细胞内源miRNAs影响副黏病毒功能研究进展

自2001年miRNAs被正式命名以来,对于miRNAs的研究已体现在病毒学研究的各个领域。目前的研究结果表明,细胞内源miRNAs能够影响副黏病毒免疫反应、细胞分裂与细胞凋亡、肿瘤生成等生物学过程。本文总结了细胞内源miRNAs对副黏病毒作用的靶基因及其功能,以期为深入剖析副黏病毒的致病机制提供理论支持。     

小鼠原始卵泡发育关键时期卵巢中miRNAs的生物学特征及功能分析

为了探究15.5胚龄和17.5胚龄小鼠卵巢中原始卵泡发育相关的miRNAs并解析其生物学功能，试验随机选用8～10周龄40只雌性和8只雄性健康小鼠进行饲养并合笼处理，提取小鼠原始卵泡发育关键时期15.5胚龄和17.5胚龄卵巢组织总RNA,PCR扩增筛选目的片段，高通量测序获得miRNAs,对其进行聚类、相关性、主成分和碱基偏好性分析，按照表达量倍数差异和表达差异显著性筛选差异表达miRNAs,对差异miRNAs进行靶基因预测，最后对获得的靶基因进行GO功能注释和KEGG富集分析。结果表明：经测序筛选共获得25个差异表达的miRNAs,其中上调的miRNAs有11个，下调的miRNAs有14个，差异倍数大于2且上调的miRNAs总共有5个，分别为mmu-miR-3471、mmu-miR-3472、mmu-miR-5132-3p、mmu-miR-3962及mmu-miR-7118-3p; 15.5胚龄和17.5胚龄的卵巢样品分别被聚集在两个区域，具有很好的一致性；miRNAs的长度不同，首位碱基的偏好性也不同；miRNAs在不同染色体上的碱基偏好程度也不一样；对筛选到的25个差异miRNA...     

新城疫病毒感染鸡胚组织miRNAs表达谱的测序及分析

为了阐明新城疫病毒(NDV)感染鸡胚后miRNAs表达谱的变化及NDV感染与宿主基因之间的相互作用,帮助寻找NDV防控的新靶点和方法。通过small RNA测序技术获得NDV强毒株(F48E9)和弱毒株(La Sota)感染的鸡胚内脏组织miRNAs表达谱。对差异表达的miRNAs进行分析发现,F48E9感染引起了33个miRNAs上调,31个miRNAs下调;La Sota感染引起36个miRNAs上调,25个miRNAs下调;La Sota与F48E9感染组比较,有27个miRNAs上调,22个miRNAs下调。选取10个差异表达miRNAs进行RT-qPCR验证,gga-miR-34a-5p、gga-miR-375、gga-miR-122-3p、gga-miR-187-3p、gga-miR-124a-3p、gga-miR-203a、gga-miR-205a、gga-miR-183、gga-miR-9-3p和gga-miR-451表达量与small RNA测序结果相似。对差异表达miRNAs进行靶基因预测和生物信息学富集分析发现,在NDV感染鸡胚时,差异表达的miRNAs主要参与调...     

水牛泌乳期与非泌乳期乳腺组织miRNAs表达谱鉴定及差异表达分析

旨在鉴定分析水牛乳腺泌乳期和非泌乳期miRNA的表达谱和差异作用机制。采集水牛泌乳期和非泌乳期乳腺组织,利用Solexa测序技术构建2个时期miRNAs表达谱,鉴定前体miRNAs、成熟miRNAs和新miRNAs,分析miRNAs的第一偏好性核苷酸和染色体分布,发掘水牛泌乳期和非泌乳期高表达及差异表达miRNAs。结果显示,本研究构建了水牛泌乳期和非泌乳期乳腺组织2个miRNA表达谱,分别获得12 768 110和12 569 467条18~31nt的高质量序列。测序确认了归属259个miRNAs家族的359个成熟miRNAs和363个pre-miRNAs及5个水牛特有的miRNAs。U是19和25nt miRNAs的5′端最普遍的核苷酸。bbu-let-7b、bbu-let-7a、miR-26a和miR-21等miRNAs在2个时期均呈现高表达;bbu-miR-148a、143、200c、200a和bbu-let-7f等miRNAs在非泌乳期特异性高表达。bbu-miR-125b、29a和bbu-let-7c等miRNAs在泌乳期特异性高表达。bbu-miR-148a、143、200a、141和30a-5p等miRNAs在泌乳期的表达量下降为非泌乳期的1/2以下。而bbu-miR-26a、29a、125b、99a和bbulet-7c等miRNAs在泌乳期表达量大于或等于2倍非泌乳期丰度。本研究构建了水牛泌乳期以及非泌乳期乳腺组织2个miRNAs表达谱,测序确认了259个水牛miRNAs家族的359个成熟miRNAs和363个前体miRNAs,5个水牛特有miRNAs和10个高差异表达miRNAs,为进一步阐明奶水牛泌乳关键miRNAs作用机制奠定了基础。     

猪GV/MⅡ期卵母细胞miRNAs表达谱及Npm2基因相关miRNAs筛选

旨在探索体外成熟前后猪卵母细胞miRNAs表达谱，并筛选参与调控Npm2基因表达的miRNAs。本试验回收屠宰场猪卵巢，收集GV期卵母细胞，经体外成熟培养后获得MⅡ期卵母细胞，分别提取约130个GV期和MⅡ期卵母细胞总RNA进行Illumina HiSeqTM 2500测序，获取miRNA测序数据，每个处理重复3次，筛选差异表达microRNAs并进行靶基因GO和KEGG聚类分析。结果表明，本研究成功构建了GV期和MⅡ期猪卵母细胞miRNAs表达谱，GV期和MⅡ期卵母细胞差异表达miRNAs有95个，具有相似表达模式的miRNA聚为一类，对95个差异表达miRNAs进行靶基因预测，共得到3 967个靶基因，经GO和KEGG富集分析表明，这些靶基因被富集于5 194个GO条目和212个信号通路，其中参与卵母细胞减数分裂成熟的信号通路有2个。在差异表达miRNAs中筛选到5个与Npm2基因相关的miRNAs。采用qRT-PCR对其中2个miRNAs进行验证，证实其表达趋势与测序结果一致。本研究筛选了GV期和MⅡ期卵母细胞差异表达miRNAs，推测差异表达的miRNAs可能通过代谢、卵母细胞减数分裂相关通路、孕激素介导的卵母细胞成熟通路等途径在卵母细胞体外成熟过程中发挥作用，并筛选出调控Npm2基因表达的miRNAs，研究结果可为进一步阐明miRNA对Npm2基因的调控及其在卵母细胞成熟过程中的作用提供依据。     

微小RNA对肠道健康的影响及作用机制

肠道既是机体营养物质消化吸收的主要场所,也是防御肠道微生物感染的先天性屏障,肠道健康是机体正常生长发育的关键。微小RNA(miRNAs)是基因转录后调控的重要因子。本文主要对肠道miRNAs表达情况,miRNAs在肠道细胞中的增殖、分化、凋亡,miRNAs在营养代谢、肠道屏障功能、肠道相关疾病进程调控中的作用以及肠道对外源miRNAs摄取等方面的研究进行综述,以期为相关研究的开展提供参考。     

乳汁miRNAs研究进展及其应用价值

乳汁是哺乳动物新生个体生长发育的重要物质来源。乳汁中蛋白质、脂类、糖及微量元素等成分被证明是婴儿成长不可缺少的能量来源与免疫保障。近来,多项研究证实乳汁中存在一类小分子RNA——miRNAs。这类生物分子主要参与机体的基因表达调控,从而发挥生理、病理的调控作用。目前,该领域研究集中在乳汁中miRNAs含量水平的检测,但其功能研究尚未见报道。本文就人、牛、鼠等物种乳汁中mi RNAs的同源性及其在不同时期乳汁中的含量进行综述。同时,对乳汁miRNAs功能研究进行展望。乳汁miRNAs的深入研究将有助于进一步明确乳汁成分、理解不同成分的功能,为改良配方乳粉等母乳替代品配方及完善相关质量控制标准提供借鉴。     

miRNAs在日本血吸虫不同发育时期的表达情况研究

本研究基于前期对日本血吸虫体内miRNAs的高通量测序及免疫共沉淀研究结果,利用半定量RT-PCR技术对24个miRNAs在15、20、28 d的日本血吸虫雌雄虫体内的表达情况进行了检测,并进一步利用实时定量RT-PCR验证表达差异明显的miRNAs。结果表明bantam、miR-1989、miR-31这三个miRNAs的表达具有期特异性,且均在雌虫中高表达;miR-219在雄虫体内高表达;其余的miRNAs在各个时期均有表达,但表达情况没有明显差异。研究结果对深入理解这些miRNAs在日本血吸虫性成熟或者生殖产卵方面的功能奠定了基础。     

microRNAs在成年羊驼皮肤组织中的表达

本研究旨在分析成年羊驼皮肤中miRNAs的表达,探讨miRNAs在皮肤和毛囊中的调控作用.利用多物种miRNA芯片与成年羊驼皮肤组织miRNAs杂交,来分析成年羊驼皮肤组织中miRNAs的表达.结果显示有20个miRNAs信号在4个样本中表达量高,microRNAs在羊驼皮肤表达,提示它们可能参与了皮肤和毛囊的更新、生长和发育.     

脂肪酸调控奶牛乳腺microRNAs研究进展

脂类是一种可以为动物体储存和提供能量的物质,大量研究证实,日粮中脂类的改变可以改变microRNAs（miRNAs）的表达从而影响机体生命活动。本综述主要概括了脂肪酸对奶牛乳腺miRNAs的调控作用,从奶牛乳腺miRNAs表达特征、调控乳脂合成的miRNAs及外源添加脂肪酸对乳腺miRNAs的调控三个方面进行概述,旨在从转录后调控角度,建立营养物质与乳腺功能的联系,为未来相关研究提供参考。     

病原感染后鸡miRNAs调控的研究进展

microRNAs(miRNAs)是一种短的单链非编码小分子RNAs，无论是在正常发育还是疾病的发生发展过程中，都能够与靶mRNA结合，参与到基因的转录后调控过程，并在其中发挥重要的调节作用。近年来随着miRNAs研究的深入，越来越多的证据表明，病原感染后会引起宿主miRNAs表达水平发生变化，这些差异表达的miRNAs能够积极地参与到疾病的发生发展过程中，并通过调控靶基因的表达参与免疫功能、自噬、炎症反应、代谢等多种生物学过程来抑制或促进疾病的发展。此外，宿主miRNAs作为一种参与转录后调节的小分子RNAs，在病原感染过程中，鸡miRNAs除了可以靶向自身的基因来调控鸡先天免疫信号，也可以靶向病原的基因从而影响病原的吸附、入侵、增殖等过程。作者主要介绍了miRNAs的生物合成、功能以及鸡miRNAs在部分病毒、细菌、寄生虫等病原侵袭过程与致病过程中的调控作用及其机制，简述了不同病原感染后鸡miRNAs的调控策略，以期从miRNAs的角度为鸡病的诊断、治疗和防控提供一定的参考。     

绒山羊骨骼肌miRNAs及其靶基因表达谱分析

本试验选取了miR-1、miR-133、miR-24、miR-122、miR-103、miR-143、let7 7个miRNAs,旨在对其表达量及靶基因表达谱进行分析.选用4只绒山羊的背部和后腿肌肉提取RNA,反转录后,利用SYBR荧光定量PCR来检测各miRNAs的表达量,并采用靶基因指纹图谱(MTFP)技术获得各miRNAs的靶基因表达谱.结果表明,miR-NA表达量依次为:miR-1＞ miR-133＞ miR-24＞ let7＞ miR-143＞ miR-103＞ miR-122,其中miR-1和miR-133表达规律相似,且这7个miRNAs在成羊中的表达量均高于羔羊;此外,miRNAs表达量的差异还受性别影响,且miR-NA表达量与靶基因个数及其表达量之间具有相关性.对5个miRNAs的10个靶基因测序并比对,表明靶基因分别编码与信号转导、细胞周期等相关的蛋白.通过这7个miRNAs与其靶基因表达的分析,揭示了肌肉发育相关miRNAs及脂肪发育相关miRNAs在绒山羊骨骼肌中的异同,有利于绒山羊肉质基因的研究.     

猪脂肪发育相关miRNAs的功能研究进展

脂肪组织与猪肉品质密切相关,是影响猪胴体品质的一大因素。了解猪脂肪组织的生长发育及代谢调控机制,对于畜牧生产及疾病治疗具有重大意义。miRNAs(microRNAs)是一类内源性的、非编码的、长度为18~24nt的小分子RNA,其主要通过调控基因表达的转录后水平起作用。大量研究表明,miRNAs参与调控脂肪细胞分化、脂肪形成、脂肪酸代谢、胆固醇合成等多个生命过程。然而目前已报道的猪miRNAs仅有326个,且miRNAs调控猪脂肪发育的研究十分欠缺。本文对近年来猪脂肪相关miRNAs的挖掘和鉴定研究工作进行回顾,同时也关注了miRNAs调控猪脂肪发育的研究。     

睾丸发育与精子发生相关miRNAs的研究进展

miRNAs是一类广泛存在于真核生物中参与调节不同生物过程的非编码小RNA,可在转录后特异结合mRNAs 3'非翻译区降解靶mRNAs或抑制其翻译,调控其表达。miRNAs对精子发生的细胞特异性调控,对调节雄性生殖具有重要意义。本文概述了miRNAs的生物合成、作用机制,特别是miRNAs对睾丸组织发育及精子发生的表达调控,旨在为进一步深入研究miRNAs在雄性生殖中的作用及分子调控机制提供参考。     

microRNAs调控动物骨骼肌发育的研究进展

microRNAs(miRNAs)是一类重要的内源性非编码小分子RNA,参与调控机体生长、发育的各个环节。近年研究表明,miRNAs在动物骨骼肌发育过程中发挥着重要的调节作用。本文综述了目前已发现的调控动物骨骼肌发育的关键miRNAs。     

乌头驴与三粉驴骨骼肌中miRNAs的表达鉴定与分析

试验旨在分析microRNAs （miRNAs）在德州驴骨骼肌中的表达情况,探讨小RNA （small RNA）在驴骨骼肌发育中的调控机制。采集德州驴2个品系（乌头驴和三粉驴）的背最长肌组织,构建乌头驴背最长肌（WB）和三粉驴背最长肌（SB）的small RNA测序文库并进行测序,运用生物信息学技术对WB和SB之间差异表达的miRNAs进行分析,预测和解析可能影响驴产肉性状的miRNAs,从中挑选了6个表达量较高的miRNAs,利用实时荧光定量PCR技术来验证测序结果的准确性。结果表明,在WB和SB文库中分别鉴定出保守miRNAs有982和1 149个,新miRNAs有106和143个。在WB与SB比较组中基于条件|log₂（fold_change）|≥2、P≤0.05获得17个差异表达的miRNAs,其中表达量上调的有5个,下调的有12个。通过GO注释,发现差异表达的miRNAs显著富集于调控细胞迁移分化、细胞分裂和骨骼肌细胞收缩等生物学过程（P<0.05）,并且挖掘到与驴骨骼肌发育相关的bta-miR-378d_L+1R-1_1ss22CA、bta-miR-378d_R-2,其靶向NPY1R、GPR152、BEST1、KCNH8、SPAG9等多个基因。KEGG富集结果表明,miRNAs富集于Wnt、MAPK、泛素蛋白水解系统等与骨骼肌发育相关的信号通路中,其中在Wnt信号通路中共涉及到17个差异表达miRNAs的207个靶基因,尤其以PC-5p-84483_31、hsa-miR-186-3p_R-3和cfa-miR-329b_1ss19CT的靶基因最多。实时荧光定量PCR结果与miRNAs测序结果一致,并发现除eca-miR-181b外,其他5个miRNAs在SB中的表达水平均高于WB。本研究首次对驴骨骼肌miRNAs进行转录组学分析,揭示了乌头驴和三粉驴miRNAs的表达差异,研究结果为阐明德州驴骨骼肌生长发育的分子调控机制提供参考。     

miRNAs对肠道健康的调控作用及机理

本文在介绍肠道组织miRNAs表达的基础上,主要就miRNAs的差异表达对肠道上皮细胞增殖、分化、凋亡的影响以及miRNAs在肠道黏膜免疫、抵御外界病原感染、抗应激、调节肠道营养代谢和维持肠道稳态等方面所起的作用及其机理进行了综述。     

鸡性成熟启动前后下丘脑microRNA表达谱分析

本研究旨在探讨miRNA在鸡性成熟启动调控中的作用。利用Solexa高通量测序技术检测了鸡性成熟启动前(Before puberty onset,BPO)和性成熟启动后(After puberty onset,APO)下丘脑中miRNA表达谱,通过生物信息学方法进行靶基因预测和功能分析。结果表明,在鸡下丘脑中鉴定出374个已知miRNAs、46个新miRNAs,144个已知miRNAs(reads10)的表达水平在性成熟启动前后发生了显著改变(P0.05)。5个差异表达miRNAs被qRT-PCR方法进一步验证。15个差异最显著miRNA(|log2(fold-change)|2.0,P0.01)预测到2 013个靶基因,GO富集和KEGG调节通路分析结果表明,这些差异表达miRNAs在性成熟启动转录调节和信号转导通路中发挥了重要作用。综上表明,miRNA是参与鸡性成熟启动新的调节因子。鉴于miRNA功能的保守性,该研究结果将为深入开展动物(包括人类)性成熟的分子调控机制研究提供新的理论依据。     

miRNAs在糖尿病心血管疾病中的作用

糖尿病是全球最常见的代谢紊乱综合征,被公认为健康最重要的威胁之一.而miRNAs在糖尿病心血管疾病、胰岛素抵抗、糖尿病肾病、肥胖及脂代谢等并发症的发生发展中具有重要的作用.因此本文综述近几年与糖尿病心血管有关的miRNAs的作用机制及功能意义的研究进展,有助于我们进一步了解糖尿病引起的心血管疾病的病理生理机制,为糖尿病心血管疾病的诊断和治疗提供新的思路和理论基础.     

绵羊不同部位脂肪组织microRNA高通量测序及生物信息学分析

本研究旨在挖掘绵羊不同脂肪组织中特异表达的miRNAs。构建肾周(PEF)、皮下(SUF)和尾部(TAF)脂肪组织的3个小RNA文库,利用Solexa测序技术进行测序,用Stem-loop qRT-PCR技术和生物信息学方法对测序结果进行验证和分析。结果表明,8个随机选择的miRNAs中有7个miRNAs的表达与测序结果一致。在肾周和皮下脂肪组织的sRNA文库中分别检测到128和112个保守miRNAs,分别发现198和196个新miRNAs。结合前期在尾脂中检测到miRNAs的分析结果,肾周脂肪中特异表达的有12个保守的和66个新miRNAs;皮下脂肪中特异表达的保守和新miRNAs分别为1个和30个;尾脂中特异表达的保守和新miRNAs分别为1个和34个。上述结果将为进一步研究miRNA调控绵羊的脂肪代谢提供科学依据。