到44条特异带;说明斑茅有着相对丰富的遗传多样性,能够广泛用于甘蔗的遗传育种改良。     

粤东地区橄榄种质资源遗传多样性的ISSR分析

该研究在于分析粤东地区橄榄种质资源的遗传多样性,从而为橄榄的保护和研究提供依据。利用ISSR分子标记对64份橄榄种质进行遗传多样性分析。共扩增得到128条谱带,其中多态性条带99条,多态性比率为77.34%。平均观察等位基因数为1.7734±0.4203、有效等位基因数1.4823±0.3888、Nei’s基因多样性0.2746±0.1975、Shannon’s信息指数0.4072±0.2721。64份种质的遗传相似性系数范围是0.5714~0.9379,平均遗传相似性系数为0.7793。聚类分析将64份种质分为5个类群,主坐标分析也将其分为5个类群。由结果可知,该地区橄榄种质总体遗传多样性水平较低,同时分子聚类分析结果与供试材料来源地无关。     

不同来源棉花种质资源遗传多样性的ISSR分析

 采取ISSR分子标记对48份棉花种质资源的遗传多样性进行分析,从60条ISSR引物中筛选出11条引物,这11条引物共扩增出92个条带,平均每条引物扩增出8.36个条带;其中多态性带77个条带,多态率达83.70％。UPGMA聚类分析显示,48份材料的相似性系数（GS）变化范围在0.27～0.93之间。聚类将48个种质资源划分为 4个大类(GS=0.55),湛江野生棉、廉江野生棉与其它品种在遗传上有很大差别,属于较原始类型,归为一类;长绒棉与陆地棉品种存在明显的遗传差异也单独归为一类;其它不同省份的陆地棉品种在遗传上有较高的相似性,归为其它类型。分析结果表明,ISSR具有丰富遗传多样性和稳定性, 是一种较好的遗传分子标记,适宜于棉花品种遗传多样性分析     

云南茶树种质资源的表型遗传多样性

对云南10个地区的830份茶树种质资源主要表型性状的遗传多样性分析和比较表明,云南茶树种质资源具有丰富的表型遗传多样性,13个描述型性状的遗传多样性指数在0.64~1.40之间,平均为1.04,以芽叶色泽较高,叶基较低;不同地区的茶树资源遗传多样性指数在0.76~0.99之间,以红河地区较高,其次是临沧和文山地区,以昭通地区较低。14个数值型性状的变异系数在10.27%~48.14%之间,平均为26.43%,以酚氨比较大,水浸出物含量较小;不同地区的茶树资源变异系数在16.09%~25.75%之间,以文山、红河地区较大,昭通、大理地区较小。茶树资源表型性状的遗传多样性和变异水平显示东南部>西部>东北部的趋势。通过聚类分析,10个地区的茶树资源划分为3个地理组,东北部的昭通和东南部的红河各单独聚为一组,其他8个地区聚为第3组,显示云南茶树资源存在东南部、西部、东北部生态地理的分化,初步推断东南部为云南茶树资源表型遗传多样性分布中心。