吉林省猪圆环病毒3型的分子流行病学调查及遗传演化分析

为了解猪圆环病毒3型(porcine circovirus type 3,PCV3)在吉林省的流行情况和分子生物学特性,本研究通过PCR方法对吉林省2015-2017年的484份血清样品进行PCV3检测,将PCV3检测阳性的样品进行ORF2基因扩增和测序,并利用生物信息学软件DNAStar和Mega 6.06对ORF2基因的分子生物学特性进行分析。结果显示,吉林省2015-2017年PCV3样品总感染率和猪场感染率分别为28.1%(136/484)和65.8%(25/38),且呈逐年上升趋势。同源性分析结果表明,本研究获得的4株PCV3 ORF2基因的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为98.3%～98.9%和97.7%～99.5%,4株PCV3 ORF2基因与国内外参考毒株ORF2基因的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为97.7%～99.7%和96.7%～100%。遗传进化分析表明,PCV3存在2个亚群:PCV3a和PCV3b。本试验分离的PCV3毒株分别位于2个亚群上,1株属于PCV3a亚群,3株属于PCV3b亚群。PCV3毒株Cap蛋白第24(A、V)和27位(R、K)氨基酸的不同可能与PCV3毒株的进化相关。本试验结果表明,PCV3在吉林省猪群和猪场中存在很高的感染率,PCV3毒株之间高度保守,本研究结果为PCV3的分子特性研究提供了参考依据。     

贵州省猪圆环病毒3型的分子流行病学调查

近年来在我国多个省份检测出新型猪圆环病毒3型(porcine circovirus 3,PCV3),为确定贵州省是否也存在该病毒,本试验对92个规模化养殖场2016—2017年所送检的308份样品采用PCR技术进行PCV3筛查,并对部分阳性样品中的ORF2进行PCR扩增、克隆及测序,将测序结果与GenBank上公布的26株ORF2序列进行遗传进化树构建、核苷酸和氨基酸比对。结果首次证实贵州省PCV3的存在,在15份PCV3阳性病料中有13份存在与其他病原共同感染现象,且多以腹泻为临床表现;株间核苷酸同源性为98.0%～100.0%,与参考毒株同源性为96.3%～99.8%,与参考株氨基酸比对相似性为97.2%～100%,遗传进化关系相对较复杂。本试验为我国PCV3的流行状况研究提供了一定的数据依据。     

吉林省猪圆环病毒Ⅱ型血清流行病学调查

猪圆环病毒(porcine circovirus,PCV)为圆环病毒科(Circoviridae)圆环病毒属成员,单股环状DNA病毒,是迄今发现的最小的动物病毒。PCV存在两种基因型,即PCV-1和PCV-2。PCV-1未发现有致病性;PCV-2主要引起仔猪免疫缺陷的断奶仔猪多系统消耗综合症(Post-weaning multisystemic wasting syndrome,PMWS)的病原之一。猪是     

新疆地区猪圆环病毒2型分子流行病学调查

为了解目前新疆维吾尔自治区猪圆环病毒2型(PCV2)的分子流行病学特征,应用PCR方法对新疆14个地区猪场送检的共430份病料进行PCV2的检测,并对阳性样品的基因组进行了扩增和克隆测序,分析研究PCV2遗传变异情况。结果显示,430份样品中,有21份样品为PCV2阳性,阳性率为4.88%。经序列比较和遗传进化分析对21株PCV2进行了基因型鉴定,其中2份样品为PCV2a(9.52%),3份样品为PCV2b(14.29%),15份样品为PCV2d(71.43%),1份样品为PCV2e(4.76%)。与其他基因型相比,新疆地区PCV2优势基因型PCV2dORF2的特异性氨基酸位点主要集中在第53I、89L、90T、121T。结果表明,目前新疆地区的PCV2以PCV2d基因型为主,同时也伴有其他类型,本研究为更好地掌握新疆地区PCV2的流行情况、基因组特性进而提出针对性防控措施提供参考数据。     

华南地区猪圆环病毒3型感染的分子流行病学调查与分析

为了解猪圆环病毒3型(porcine circovirus 3,PCV3)在我国华南地区的感染情况,从2016年12月到2017年12月期间,从广东、广西、海南、福建、江西和湖南的177家规模化猪场采集1 078份病料,利用PCR技术检测PCV3的流行情况,并对PCV3阳性病料进行全基因组测序分析。结果显示:样品阳性率为29.04%(313/1 078),猪场阳性率为44.63%(79/177);从病料中测得的10株PCV3毒株全基因组核苷酸序列相似性为98.8%~100%,与国内外其他毒株的同源性在98.2%~100%之间;全基因组遗传进化分析显示PCV3遗传进化可以分为PCV3a和PCV3b,其中毒株CHN/HUNAN、CHN/GD-SH和CHN/GD-ZQ属于以美国毒株US/MO2016为代表的PCV3a分支,其余7个毒株属于PCV3b分支。结果表明:PCV3广泛存在于华南地区的猪群中,其基因组在不断进化,对PCV3的流行与致病机理有待进一步研究。     

河北省猪圆环病毒3型流行病学调查及遗传变异分析

为了解猪圆环病毒型(porcine circovirus3,PCV3)在河北省的流行情况及遗传变异特点,本研究在2017年2月至2018年7月间,从河北省不同地区60个猪场采集了310份不同临床症状表现的发病猪组织样本,应用PCR方法对其进行检测。结果显示该地区PCV3阳性率为16.5%(51/310),猪场阳性率为45.0%(27/60),对不同临床症状发病率分析显示PCV3在表现为繁殖障碍及腹泻猪群中具有较高的阳性率,且易与PCV2发生共同感染。对获得的8株PCV3的cap基因进行测序及同源性分析显示,所得8条序列之间的核苷酸相似性为98.0%～99.7%,与24条国内外参考株之间的核苷酸相似性为98.0%～100.0%。对cap基因所推导的氨基酸序列进行分析发现cap基因的主要突变位点发生在24,27,77及150位,其中24和27位主要发生了A24V和R27K变异。对32条序列进行进化树的构建发现,进化树可分为3a、3b和3c 3个基因群,河北分离株主要分布于3a基因群和3c基因群,表明了河北省PCV3流行株相对稳定。我们的研究结果为PCV3在河北省的流行及进化特点提供了理论参考,这些数据可为该地区PCV3的诊断及综合防控提供科学依据。     

广西猪圆环病毒3型流行病学调查与分析

本研究旨在了解新发猪圆环病毒3型(porcine circovirus 3,PCV3)在广西猪群的感染情况及流行特点,为有效防控PCV3提供科学依据。试验采用PCR检测方法对2017年9月至2019年3月广西482个规模猪场送检的917份病猪样品进行PCV3检测,并分析PCV3阳性率在广西不同地区、年份、季节和年龄段猪群之间的差异。对145份PCV3阳性病料进行猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪圆环病毒2型(PCV2)、猪伪狂犬病病毒(PRV)和猪流行性腹泻病毒(PEDV)检测。结果显示,PCV3除在百色、防城港未检出,在广西其他12个地市均存在不同程度的感染;2017～2019年广西PCV3样品阳性率和PCV3猪场阳性率均呈逐渐上升趋势;夏季PCV3阳性率最低,且明显低于其他3个季节;育肥猪PCV3阳性率最高,为21.70%,其次是流产母猪、保育猪、流产胎儿,阳性率分别为20.00%、19.05%和11.02%,哺乳仔猪PCV3阳性率最低,为8.21%;PCV3单一感染率较高,为30.34%,与其他病原混合感染情况也较为常见,甚至出现四重感染。调查结果表明,PCV3感染在广西普遍存在,且近年来感染呈增加趋势,可能有一定的季节性,对各生长阶段猪群均有一定程度的危害,以育肥猪最为严重,对母猪和保育猪危害也较大;PCV3单一阳性率较高,但仍以混合感染为主,尤其是与PRRSV和PCV2的混合阳性率较高,提示这3种病原在感染致病过程中可能存在协同作用。     

广西猪圆环病毒3型流行病学调查与分析

本研究旨在了解新发猪圆环病毒3 型（porcine circovirus 3,PCV3）在广西猪群的感染情况及流行特点,为有效防控PCV3提供科学依据。试验采用PCR检测方法对2017年9月至2019年3月广西482个规模猪场送检的917份病猪样品进行PCV3检测,并分析PCV3阳性率在广西不同地区、年份、季节和年龄段猪群之间的差异。对145份PCV3阳性病料进行猪瘟病毒（CSFV）、猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）、猪圆环病毒2型（PCV2）、猪伪狂犬病病毒（PRV）和猪流行性腹泻病毒（PEDV）检测。结果显示,PCV3除在百色、防城港未检出,在广西其他12个地市均存在不同程度的感染;2017~2019年广西PCV3样品阳性率和PCV3猪场阳性率均呈逐渐上升趋势;夏季PCV3阳性率最低,且明显低于其他3个季节;育肥猪PCV3阳性率最高,为21.70%,其次是流产母猪、保育猪、流产胎儿,阳性率分别为20.00%、19.05%和11.02%,哺乳仔猪PCV3阳性率最低,为8.21%;PCV3单一感染率较高,为30.34%,与其他病原混合感染情况也较为常见,甚至出现四重感染。调查结果表明,PCV3感染在广西普遍存在,且近年来感染呈增加趋势,可能有一定的季节性,对各生长阶段猪群均有一定程度的危害,以育肥猪最为严重,对母猪和保育猪危害也较大;PCV3单一阳性率较高,但仍以混合感染为主,尤其是与PRRSV和PCV2的混合阳性率较高,提示这3种病原在感染致病过程中可能存在协同作用。     

福建省新发猪圆环病毒3型流行病学调查及遗传变异分析

猪圆环病毒3型(PCV3)是新发现的一种猪圆环病毒,该病毒可以引起猪皮炎与肾病综合征(PDNS)、母猪繁殖障碍和全身多器官的炎症反应。为了解福建省PCV3流行株的现状、分子生物学特征和遗传演化规律,本研究采集福建地区规模化猪场120份临床表现繁殖障碍和呼吸道疾病的组织样品,采用PCR方法对其进行PCV3检测。结果显示福建省猪场PCV3的感染率为12.5%。对福建省5株PCV3全基因组进行序列分析,结果显示,5株PCV3间核苷酸同源性为98.2%~99.6%,与国内PCV3分离株的核苷酸同源性为97.6%~100%,与美国分离株(PCV3-US/MO2015、PCV3-US/MN2016、PCV3-US/SD2016、PCV3 2164和PCV3 29160)的核苷酸同源性为97.8%~99.3%,而与PCV2的核苷酸同源性为43.8%~44.1%,与我国蝙蝠圆环病毒的核苷酸同源性为49.2%~51.1%。PCV3系统进化树结果显示,福建省5株PCV3处于3大亚群,1株属于3a亚群,1株属于3b亚群,3株属于3c亚群。其氨基酸序列分析显示PCV3 Cap蛋白比较保守,仅存在个别位点的氨基酸突变。本研究为福建省PCV3的分子流行病学、疫苗研究和有效防控提供实验依据。     

猪圆环病毒2型的流行病学调查

自2002年1月份以来，笔者对安徽、江苏、江西、山东、湖北、上海等地17个集约化养猪场，进行了猪圆环病毒2型（PCV-2）感染的流行病学调查。此次调查，我们运用PCR方法，调查范围主要为断奶仔猪多系统衰竭综合症疑似发病猪场及正常猪群不同年龄阶段的猪。结果疑似猪群中，PCV-2检出率为60.6％（43／71），屠宰猪群的阳性率仅为6.7％（1／30），而初生仔猪（2-3日龄）的阳性率亦可达42.9％（15／35）。表明我国猪群中普遍存在PCV-2的感染。     

猪圆环病毒3型全基因克隆及遗传演化分析

辽宁地区某猪场发现疑似断奶仔猪多系统综合征(PMWS),经临床症状、病理变化和PCR检测,确诊为猪圆环病毒3型(PCV3)感染;根据Gen Bank中收录的PCV3基因序列,设计2对特异性引物,从患有PMWS的仔猪内脏组织中扩增PCV3全基因序列,克隆到p MD18-T载体中,经测序、拼接获得PCV3全长c DNA序列,利用DNAStar和DNAman生物软件对全基因组进行遗传变异分析。结果显示:PCV3毒株基因组全长2 000 bp,命名为CN/Liaoning-2017 (简称LN株)(GenBank登录号:MH177453. 1),基因组有3个开放阅读框(ORF),其中2个ORF编码的蛋白与圆环病毒的复制相关蛋白(Rep)和衣壳蛋白(Cap)同源。Cap基因大小为645 bp,编码214个氨基酸。PCV3国内株可分为3大分支(3a簇、3b簇与3c簇),LN株处于3a簇分支中,与湖北株(KY354039. 1)同源性最高,达到99. 7%; LN株与PCV3a簇代表株(PCV3-USMN2016,PCV3-US-MO2015)同源性在98. 8%～99. 2%之间,与PCV3b簇代表株(PCV3-US-SD2016)的同源性为98. 8%,与PCV3c簇代表株(PCV3-China-GD-2016)同源性为98. 7%。Cap蛋白氨基酸位点分析显示,LN株在第68位发生突变,与其他代表株都不相同。以上试验结果表明,成功从患有PMWS的仔猪体内克隆了PCV3全基因,并完成了序列分析。LN株是辽宁省首次发现的PCV3毒株,这些数据将为研究PCV3的遗传变异和流行病学特征提供分子生物学依据。     

我国部分猪场猪圆环病毒3型流行病学调查

猪圆环病毒3型(Porcine circovirus 3,PCV-3)是近2年从猪体内新检测到的病原。为了解我国猪群的PCV-3感染现状、临床症状和病变特征,在分析流行病学资料基础上,运用荧光PCR技术,对部分猪场采集的80份病料进行PCV-3检测。结果表明,我国至少已有山东、河南、福建、广西等4省份的猪群存在PCV-3感染;发病样品中的PCV-3个体感染率为27.50%,表明我国部分猪群中PCV-3感染较普遍;腹泻样品的感染率最高,为34.09%,而呼吸道症状、流产和高热样品的感染率分别为27.27%、22.22%和14.29%,提示腹泻可能与PCV-3感染的相关性最强,而腹泻样品可能是检测PCV-3的较佳采样器官;不同生长阶段仔猪的感染率不同,保育仔猪感染率最高(40.00%),其次是流产胎儿(20.00%),哺乳仔猪最低(12.50%)。这些结果为PCV-3的采样、监测和防控提供了依据。     

福建省新发猪圆环病毒3型分子流行病学调查及其Cap基因分子特征

为了解2015―2017年福建省新发猪圆环病毒3型(PCV3)的流行现状、分子生物学特征和遗传演化规律,收集福建省不同地区186个猪场的267份疑似PCV3感染猪的组织病料进行分子流行病学调查,并对其Cap基因进行了遗传变异分析。结果显示,福建地区PCV3猪场总阳性率为30.11%,疑似样品总阳性率为21.72%,且呈逐年增高的趋势;17株PCV3福建分离株与其他17株国内外参考毒株Cap基因核苷酸序列及氨基酸序列同源性较高,分别为96.0%～100.0%和96.3%～100.0%,表明这些毒株可能有相同的进化来源;氨基酸多序列比对发现,Cap基因氨基酸序列最有特征性的是第168位(R→K)和173位(L→F)的氨基酸替换,该位点的突变可能是该地区流行的PCV3毒株的一个重要分子特征;同时,抗原性分析发现第173位(L→F)的突变还位于Cap蛋白的抗原表位区内。遗传进化树分析结果表明,17株PCV3福建分离株中有2株属于3a亚型,其余15株属于3b亚型,表明当前福建地区PCV3流行毒株主要为3b亚型。     

湖南省猪圆环病毒2型流行病学调查

为进一步摸清湖南省猪群中猪圆环病毒2型（PCV2）的感染情况和危害程度,控制该病在湖南省的流行,应用ELISA方法对湖南省8个地区的526份血样进行PCV2抗体检测,结果抗体阳性率为57.41%。其中母猪抗体阳性率为72.4%,公猪抗体阳性率为51.92%,育肥猪抗体阳性率为61.46%,仔猪抗体阳性率为47.34%。可见,PCV2在湖南省猪群已经普遍存在,应引起注意。     

猪圆环病毒3型PCR检测方法的建立及其分子流行病学调查

为了了解我国猪圆环病毒3型的流行现状,本研究建立了一种简单、特异、灵敏的PCR检测方法,同时利用该方法对我国14个省市的病猪样品进行检测。结果显示,我国PCV3个体阳性率在23.2%,猪场阳性率为36.5%。通过对6份PCV3阳性病料的Cap蛋白基因序列进行测序,经比较分析,6份Cap蛋白基因序列之间的同源性为98.6%～100%,与国内序列同源性为97.3%～99.3%,与泰国序列为97.6%～98.3%,与韩国序列为97.5%～99.3%,与巴西序列为97.6%～99.2%,与意大利序列为98.6%～99.3%,与美国序列为97.3%～98.1%,与瑞典序列为97.8%～98.5%;遗传进化树显示,2018年所检出的PCV3 Cap蛋白基因序列与2016-2017年间检出的序列相比处在不同的分支上,由此可以推测,PCV3 Cap序列随着时间的推移,部分碱基发生了突变。本研究为预防和控制PCV3的流行和传播奠定了理论基础。     

猪圆环病毒2型、3型流行病学调查及防控措施

猪圆环病毒(PCV)为圆环病毒科圆环病毒属成员是目前已知最小的哺乳动物病毒.目前已确认PCV有4种基因型PCV1、PCV2、PCV3、PCV4.PCV1不能引起猪发病,PCV2不仅可引起断奶仔猪多系统衰竭综合征,且还与猪皮炎与肾病综合征(PDNS)、猪先天性震颤、母猪繁殖障碍、猪增生性和坏死性肺炎等疾病密切相关.通过流...     

海南猪圆环病毒2型的流行病学调查

猪断奶后多系统衰竭综合征（postweaing multisystemic wasting syndrome,PMWS）主要是由猪圆环病毒2型（porcine circovirus-2,PCV2）感染引起的一种病毒病,PCV2主要侵害机体的免疫系统,导致感染猪免疫抑制,降低对其他病原体的抵抗力,从而有利于其他病毒和细菌的继发感染,使死亡率明显升高,给养殖业造成巨大的经济损失。本次调查范围主要是本省8个市县和海口地区2个规模化养猪场,采用PCV2的血清学和临床症状进行调查,报告如下。     

猪圆环病毒2型流行病学调查及免疫防控

本试验于2012年下半年至2013年底对嘉定区4个乡镇的规模养猪场进行猪圆环病毒2型流行病学调查,结果4个乡镇养猪场全部检出猪圆环病毒2型感染个体,对4个乡镇养猪场采取紧急免疫、计划普免、扑杀淘汰等防控措施后,免疫抗体阳性率有了显著提高,基本控制了PCV-2的扩散。     

猪圆环病毒2型的血清流行病学调查

从重庆武隆县猪场及农村散养户采集猪血清286份,用ELISA检测试剂盒对PCV-2抗体进行了检测,结果发现,PCV-2抗体阳性率为79.0%,其中断奶仔猪、育肥猪、经产母猪、种公猪的抗体阳性率分别为76.6%、74.2%、86.2%、82.1%,表明在重庆武隆地区PCV-2感染已普遍存在。     

猪圆环病毒2型感染的流行病学调查

应用ELISA方法对河北省及北京、天津地区部分规模猪场和散养猪群共398份猪血清样品进行猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)抗体检测,结果抗体阳性率为90.9%,血清样品抗体总阳性率为84.2%,其中种母猪抗体阳性率86%,种公猪88.2%,育肥猪85.2%,断奶仔猪76.7%,初步表明PCV2感染在被检地区猪群中普遍存在。对阳性的血清样品中随机抽取14份,用PCR方法进行PCV2 ORF1基因的检测,结果从6份血清中扩增到了特异性目的基因片段,检出率为42.9%,进一步证实了PCV2感染在上述地区规模猪场和散养猪群中存在。