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木瓜属优良品种亲缘关系的AFLP分析 总被引:3,自引:1,他引:2
用AFLP技术对29个木瓜属品种的亲缘关系进行分析.用8对引物(EcoRⅠ+3/Mse Ⅰ+3)对基因组DNA进行选择性扩增,共获得1095条扩增带,其中1035条具有多态性,多态带百分率达94.52%,揭示木瓜品种具有丰富的遗传多样性.采用NTSYS-PC软件的DICE法计算样本间的相似系数,UPGMA法进行聚类分析.结果表明:品种间的相似系数在0.4650~0.8339之间,具有相似形态特征的品种优先相聚,29个品种可以划分为4类,且基本对应着贴梗海棠、日本木瓜、木瓜海棠和傲大贴梗海棠,但品种'猩红与金黄'宜归人贴梗海棠内,而'碧雪'的分类地位值得进一步探讨.说明AFLP标记技术能较好地揭示木瓜属种质资源的亲缘关系及演化规律. 相似文献
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用RAPD分子标记探讨倭竹施的属间关系 总被引:6,自引:0,他引:6
采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对倭竹族(Shibataeeae
Nakai emend keng f. )中 8属,即倭竹属Shibataea、刚竹属Phyllostachys、业平竹属Semiarundinaria
,短穗竹属Brachys-tachyum ,大节竹属Indosasa ,唐竹属Sinobambusa ,方竹属Chimonobambusa
,筇竹属Qiongzhuea 中的16种进行了分析.选用20个10碱基随机引物扩增结果,计算属间遗传相似系统,建立UPGMA聚类图.分析结果表明①大节竹属和唐竹属,方竹属和筇竹属关系密切,这一结果与形态学研究结果一致;②业平竹属和短穗竹属关系较密切;③在倭竹族内基于形态研究结果建立刚竹亚族Phyllostachydinae
Keng f.和倭竹亚族Shibataeinae或唐竹亚族Sinobambusinae Z. P. Wang和倭竹亚族Shibataeinae
Soderstrom & Ellis的观点没有得到RAPD分析的支持. 相似文献
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甘肃省苹果属植物种类及分布 总被引:1,自引:0,他引:1
在多年调查研究的基础上,首次报道了甘肃省苹果属植物种类及分布。甘肃产苹果属植物14种2变种1变型,其中野生种类9种2变种1变型,主要分布于全省天然林区,栽培种类5种,主要在兰州以南农区、城镇栽培。 相似文献
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苹果属观赏海棠McCHI基因的克隆及不同叶色品种间表达差异分析 总被引:1,自引:0,他引:1
以苹果属观赏海棠品种‘王族'叶片提取的总RNA为模板,通过RT-PCR与RACE扩增.获得1条660 bp的查尔酮异构酶(CHI)基因的全长eDNA序列,编码219个氨基酸,命名为McCHI.该基因DNA序列全长1180bp,由3个内含子和4个外显子组成,具有CHI基因的典型结构.采用实时荧光定量PCR和紫外可见光分光光度计法,对3类不同叶色类型的观赏海棠品种‘火焰'(绿色类叶片)、‘绚丽'(新叶有色类红色叶片)、‘高原之火'(新叶有色类红色叶片)和‘王族'(常色叶类紫色叶片)幼叶和功能叶中的McCHI表达及其花色苷含量进行测定分析,结果表明:McCHI在4个品种的幼叶和功能叶中均有表达,其表达量与花色苷积累随品种不同和叶龄不同表现出明显差异. 相似文献
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十一种槭属植物遗传多样性AFLP分析 总被引:4,自引:0,他引:4
采用了AFLP技术分析了槭属十一种植物的遗传多样性,从12对AFLP引物中筛选出5对多态性高、分辨率清晰的引物,其中选择最优的3个引物组合分别扩增出101、163、178条多态性带。三对引物(E ACG/M CAG、E ACA/M CAT、E AAC/M CAC)共扩增出484条带。分析结果按UPGMA类平均法进行聚类,聚类结果显示将11种械属植物聚为I、Ⅱ、Ⅲ三大类,其中羊角槭和栓皮槭,长尾秀丽槭和毛脉槭,复叶槭与剑叶槭之间的亲缘关系最近。 相似文献
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杨属部分种及杂种的AFLP分析 总被引:11,自引:3,他引:11
利用13对AFLP引物对杨属4个派19个种及杂种的47个无性系进行分析,共检测到858个标记,其中多态性标记为771个,多态性位点的百分率为89.9%,每对引物产生的多态性位点的百分率在80.7%~98.1%之间,表明杨属种间及无性系间在DNA水平上存在广泛变异.根据AFLP标记结果计算杨属派间、派内种间、种内无性系间分子遗传距离,对它们的亲缘关系进行定量描述.聚类分析结果表明,派间聚类与经典形态分类完全一致,派内种间及种内无性系间聚类与形态分类基本相同.最后,探讨根据分子标记结果进行杂交亲本选配及杂种子代早期选择的可行性. 相似文献
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人心果品种资源亲缘关系的AFLP分析 总被引:1,自引:1,他引:1
利用荧光AFLP分子标记技术对27个人心果品种(类型)及4个蔓妹人心果品种资源的亲缘关系进行研究.9对引物(Pst Ⅰ-Mse Ⅰ)共扩增得到1131条带(75~500 bp),其中多态性带1096条(96.90%).28个品种(类型)具特征性条带,特征带大小为350~500 bp.品种间多态性比例在22.19%~45.89%之间,遗传相似性系数为0.40~0.87.UPGMA聚类结果将31个品种聚为蔓妹人心果类群(MAM)和2个人心果类群(SAP1和SAP2).在遗传相似性系数0.52处,4个蔓妹人心果品种首先被区分开,单独聚为一类(MAM).人心果类群中,11个美国品种和10个国内地方类型在相似性系数0.66处聚为一大组(C、D组),相互之间表现出较近的亲缘关系.大部分栽培品种聚于D-2亚组,与地方类型有一定的遗传距离,说明栽培种的亲缘关系较为相近.人心果表型标记与分子标记结果间存在一定差异,二者的相关性不高. 相似文献
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部分箬竹属植物的荧光AFLP分析 总被引:4,自引:1,他引:3
利用AFLP技术,选择EcoR I/Mse I这一酶切组合,应用9对(EcoR I+3)/(Mse I+3)引物组合进行选择性扩增,检测16种箬竹和5个形态相似的外源竹种的基因组DNA多态性.在21个样品基因组中共获得1 367条清晰的谱带,其中共有条带115条,特异性带273条,特异性缺失条带72条.在16个箬竹样品基因组中共获得1 193条清晰的谱带,其中共有条带190条,特异性带177条,特异性缺失条带98条.这些特异性带或特异性缺失条带可作为识别不同竹种的分子标记.聚类结果表明:所有的箬竹属植物聚成一类,其他5种外源植物聚成一类.此外,AFLP分析提供的分子证据,支持耿氏分类系统(1996),将天目箬竹归入阔叶箬竹中. 相似文献
11.
采用AFLP标记检测海南岛青梅7个主要自然居群192株个体的遗传多样性及遗传结构.应用筛选出的6对引物共扩增出频率大于5.00%的位点777个,其中多态位点比例为99.61%(774).在种级水平上,Nei's基因多样性指数(H)为0.266 1,Shannon多态性信息指数(I)为0.420 4;总基因多样度(H,1)为0.268 4.居群水平的平均多态性位点数和多态性比例为617个和79.45%;H和I平均值分别为0.215 3和0.335 2.遗传分化指数(Fst)和基因流(N,m)分别为0.198 0和1.012 7.UPGMA聚类和遗传距离与空间距离相关性分析结果表明,居群间遗传亲缘关系与其地理位置关系不明显(P=0.230 0,r'2=0.232 5.综合研究结果表明,青梅具有较高的遗传多样性,居群间有一定的遗传分化.建议采取人工促进天然林下层苗木生长和人工造林等措施,促进现有青梅居群遗传多样性保育和发展. 相似文献
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杨树部分种的AFLP遗传多样性分析 总被引:3,自引:2,他引:1
利用10对AFLP引物对杨属5个派20个种及杂种的44份杨树材料进行分析.结果表明:在这些材料中,不同引物组合的多态性均为100%,表明杨属种间及无性系间在DNA 水平上存在广泛变异.利用 UPGMA 法对 AFLP 数据进行聚类分析,相似系数在 0.765~0.971 之间,派间聚类与经典形态分类完全一致,派内种间及种内无性系间聚类与形态分类基本相同.构建了 44 份材料的指纹图谱,在该图谱中,每个材料都具有自身独特的条带.最后,探讨根据分子标记结果进行杂交亲本选配及杂种子代早期选择的可行性. 相似文献
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利用AFLP分子标记技术对松树脂溃疡病菌及其近缘种进行DNA指纹分析,筛选出10对多态性较高的引物.上述引物在供试的9种17个菌株中共扩增出298条带,其中有多态性带283条,多态性位点百分率为94.97%.每对引物产生的多态性位点百分率在89.29%-100%之间,表明松树脂溃疡病菌及其近缘种间在DNA水平上存在广泛变异.根据AFLP标记结果计算松树脂溃疡病菌及其近缘种间的相似系数,对它们的亲缘关系进行定量描述.聚类分析结果表明,菌株间的聚类与生物学种分类的结果一致.分析引物E-AT/M-CAA绘制的镰刀菌AFLP指纹图谱遗传多样性,确定李瑟组镰刀菌各交配群的特异带、差异带,区分供试的7个交配群. 相似文献
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利用筛选出的5对引物,对来自菏泽的2号、8号、172号、sH4、SH7、SH9、SH10、SH15、SH17、SH18、SH22、SH25、SH26、SH28、SH31、SH32、SH37、SH39、SH48、SH49共20个柳树种质进行了AFLP分子鉴别和多态性分析研究。结果表明:5对引物共产生645条谱带,多态带542条,多态带的比例为84.03%;每对引物鉴别效率为100%。AFLP是进行鉴别亲缘关系比较近的柳树种质的有效方法。 相似文献
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以我国北方地区杨树人工林广泛种植的10个黑杨派品种(36杨、50杨、107杨、108杨、111杨、加杨、沙兰杨、I-214杨、109杨和110杨)为实验材料,先进行了苗期形态特征分析,并利用AFLP标记技术,选用E-TA/M-CAG和E-TC/M-CAG两对选择性扩增引物组合,获得了12条特异性条带,建立了这10个杨树品种的DNA指纹图谱,每个品种的扩增带型互不相同,可为杨树品种或无性系鉴定提供独特的特征.结果表明:利用AFLP DNA指纹图谱可以灵敏地鉴别相近无性系并与形态学鉴别分类结论相吻合,表明DNA指纹鉴定配合形态学鉴定方法具有较高的准确性和有效性. 相似文献
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Genetic relationships among Prunus mume var. pendula were studied by using AFLP markers. 18 accessions representing 14 cultivars ofPrunus murne var. pendula were selected from the germplasm collection at the Research Center of China Mci Flower. Seven Mse I-EcoR I AFLP primer combinations revealed 450 legible bands, and 269 of which were polymorphic markers. A similarity matrix was prepared using the simple matching coefficient of similarity and Nei‘s (72) distance coefficient. A UPGMA dendrogram demonstrated the genetic relationships of the cultivars. The information given by AFLP markers was basically consistent with the morphological classification and the evolutionary history of the morphotypes, and roughly supported the new revised classification system for Chinese Mci Cultivars. But there were still several exceptions: 1) the ‘Guhong Chuizhi‘ inserted between the ‘Tiaoxue Chuizhi‘ and the ‘Danfen Chuizhi‘; 2) the ‘Wufu Chuizhi‘ kept off the Pink Pendant Form, and the ‘Moshan Chuizhi‘ was removed from Viridiflora Pendant Form; 3) the ‘Danbi Chuizhi‘ and the ‘Shuangbi Chuizhi‘ of Viridiflora Pendant Form got together well but fell within the Pink Pendant Form. 相似文献
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利用毛新杨×毛白杨的杂交群体构建了毛新杨×毛白杨的AFLP分子遗传图谱,这个群体对杨树溃疡病的抗性是正态分布。本实验使用AFLP分子标记技术对这一构图群体进行了分析,共选用了19对PstI/MseI引物和4对EcoRI/MseI引物,得到标记662个,其中3∶1标记占43 2%,异倍标记占14 5%,偏分离标记(P<0 05)占48 8%。在双亲整合的图谱中,239个标记形成22个含4个以上标记的连锁群,总图距4418cM,标记间的平均图距是18 5cM。图中还有8个重复位点和7个只与连锁群中的某一个标记连锁,但却无法加入这一连锁群的标记,这可能是由染色体的同源性造成的。此外还得到15个属于双亲共有的只有2~3个标记的小连锁群,13个父本独有的连锁群和21个母本独有的连锁群。 相似文献