微卫星的起源、作用以及在基因组中的分布与进化动力学(英文)

微卫星 ,即简单重复序列 (SSR ,1～ 6个碱基单元 ) ,广泛存在于基因组中 ,具有丰富的多态性。本文对SSR的起源与可移动因子 (如逆转录转座子 )之间的联系进行了探讨和分析 ,表明许多SSR的起源与逆转录转座子有关。同时分析了SSR在基因表达、染色质的结构、重组、DNA的复制和细胞周期等方面的重要作用 ,结果表明SSR是使有机组织的正常生长和保持种族特异性的重要DNA片段。就SSR的进化机制而言 ,跳跃复制和重组是产生SSR变异的内因 ;相反 ,通过不同形式的自然选择使得SSR广布于整个基因组 ,并且限定重复片段大小的上、下限临界值以及位点专一性变异和群体差异     

甘蔗的起源与进化

Ｓａｃｃｈａｒｕｍｏｆｆｉｃｉｎａｒｕｍ在世界上已形成几个多样性中心，如新几内亚、印尼东部和南太平洋群岛等。但多样性中心并不一定就是起源中心。Ｓ．ｏｆｆｉｃｉｎａｒｕｍ的起源中心是印尼东部－新几内亚地区。此外，还有其他一些地区被认为是起源中心，如中国、印度、东南亚，但证据还不够充分，有待于进一步证实。Ｓ．ｏｆｆｉｃｉｎａｒｕｍ是通过Ｓ．ｓｐｏｎｔａｎｅｕｍ与其他属的植物（包括Ｅｒｉａｎｔｈｕｓａｒｕｎｄｉｎａｃｅｕｓ、Ｍｉｓｃａｎｔｈｕｓｓｐ．等）的种质渗透而进化来的，进化的中间阶段是Ｓ．ｒｏｂｕｓｔｕｍ。种质渗透的第一步可能是在印尼东部，然后一些材料被传到新几内亚，通过漫长的自然和人工选择而进化成Ｓ．ｏｆｆｉｃｉｎａｒｕｍ。Ｓ．ｓｉｎｅｎｓｅ和Ｓ．ｂａｒｂｅｒｉ可能是Ｓ．ｏｆｆｉｃｉｎａｒｕｍ传到中国和印度后，分别与Ｓ．ｓｐｏｎｔａｎｅｕｍ及近缘植物发生种质渗透而形成的。但也有一些学者认为，一些Ｓ．ｂａｒｂｅｒｉ无性系独立于Ｓ．ｏｆｆｉｃｉｎａｒｕｍ。     

论莴苣的起源和进化

本文根据有关历史文献和莴苣的分布及生理生态特点,提出:地中海沿岸为莴苣的初生原产中心。欧洲南部为直立莴苣、结球莴苣、皱叶莴苣的次生原产中心,中国北方为茎用莴苣的次生原产中心。     

线粒体基因组遗传与进化

线粒体基因组是当前生命科学的热门课题之一。根据目前有关线粒体DNA的结构、表达过程和遗传特征方面的最新研究成果，介绍线粒体基因组与核基因组关系、线粒体遗传密码及基因组的进化线索等问题，并说明线粒体基因组遗传分析的要点。     

蝴蝶进化与起源的研究现状

本文从形态结构、化石、地质历史及分子钟等方面,对蝴蝶进化与起源的研究现状进行了总结,认为不同蝴蝶类群的进化没有十分清晰的脉络,一般认为蝴蝶的3个总科中广蝶总科最为原始,弄蝶总科次之,凤蝶总科则最为进化;蝴蝶起源于何时仍然是备受关注且有待探索的科学命题。     

烟草的起源与进化

烟草在植物分类学上属于双子叶植物纲（Dicotyledoneae）、管花目（Tubiflorae）、茄科（solanacene），烟属（Nicotinan），是许多国家的重要经济作物之一。目前已发现的烟草属有黄花烟、普通烟、碧冬烟三个亚属，14个组，共66个种。烟属植物大多是草本，少数是灌木或乔木状，为一年生或多年生植物。     

三倍体虹鳟线粒体基因组结构与系统进化分析

【目的】获得三倍体虹鳟线粒体基因组（mtDNA）全序列,揭示其序列的主要结构特征,探究三倍体虹鳟系统发育相关信息,丰富鲑科鱼类mtDNA数据库,为三倍体虹鳟进化和系统发育研究提供参考。【方法】选取健康状况良好且规格相似的三倍体虹鳟3条,采集其背脊上部肌肉组织,提取基因组DNA,检测DNA质量后通过Illumina测序技术对三倍体虹鳟mtDNA进行测序、组装和注释,并进行生物信息学分析;基于已报道的27种鲑科鱼类的mtDNA,运用邻接法（neighbour joining,NJ）构建鲑科鱼类系统发育树。【结果】三倍体虹鳟mtDNA全长为16 655 bp;A+T含量较高（54.06%）,G+C含量较低（45.94%）,其碱基组成有明显的A/T偏向性。三倍体虹鳟mtDNA包括13个蛋白编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个非编码控制区（D-loop区）。13个蛋白编码基因中,除cox1的起始密码子为GTG外,其他12个基因的起始密码子均为ATG,终止密码子均为TNN;2个rRNA基因总长度为2 606 bp,22个tRNA基因中除trnS1外,其余21个基因均能形成典型的三叶草结构;D-loop区在环状的DNA分子中位于trnF和trnP之间。系统发育树结果显示,28个物种明显分为2个大的支系,鲑亚科的麻哈鱼属、副哲罗鱼属、细鳞鲑属、哲罗鱼属、红点鲑属、鳟属的鱼种聚为一支,其中三倍体虹鳟和虹鳟最先聚为一支,表明其亲缘关系最近;茴鱼亚科茴鱼属和白鲑亚科的白鲑属、柱白鲑属鱼种聚为另一支。【结论】获得了三倍体虹鳟mtDNA,三倍体虹鳟与虹鳟亲缘关系最近。     

甘蔗的起源和进化

文章通过总结近20年来有关甘蔗属分类、地理起源、栽培起源与传播、甘蔗进化以及甘蔗基因组进化等的研究结果,全面分析了甘蔗的起源和进化进程,分析结果支持Brandes于1958年提出的假说。建议今后应对割手密种、大茎野生种和热带种之间的相互关系展开深入研究,以便更全面了解甘蔗的起源和进化;同时应开展甘蔗全基因组测序研究、甘蔗叶绿体基因组学研究及构建甘蔗遗传连锁图谱,全面深入剖析甘蔗的遗传结构和驯化进程。     

马铃薯栽培种的起源与进化

简述了马铃薯栽培种起源与进化的现代和原始生态条件。说明马铃薯栽培种是在安第斯山中部冷凉的生态条件下进化而来的;利用詹克森等对马铃薯原产地的调查资料,分析了起源地栽培种的进化情况和进化机制;综述了栽培种的种间关系及进化途径;讨论了栽培种进化对现代育种与栽培研究的意义。     

中国芸薹属植物的起源、演化与散布

芸薹属BrassicaL植物在世界上大约有40余种,其中中国有15种。在此,就中国芸薹属植物的起源、演化和扩散问题进行了研究,结果表明:(1)芸薹属植物的起源。通过芸薹属与其外类群白花菜科Capparaceae形态特征的比较,将中国芸薹属植物划分为白菜组SectPekinensis、芥菜组SectJuncea、甘蓝组SectOleracea三个类群,其中白菜组最原始、芥菜组较进化,甘蓝组进化程度最高;(2)芸薹属植物广泛分布于中国的长江、黄河流域及西部山区,但从其现代分布来看,多栽培于青藏高原及其周边地区,笔者认为以青藏高原为主体的西部高山、丘陵地区可能是中国芸薹属植物的分布中心区,并提出中国芸薹属植物是本土起源的,并非来源于地中海地区。(3)通过对中国芸薹属植物分布的分析,笔者推测中国芸薹属植物的散布可能有四条散布途径。第一条是由藏南河谷及横断山脉的北部向西沿青海东部的祁连山以及甘肃的河西走廊,新疆的天山一带,抵达塔里木盆地两侧山地。第二条是由藏南河谷及横断山脉地区向东北方向延伸,经中国甘肃东部、宁夏、陕西北部、山西、河北北部、内蒙古及东北的大、小兴安岭,沿黄河流域及东北三江流域分布。第三条是由藏南河谷及横断山脉地区向东南方向延伸,经四川、云南、重庆、沿长江流域分布,并延伸到广东、台湾一带,第四条是沿藏南河谷及横断山脉向南到达喜马拉雅山南北两侧的干旱河谷。     

栽培大豆起源与演化研究进展

 从大豆属物种的系统进化和栽培大豆起源研究的方法等方面评述了栽培大豆中国东北起源、黄河中下游起源、长江流域及南方起源、日本南部起源等多种假设的依据。在此基础上讨论了多样性中心与起源中心的关系、栽培物种起源与演化的研究方法,以及运用比较实验生物学研究作物进化时的技术性问题。作者倾向于支持栽培大豆南方起源假设。     

大豆与棉花抗性基因类似物的同源性比较及其进化分析

已知许多植物抗病基因的蛋白质产物具有保守的结构域 ,如NBS、LRR、TM等。根据烟草的N基因、亚麻的L6基因和拟南芥的RPS 2基因的保守序列设计了 1对简并引物 ,并以应县小黑豆基因组DNA为模板 ,PCR扩增获得 16个不同的RGA片段 ,大小在 470～5 45bp ,且不同程度地含有抗病基因的保守序列 ,如GGVGKTT、GSRII、GLPL等。与已知大豆、棉花RGA进行比较 ,发现该试验获得的大豆RGA和用相同引物扩增获得的棉花RGA核酸序列以及相应的氨基酸序列之间同源性较低 ,与已经克隆的大豆RGA及其氨基酸序列之间相似性较高。在分子水平揭示了大豆及棉花RGA的起源及其进化。     

棉盲蝽在江苏沿海棉区的发生演变及原因剖析

40多年来,棉盲蝽在江苏沿海棉区经历了加重发生、大发生、治理下降、稳定发生和恢复上升等5个阶段的演变;分析了导致多年来棉盲蝽发生演变的主要因素有耕作制度、作物布局、栽培方式、生态环境、防治水平和气候条件等。     

中国棉花产业百年发展历程

棉花既是人们的衣着之源,又是关系国计民生的重要物资,在整个国民经济中占有非常重要的位置。在中国两千多年的植棉历史长河中,中国棉花经历了从无到有、从小到大、从弱到强的发展历程,其间有坦途,也有曲折;有成功,也有失败;有经验,也有教训。本文重点回顾中国民国时期至今的棉花产业发展历程,总结中国在这一学科或产业领域取得的创新突破、重要成果、重要贡献、 重要人物等情况。     

RAPD-PCR对梨属植物品种鉴定的研究

用RAPD-PCR技术分析鉴定了梨属的18份品种材料(包括不同品种、杂交种和芽变种材料).从OP系列8组共160个10碱基随机引物中,筛选出12种能很好地用于梨品种鉴定的引物.     

利用RAPD-PCR与ISSR-PCR标记技术分析长江口刀鲚的群体遗传结构

利用RAPD-PCR及ISSR-PCR两种分子标记技术对长江出海口两年3个群体的52条刀鲚（Goiliaectenes）进行群体遗传结构的分析。在3个群体中,利用RAPD-PCR标记技术,15个10bp随机引物共检测到110条带,多态性为0．490～0．657,Shannon多样性指数为18．63～22．38,Nei平均遗传距离为0．1195～0．1454;而利用11个ISSR引物所获得的相应结果分别为67、0．576～0．682、11．56～13．66以及0．117～0．147。相关性分析表明这两种技术所获得的上述数据呈正相关（r=0．95,P〈0．05）。AMOVA结果显示,3个群体按采集时间划分成的两年之间的遗传变异不超过总变异的1．1％,同一年内群体间的遗传变异也分别只占总变异的6．99％（RAPD）和2．75％（ISSR-PCR）,群体内各个体之间的遗传变异占总变异的96％（P〈0．0001）,说明两年内所采集的3个群体之间基本上没有产生遗传分化。基于样品之间的Nei遗传距离所构建的Neighborjohing聚类图也清楚地显示出没有按采样的时间产生群体的遗传分化。对各样品之间的Nei遗传距离及Neighbor-joining聚类图分别经Mantel检测及支序分析,发现ISSR-PCR技术所获得的结果与RAPD-PCR技术的结果不存在明显的正相关,但ISSR-PCR标记技术具有在待测样品中能检测到高多态性等优点。     

利用RAPD-PCR与ISSR-PCR标记技术分析长江口刀鲚的群体遗传结构

利用RAPD-PCR及ISSR-PCR两种分子标记技术对长江出海口两年3个群体的52条刀鲚（Goiliaectenes）进行群体遗传结构的分析。在3个群体中，利用RAPD-PCR标记技术，15个10bp随机引物共检测到110条带，多态性为0．490～0．657，Shannon多样性指数为18．63～22．38，Nei平均遗传距离为0．1195～0．1454；而利用11个ISSR引物所获得的相应结果分别为67、0．576～0．682、11．56～13．66以及0．117～0．147。相关性分析表明这两种技术所获得的上述数据呈正相关（r=0．95，P〈0．05）。AMOVA结果显示，3个群体按采集时间划分成的两年之间的遗传变异不超过总变异的1．1％，同一年内群体间的遗传变异也分别只占总变异的6．99％（RAPD）和2．75％（ISSR-PCR），群体内各个体之间的遗传变异占总变异的96％（P〈0．0001），说明两年内所采集的3个群体之间基本上没有产生遗传分化。基于样品之间的Nei遗传距离所构建的Neighborjohing聚类图也清楚地显示出没有按采样的时间产生群体的遗传分化。对各样品之间的Nei遗传距离及Neighbor-joining聚类图分别经Mantel检测及支序分析，发现ISSR-PCR技术所获得的结果与RAPD-PCR技术的结果不存在明显的正相关，但ISSR-PCR标记技术具有在待测样品中能检测到高多态性等优点。     

棉花半配生殖材料后代单倍体的来源

以半配生殖材料作母本与遗传标记基因系杂交，Ｆ１能产生５％左右的嵌合体，由这些嵌合体发育而来的单倍体绝大多数完全具有父本或母本性状，可能由未融合的精核或卵核独立分裂、发育而成