鸡CAPN1基因3'-UTR多态性及其与肉质性状的关联分析

试验利用PCR-SSCP技术对寿光鸡CAPN1基因3'-UTR的多态性进行了检测,并进一步分析了其与肉质性状的相关性.结果显示,在寿光鸡群体中检测到AA、AB2种基因型,基因型频率分别为0.43、0.57,AB为优势基因型;A、B等位基因频率分别为0.715、0.285,A为优势等位基因;群体中未检测到BB基因型个体.经x2检验,群体处于Hardy-weinberg非平衡状态(P＜0.05).CAPN1基因3'-UTR的多态性对胸肌pHu、腿肌pHu、肌内脂肪含量和胸肌剪切力有显著性影响(P＜0.05);对腿肌剪切力、失水率、胸肌蒸煮损失和腿肌蒸煮损失无显著性影响(P＞0.05).     

CAPN1基因PCR-SSCP多态性对鸡肉质性状的影响

为了分析寿光鸡CAPN1基因的多态性与部分肉质性状的关系,试验采用PCR-SSCP方法对CAPN1基因外显子2,3及其侧翼序列进行多态性检测.结果表明:CE2引物扩增的座位在群体检测到3种基因型即AA型、AB型和BB型,基因型频率分别为0.531,0.327,0.143;CE3引物扩增的座位在群体也检测到3种基因型即C...     

荆江麻鸭A-FABP基因内含子2多态性及其与屠体性状的关联研究

采用PCR-SSCP法检测了96只荆江麻鸭A-FABP基因内含子2的多态性,并对基因多态性与屠体性状进行关联分析。结果发现,本试验群体中检测到AA、AB和BB 3种基因型,其中AA、BB基因型频率相同,均为0.2083,A、B等位基因频率均为0.5000,群体该多态位点处于Hardy-Weinberg遗传平衡状态。最小二乘分析结果显示,荆江麻鸭A-FABP基因内含子2多态位点AA基因型个体活重、腿肌率和瘦肉率显著高于BB基因型(P0.05),皮脂率显著低于BB基因型(P0.05)。初步推断,A-FABP基因可作为影响荆江麻鸭皮脂性状的候选基因(标记),其中基因型AA为有利基因型。     

鸡骨骼肌纤维类型鉴定及CAPNCAPN1基因与鸡腿肌纤维类型比例的关联分析

研究通过SDH染色技术鉴定了明星E系、明星C系、寿光鸡、藏鸡和农大褐5个群体的鸡骨骼肌纤维中红肌纤维、白肌纤维和中间型纤维的比例,并以钙蛋白酶(CAPN1)基因为候选基因,检测了位于CAPN1基因3′UTR区3个SNP位点的基因型,进行上述表型与基因型的关联分析。结果表明,每个SNP均在试验群体中发现三种基因型,各SNP与胸肌各类肌纤维类型比例的关联不显著,但均与腿肌中的肌纤维类型比例显著关联。SNP1的CC基因型白肌纤维比例显著低于CG型个体(P0.05),SNP2的GG型个体白肌纤维比例极显著低于CG型个体(P0.01),SNP3的CC型个体白肌纤维比例显著低于CT型(P0.05)。推测CAPN1基因对鸡骨骼肌各种肌纤维类型的形成或转化有一定影响,可作为影响肌纤维转换的候选基因进行深入研究。     

中国西门塔尔牛CAPN1基因SNPs及其与经济性状关联分析

本研究旨在分析CAPN1基因部分SNPs与中国西门塔尔牛经济性状的关联性.试验选取同龄、同场的135头中国西门塔尔牛为材料,利用PCR-RFLP方法检测CAPN1 316和CAPN1 4751 2个SNPs位点的多态性,并进行方差分析.结果发现,CAPN1 316 SNP位点与大理石花纹显著相关(P＜0.05),杂合子AB基因型个体的大理石纹评分显著高于AA和BB基因型个体(P＜0.05);CAPN1 4751位点与大理石花纹和剪切力显著相关(P＜0.05),大理石花纹性状中杂合子AB基因型个体评分显著高于AA基因型个体,剪切力性状中BB基因型个体显著高于AA基因型个体.结果表明,CAPN1 316和CAPN1 4751位点适合用于中国西门塔尔牛眼肌、肌肉大理石花纹的分子标记选择.     

樱桃谷鸭MyOD1基因5′-UTR区域多态与生长和屠宰性状相关分析

为揭示樱桃谷鸭MyOD1基因5′-UTR区的多态性,本研究随机选取100只同日出雏、同等管理条件、健康无病的樱桃谷鸭(♂:55;♀:45)为实验材料,采用PCR-SSCP法结合直接测序技术,筛查MyOD1基因5′-UTR区的SNPs,分析其与鸭体生长和屠宰性状的关联性。结果表明:在5′-UTR区域筛查到了1个SNP位点g.95617 CG,形成了AA、AB和BB 3种基因型,其中AB基因型为优势基因型(P=0.5385),A等位基因为优势等位基因(P=0.587),多态信息含量(PIC)为0.367,属中度多态(0.25PIC0.5),卡方适合性检验结果表明(χ2=1.262),基因型分布未偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P0.05),可能是经过长期的选育并使得该区域重新回到了平衡状态,一定程度上反映了樱桃谷鸭的高度选育现状;关联性分析结果证实,突变AA基因型鸭群体2、6、8周龄活重显著高于其他基因型群体(P0.05),AA型鸭个体屠宰率显著优于野生BB型个体,可能是g.95617 CG突变增强了鸭群体的肌肉沉积效率。以上结果表明,MyOD1基因5′-UTR区域对鸭的生长和屠宰性状有重要意义。     

zyxin基因外显子7(exon 7)SNP位点与京海黄鸡屠宰及肉品质性能的相关性

以京海黄鸡为试验材料,采用PCR-SSCP技术检测斑联蛋白(zyxin)基因第7外显子SNP,探讨zyxin基因该位点多态性与京海黄鸡屠宰性能以及肉品质之间的关系.结果发现该位点存在1个SNP突变位点,表现为3种基因型,分别为AA、AB和BB.统计分析表明公鸡的肝质量、屠宰率,BB基因型显著高于AA型(P＜0.05);腹脂质量、胸肌率、腿肌率,AA型显著高于BB型(P＜0.05).母鸡群体中,只有爪质量AA型显著高于BB型(P＜0.05).3种基因型对内品质的影响均不显著(P＞0.05).     

寿光鸡IGF-Ⅰ基因多态性与体重及屠体性状关系的研究

采用PCRRFLP技术,对200只寿光鸡的胰岛素样生长因子Ⅰ(IGFⅠ)基因的5′端调控区进行遗传多态性研究,该调控区的扩增产物经PstⅠ酶切后出现AA、AB和BB3种基因型,其基因型频率分别是0.335、0.485和0.180。经χ2检验,寿光鸡在IGFⅠ位点上处于HardyWeinberg平衡状态(P>0.05)。分析基因型与10周龄体重和部分屠体性状时发现:基因型对半净膛重和胸肌重有显著影响(P<0.05)。公鸡中在半净膛重和胸肌重上基因型BB与AB、AA之间存在显著差异(P<0.05),而母鸡群体中却在肝脏重和半净膛重上基因型BB同AB、AA之间存在显著差异(P<0.05)。在研究指标中寿光鸡的BB基因型效应均大于AB和AA基因型。     

奶牛群体生长激素基因多态性与产奶量关联性

设计7对引物,利用PCR-SSCP技术检测GH基因在130头中国荷斯坦奶牛群体的遗传多态性,研究该基因对产奶量的影响。结果发现在GH基因的第3内含子、第5外显子和3′端存在多态性。GH基因第3内含子等位基因A、B的基因频率为0.775和0.225,3′端等位基C、D在奶牛群体中的基因频率为0.729和0.271,GH基因第5外显子等位基因E、F和G、H在奶牛群体中的基因频率分别为:0.507、0.138和0.259、0.096,GH基因第3内含子座位上不同基因型对305d产奶量有显著效应,AB基因型305d产奶量显著高于AA和BB型(P0.05)。     

Genetic Effects of IGF-Ⅰ and IGFBP-1 Genes on the Growth Traits in Jinghai Yellow Chicken

旨在对IGF-Ⅰ和IGFBP-1基因部分SNPs与鸡生长性状进行关联分析.试验以京海黄鸡为材料,采用PCR-SSCP方法检测2个候选基因的单核苷酸多态性(SNPs),采用一般线性模型(GLM)分析基因型与生长性状的遗传效应.结果表明,IGF-Ⅰ基因外显子3序列的60 bp处有A→G的点突变,在京海黄鸡中检测到AA、AB、BB 3种基因型,A等位基因频率为0.613,B等位基因的频率为0.387;IGFBP-1基因外显子2序列的21 bp处有A→T的点突变,104 bp处有T→C的突变,在京海黄鸡中检测到CC、CD和DD 3种基因型,C等位基因频率为0.558,D等位基因频率为0.442.IGF-Ⅰ基因BB基因型个体4周龄体质量显著高于AA和AB型个体(P＜0.05);IGFBP-1基因DD基因型个体8周龄体质量显著高于CC基因型个体(P＜0.05),4、12和16周龄体质量差异极显著(P＜0.01).因此,推测这些SNPs对京海黄鸡生长性状具有一定的影响,应用于鸡育种过程中的标记辅助选择可以加快育种进程.     

鸡CFL2基因3′UTR多态性与肉质性状的关联分析

以固始鸡×安卡鸡F2代资源群为研究对象,利用PCR-RFLP方法检测鸡CFL2基因3′UTR多态性,并将不同基因型与肉质性状进行相关性分析。结果表明:在鸡CFL2基因3′UTR区预测到5个microRNA靶位点。在CFL2基因3′UTR区发现G577A位点,该位点为KpnⅠ自然酶切位点,表现为GG、AA和GA 3种基因型,基因型频率分别为0.589、0.349和0.061,经χ2适合性检验,该位点在群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态。该突变位点对鸡的腿肌肌纤维密度和肌纤维直径具有显著影响(P<0.05)。结果显示,CFL2基因对鸡的腿肌肌纤维性状有一定影响,同时为该基因的标记辅助育种和进一步研究提供参考。     

IGF-1基因5′调控区DNA序列多态性与新扬州鸡肌肉产量关系的研究

以150只非同胞新扬州鸡为材料,采用PCR-RFLP法检测了该基因5′调控区DNA序列多态性,并运用线性模型统计方法分析了多态性与肌肉生长相关性状的关系。结果表明:新扬州鸡IGF-1基因5′调控区存在两种不同DNA序列,经Pst1酶切后出现3种基因型(“-/-”、“+/-”、“+/+”),-/-基因型频率为16%,+/-基因型频率为45.33%,+/+基因型频率为38.67%,基因型分布符合“哈代-温格伯定律”(P>0.05)。各基因型鸡的12周龄体重、屠体重、全净膛重、胸肌肉重和腿肌肉重的最小二乘均数存在“-/-”>“+/-”>“+/+”的趋势,且-/-基因型显著高于“+/+”型(P<0.05),-/-基因型胸腿肌肉总产量比+/+型高8.76%。基因型效应分性别考察与合并考察有相似的趋势。而胸肌率、腿肌率和全净膛率各基因型间差异均不显著(P>0.05)。     

不同性别瓢鸡肉质物理特性的初步分析

以40只(公母各半)45周龄的镇沅瓢鸡为研究对象,对其肉质物理特性进行测定分析。结果表明,同一部位不同性别间,公鸡腿肌肉色的L*值及胸、腿肌p H24h值均显著低于母鸡(P0.05),公鸡胸、腿肌的a*值及腿肌的剪切力(N)显著高于母鸡(P0.05)。同一性别不同部位间,公鸡胸肌L*值显著高于腿肌(P0.05),胸肌a*值显著低于腿肌(P0.05),母鸡胸、腿肌L*值和a*值差异不显著(P0.05);公、母鸡胸肌的蒸煮损失均低于腿肌(P0.05);公、母鸡腿肌p H45 min值和p H24 h值均显著高于胸肌(P0.05)。对肉品质物质指标之间的相关性分析发现p H45min值与失水率和蒸煮损失呈显著负相关,L*值与a*值呈显著负相关,L*值与失水率呈显著正相关,a*值与失水率呈显著负相关,失水率与蒸煮损失呈显著正相关。     

云南无量山乌骨鸡肉品质物理指标比较分析

为进一步了解无量山乌骨鸡肉品质,试验以40只(公母各半)150日龄的云南无量山乌骨鸡为研究对象,对其肉品质物理特性指标进行测定,通过对无量山乌骨鸡肉品质客观指标(肉色、失水率、嫩度、pH值、蒸煮损失、剪切力)的综合分析,结果表明:相同肌肉组织不同性别间公鸡胸肌和腿肌肉色的黄度(b*值)、剪切力(N)、pH45 min值、pH24 h值均显著高于母鸡(P0.05),公鸡胸肌的亮度(L*值)显著低于母鸡(P0.05),公鸡腿肌肉色的红度(a*值)极显著的高于母鸡(P0.01),公、母鸡胸肌和腿肌的失水率和蒸煮损失率均差异不显著(P0.05);相同性别不同肌肉组织间公、母鸡腿肌pH45 min值和pH24 h值均显著高于胸肌(P0.05),公母鸡胸肌亮度(L*值)和黄度(b*值)显著高于腿肌(P0.05),相反公鸡胸肌红度(a*值)极显著低于腿肌(P0.01),母鸡胸肌和腿肌红度(a*值)差异极显著(P0.01),公、母鸡胸肌的剪切力(N)和蒸煮损失均显著低于腿肌(P0.05),公、母鸡胸肌的失水率均显著高于腿肌(P0.05)。     

钙蛋白酶3(CAPN3)基因多态性与牛胴体性状的关联分析

为了探讨钙蛋白酶3(Calpain3,CAPN3)基因作为影响牛肉质性状候选基因的可能性,寻找与牛肉质性状相关的分子标记,对CAPN3基因的5′端区域进行SNPs检测,分析不同基因型在不同品种或者组合群体间的分布规律。利用测序和PCR-RFLP的方法进行SNPs检测和基因型分析,计算等位基因频率、各位点多态信息含量。结果发现,2546位处发生点突变C→T。各位点的3种基因型与牛生产性状的最小二乘分析结果表明,AB与BB基因型个体在胴体质量指标上存在显著差异(P0.05)。初步推断CAPN3基因可能是影响牛肉质性状潜在的主效基因或与主效基因连锁,并且这个位点具有成为分子标记的潜在可能。     

瑶山鸡MTNR1B基因的多态性及其与产蛋性状的关联分析

本研究拟为贵州优质品种资源瑶山鸡的高产选育提供科学依据。运用分子生物学手段,设计2对引物P1、P2采用单核苷酸多态性和测序相结合的方法,研究瑶山鸡MTNR1B基因的遗传多样性,并与产蛋性状进行关联分析。结果表明:P1检测出AA、AC、BC 3种基因型,AA基因型为优势基因型,等位基因A的频率最高为0.90,多态信息含量为0.17,P1位点的3种基因型与开产日龄和38周龄产蛋数差异均不显著;P2检测出AA、AB、AC、AD 4种基因型,AC为优势基因型,等位基因A的频率最高为0.51,多态信息含量为0.46,AD和AC基因型的开产日龄显著高于AA和AB基因型(P0.05),AA和AD基因型的产蛋数极显著高于AB基因型(P0.01),AC基因型的产蛋数显著高于AB基因型(P0.05)。     

急性热应激对雁鹅肌肉品质的影响

将42只1日龄健康雁鹅随机分为7组,每组6只,饲养至8周龄时,A组置于(22±1)℃作为对照,B、C、D、E、F组分别实施2、4、6、8h和10h(40±1)℃的急性热应激,热应激后立即屠宰,G组热应激10h后恢复12h再进行屠宰,以测定急性热应激对雁鹅肉质的影响。结果表明:胸肌pHi和pHu分别从宰前热应激6h和8h开始显著降低(P0.05),而腿肌pHi无显著变化,pHu也仅在热应激10h后才开始显著降低(P0.05);宰前热应激2h后胸肌剪切力开始显著升高(P0.05),4h后滴水损失和烹饪损失也显著高于对照组(P0.05),但此后除了烹饪损失在热应激达10h时又表现出显著升高外,随着热应激时间的延长胸肌的剪切力、滴水损失和烹饪损失并无显著变化;10h热应激后恢复12h,pH、滴水损失、烹饪损失和剪切力等仍未能恢复正常。腿肌的滴水损失、烹饪损失和剪切力变化规律与胸肌基本相同,但烹饪损失和剪切力的变化均略滞后于胸肌;本试验条件下,宰前热应激对肉色无显著影响。     

庄河大骨鸡GHR基因的多态性及其与产肉性能的关联分析

本文旨在探究庄河大骨鸡GHR基因的多态性及其与产肉性能相关的遗传标记.以17周龄庄河大骨鸡的公母鸡为试验材料,利用PCR-RFLP分子标记技术分析了GHR基因的内含子2,结果发现:GHR基因在庄河大骨鸡中存在AA、AB和BB三种基因型,基因型的频率分别为:0.3575、0.3825和0.2600,A和B基因的频率分别为0.5488和0.4513;AA型公母鸡的活体重、屠体重、半净膛重、全净膛重、胸肌重和平均日增重分别显著高于AB型和BB型的公母鸡(P＜0.05);腿肌重、半净膛率和全净膛率三个基因型间的公母鸡差异不显著(P＞0.05);AB型公母鸡和BB型的公母鸡在所测性状方面无差异(P＞0.05).GHR基因的AA型对鸡的产肉性能有显著影响,但是否能作为研究该基因与庄河大骨鸡产肉性能相关的重要遗传标记还需做进一步研究.     

3品种鹅Myostatin基因3′-调控区SNPs群体遗传学分析

利用已测得的鹅Myostatin基因3′-调控区核苷酸序列设计5对PCR-SSCP引物,对扬州鹅、皖西白鹅以及五龙鹅3品种家鹅该区域内单核苷酸多态性进行了分析,并探索了单核苷酸多态性与生产性能之间的关系。结果表明,检测到A→G（88位）和G→T（353位）2个单碱基突变位点。88位处,E等位基因为优势等位基因,具有EE、EF两种基因型,以扬州鹅杂合子频率最高（0.550）,皖西白鹅30个个体仅有一例EF型;353位处,G为优势等位基因,具有GG、GH和HH 3种基因型,3品种均具有较高的GG基因型频率、较低的HH基因型频率。屠体性能分析发现,EF基因型家鹅具有更高的屠体性能;扬州鹅、皖西白鹅GG型个体的腿肌重和腿肌率显著高于HH型个体（P〈0.05）,五龙鹅腿肌重、腿肌率具有GG型（GH型（HH型的趋势,但差异不显著（P〉0.05）。     

鸡CACNA1S基因SNPs及其与部分屠体性状的关联性研究

为了研究L型钙离子通道α1亚单位(CACNA1S)编码基因与动物肌肉收缩和发育的关系,试验采用PCR-SSCP技术,首次对萧山鸡、仙居鸡、灵昆鸡、萧山鸡×仙居鸡杂交F1代、爱拔益加鸡(AA鸡)CACNA1S基因5’-调控区(5’-UTR)和外显子1进行多态性检测,同时结合屠体性状进行关联分析。结果表明:试验群体CACNA1S基因5’-UTR和外显子1存在2个单核苷酸多态性(SNPs)位点与屠体性状关联;SNPs716位点JJ基因型的胸肌率极显著大于KK基因型(P<0.01),SNPs1711位点YY基因型的胸肌率极显著大于XY和XX基因型(P<0.01),YY基因型的半净膛率极显著大于XX基因型(P<0.01)。初步推断CACNA1S基因可能是影响鸡部分屠体性状(全净膛率、半净膛率、胸肌率、腿肌率)的主效基因或与主效基因连锁,并且这些突变位点可能作为分子遗传标记用来选择鸡的屠体性状。