鳜miR-21的时空表达特征及短期饥饿胁迫下的适应性节律表达调控

miRNAs 作为一类具有重要调控作用的非编码单链小分子 RNA, 对生物节律的调控发挥着重要的作用。为探究鳜(Siniperca chuatsi) miR-21 的时空表达特征以及短期饥饿对其昼夜节律表达的影响, 本研究利用实时荧光定量 PCR 分析了鳜胚胎不同发育阶段、幼鱼不同组织以及饥饿 5 d 后鳜白肌中 miR-21 的表达特征。结果显示, 在胚胎发育的早期可以检测到较高水平的 miR-21, 随着胚胎的发育其表达逐渐降低, 至原肠胚早期仅能检测到少量 miR-21; miR-21 在原肠胚后的表达有所提高, 但除尾芽期和心搏期外其余各阶段表达量无显著性差异; miR-21 在所检测的组织中均有表达, 其中在心、肠和红肌中具有较高水平的表达; 正常投喂时, 鳜白肌中 miR-21 的表达具有昼夜节律性, 为昼低夜高的节律性振荡; 饥饿 5 d 后, miR-21 的表达虽仍具有昼夜节律性, 但其中值、振荡幅度、 峰值相位等都受到了明显影响; 靶基因预测分析显示 Arntl2 mRNA 的 3′UTR 序列有 miR-21 结合的靶位点, 且荧光定量 PCR 的结果显示 Arntl2 的表达趋势在饥饿 5 d 后与 miR-21 的表达趋势相反。结果表明, miR-21 呈母源性表达, 在神经胚后表达开始上升说明 miR-21 可能参与调控神经胚后的器官形成; miR-21 在不同组织中的表达无明显组织特异性, 但在心、肠和红肌组织中可能有重要功能; 饥饿胁迫能够影响 miR-21 在鳜白肌的节律性表达, 并且 miR-21 可能通过调控昼夜节律基因 Arntl2 参与鳜的节律性调控从而影响鳜肌肉的生长和逆境胁迫下的生理功能。     

石磺钙调蛋白Os-IP3R和Os-RyR基因的克隆、相对表达量及进化关系

为明确石磺钙通道蛋白1,4,5-三磷酸肌醇受体（IP₃R）基因和蓝尼碱受体（RyR）基因的序列和结构信息,初步研究不同石磺中的Onchidium struma-IP₃R/Onchidium struma-RyR（Os-IP₃R/Os-RyR）基因表达量百分比与石磺系统进化的相关性,实验在瘤背石磺表皮转录组数据库的基础上,克隆得到2条钙通道蛋白基因Os-IP₃R和 Os-RyR,利用生物信息学技术对该基因及所编码蛋白的结构特征进行分析,并通过qRT-PCR技术分析2个基因在瘤背石磺、平疣桑椹石磺和紫色疣石磺各组织中的表达情况。结果显示,Os-IP₃R核酸序列为4 574 bp,包括2 808 bp的开放阅读框,共编码935个氨基酸,预测编码的蛋白有6个跨膜区;Os-RyR核酸序列为1 253 bp,包括1 131 bp的开放阅读框,共编码376个氨基酸,预测编码的蛋白有3个跨膜区。将瘤背石磺IP₃R和RyR的氨基酸序列进行比对,发现位于钙离子通道区的G*R*GGG*GD序列处高度保守;发现3种石磺Os-IP₃R/Os-RyR 的相对表达百分比的高低顺序与各石磺从陆地到浅海的梯度分布趋势相一致,依次为瘤背石磺>平疣桑椹石磺>紫色疣石磺;石磺的陆栖性越强,则Os-IP₃R/Os-RyR 的相对表达百分比越高。不同种石磺的Os-IP₃R/Os-RyR表达量百分比的研究能为分析海洋无脊椎动物由海洋向陆地进化学说提供新的分子生物学线索。     

活饵与饲料投喂下鳜胃饥饿素的表达变化比较

为探讨饲料代替活饵投喂对鳜(Siniperca chuatsi)胃饥饿素(ghrelin)的调控作用, 本研究通过转录组测序和基因组测序数据匹配, 首次获得了鳜(Siniperca chuatsi)胃饥饿素前体基因 DNA 序列, 对其胃中分泌细胞进行定位。 诱食试验模拟鳜进食前看到食物但不能摄食, 进食试验模拟鳜正常摄食。研究检测了诱食、进食后胃饥饿素基因和蛋白表达水平变化。结果表明, 鳜胃饥饿素前体由信号肽、成熟肽(胃饥饿素)和 C-端肽 3 部分构成;前体基因含有 4 个外显子和 3 个内含子, 属于Ⅱ型基因型; 编码 107 个氨基酸, 成熟肽胃饥饿素由 20 个氨基酸构成, 活性中心为 GSSF。免疫组化显示胃饥饿素阳性细胞位于胃腺中。诱食试验中, 活饵组胃饥饿素 mRNA 和蛋白表达水平均显著升高; 而饲料组胃饥饿素基因 mRNA 和蛋白表达水平未发生显著变化, 且显著低于活饵组(P＜0.05)。进食实验中, 活饵组进食后 0 h, 胃饥饿素 mRNA 和蛋白表达水平显著上升(P＜0.05), 进食后 2 h 下降至摄食前水平 (P＜0.05), 后续无显著变化(P＞0.05); 饲料组进食后 0 h 胃饥饿素 mRNA 表达水平未出现显著变化(P＞0.05), 蛋白水平呈波动变化, 进食后 2 h 及后续胃排空时间内皆无显著变化(P＞0.05)。综上, 鳜胃饥饿素细胞位于胃腺位置, 参与调节摄食活动, 进食前上升, 进食后下降, 而饲料投喂下 ghrelin 对摄食调节作用明显减弱, 研究结果可为鳜饲料养殖提供科学参考。     

仿刺参硫酸软骨素合酶1基因克隆及灿烂弧菌感染后的表达特征模式分析

硫酸软骨素在生物体应对病毒和细菌感染中起着重要作用, 为研究硫酸软骨素合酶 1 (chondroitin sulfate synthase-1, ChSy-1)在仿刺参(Apostichopus japonicus)受到灿烂弧菌(Vibrio splendidus)感染后的作用, 本研究开展了仿刺参 ChSy-1 基因(AjChSy-1)全长序列克隆和结构及系统进化分析, 并采用荧光定量 PCR 技术测定了该基因在刺参不同组织中的表达差异及灿烂弧菌感染下的表达模式。结果显示, AjChSy-1 基因 cDNA 全长为 2756 bp, 其中, 5′-UTR 长度为 194 bp, 3′-UTR 为 228 bp, ORF 为 2334 bp, 编码 777 个氨基酸。AjChSy-1 基因编码的蛋白含有糖基转移酶保守性 DXD 基序、β3-糖基转移酶基序及 β4-糖基转移酶基序等结构。刺参基因组比对发现在 chr13 染色体上存在 2 个 AjChSy-1 基因拷贝。系统进化分析表明, 刺参 AjChSy-1 编码蛋白与玉足海参(Holothuria leucospilota) 和棘冠海星(Acanthaster planci)的蛋白亲缘关系较近, 与斑马鱼(Danio rerio)、智人(Homo sapiens)等脊椎动物的蛋白亲缘关系较远。荧光定量 PCR 显示, AjChSy-1 基因具有广泛的组织表达特性, 其中, 体腔细胞中表达量最高, 体壁、性腺(雄性和雌性)和纵肌次之。在响应灿烂弧菌侵染过程中, 随灿烂弧菌侵染时间增加, 体壁中 AjChSy-1 表达量呈现先上升后下降的趋势, 在第 3、6、9 天分别为对照组的 1.79、2.06、3.12 倍, 对发病期抗病群体和易感群体中该基因的检测结果表明, 易感群体体壁该基因表达量显著低于抗病群体(P＜0.05), 表达量降低 11.4%。推测该基因可能在刺参应对灿烂弧菌中发挥免疫防御作用, 相关研究结果为解析刺参 AjChSy-1 基因功能以及抗病分子调控机制提供了参考数据。     

蛋白核小球藻psbA基因的克隆及其在自养和异养培养的表达变化

psbA基因是高等植物和藻类中介导光合电子传递D1蛋白的编码基因,该基因受光照等因素的调控。以单细胞绿藻蛋白核小球藻为材料,克隆了psbA全编码序列并用荧光定量PCR的方法研究了自养和异养藻psbA基因转录水平的变化,以揭示不同培养方式下psbA基因表达变化规律。结果克隆到2 595 bp psbA序列,包括676 bp的 5′-非翻译区和857 bp的3′非翻译区。该psbA基因开放阅读框编码353个氨基酸,A+T百分含量为58.0%,其成熟的D1蛋白加工方式与高等植物高粱相似。荧光定量结果表明,自养藻在光周期内psbA基因表达量先升高后下降,而异养藻psbA表达变化不明显。从自养转为异养2 h 时psbA表达量略有升高,4 h后下降至转化前的0.41倍并缓慢下降,而从异养转为自养psbA表达量增加,4 h时增加至1.69倍,4 h后趋于稳定。不同浓度光合抑制剂DCMU降低自养小球藻psbA转录活性至未添加组的40%~59%,而不同程度地促进了异养藻psbA的转录表达。     

花鲈cox6a基因与相关miRNA的鉴定及其在盐度适应中的表达调控分析

细胞色素c氧化酶（COX）是线粒体电子传递链的末端酶,COX6A是细胞色素c氧化酶的核编码亚基之一。为丰富花鲈（基因及相关miRNAs在花鲈渗透调节机制中的潜在作用,本研究开展了花鲈cox6a基因的miRNAs,并对其与）。系统进化树分析进一步确认了两个花鲈在垂体、脑、肝脏和肾脏中的表达量较高,基因的miRNA：miR-30e-5p、miR-223、miR-200a-3p和miR-155-5p,但没有发现可能靶定基因以及miR-30e-5p、miR-223、miR-200a-3p都呈现显著差异表达,而miR-155-5p仅在适应高盐环境时出现了显著的差异表达。这表明,基因和4个miRNAs在花鲈的渗透调节过程中发挥潜在作用。其中miR-30e-5p、miR-223和miR-200a-3p的表达趋势与cox6a2基因的表达调控。本研究为探讨花鲈适应不同盐度环境的渗透调节机制提供了基础数据。     

翘嘴鳜MyomiRs时空表达特征及靶向Pax7的预测分析

MyomiRs为一类肌肉特异性microRNAs (miRNAs),对于肌细胞的增殖和分化具有重要作用。本研究旨在探究翘嘴鳜(Sinipercachuatsi)4种MyomiRs基因(miR-1a、miR-133a-3p、miR-206和miR-499)的时空表达及其在短期饥饿胁迫下的表达特征,并预测分析4种MyomiRs对Pax7的调控作用。应用实时荧光定量PCR检测4种MyomiRs在翘嘴鳜不同组织、胚后不同发育阶段的白肌以及饥饿5d白肌中的表达情况，并利用RNAhybrid对4种MyomiRs与Pax7 mRNA 3′UTR的靶向位点进行预测。结果显示, miR-1a、miR-133a-3p和miR-206在D60 (出膜后60 d)高表达, miR-499在D100高表达。miR-1a和miR-133a-3p在红肌、白肌和心肌中高表达,在其他组织中表达量低。miR-206在红肌和白肌中高表达,在其他组织中表达较量低。miR-499在心肌中表达量较高,在红肌和白肌中的表达量次之,其他组织中表达量低。饥饿5d后4种MyomiRs的表达均显著上升,表明鳜骨骼肌可能对饥饿胁迫做出应激反...     

盐度胁迫后青海湖裸鲤Grp78及其相关基因的应答表达

为深入研究青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)面临盐度胁迫时的分子应答机制, 本研究克隆了青海湖裸鲤葡萄糖调节蛋白 78 (glucose-regulated protein 78 kD, Grp78)基因, 并采用 qPCR 法检测 5‰, 10‰和 15‰盐度胁迫后 Grp78 及其相关基因的应答模式。结果显示, 青海湖裸鲤 Grp78 的开放阅读框长度为 1962 bp, 编码 653 个氨基酸, 并包含 HSP70 超家族保守结构域。Grp78 在青海湖裸鲤 9 个组织中均有表达, 其中在肠道、肝脏和心脏中的表达显著高于其他组织(n=3, P＜0.05)。在鳃组织中, 随着盐度增加和胁迫时间的延长, Grp78、Hyou1、Prdx1、Nqo1 和 UBC 基因的表达先被抑制, 随后逐渐上调, 而 DNAJC2、Cu/Zn-SOD、Mn-SOD 和 Hmox1 基因的表达则先上调后逐渐下调, 随后又上调; 在肾脏和肝脏中, DNAJC2、Cu/Zn-SOD、Mn-SOD、Hmox1 和 Nqo1 基因的表达也呈现类似的先上调后下调再上调的模式。以上结果表明, Grp78 及其相关基因对盐度胁迫具有复杂的响应, 可能参与了青海湖裸鲤适应和应对盐度胁迫的过程。此外, Grp78 及其相关基因 Hyou1、DNAJC2、Hmox1、Nqo1、UBC、Prdx1、 Cu/Zn-SOD 和 Mn-SOD 参与了机体抗氧化应激调节, 在减少盐度损伤方面发挥重要作用。     

日本鳗鲡TRAF3基因的克隆及功能研究

为探究鱼类TRAF3在鱼类抗病毒免疫应答中的功能及作用机制,实验利用逆转录PCR克隆获得了日本鳗鲡TRAF3转录本 (AjTRAF3),利用生物信息学软件分析了AjTRAF3的结构特征,利用实时荧光定量 PCR(qPCR)、双荧光素酶报告系统以及免疫共沉淀等方法对其表达规律、功能及作用机理进行了初步分析。AjTRAF3的开放阅读框长度为1 707 bp,编码568个氨基酸。序列结构分析结果显示,AjTRAF3由N端的环结构域2个锌指结构域以及1个螺旋结构域和C端高度保守的TRAF-C (MATH)结构域组成。qPCR结果显示,AjTRAF3在日本鳗鲡各组织中均有表达,脑组织中表达量最高,其次为头肾,心脏中的表达量最低。Poly I:C刺激6 h后,日本鳗鲡脾脏组织中AjTRAF3上调倍数最高,为对照组的15.83倍。迟缓爱德华氏菌感染24 h后,日本鳗鲡脾脏组织中AjTRAF3上调倍数最高,为对照组的31.47倍。此外,本研究构建了AjTRAF3真核表达质粒,发现过表达AjTRAF3能显著上调炎症及抗病毒相关基因的表达,可显著增强AjIFN2、AjIFN4和NF-κB启动子荧光素酶活性。并能显著上调由AjRIG-IN、AjMAVS、AjIRF3诱导的AjIFN2、AjIFN4和NF-κB启动子活性。免疫荧光结果显示,AjTRAF3主要定位于细胞质中,且与AjMAVS存在共定位。免疫共沉淀结果显示,AjTRAF3通过MATH结构域与AjMAVS相互结合,缺失该结构域后,其与AjMAVS的相互作用消失,推测AjTRAF3可通过介导RIG-I/MAVS信号转导途径调控鱼类的抗病毒免疫应答。本研究结果为进一步揭示鱼类TRAF3的生物学功能奠定了基础。     

大鲵皮肤cDNA文库ESTs分析及Dynll 2基因的分离与表达

以本实验室构建的大鲵皮肤cDNA文库为材料,通过文库质量检测、随机测序、ESTs拼接、COG软件进行基因注释等对文库进行了分析,并从中分离获得了大鲵胞质动力蛋白轻链2(dynein light chain,LC8-type 2,Dynll 2)基因的cDNA序列,对Dynll 2基因进行了生物信息学分析及组织表达研究。结果表明,本实验室构建的大鲵cDNA文库初级库容为1.50×10⁶ cfu,文库重组率为94.8%,插入片段平均长度约为1 kb。400个随机克隆测序共获得343个有效ESTs,其中214条ESTs序列E值＜10^-6,经COG软件归为9大类,其中与分泌蛋白、细胞代谢、细胞骨架以及信号转导相关的基因表达量最高,分别为31.3%、14.0%、13.0%和12.6%。表明大鲵皮肤分泌活动强烈,代谢旺盛,这和大鲵皮肤发挥免疫、呼吸以及渗透压平衡等生理功能相一致。获得的大鲵Dynll 2基因全长为682 bp,其中5′-UTR为57 bp,3′-UTR为313 bp,生物信息学分析表明,该基因编码104个氨基酸,分子量为12.03 ku,等电点pI值为7.05。Dynll 2蛋白在88~104处有由里向外和由外向里的2个跨膜螺旋区,且二级结构以α—螺旋为主;在69~87处有典型的“ZnFC2H2”结构模体;经比较,其三级结构与鼠Dynll 2蛋白相似。Dynll 2蛋白的进化分析表明,大鲵与无尾两栖类相比,更接近陆生动物。荧光定量实验表明,大鲵Dynll 2基因在肌肉中高表达,在其他组织中低度表达。     

全同胞家系中生长差异翘嘴鳜肌肉转录组分析

翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)是中国重要的经济水产养殖品种,对翘嘴鳜基因表达模式进行研究有助于筛选优势个体,培育生长特性优良的品种。为了解体重明显差异翘嘴鳜个体的差异基因表达信息,为翘嘴鳜培育提供基因指导,本研究从同一家系中挑选体重明显差异的3月龄翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)个体进行肌肉转录组测序,研究不同体型个体间基因表达模式差异。结果显示,来自同一家系的翘嘴鳜个体在相同养殖条件下仍出现明显体重差异,养殖3个月后,极大个体(overweight)平均体重可达到极小个体(underweight)的4倍。分别对极大个体和极小个体的肌肉组织进行转录组测序,共获得73353个非重复序列基因(unigenes),通过基因表达量比较共获得8942个差异基因,对差异表达基因进行定义发现,GHR2、IGFR1、4ebp、Mhc、Mlc、Troponin等基因在极小个体中具有更高的表达水平。通过KEGG通路富集显示,蛋白质生成、蛋白质消化、RNA转运通路富集了大量差异表达基因。本研究发现体重差异明显的翘嘴鳜个体具有不同基因表达模式,转录组测序获得了大量差异表达基因信息,为翘嘴鳜生长研究提供了丰富的基因资源。     

草鱼miR-23a在嗜水气单胞菌感染过程中的调控机制

为探索嗜水气单胞菌感染后草鱼肾脏细胞(Ctenopharyngodon idella kidney,CIK)中miR-23a的调控机制,实验通过实时荧光定量PCR(qPCR)测定了嗜水气单胞菌感染CIK细胞后miR-23a的表达量变化,使用RNAhybrid软件预测miR-23a的靶基因并用双萤光素酶报告基因检测系统进...     

肖四海湖五种渔具的鳜渔获结构特征及其对鳜资源的影响

为评估不同渔具对鳜资源的影响,于2007年5月和12月对长江中游浅水湖泊肖四海湖刺网、延绳钓、网簖、电拖网和电捕仪5种渔具捕获的鳜渔获物结构特征进行了调查分析.结果发现,共采集鳜样本359尾,全长分布范围为92 ～600 mm,优势全长集中于251～350 mm;体质量分布范围为10～3 380 g,优势体质量集中于300 ～500 g.种群由5个年龄组构成,2～3龄为优势龄组,占总数的74.6％.刺网、延绳钓和网簖对鳜有较强的捕捞选择性,网目大小为80 mm和100 mm刺网的鳜渔获物中2龄及以上成熟个体占总数的93.3％,个体平均体质量466 g,“标鳜”(0.4 ～0.75 kg)个体占总数量的57.0％;延绳钓捕获的鳜渔获物中2龄及以上成熟个体占总数的86.9％,“标鳜”个体占总数量的43.5％;网簖捕获的鳜渔获物中90％以上为1龄的未成熟个体.电拖网和电捕仪捕获的鳜全长范围明显较大,其渔获物以1龄和2龄个体为主.综合分析表明,刺网适于作为鳜捕捞的主要渔具,延绳钓可以作为一种鳜捕捞的辅助渔具.网簖对鳜补充群体有较大危害,不适于作为鳜的捕捞网具.电拖网和电捕仪均属于违法渔具,对鳜资源危害巨大,应该加大监管力度,严禁使用.     

Disease resistance and immune‐relevant gene expression in golden mandarin fish,Siniperca scherzeri Steindachner,infected with infectious spleen and kidney necrosis virus‐like agent

Infectious spleen and kidney necrosis virus (ISKNV), family Iridoviridae, genus Megalocytivirus, may cause high mortality rates such as those seen in mandarin fish, Siniperca chuatsi. ISKNV has attracted much attention due to the possible environmental threat and economic losses it poses on both cultured and wild populations. We have investigated the pathogenicity of ISKNV‐like agent Megalocytivirus, isolated from infected pearl gourami, in golden mandarin fish, Siniperca scherzeri – a member of the Percichthyidae family – and in another Percichthyidae species, S. chuatsi. Fish were challenged with four different doses of ISKNV‐like agent Megalocytivirus (1, 10, 100 or 1000 μg per fish) over a 30‐day period, and cumulative fish mortalities were calculated for each group. No significant mortality was observed for fish challenged with the lowest dose (1 μg per fish) relative to a control group. However, all other challenged groups showed 100% mortality over a 30‐day period in proportion to the challenge dose. Quantitative real‐time PCR was performed to measure mRNA expression levels for six immune‐related genes in golden mandarin fish following ISKNV‐like agent challenge. mRNA expression levels for IRF1, Mx, viperin and interleukin 8 significantly increased, while mRNA levels for IRF2 and IRF7 remained constant or declined during the challenge period.     

Meiotic gynogenesis with heterologous sperm in the mandarin fish Siniperca chuatsi and evidence for female homogamety

The mandarin fish Siniperca chuatsi is a historically important aquaculture species in China and exhibits sexually dimorphic growth. However, sex determination of this fish remains unclear so far. In this study, we induced meiotic gynogenesis in S. chuatsi using irradiated heterologous sperm from spotted mandarin fish (Siniperca scherzeri) to uncover its mechanism of sex determination. Up to 7.52% diploid progeny were obtained among three gynogenetic families in this study. Molecular analysis of female and male donors and sampled young gynogens by seven microsatellite loci further confirmed no genetic contributions from the ‘father’ S. scherzeri. After 8 months of culture, external morphology of adult fish showed that all gynogens were cloned from their mothers. Gonads of the gynogenetic progeny were examined by histological observations and the sexing results showed that they were almost 100% females, strongly supporting an assumption of female homogamety in mandarin fish. By this study, we obtained pure lines of S. chuatsi and elucidated its genetic mechanism of sex determination, providing a basis for possible sex control breeding in this species.     

Involvement of the miR-462/731 cluster in hypoxia response in <Emphasis Type="Italic">Megalobrama amblycephala</Emphasis>

MicroRNAs (miRNAs) are non-coding small RNAs showing both evolutionarily conserved and unique features and are involved in nearly all biological processes. In the present study, the role played by miR-462/731 cluster miRNAs in hypoxia response in Megalobrama amblycephala, an important freshwater fish, was investigated. The M. amblycephala miR-462/731 cluster locus and their 5′ flanking sequences were sequenced and analyzed. In M. amblycephala and other teleost fish species, the mature sequences of miR-462 and miR-731 were identical and hypoxia-responsive elements (HREs) were identified upstream of the miR-462/731 loci. The two miRNAs were significantly induced in the liver, spleen, gill, muscle, and brain after hypoxia treatment. The expression of both miRNAs was also upregulated in cells that received treatment which mimicked hypoxia. Furthermore, reporter assay revealed that M. amblycephala HREs can be activated by hypoxia. Taken together, the 462/731 cluster may play a role in the regulation of the hypoxia response in M. amblycephala.     

鳜胚胎细胞系的建立与应用

为更好地开展鳜基因功能研究和药物筛选工作,提高基因转染效率,本研究以鳜囊胚期胚胎为材料,采用含有20%胎牛血清的DMEM培养基进行培养,建立了生长稳定的鳜胚胎细胞系MFE。在此基础上,采用绿色荧光蛋白(GFP)作为标记物,在HEK293T细胞中体外包装逆转录病毒,再感染MFE细胞系。MTT法分析表明传代后细胞培养96 h内,细胞生长率变化也经历增殖、降低到达稳定期。而且MFE细胞能稳定表达GFP基因,感染效率为20%±5%,而脂质体转染效率为3%±2%。可见包装病毒感染细胞不仅能获得稳转细胞系,效率也远高于脂质体瞬时转染。荧光定量PCR分析表明,MFE细胞系能表达Irf1、Irf3和Irf7基因,Irf1基因表达量最高。MFE细胞系受到poly I:C刺激后,Irf1、Irf3和Irf7的表达量分别升高3.5,2.3和2.1倍。因此,MFE细胞通过病毒感染可以获得较高的转染效率,该细胞可作为鳜免疫相关基因功能研究的工具。     

Genomic structure,tissue expression and single nucleotide polymorphisms of lipoprotein lipase and hepatic lipase genes in Chinese perch

Chinese perch, an obligate piscivorous fish, could serve as an excellent model system for studies on the diversification of lipoprotein lipase (Lpl) and hepatic lipase (Hl) genes. In this study, we characterized the genomic structure, tissue expression and single nucleotide polymorphisms of Lpl and Hl genes in Chinese perch (Siniperca chuatsi). Consistent with findings in other vertebrates, Chinese perch Lpl gene consisted of ten exons and nine introns, and Hl gene consisted of nine exons and eight introns. The promoter region of Hl gene was not highly homologous to that of Lpl gene in Chinese perch. The mRNA expression of Lpl in Chinese perch was the highest in adipose tissue, followed by liver, brain, intestine and muscle, and the lowest in spleen, whereas Hl was almost exclusively expressed in liver. These results suggested that Chinese perch Lpl and Hl might be derived from an early duplication of an ancestral gene. Polymorphisms of Lpl and Hl genes were examined in feeders and non‐feeders of dead prey fish by direct sequencing of these genes in 130 fish from each group. Three SNPs (A1220T, G1221T and C1224G) were identified in Lpl gene, whereas none was identified in Hl gene. Diplotype 2 in Lpl gene was significantly correlated with acceptance of dead prey fish.