内蒙古地区西门塔尔牛亲子鉴定微卫星标记筛选

研究旨在筛选适合于我国肉牛亲子鉴定的微卫星标记,以内蒙古乌拉盖地区368头西门塔尔牛为实验材料,利用荧光引物PCR和ABI3730测序仪对12个微卫星标记进行基因型检测,应用Cervus3.0软件统计12个微卫星标记的遗传多态性。结果表明:其中4个微卫星标记扩增效率较低,被剔除;其他8个微卫星的多态性丰富,平均等位基因数为11.38,平均期望杂合度为0.6686,平均多态信息含量为0.6354,适合于我国肉牛亲子鉴定。     

荷斯坦牛亲子鉴定检测方法的建立与应用

为了构建北京奶牛中心荷斯坦种公牛个体及亲子鉴定DNA数据库,本研究从联合国粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)推荐的具有高度多态性的微卫星标记中选取11个常染色体微卫星标记(BM1824、BM2113、ETH3、ETH10、ETH225、INRA023、SPS115、TGLA53、TGLA122、TGLA126和TGLA227),采用荧光引物PCR和ABI3730XL遗传分析仪,对229头荷斯坦种公牛个体基因型进行了检测,并探讨其用于牛个体识别和亲子鉴定的可行性。研究结果表明,11个微卫星标记平均杂合度为0.733,平均多态信息含量为0.695,其中TGLA122标记平均多态信息含量最高为0.866,SPS115标记最低为0.506,均属于高多态性标记。11个标记累积个体识别能力为99.99%,累积非父排除率达到99.99%,随机个体一致性概率为1.59×10-17。研究结果表明上述11个微卫星标记进行个体识别和亲子鉴定的效力与可靠性均很高,同时初步建立了北京奶牛中心荷斯坦种公牛DNA数据库。     

微卫星DNA标记与亲子鉴定

本文阐述了几种家畜亲子鉴定中使用的微卫星座位及其在亲子鉴定中的应用,并对微卫星DNA标记与亲子鉴定研究急待解决的问题与发展方向做了阐释。     

微卫星DNA在家畜亲子鉴定中的应用及研究进展

概述了微卫星 DNA用于亲子鉴定的优点及存在的缺陷 ,并对未来的应用前景作了展望     

微卫星DNA在牛亲子鉴定方面的研究进展

微卫星DNA因具有长度多态性这一特点,而被广泛应用于个体的亲子鉴定。作者概述了微卫星DNA在牛亲子鉴定方面的研究进展及发展趋势。     

基于SNP标记的滩羊亲子鉴定研究

旨在筛选可用于滩羊亲子鉴定的部分SNP标记,对羊群的保种和繁衍具有重要意义。本试验以宁夏盐池地区的159只滩羊为研究对象,利用600K基因芯片进行SNP测定,通过主成分分析了解样本的遗传背景,依据系统进化树划分家系,最后进行亲子鉴定研究。结果显示,大多数滩羊之间遗传背景相近,系统进化树将其划分为5大家系;亲子鉴定筛选到了211个高质量SNPs,单亲累积排除概率超过99.99%,具有很高的准确性和可靠性;父权鉴定结果表明,在95%置信水平下,观测鉴定率为79%,80%置信度下,观测鉴定率达到87%。在有结果的子代中,大部分真实亲本在疑似父本中找到,即非系谱记录的父本,说明场内应加强系谱管理,尽量避免错误的发生。     

微卫星DNA在动物亲子鉴定中的应用及研究进展

本文概述了微卫星DNA进行亲子鉴定的基本原理与方法,将其用于亲子鉴定的优点以及研究进展,最后对未来的应用进行了展望。     

利用微卫星标记进行猪亲子鉴定

以杜洛克猪、长白猪、大白猪3个品种的48头系谱清楚的猪为样本,使用PAGE法从55个微卫星位点中筛选出扩增效果好、多态性丰富且便于进行多重PCR扩增的位点,对试验样本逐一进行基因分型,并据此进行亲权确认,建立一种高效的亲子鉴定方法。结果显示,试验选取的14个微卫星位点在48个样本中进行排父率分析,在双亲未知、只知单亲和双亲已知的情况下计算的累积排父率分别为0.978 5,0.998 4,0.999 99;利用建立的亲子鉴定体系对样本中8个家系进行检测,结果累积排父率均大于99.99%。结果表明,试验构建的微卫星标记体系,为亲本信息不明的个体进行亲子关系的验证,纠正潜在的错误系谱,建立完整、准确的系谱体系,保证育种值估计的准确性,保障猪育种工作的正常开展具有非常重要的意义。     

微卫星DNA在动物亲子鉴定中的应用及研究进展

本文概述了微卫星DNA进行亲子鉴定的基本原理方法，将其用于亲子鉴定的优点以及研究进展，最后对未来的应用进行了展望。     

基于微卫星标记的南白犀亲子鉴定

为了保证人工繁育的南白犀（Ceratotherium simum simum）种群能够健康长远发展,需要有详细准确的谱系记录,但是往往会存在子代亲生父亲不详的情况。通过亲子鉴定可以帮助确定子代亲生父本,从而获得准确的谱系记录。本研究在110只人工半散放南白犀群体中使用13个微卫星标记,对13个微卫星标记的多态性进行分析,计算非父排除概率和累积非父排除概率,结果显示：双亲已知时,13个位点的累积非父排除概率可达0.99以上,三联体父权分配时置信度可达到严格置信,选用的微卫星标记组合可用于南白犀子代生物学父亲的确认。亲子关系的确定可以在一定程度上避免近亲交配,保证群体内遗传基因的多样性。     

利用微卫星和SNP标记信息进行奶牛亲子鉴定的模拟研究

本研究旨在比较微卫星标记和单核苷酸多态(SNP)标记进行奶牛亲子鉴定的效率。研究中随机模拟了10 000对含微卫星或SNP标记信息的非亲子关系的个体,用排除法进行亲子鉴定,该过程重复100次。结果表明,标记的多态性对于排除概率的影响最大。达到同样的排除概率,所需低多态标记数量远高于高多态标记。当真实母亲基因型已知时,个体父亲的推断效率较高。达到同样的排除概率,无论标记多态性高或低,3种鉴定类型所需SNP标记数量均大于微卫星标记。当SNP和微卫星标记的平均杂合度为0.484和0.875时,需要的SNP标记数是微卫星标记的5~6倍;当SNP和微卫星标记的平均杂合度为0.363和0.566时,需要的SNP标记数约是微卫星标记的2倍。在2种标记中,达到同样排除概率(大于0.99),采用至少2个矛盾推断原则推断所需标记数为单个矛盾推断原则的1.45倍。结果表明,由于SNP标记具有误判率低、重复性高和易于高通量自动化检测等特点,随着检测成本降低,SNP标记将来完全有可能取代微卫星标记用于奶牛群体的亲子鉴定。     

单核苷酸多态性及其在牛育种中的应用

单核苷酸多态性(SNPs)被公认为是最新的第3代分子标记,它将成为理想分子标记之一.本文介绍了SNP的概念、特点以及在牛生长发育性状、胴体和肉质性状、产奶性能、抗病性状中的应用.     

布莱凯特黑牛心脏脂肪酸结合蛋白基因单核苷酸多态性的研究

利用PCR-SSCP方法测定96头布莱凯特黑牛H-FABP基因外显子2和内含子2的部分序列多态性,并对含有多态序列的片段进行了序列分析。结果表明,引物1、3的扩增序列不存在多态性,引物2、4的扩增序列存在多态性;引物2在内含子第323位点处存在G→A突变,在群体中产生了AA、AB、BB 3种基因型,基因型频率分别为0.448、0.146、0.406,多态信息含量(PIC)为0.375,属于中度多态(0.25χ²检验该位点基因型频率不处于Hardy-Weinberg平衡状态;引物4在内含子2第872位点处存在C→G的突变,产生了HH、Hh、hh3种基因型,基因型频率分别为0.104、0.417、0.479,多态信息含量(PIC)为0.337,为中度多态(0.25χ²检验该位点基因型频率达到Hardy-Weinberg平衡状态。     

单核苷酸多态性及其应用

单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms,SNPs）是一种新的分子标记，是指基因组由于单个核苷酸的变异所产生的差异。由于其多态性高，便于自动操作等特点，在基因组、后基因组时代具有广泛的应用前景。本文对SNPs的概念、特点、分析方法及应用等方面做了简要的概述。     

单核苷酸多态性(SNP)的研究进展和应用

单棱苷酸多态性(SNP)是最新发展起来的第三代分子标记，具有密度高、双等位基因、易实现自动化检测等优点。本文重点介绍了SNP的概念、特点、分析检测技术以及SNP的应用。     

单核苷酸多态性作为新一代分子标记的优越性

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP) 是可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上,为数众多且分布广泛,遗传稳定,现已成为新一代的分子标记,其相关研究方兴未艾。遂作者将SNP的优越性做了一个多方面的阐述,以期对SNP的认识及以后的深入研究有所帮助。     

利用SNP标记进行北京地区中国荷斯坦牛亲子推断的研究

本研究旨在利用SNP标记对北京地区中国荷斯坦牛群进行亲子推断,并分析场、母牛出生年月、公牛家系对系谱错误率的影响,以期为指导奶牛育种和生产管理提供依据。共选取了255个最小等位基因频率大于0.45的高多态SNPs标记,利用似然法,采用Cervus3.0软件对北京地区84头荷斯坦公牛和1 927头母牛进行亲子推断研究。结果显示,试验群体平均系谱错误率为20.9%,不同的场、出生年份和月份的母牛的系谱错误率有显著差异(P<0.05),而各公牛家系间系谱错误率差异不显著(P>0.05)。结果说明,错误系谱的发生主要是由于牛场本身记录不完善造成的。在我国亟需建立利用遗传标记监测、校正系谱准确性的制度,采取措施提高系谱的准确性,加快我国荷斯坦牛遗传改良进程。