用反转录—聚合酶链反应快速鉴别新城疫病毒

根据新城疫病毒基因结构特点及强、弱毒株Ｆ０裂解位点的序列差异设计２对引物,建立了快速诊断新城疫并能鉴别诊断新城疫强、弱毒株的反转录－聚合酶链反应（ＲＴ－ＰＣＲ）技术。试验表明,该方法具有快速特异和操作简便等特点,不仅适用于对鸡胚毒的检测,也适用于对病鸡组织匀浆液的检测,是新城疫鉴别诊断和流行病学调查的颇具潜力的分子诊断方法。     

新城疫强、弱毒株分子生物学鉴别诊断方法的建立

为了快速、敏感、特异地鉴别区分新城疫强、弱毒株,根据新城疫病毒F基因序列设计出并合成两对特异性引物,XsXq、XrXa,用来区分新城疫强毒株和弱毒株,其中XsXa可组合用来扩增新城疫所有毒株,利用这三对引物对新城疫病毒的F基因片段进行多联RT—PCR扩增,并对该多联RT—PCR检-测方法进行敏感性及特异性试验。结果表明：这三对引物能特异性地扩增出新城疫强、弱毒株及NDV毒株的F基因片段,大小分别为259bpNDV（F48E9）、522bpNDV（LaSota）、757bp（NDV）,该检测方法敏感性高,特异性强,初步建立起快速、敏感、特异的鉴别诊断新城疫强、弱毒株的分子诊断方法。     

新城疫病毒强弱毒株PCR-RFLP鉴别方法的建立

设计1对特异性引物扩增新城疫病毒F蛋白基因460 bp大小片段,而后利用PstⅠ和Bbe Ⅰ进行酶切,弱毒株酶切出120 bp和220 bp两个片段,而强毒株酶切出120 bp和340 bp两个片段,经敏感性、特异性试验,表明该方法敏感性高、特异强.用该PCR-RFLP检测了170份病料,检出强毒株5份、弱毒株1份,PCR阳性病料经SPF鸡胚进行病毒分离,用MDT、ICPI试验测定其生物学毒力,并对它们的F蛋白基因克隆测序,通过MDT、ICPI和推导氨基酸裂解位点分析,确定其毒力的结果与PCR-RFLP检测结果一致.表明该方法快速、特异、敏感,很适合于鸡群中新城疫快速诊断和新城疫病原学监测.     

鸡肿瘤病快速鉴别诊断试剂盒的研制及其应用

建立了快速鉴别诊断鸡肿瘤病的PCR技术，研制鸡肿瘤病快速鉴别诊断试剂盒，应用该试剂盒在两年多时间里，对来源于广西养殖鸡业发达地区的139个鸡群共505只病，死鸡的1570份肿瘤及可疑肿瘤组织病料进行了检测，马立克氏病，网状内皮增生症和禽白血病的阳性率分别为74．065，11．49％和6．73％，肿瘤病的混合发生率为16．83％。结果表明，应用PCR技术建立的鸡肿瘤病快速鉴别诊断试剂盒具有操作简便快捷，结果准确保靠，保存方便等特点，不仅适用于临床肿瘤病的鉴别诊断，而且对开展肿瘤的流行病学调查及兽医检疫具有重要意义。     

用RT—PCR鉴别新城疫病毒不同毒力株的研究进展

本文概述了用RT－PCR技术检测新城疫病毒（NDV）的研究进展。主要介绍了鸡新城疫病毒（NDV）基因组结构以及强弱毒株F蛋白在裂解位点附近的氨基酸差异以及从感染鸡胚尿囊液提取RNA和从组织匀浆直接提取RNA,并用之作RT－PCR以鉴别NDV毒株毒力和诊断ND的研究现状及应用前景。     

鸡IBV、NDV和AIV多重RT-PCR检测方法的初步建立

根据鸡传染性支气管炎病毒M基因、禽流感病毒NP基因和新城疫病毒F基因各设计1对引物,初步建立了针对鸡传染性支气管炎(IB)、新城疫(ND)和禽流感(AI)的多重RT-PCR鉴别诊断方法,并对其特异性和敏感性进行了检测。结果表明,所设计的3对引物可对同一样品中的IBV、NDV和AIV进行特异性扩增,所扩增的目的片断的长度分别为333bp(IBV)、438bp(NDV)和196bp(AIV);建立的多重RT-PCR检测方法能够检测出1ng/μLAIV、1ng/μLNDV和10ng/μLIBV的cDNA,说明该检测方法特异性强,敏感性较高。本研究所建立的多重RT-PCR方法可用于上述3种鸡病毒性呼吸道疾病的快速鉴别诊断,在临床诊断和流行病学调查方面具有较好的应用前景。     

鉴别新城疫强、弱毒一步RT-PCR方法的建立及应用

设计2对引物分别用于新城疫强、弱毒的检测。使用强毒引物F1、R1可从NDV强毒株中特异性扩增出349bp的目的片段,使用弱毒引物F2、R2可从NDV弱毒株中特异性扩增出255bp目的片段,该方法对H9亚型禽流感病毒(AIV)、传染性支气管炎病毒(IBV)和传染性法氏囊病毒(IBDV)的检测结果均为阴性。灵敏性试验结果显示,该方法对NDV强、弱毒株的最小检出量分别为1pg和10pg。利用该方法对7份临床样品进行检测,结果与测序结果一致,说明该方法可用于新城疫强、弱毒的快速鉴别诊断。     

RT-PCR对新城疫病毒强弱毒株的快速鉴定

根据新城疫病毒(NDV)F蛋白基因结构的特点及强、弱毒株F蛋白基因裂解位点的序列差异设计了4条引物,并将其配成3对引物,采用RT-PCR试验对来自鸡和七彩山鸡的9株NDV野毒分离株,F48E8和LaSota 2株标准强、弱毒株进行了快速鉴定;并将RT-PCR鉴定结果与NDV常规致病性试验结果进行了比较。结果表明,RT-PCR试验能够快速将11个参试毒株区分为强毒株和弱毒株,其结果与传统致病性试验测定结果基本一致,该方法可以用于ND的快速诊断和强、弱毒株的快速鉴定。     

鸡毒支原体强弱毒株荧光定量PCR鉴别检测方法的建立

为建立一种能鉴别鸡毒支原体(MG)强、弱毒株的快速检测方法,本研究根据GenBank中MG强毒株和弱毒株的基因组序列,选取特异性保守区序列设计了2对引物和2奈探针,分别用于强弱毒株和弱毒株的检测,优化反应条件,建立了能区分MG强、弱毒株的荧光定量PCR检测方法.该法特异性强,对鸡常见呼吸道病原体的反应均为阴性;灵敏度高,可检测到100拷贝/μL的模板;稳定性好,批内和批间试验Ct值的变异系数小.本研究建立的MG强、弱毒鉴别检测方法简便、快捷,为该病的防控与净化提供新方法、新思路.     

鸡副黏病毒YM毒株F基因的克隆及遗传进化关系研究

近年来,我国相继有新城疫强毒株出现的报道,为分析这些强毒株与疫苗株之间的遗传进化关系,研究新城疫的流行病学特点,文章以华中农业大学病毒室分离的YM毒株基因组RNA为模板,利用RT-PCR扩增F基因的cD-NA,将其连接入pMD18-T载体,经筛选证明已获得鸡副黏病毒YM毒株F基因的阳性克隆子。核苷酸序列和氨基酸序列分析表明,YM毒株属于NDV基因Ⅶ型强毒株;F蛋白氨基酸序列与中国标准强毒株F48E9 F蛋白氨基酸序列同源性为86％,与弱毒疫苗Lasota／46株氨基酸序列同源性仅为83％,证明为变异株,且其重要的抗原位点343位氨基酸由Leu→Pro,免疫原性发生了较大变化。从基因进化树也可见,其与中国标准强毒株F48E9,弱毒疫苗Lasota／46株的进化关系较远,这从分子角度解释了为什么高免的鸡仍然暴发新城疫。     

应用RT-PCR和病毒学方法诊断山东省鸡新城疫感染的比较研究

分别应用病毒分离和区分新城疫强弱毒株的RT-PCR技术,对山东各地疑似鸡新城疫感染的25份病料进行了实验室诊断。结果表明:从18份病料中既扩增到了新城疫强毒基因,也分离到了新城疫病毒;3份病料未分离到病毒,仅扩增到了新城疫强毒基因;4份病料分离到了新城疫病毒,但未检测到相关基因。研究表明,将RT-PCR和病毒分离鉴定两种方法相结合,可更好的满足快速、灵敏、准确的新城疫诊断要求。     

Rapid detection and differentiation of Newcastle disease virus isolates by a triple one-step RT-PCR

A triple one-step RT-PCR was developed to screen and differentiate virulent from avirulent Newcastle disease virus (NDV) isolates. Three sets of oligonucleotides were designed, each specific for amplifying NDV fusion protein gene-specific RNA from virulent, avirulent or all isolates respectively. The sensitivity of one-step RT-PCR was determined using viral RNA extracted from serially diluted NDV-infected allantoic fluid and found to be 10(-5) HA units. Application of one-step RT-PCR to various NDV samples, including wild-type virulent isolates and avirulent vaccine strains, demonstrated the potential for rapid identification (3-4 h) of NDV isolates as well as the differentiation of virulent from avirulent strains.     

Differential detection of Newcastle disease virus strains by degenerate primers based RT-PCR

Degenerate primers based RT-PCR (previously described by [Avian Dis 26 (1997) 837]) has been used for the detection and differentiation of Newcastle disease (ND) viruses. Two sets of primers (A+B and A+C), with common forward primer and distinct reverse degenerate primers, designed from fusion protein gene encoding for cleavage site, could differentiate virulent and avirulent Newcastle disease viruses (NDV). Both sets of primers amplified "F" gene sequence of virulent (velogenic and mesogenic) viruses, whereas in avirulent strains, amplification was only with primer set A+C. Total 10 NDV isolates and two clinical samples including both known and unknown pathotypes, were checked. Based on amplification results 5 viruses were found to be virulent type and 6 as avirulent with one of the two clinical samples, earlier positive by RT-PCR using non-degenerate "F" gene specific primers was found negative in this study. The technique has been found to be a simple and quick for the detection and differentiation of virulent and avirulent NDV, which is important for control of the disease in the events of the outbreaks.     

Sensitive, semi-nested RT-PCR amplification of fusion gene sequences for the rapid detection and differentiation of Newcastle disease virus

A rapid, sensitive and specific semi-nested RT-PCR was developed to detect and differentiate virulent and avirulent strains of Newcastle disease virus (NDV). For a total of 67 NDV strains, the results obtained from the semi-nested RT-PCR were consistent with those from nucleotide sequence analysis, plaque forming assays, mean death time (MDT) measurements and intracerebral pathogenicity index (ICPI). Furthermore, 13 class I NDV strains can be characterized by the semi-nested RT-PCR approach, which was feasible by the conventional methods. The detection limit for the semi-nested RT-PCR was two plaque forming units (PFU) both for NDV strain F48E9 in allantoic fluid and for isolate APMV1/ch/ChinaND4031 in oral or cloacal swabs. In conclusion, this semi-nested RT-PCR method offers a new assay for the rapid detection and differentiation of NDVs.     

新城疫病毒山东分离株ShD-5-06 F和HN基因序列分析

从山东济南某非典型新城疫发病鸡群中分离到一株新城疫病毒株（ShD-5—06）,研究其生物学特性表明,该病毒具有新城疫强毒株的一些特征。从该分离株扩增出其F和HN基因,并与标准株进行同源性比较,为探讨NDV是否发生变异提供理论依据。本试验通过RT—PCR法特异性地扩增出F和HN基因全基因序列,并对其与已经发表的序列进行核苷酸序列测定和分析。结果表明,ShD-5—06株的F和HN基因开放性阅读框架（ORF）为1662bp和1716bp,分别编码489个和571个氨基酸。与国外发表的部分新城疫病毒强毒株和弱毒株之间相应序列进行比较,F基因核苷酸序列的同源性在84．1％～88．7％之间,氨基酸同源性在88．1％～93．3％之间;HN基因核苷酸序列的同源性在82．19,5～87．4％之间,氨基酸同源性在88．6％～90．9%之间;F蛋白裂解位点区（112～117）氨基酸组成与强毒株一致,说明NDV山东分离株（ShD-5—06）为新城疫强毒株。     

应用抗多肽抗体鉴别新城疫病毒强弱毒株

在克隆我国流行的新城疫病毒（ＮＤＶ）强毒株Ｆ４８Ｅ８株、四平株及弱毒株长春株、Ｖ４株和ＨＮ和Ｆ基因并进行测序的基础上,针对我国流行的ＮＤＶ强毒株Ｆ蛋白前体（Ｆ０）的Ｆ２片段的特异结构,人工合成特异性多肽,将其与小牛血清白蛋白（ＢＳＡ）化学偶联制备成全抗原,免疫小鼠制备出抗多肽血清。经ＥＬＩＳＡ检测,该抗体与ＮＤＶ强毒株呈强阳性反应,而与鸡痘病毒、鸡传染性法氏囊病病学、ＮＤ 弱毒株长春株和Ｖ４株呈阴     

新城疫病毒系统发育分析及强弱毒株的鉴别诊断

本文综述了新城疫病毒的流行病学和病毒基因的系统发育情况，对不同ＮＤＶ毒株的强弱毒力鉴别方法进行了详细的介绍，将为新城疫的认识和防制提供新的理论基础和实践方法。     

鸡新城疫病毒强弱毒株RT_PCR鉴别诊断方法

本研究通过对大量不同毒力ＮＤＶ Ｆ基因核苷酸序列分析,根据毒力和序列间的相关规律,分别设计合成了两组引物,建立一个可以迅速鉴别ＮＤＶ强、弱毒株的ＲＴ－ＰＣＲ方法,对强毒株可扩增出１３３ｂｐ的特异性片段的３６２ｂｐ的通用片段,弱毒株可以扩增出２５２ｂｐ的特异性片段的３６２ｂｐ的通用片段。只需一个ＲＴ－ＰＣＲ反应,整个实验过程可在５小时内完成。敏感性测定结果表明该方法的最低检出量不低于５００ｐｇ的ＤＮＶ ＲＮＡ。为了增加方法的实用性,我们进一步建立了直接从组织病料中检测并鉴别强弱毒株的方法。     

RT-PCR结合限制性内切酶分析法区分NDV强弱毒株

通过设计的特异引物，采用RT-PCR对1996年以来分离的45株国内新城疫病毒分离株进行鉴定和分析，并与其MDT实验结果进行比较，建立了RT-PCR结合BglⅠ内切酶分析区分新城疫强弱毒的方法。此方法操作简便、迅速，不仅能区分新城疫的强弱毒株，还可诊断AMPV-1引起的其他禽类的感染。     

新城疫病毒ShD-5-04株F基因和HN基因序列分析

从山东潍坊某非典型新城疫发病鸡群中分离到一株新城疫病毒(暂命名:ShD-5-04),其生物学特性表明该病毒具有新城疫强毒株的一些特征。通过RT-PCR特异性地扩增出F和HN基因序列,并对其进行核苷酸序列测定和分析,结果表明ShD-5-04株的F和HN基因开放性阅读框架(ORF)为1662bp和1716bp,分别编码489个和571个氨基酸,与国外发表的部分新城疫病毒强毒株和弱毒株之间相应序列进行比较,F基因核苷酸序列的同源性在84.1%～88.7%之间,氨基酸同源性在88.1%～93.3%之间;HN基因核苷酸序列的同源性在82.1%～87.4%之间,氨基酸同源性在88.6%～90.9%之间;F蛋白裂解位点区(112-117)氨基酸组成与强毒株一致,说明NDV山东分离株(ShD-5-04)为新城疫强毒株。