基于ISSR标记的丁香属植物亲缘关系分析

本研究利用ISSR分子标记技术对40份丁香属种质资源进行亲缘关系分析。通过13条ISSR引物对40份丁香材料扩增共得到264条谱带,其中多态性谱带264条,多态率为100%。供试材料间的遗传相似系数在0.6553～0.9508之间。通过非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析,在遗传相似性系数为0.7420时,可将40份丁香属材料划分为4大类,有效的区分不同品种及变种之间亲缘关系。利用核心引物UBC836构建的DNA指纹图谱可单独鉴别出40份丁香属材料。该研究为丁香种质资源鉴定、杂交育种亲本选择等提供了帮助。     

23种中国兜兰属植物亲缘关系的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术对23种中国兜兰属植物进行种间亲缘关系研究.研究发现:从50条引物中筛选出6条引物进行扩增,共扩增出136条带,其中多态性条带136条,占总条带数的100％,平均每条引物扩增出的DNA条带数为22.7条;根据ISSR扩增结果,采用NTSYS-pc2.10e分析软件进行遗传相似性系数分析,发现23种兜兰的遗传相似性系数在0.145 5～0.780 5之间,平均遗传相似性系数为0.383 9;UPGMA聚类分析发现,在相似性系数为0.292时,23种兜兰被划分为3个类群,即兜兰亚属(Paphiopedilum)、宽瓣亚属(Brachypetalum)和小萼亚属(Parvisepalum),与形态学系统分类结果完全一致.     

茶藨属植物遗传变异和亲缘关系ISSR标记与表型分析

采用ISSR标记和表型特性分析对茶属植物的遗传变异和亲缘关系进行分析.结果表明,12个ISSR引物共扩增出125条谱带,所有条带都具有多态性,平均Nei's基因多样性和Shannon's信息指数分别为0.257和0.413.13个茶属植物的相似性系数为24.66%~82.05%,在阈值为58%处,共分为5组.7个茶属植物的表型遗传变异为0.17%~28.60%,长白茶的可溶性固形物、可溶性蛋白、单宁和果实黄酮类物质含量最高,东北茶芳鹿灬芳鹿灬芳鹿灬芳鹿灬具有较高的维生素C,并且这两个种同黑穗醋栗、红穗醋栗和醋栗分别聚在不同的组,亲缘关系较远,因此长白茶和东北茶可作为穗醋栗和醋栗育种的重要资源.芳鹿灬鹿灬芳芳鹿灬     

百合属野生种及品种亲缘关系的ISSR分析

利用ISSR分子标记对14个百合野生种及7个栽培品种的亲缘关系进行分析.用15条引物扩增出150条谱带,均为多态谱带.UPGMA聚类分析结果将野生种基本分为2个类群,与形态分类的百合组和卷瓣组基本相符;宜昌百合与岷江百合亲缘关系较近.栽培品种分为2个类群,东方系为一个类群,麝香系与亚洲系为另一类群.麝香系与亚洲系比东方百合距卷瓣组百合亲缘关系更近.ISSR分子标记技术适合百合属植物的组间亲缘关系分析.     

野生大豆与栽培大豆杂交F1代ISSR多态性分析

[目的]探究野生大豆与栽培大豆之间遗传多态性的差异,以期为大豆杂交育种的亲本选配提供理论依据。[方法]用20对ISSR引物对野生大豆与栽培大豆及其10份杂种F_1材料进行遗传多样性分析,探讨野生大豆与栽培大豆之间的遗传关系。[结果]此次试验共扩增出167条带,其中121条为多态性带,多态率达72.45%;杂交F_1代材料与其母本中黄19及父本ZYD04350间的平均遗传相似系数分别为0.65和0.47。[结论]栽培大豆与野生大豆杂交F_1代材料间存在着丰富的变异,杂交F_1代从母本获得的遗传物质多于父本。     

悬钩子属野生种及品种亲缘关系的ISSR分析

利用ISSR分子标记方法,对39份悬钩子属(Rubus L.)野生种或变种及17份栽培品种进行分析,探讨这56份材料间亲缘关系的远近.通过试验从35个引物中筛选出12个能扩增出清晰带型并具多态性的引物,共扩增出166条DNA片段,分子量在250～2300 bp之间,平均每条引物扩增出13.83条DNA片段,多态性比率为96.33％,然后采用NTSYS-pc软件和UPGMA法构建了系统树.聚类分析结果将野生种分成5大类群,其中15份栽培品种包含在内,而有2份栽培品种(酷它它和宝森)另成一类,区别于其他54份材料.试验认为ISSR分子标记技术适合作悬钩子属植物组间亲缘关系的分析.     

滇西北部分悬钩子属植物亲缘关系的ISSR分析

利用ISSR分子标记研究滇西北39种悬钩子属植物的亲缘关系,从100个引物中筛选出12个能扩增出清晰带型并具多态性的引物,共扩增出166条DNA片段,片段大小为259～2 300 bp,平均每条引物扩增出13.83 条DNA片段,多态性比率为95.78%.利用NTSYS-pc软件计算39种悬钩子属植物种间的Nei's距离,并用UPGMA 法构建系统树.结果表明,39份供试材料明显聚为5大类:即空心莓组、木莓组、刺毛莓组、矮生莓组和葡匐莓组,与形态学的分类结果基本一致.39个悬钩子属植物种间的遗传距离为0.452 8～0.941 1,说明滇西北悬钩子植物在DNA分子水平上具有丰富的遗传多样性.另外,UPGMA聚类结果表明,形态学分类上的同组不同种间具有较近的亲缘关系,不同组的种间具有复杂的遗传差异.     

金枣柿与部分柿属植物亲缘关系的ISSR分析

应用ISSR标记对柿属(Diospyros)17份植物材料的亲缘关系进行分析,以明确金枣柿的分类地位。用君迁子(D. lotus L.)进行预扩增后,从100条引物中筛选出37条扩增清晰的多态性引物,这些引物共扩增出997条DNA条带,平均每个引物扩增的DNA条带数为26.94条,其中多态性DNA条带973条,占97.59%。根据ISSR扩增结果,进行聚类分析,结果表明: 17份柿属材料可明显分为2个大类群,其中金枣柿的6份试材为一个大类群,与组成另一类群的3个种形成明显遗传界限。通过聚类分析,结合形态观察,认为金枣柿极有可能是柿属的又一个新种。     

冬青属植物的ISSR标记分析及其应用

利用ISSR分子标记对36种冬青属植物的种间关系进行了研究,从100条引物中筛选出12条能扩增出清晰带型并具多态性的引物,共扩增出235条DNA片段,相对分子质量主要集中在400～1 500 bp之间,其中232条片段呈多态性,多态率为98.7%,平均每条引物扩增出19.6条DNA片段;依据扩增结果用UPMGA类平均聚类法进行遗传相似系数分析并构建了系统树.结果表明,36种冬青属植物在遗传相似系数0.64处明显聚为落叶类和常绿类,初步证明了利用ISSR分子标记时冬青属植物进行系统进化和亲缘关系分析的可行性.     

利用ISSR标记解析紫花苜蓿·黄花苜蓿和胡卢巴属植物的亲缘关系

[目的]解析紫花苜蓿、黄花苜蓿和胡卢巴属植物的亲缘关系。[方法]利用ISSR分子标记技术,对紫花苜蓿、黄花苜蓿和胡卢巴种质资源之间的亲缘关系进行研究。[结果]紫花苜蓿、扁蓿豆和黄花苜蓿有较广遗传基础,胡卢巴种质材料相对于紫花苜蓿种质材料与黄花苜蓿的亲缘关系更近。苜蓿属和胡卢巴属亲缘关系研究有利于对一些存在争议的中间过渡类型进行分类,但在对中间过渡类型分类时应找一个合适的"度",以鉴定存在争议的中间过渡类型属于胡卢巴属还是苜蓿属。[结论]该研究结果为一些植物材料中间过渡类型的分类学研究提供了指导。     

ISSR分子标记及其应用

本文简述了ISSR分子标记的原理、基本操作程序,介绍了ISSR分子标记技术反应条件的选择及其在遗传多样性分析等方面的应用。     

9种耐寒杜鹃花亲缘关系ISSR分析

利用ISSR分子标记研究了辽宁9种耐寒杜鹃花的亲缘关系,从100个引物中筛选出13个能扩增出清晰带型并具多态性的引物,共扩增出了576条DNA片段,分子量为300~2000 bp,平均每条引物扩增出44.31条DNA片段。采用DPS软件,计算9种杜鹃花的Nei氏距离,并用UPGMA法构建了系统树。结果表明,9种杜鹃花明显聚为3大类:照白杜鹃、牛皮杜鹃聚为一类;迎红杜鹃、缘毛迎红杜鹃、兴安杜鹃聚为一类;黄杨杜鹃、淀川杜鹃、红枫杜鹃和大字杜鹃聚为一类,其中第2类与形态学分类结果一致。     

利用SSR分子标记鉴定大豆新品种北农103

SSR分子标记技术已经在农作物品种鉴定上广泛应用,利用SSR标记对新选育的大豆品种北农103和其亲本品种中黄18进行分子鉴定,期望通过分子标记鉴别上述2个品种。结果表明,在随机选取330对大豆SSR引物中,有7对引物在2个品种间表现出清晰差异带,可以作为分子标记区分北农103和中黄18,并在今后的品种纯度鉴定上应用。     

基于遗传标记的亲缘关系估测方法的建立

 【目的】利用分子标记重构动物之间的亲缘关系。【方法】利用分子标记的同源相同特性,通过对一个随机交配的大群体中任意两个个体在某个标记位点4个等位基因的比较,建立估测群体中任意两个个体之间的亲缘关系的方法（记为Liu模型）。【结果】用蒙特卡罗模拟法（Monte Carlo Simulation）随机模拟4种特殊亲缘关系的群体对Liu模型进行了研究,在4种特定的亲缘关系下,与其它几种模型相比较,Liu模型对个体之间亲缘关系的估测最接近模拟群体的真实值,且估测结果稳定。【结论】建立了估测两个个体之间亲缘关系的Liu模型,通过比较分析证明了Liu模型是目前估测效果最好的模型。     

17份鱼腥草种质亲缘关系的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术对17份鱼腥草种质进行了基因组DNA多态性分析.从50条引物中筛选出12条多态性引物用于PCR扩增,共扩增出112条DNA条带,其中多态性条带95条,所占比例为84.8%,平均每条引物扩增的DNA条带数目为9.3条.根据ISSR扩增结果,利用POPGENE 1.32软件计算了Nei's基因距离,Nei's基因多样性指数(H)为0.318 5,Shannon信息指数(I)为0.469 9,并用MEGA3.1软件通过UPMGA法进行了聚类分析.结果表明:鱼腥草种质资源具有较丰富的遗传多样性;ISSR技术可将17份供试的鱼腥草材料全部分开,在遗传距离系数0.2处可将17份材料划分成三大类,其中多数材料根据ISSR遗传距离系数划分的类群与地理位置分布有一定关系.同时对鱼腥草道地性与环境因素和遗传因素的关系进行了探讨.     

ISSR标记的研究与应用

简单序列重复区间扩增多态性(Inter-simple sequence repeat,简称ISSR)是一种新型的分子标记。它直接对基因组DNA进行分析,不受任何环境条件影响,在遗传上多为共显性。在不同的发育阶段,同一个个体的任何体细胞所得的带型或指纹都是一样的,并且符合孟德尔遗传规律。本文对ISSR在品种鉴定、遗传关系及遗传多样性分析、基因标签、植物基因组作图、指纹图谱的建立等方面作了简要概述。     

大豆种质对胞囊线虫1号小种抗性的SSR标记辅助鉴定

本研究以15份大豆种质为材料,采用抗病基因型鉴定和人工接种鉴定的方法,探讨了Satt309和Sat_210标记对胞囊线虫1号小种抗性的选择效率。结果表明,Satt309对胞囊线虫1号小种抗性的选择效率为50%,Sat_210对胞囊线虫1号小种抗性的选择效率为87.5%,Satt309和Sat_210的标记组合可以提高对胞囊线虫1号小种抗性的选择效率,达100%;获得8份抗胞囊线虫1号小种的大豆种质,分别是Peking、高作选1号、齐黄28、齐黄30、齐黄33、齐黄29、齐黄31和沧豆11。     

SSR标记技术鉴定新食葵6号品种纯度的研究

[目的]通过利用SSR分子标记技术测定向日葵种子纯度,以期为生产加工应用提供准确、便捷的杂交种种子纯度鉴定方法提供依据.[方法]该研究以新食葵6号及其双亲的DNA为模板,通过DNA提取、PCR扩增反应和 制作电泳的步骤,进行了约100对SSR物分子标记的筛选.[结果]SSR多态引物标记532在新食葵6号母本分别产生特异条带大小为496bp,父本特异标记条带大小为451 bp;引物标记574在母本上特异条带大小为364 bp,父本上的特异标记条带大小为384 bp,同时室内分子鉴定的纯度和田间鉴定纯度基本一致;通过SSR分子标记方法可出可得到区分父本、母本和杂交种的引物标记532和574,这2个引物标记可有效用于鉴定上述新食葵6号杂交种种子的纯度,辨别种子的真伪.[结论]该方法具有简单,快速、准确、重演性高的优点,目前该方法已成为向日葵品种鉴定的主要方法.     

用ISSR分子标记技术分析16个蝴蝶兰品种的亲缘关系研究

从DNA提取、退火温度、扩增循环数、镁离子浓度等方面对ISSR-PCR反应体系的条件进行了优化,筛选出8个引物,共扩增出193条片段(多态性条带比例为92.2%),所扩增的条带数分布范围为300~2 500 bp,表明供试品种间具有丰富的遗传多态性。聚类分析结果表明：来源于不同地域的16个品种在遗传距离L=0.222 5处可分为2个类群;来源于日本、台湾的品种分别聚类为一簇,公司新育成的品种为一簇。根据分子标记确定的亲缘性远近提出了可能的杂交组合。蝴蝶兰ISSR分子标记优化体系的建立为兰科类观赏植物的亲缘关系分析提供了理论依据。