R软件在森林生物多样性动态监测中的应用

森林生物多样性动态监测样地的数据巨大且繁杂,迫切需要一种功能强大且灵活的软件来处理,R软件具有免费、开源、强大的统计分析及其完美的作图功能.基于西双版纳20 hm2热带季节雨林动态监测样地的野外调查数据,采用R软件处理.着重介绍了R软件在地形图的绘制、种面积曲线和种序列曲线的绘制、以及物种空间分布图等方面的应用,希望能起到抛砖引玉的作用.     

R软件在植物种群分布格局研究中的应用

【目的】研究R软件在植物种群分布格局中的应用,为分析植物种群分布格局的繁杂数据提供一种新方法。【方法】基于西双版纳20ha热带季节雨林动态监测样地的野外调查数据,以绒毛番龙眼、网脉肉托果、玉蕊树种为例,应用R软件绘制其树种空间分布图,并分析树种种群分布格局及种间关系。【结果】网脉肉托果在样地空间分布中为集群分布,而在空间分布格局中分析,在尺度0-2m为集群分布,在12～15m为随机分布;网脉肉托果和玉蕊两个树种在空间分布图中为交错分布,重叠区域不大,进行种间关系分析,两个物种在尺度0～5m无明显相关,在5～30m为负相关。【结论】R软件能够根据研究需要实现物种空间分布图的绘制、种群分布格局分析及物种相关性分析,值得推广。     

基于MATLAB的水稻种子几何特征提取的程序实现

基于MATLAB编写的程序能够对水稻种子图像进行分析,提取出种子的几何特征。将拍摄的水稻种子图像,读入程序以后,进行类型转换、顶帽变换、灰度开运算等方法对图像进行预处理,接着用最大类间方差法分割图像、标注连通区、画出最小外接矩、提取几何特征、输出数据等。实现了数据自动化检测统计,为自动化考种、品质分析等提供参考,丰富了国内相关领域的研究内容。     

重庆市主城区地下综合信息评估及管理

为支撑重庆市主城区地下空间专项规划的实施,为其提供丰富的数据支撑,运用地质调查、地理信息分析评估及三维地理信息系统等相关方法对重庆市主城区5 473 km~2范围内地下空间现状进行了研究、评估,并实现了该范围内地下空间多源数据的综合管理.结果表明:①多源地下空间数据综合分析,才能有效地为地下空间专项规划实施提供依据;②综合地质条件分析发现,该区域约80%的区域适宜进行地下空间开发;③截止2017年底重庆市主城区地下空间开发利用总规模约为7 151万m~2,其中地下交通设施占比约为90%;④利用多源地下空间三维数据集成管理模式,不仅可以满足区域内地下空间现状数据的宏观管理,更能通过可视化模拟分析指导实际工程的设计、建设和评估.     

R/S方法应用于变形数据预报的算法研究

非线性科学的发展为数据处理提供了新的思路,R/S分析方法是以时序数据为基础的一种非线性理论方法,可以应用于对时间序列数据进行分析与预报。简要介绍了分形理论基础,对R/S分析方法应用到变形数据分析与预报的算法进行了探讨。     

基于SCI的图书馆外文期刊资源建设可视化分析——以西安交通大学图书馆为例

以科学引文索引SCI数据库为数据源,下载西安交通大学医学院2010年—2014年间所发表论文的数据,利用SCI文献分析功能和信息可视化方法(CiteSpace3.9.R5软件),对近5年西安交通大学医学院所发表论文的引文数据进行统计和可视化分析,结果表明外文期刊特别是英文期刊是高校教师学者在教学科研中必不可少的参考文献,图书馆应合理配置期刊资源,优化馆藏期刊结构,提高期刊保障率,为学校教学科研及学科建设提供有力支撑。     

3种常见统计软件在生物统计学教学中的应用比较 ——以配对数据t-检验为例

生物统计学是大多数高等院校生命科学领域本科学生必修的基础课程,也是一门在实践中广泛应用的学科.该课程的主要目的是培养学生的数据分析能力,提高其科研和实践应用能力.然而,传统教学侧重于理论知识的讲解,而忽略了培养学生应用统计软件分析试验数据的能力.基于此,该研究以配对数据t-检验为例,通过对3种代表性的统计软件(Excel、SPSS和R)进行比较,分析总结了3种软件在生物统计学教学中的优缺点.针对本科生教学,选择Excel或SPSS为教学辅助软件,加深学生对理论知识的理解,提高学生的数据处理能力.并将R逐步引入教学中,提升学生处理复杂数据和解决实际问题的能力,使其成为具有对理论知识理解和软件应用能力的综合性人才.     

一种基于小波的并行算法及其在大型数值计算中的应用

提出了一种基于小波变换的并行算法,可以把一个大型的数值计算过程分成若干部分进行并行计算,为实现数据的实时处理提供了一种有力工具。数据仿真结果表明,这种方法是可行的。     

成品油管网生产数据管理系统研发

成品油管道企业的SCADA系统产生大量的生产数据,如何对这些数据进行分析处理,并服务于企业,是亟待解决的一大难题。利用ASP.NET软件(基于C#)及SCADA系统自带模板软件对华东管网的生产数据(日报表、月报表、批次统计表、设备运行时间统计表、混油情况表和输油量同比表等)进行有效管理,在设定时间内,从SCADA系统自动获取生产数据并进行统计和分析,进而呈现在Web网页上,以便进行生产优化,并方便各部门人员浏览和下载。实践证明:成品油管网生产数据管理系统可以自动从SCADA系统中提取用户所需的数据,为管道企业的管理人员提供所需的数据,并为生产运行方案的优化提供有力的数据支持。     

GIS技术在道路选线中的应用研究

针对现阶段一般道路选线方法工作周期长、效率较低和耗费大量人力物力等缺陷,引入地理信息系统的相关理论、方法和技术分析手段,利用Google Earth、ArcGIS等系列软件,对道路选线过程中出现的相关问题进行对比分析研究,选取一种最优的道路选线方法。基于GIS的道路选线方法,不仅为道路空间分析的方案策划、数据获取、前期预设计提供了广泛的空间信息技术的应用平台,也为大区域的空间工程项目建设提供了合理的数据组织基础,为道路工程设计提供了一个更为科学的技术设计手段。     

一个高效实现灰色关联分析的R程序

灰色关联分析模型是一种广泛应用于各个科研领域的重要的统计模型,但其数据处理过程计算量很大。R是一门高级统计计算编程语言,可以在通用公共许可(GPL)规则下从互联网免费获取。该研究基于灰色关联分析方法设计了一个可快速自动计算邓氏关联度的R程序,通过成功应用于实例,验证了本程序的可行性和高效性。     

The ASYST Software for Scientific Computing

The acceptance of ASYST by the scientific community could dramatically change the way scientific data are handled and reduce the need for extensive in-house software development for many applications. However, there is no substitute for a well-conceived use of any software. We feel that the full acceptance of the ideas and concepts pioneered by Adaptable Laboratory Software and other software houses will depend on the ability of the scientific community to fully test and verify the procedures used by such products. Only then can the results produced by these software packages be subjected to confirmation which is crucial to rigorous scientific endeavor.     

用EXCEL中的VBA编写植物病害流行学常用程序软件包

采用基于Excel的VBA编程方法,实现复杂的数据统计功能,编写了植物病害流行学常用程序计算机软件包,解决了国内外常用的几种软件包(如SAS、SPSS、DPS等)不能解决的许多问题:如利用Weibull模型拟合"S"型曲线、用Mac kenzie模型拟合病害传播曲线、用多项式的三角函数拟合单峰曲线等.经在科研教学工作中使用,获得了极为理想的效果.     

R2V与MapInfo在太湖渔业资源调查上的应用

以太湖渔业资源调查为背景,结合使用R2V与MapInfo 2种应用软件,以实现其功能模块的优势互补。根据渔业资源调查的要求,构建了ACCESS数据库,通过ODBC将数据表和图层图元进行数据绑定,利用MapInfo提供的专题图制作模块和空间分析模块对太湖渔业资源监测站点的数据进行了分析。     

洞庭湖区水稻优质稻多因子产量预测专家系统的研制

在国家863计划的支持下,我们通过深入分析洞庭湖区水稻综合栽培特点,利用SAS 软件分析了不同因子对产量的影响,建立了湖南省洞庭湖区水稻优质稻多因子产量预测模型。同时运用ASP等软件技术, 开发了水稻优质稻产量智能化预测软件系统。     

Software applications for providing comprehensive computing capabilities to problems related to mixed models in animal breeding

Recently,several computer packages havebeen developed to accomplish problems relatedto mixed model in animal breeding.Special soft-ware for estimation of variance components andprediction of genetic merits are basically neededfor genetic evaluation and selection program.Al-though there are some packages available on theinternet,however,most of them are commercialor unfriendly to be used.The lists of recent soft-ware available on the internet are shown in Tab.1.Most software is free license(mo…     

智能化海量空间信息分析与地图制图软件包IMAT设计及构建

【目的】在农业与环境研究领域,受研究条件和手段限制,多数研究实际上只能集中于点过程、局部地区或某一时段问题,只能关注某些特定主题相关现象和机制。由此产生大量分散数据。通过坐标关联可以对原先在各自独立研究中获取的不同类型数据与证据进行关联,这种连接可能赋予原先所认知的过程以新的涵义。海量空间数据分析方法能够从多渠道、多角度获得对事物的认知,并能够利用新的数据与证据不断修订假设。大数据分析的主要难点是海量空间信息不仅体量大,还要根据数据异质类型进行差异化抽提、整合和表达,难以采用现有主流软件工具,针对这一问题,本研究旨在创建一个能够以自动化和人机交互方式对异源、异质海量空间信息进行抽提、整合与大尺度、大比例尺专题图表达的专用工具--智能制图工具（IMAT）。【方法】采用海量空间信息分析方法中的流程设计与软件设计原则构建IMAT。总设计由系统体系架构设计、系统数据支撑平台设计、模块与组件模型设计3部分组成。程序采用C#为编程语言,以NET Framework 4 Extended为软件开发环境,同时调用制图软件包ArcGIS、数据库软件包Access与界面制作软件包DotNet Bar控件。【结果】IMAT含38个独立功能模块,覆盖了对农业与环境领域产生的海量空间信息进行抽提与制图表达所需主要功能,各模块既可独立进行某项特定数据分析与处理,例如,海量信息调用、存贮、空间要素统计、分类码审核、赋码、要素筛选、数据整合、制图表达等,也可通过多模块组合,完成一项比较复杂的数据抽提与表达任务,弥补了国内外主流数据库软件包与专业制图软件包与在处理海量空间信息方面的功能缺失。IMAT数据分析对象为海量空间数据库。在进行数据分析时,IMAT能够根据研究目标设定对各异源、异质、异构库进行信息抽提的规则,并以自动化、批量化方式完成海量空间信息的逻辑结构与存储结构整合;在进行制图表达时,IMAT能在全图设定分幅图差异化要素抽提规则,并以智能化、自动化、人机交互方式完成由多图幅组成的大比例尺专题图全图的视图表达。【结论】在对农业与环境主题相关海量空间信息进行分析时,IMAT既适用于土壤类型、土壤质地等以多等级分类系统表示的专题要素,也适用于土壤养分含量、土壤污染物含量、面源污染排放指数等以量化分级指标表达的专题要素;既可用于对多专题要素与图层的综合性信息抽提与复合性制图表达,还能用于进行不同比例尺、不同分幅类型的可视化地图制图。IMAT设计中采用组建化模块与模型设计构筑系统体系架构,提高了设计与研制效率;利用函数化的海量空间数据集四元表达式作为IMAT系统中各空间数据库接口文件,使得IMAT各模块均能够接受和处理处于数据整合与表达进程不同阶段的异质、异构海量空间信息,从而实现了各功能模块的可装配性,分析人员能根据数据抽提、整合和表达目标选择并灵活组合适宜的功能模块。     

Hardware and software efficacy in assessment of fine root diameter distributions

Fine roots constitute the majority of root system surface area and thus most of the nutrient and water absorption surface. Fine roots are, however, the least understood of all plant roots. A sensitivity analysis of several software programs capable of providing root diameter distribution analyses was undertaken to determine if this software was capable of discriminating 10% changes in diameters of roots in the 0.05–0.2 mm diameter range. Digital images produced by drawing discrete lines, by scanning wires of various diameters, and by scanning roots from several legume species were analyzed and compared. None of the three packages were able to adequately analyze these images. Each introduced artifacts into the data that were severe enough to confound interpretation of the resulting diameter class length histograms at resolutions from 24 to 400 pixels (px) mm⁻¹, and root diameters from 0.06 to 0.5 mm or larger. One package was, however, clearly superior to the other two for routine digital analysis. All three packages require additional development before they are suitable for routine analysis of fine roots. Due to the 252 px mm⁻¹ resolution ceiling with currently available scanners, the smallest roots for which this level of discrimination is possible is 0.12 mm diameter. For many agricultural and forest species, up to 95% of their total root length is less than 0.1 mm in diameter. It is concluded that both hardware and software constraints currently inhibit the sensitivity of investigations into fine root diameter shifts in response to environmental conditions.     

Excel Workbook for automatic parameter calculation of EPG data

The electrical penetration graph (EPG) technique is a powerful tool for studying feeding behavior of pierce-sucking insects, because it allows quantification of complex insect–plant interactions occurring inside the plant. However, this technique has an important limitation related to the time-consuming analysis of the acquired data, mainly due to the length of the EPG recordings and the complexity of the parameters used to explore insect behavior. This paper presents a Microsoft Excel Workbook that simplifies the analyses of EPG data and automatically calculates a large number of EPG parameters that characterize insect probing and ingestion behavior. These parameters arise from a wide review of EPG papers related to different aspects of insect–plant and virus–insect vector interactions. Another advantage of this application is that data input can be entered from both AC- and DC-based amplifiers and from different software packages used to acquire EPG data (e.g. MacStylet, WINDAQ and PROBE). The workbook summarizes the results and generates an output sheet for further statistical analysis. In this report, we explain how the workbook can be used to analyze the probing and ingestion behavior of two hemipteran species, demonstrating its flexibility and potentiality for efficient and rapid analysis of EPG data.     

SAS统计软件在生产试验中的应用

SAS是目前世界上应用最广泛的数据统计分析软件,具有强大的数据处理功能。熟练掌握SAS对高效处理数据大有裨益。为此,通过不同作物田间试验数据介绍了SAS软件在实际运用过程中进行X2测验、方差分析及直线回归等的操作,以期为现代农业的推进提供信息技术支持。