如皋黄鸡42日龄体重母体遗传效应评估

随着遗传模型和计算方法的发展,动物遗传育种研究中可以应用复杂模型分析大数据集,文章应用6种模型分析如皋黄鸡42日龄体重方差组分和遗传力。收集2010-2013年如皋黄鸡生产记录,包括8575只鸡的22 935条体重记录,利用WOMBAT软件以平均信息约束最大似然法(AIREML)分析表型方差组分。应用动物模型时考虑了加性效应、母体遗传效应和环境效应,对不同日龄体重进行了标准化。以AIC值、BIC值以及似然比值选择最优模型。结果表明:如皋黄鸡42日龄体重性状遗传模型应考虑加性遗传效应、母体遗传效应和母体环境效应;如皋黄鸡42日龄遗传力为0.33±0.02,母体遗传效应可以解释8%表型方差,加性遗传与母体遗传呈现负相关。遗传分析结果显示42日龄体重属于中低遗传力性状,因此应用动物模型-BLUP方法估计育种值更有效。     

应用贝叶斯算法评估如皋黄鸡40周龄体重母体遗传、显性遗传效应

文章旨在评估亲本印记及显性遗传效应对如皋黄鸡40周龄体重表型方差的影响。收集2009~2011年如皋黄鸡生产记录,包括3 890只鸡的产蛋高峰期体重记录,以贝叶斯算法分析表型方差组分。应用动物模型时考虑加性遗传、母体遗传以及显性遗传效应,对不同日龄体重进行标准化,以DIC值选择最优模型。结果表明,如皋黄鸡40周龄体重性状遗传模型应考虑加性遗传效应和母体遗传效应;如皋黄鸡40周龄遗传力为0.45,母体遗传效应可解释6%表型方差;如皋黄鸡40周龄体重基本不受显性遗传效应影响。遗传分析结果显示40周龄体重属于中等遗传力性状,可以利用母体遗传效应估计育种值进行专门化选育。     

如皋黄鸡选育群105日龄体重遗传力及近交参数分析

为评估如皋黄鸡选育群个体间亲缘关系远近程度,分析105日龄体重遗传力。收集2011—2014年连续4代如皋黄鸡有称重记录的育成期母鸡资料,整理后得到7 550条个体记录。对非105日龄体重进行校正处理。应用Endog软件计算近交相关参数,包括个体近交系数(Fi)、个体近交速率(ΔFi)、平均亲缘关系(AR)以及每个世代Fi和AR平均值。应用AIREML算法剖分表型方差组分,计算遗传力时考虑了近交、批次以及母本日龄对表型方差的影响,将加性遗传、母体遗传列入随机效应,以AIC值、BIC值选择最优模型。结果表明选育群个体近交系数平均值为0.44%、亲缘关系平均值为1.58%;个体近交系数适合以3阶协变量嵌入遗传模型;如皋黄鸡105日龄体重遗传力为0.45±0.03。如皋黄鸡105日龄体重属于中等遗传力性状;分析体重遗传参数时应考虑个体近交系数。     

如皋黄鸡开产性状加性遗传及母体遗传效应分析

【目的】以动物模型分析加性遗传、母体遗传对如皋黄鸡开产性状的影响,并计算开产性状遗传参数。【方法】收集如皋黄鸡2009—2012年生产数据,包括10 454个动物个体、31 362条生产记录。依据是否考量母体效应,设计4种统计模型。利用WOMBAT软件以平均信息约束最大似然法(AIREML)剖分表型方差,以似然比统计值检验模型适用性。以单性状模型分析遗传力,以多性状模型分析遗传相关系数和表型相关系数。【结果】母体环境对开产日龄有显著的影响,模型II为开产日龄最适模型,开产日龄遗传力为0.28±0.02;母体遗传对平均开产蛋质量影响显著,模型III适合计算开产蛋质量遗传力,开产蛋质量加性遗传力为0.23±0.02、母体遗传力为0.03±0.01;母体遗传和母体环境对开产体质量有显著影响,开产体质量加性遗传力为0.34±0.03、母体遗传力为0.04±0.01,模型IV为开产体质量最适模型。如皋黄鸡开产蛋质量、开产体质量加性遗传与母体遗传存在负相关。开产体质量、开产蛋质量与开产日龄之间的遗传相关系数分别为0.36±0.07、0.33±0.07,开产蛋质量与开产体质量之间的遗传相关系数为0.65±0.05。【结论】如皋黄鸡开产日龄、开产体质量、开产蛋质量等开产性状均受母体效应影响,且遗传力较低。     

基于随机回归模型的如皋黄鸡产蛋数遗传参数分析

【目的】应用随机回归模型分析如皋黄鸡产蛋数的方差组分和遗传参数。【方法】收集2009-2012年如皋黄鸡的生产记录,包括9 298只蛋鸡的46 327条月产蛋记录。应用随机回归模型分析时将Legendre多项式嵌入加性遗传效应、永久环境效应以及固定效应,各产蛋月以不同的残差效应处理。加性遗传与永久环境效应分别以1~4阶Legendre多项式评估,以AIC、BIC以及残差值选择最优模型。利用WOMBAT软件以平均信息约束最大似然法(AIREML)分析表型方差组分。【结果】如皋黄鸡月产蛋数遗传力为0.05~0.32;开产第2月产蛋数遗传力最低,第1~2月的产蛋数遗传力在0.1以下,第3~7月产蛋数遗传力为0.20~0.32;如皋黄鸡第1个月产蛋数与其他月份产蛋数遗传相关系数较低,相邻产蛋月遗传相关系数较高。【结论】如皋黄鸡产蛋数遗传力较低;随机回归模型适用于地方鸡产蛋数遗传参数估算。     

如皋黄鸡

一、品种来源 如皋黄鸡属蛋肉兼用型地方品种鸡．主要分布于江苏省如皋、如东、通州及泰兴、姜堰等地，由江苏省如皋市畜牧兽医站、如皋市万生黄鸡原种场选育而成。2005年通过省级品种审定。     

国家级畜禽遗传资源——如皋黄鸡

1如皋黄鸡的起源如皋黄鸡,俗称＂三黄鸡＂,＂草三黄＂。中心产区以江苏省如皋市为主,分布于毗邻的如东、海安、泰兴、通州等地。产区如皋市位于长江下游北岸,北纬32°～32.3°,东经120.2°～120.5°,滨江临海,地势平坦,属江海冲积平原区,海拔2~6米,气候属北亚热带湿润气候区,气候温和,雨水充沛,     

枯草芽孢杆菌制剂对如皋黄鸡生长性能与屠宰性能的影响

为研究日粮中添加枯草芽孢杆菌制剂对如皋黄鸡生长性能与屠宰性能的影响,选取8日龄公母混合韵如皋黄鸡肉用商品鸩雏鸡160羽,随机分成对照组和试验组,每组80羽.对照组喂给基础日粮,试验组在基础日粮中添加0.05%枯草芽孢杆菌制剂.结果显示:与对照组相比,试验组日增重在第4、5、6周分别提高了32.4%、22.7%和32.8%(P<0.01);试验组料肉比在第4、5、6、7周分别降低了25.7%、23.7%、21.5%和31.7%;试验组半净膛率和腿肌率有显著性差异(P<0.05),比对照组分别提高了3.00%和8.09%,其余测定指标差异均不显著(P>0.05).表明日粮中掭加0.05%枯草芽孢杆菌制剂,能提高如皋黄鸡的生长性能和屠宰性能.     

大黄鱼40日龄体长和体重遗传力估计

应用数量遗传学原理和全同胞组内相关法估计了40日龄大黄鱼的体长和体重遗传力,通过巢式平衡设计和人工授精技术,构建了5个半同胞家系和15个全同胞家系,利用SAS9．0软件的一般线性模型（GLM）计算表型变量的方差组分,估计体长和体重性状的遗传力．结果表明：大黄鱼鱼种阶段体重和体长遗传力分别为0．29和0．31．t检验显示两个性状遗传力的估计值均不显著,且雄性遗传方差组分大于雌性遗传方差组分,说明雄性遗传方差组分存在非加性效应或受环境影响较大．     

新扬州鸡早期体重的遗传力估计

在新扬州鸡随机交配大群中,按家系随机选择不同年份的新扬州鸡2批,采用约束极大似然法对新扬州鸡早期体重遗传力进行估计。结果表明:初生和2、4、6、8周龄5个不同时期体重遗传力中等,遗传力为0.3096～0.5684,达到或接近显著水平(P<0.05);2、4、6及8周龄4个不同时期体重遗传力为0.30～0.44;初生重遗传力较高,接近0.60。     

略阳乌鸡体重和产蛋数性状遗传参数估计

【目的】略阳乌鸡是陕西省特有的家禽品种,该品种具有体型大、肉质好、氨基酸含量丰富、对林地散养适应性强的优点,但也存在生长缓慢,产蛋性能差的不足。为此,在系统测定略阳乌鸡生产性能的基础上,开展对体重和产蛋性状遗传参数的估计,阐明遗传效应对上述性状的调控作用及性状间的遗传关系,期望为这些性状的选育奠定理论基础。【方法】对略阳乌鸡蛋用系一世代71个半同胞家系799只公鸡和804只母鸡6、10、14、20周龄和开产日龄体重进行测定,以个体为单位记录从开产到31、35和40周龄产蛋数,以四分位数〒1.5倍四分位距为界删除异常值,更正性别记录错误。以性别为固定效应,育种值为随机效应用单变量动物模型估计各性状遗传力,用双变量动物模型估计性状间遗传相关,用逆伽玛分布指定育种值和残差项方差先验分布,用贝叶斯算法执行130 000次迭代,弃去前30 000次迭代结果,以100为间隔抽取1 000个估计值获得方差和协方差后验分布,计算各性状遗传力和性状间遗传相关。用R语言PerformanceAnalytics软件包chart.Correlation命令计算性状间表型相关。【结果】略阳乌鸡6、10、14、2...     

青格里绒山羊体尺、体重与产绒量的相关性分析

为探讨青格里绒山羊体尺、体重与产绒量的相关关系,采用SPSS16.0软件对2 090只青格里绒山羊进行体尺指标、体重与产绒量的相关性分析、通径分析和回归分析.建立体尺、体重与产绒量间的回归模型.结果表明,体重（X1）、体高（X2）、体长（X3）、胸围（X4）、管围（X5）、绒长（X6）与产绒量（y）均呈极显著正相关（P＜0.01）.体重、胸围对产绒量的直接作用较大,而体高主要通过间接作用影响产绒量.得到最优回归方程：y=0.267X1＋0.094X3＋0.231X4 ＋0.047X5＋0.089X6.在青格里绒山羊选育工作中,应以体重为主要选育指标,兼顾胸围.     

三河牛初生体尺和初生重遗传参数的估计

【目的】利用2000—2012年出生的5 521头三河牛的初生体尺、初生重记录,估计出生体高、体长、胸围、管围和初生重的遗传参数。【方法】使用DMU软件,采用AI-REML结合EM算法并配合多性状动物模型,以犊牛性别和母亲年龄为固定效应、出生场年月和动物个体加性遗传效应为随机效应。【结果】三河牛初生体高、体长、胸围、管围、初生重的遗传力分别为0.46、0.48、0.38、0.50和0.41,遗传相关为-0.05（管围和体长、初生重）—0.86（体长和初生重）,表型相关为-0.10（体长和管围）—0.70（体长和初生重）。【结论】三河牛初生体尺、初生重的遗传力为0.38—0.50,属于高遗传力。     

南江黄羊体重性状的微卫星标记研究

通过10个微卫星位点,对周岁体重差异较大的南江黄羊极端个体基因组DNA进行扩增检测, 方差分析寻找与体重性状显著相关的微卫星标记。然后,利用该引物对随机群体进行检测,应用线性模 型计算含有相应标记个体体重性状的标记效应和替代效应。结果发现,BM3413位点的186bp和190bp 等位基因、MFA70位点的109bp等位基因、INRA063位点的178bp和184bp等位基因、MB066位点的 110bp等位基因、MB3501位点的176bp等位基因,这些标记基因与南江黄羊周岁体重呈极显著正相关, 相关系数在0．5180-0．7375之间。BM3413位点的182bp等位基因、MFA70位点的115bp等位基因、 MB066位点的98bp等位基因,这些标记与南江黄羊周岁体重呈显著(极显著)的负相关．相关系数在- 0．6539--0．388之间。     

多元统计分析方法在羊体质量与体尺研究中的应用

多元统计分析常用的方法包括回归分析、主成分分析、因子分析、聚类分析、判别分析、相关分析等。全面、综合地分析羊多项体尺及体质量指标所反映的信息,对深入研究育种及生产实践有重要作用。对多元统计分析方法在羊体质量与体尺研究中的应用作出较全面的概述。     

Quantitative and Qualitative Body Traits of Longling Yellow Goats in China

Quantitative, qualitative and phenotypic body measurements were determined on Longling Yellow goats in Longling of Yunnan Province in China. Body weight was determined at birth and then at 3, 6, 9, 12, 18, 24, 36, and 48 mon of age. Body measurements traits including height at wither （HW）, body length （BL）, heart girth （HG）, chest depth （CD）, and circumference of cannon bone （CCB） were determined at 3, 6, 9, 12, 18, 24, 36, and 48 mon of age. Phenotypic traits including coat colour, horns type, tip horn torsion, nose type, hair on forehead, wattles, ear lobes, black back line, hair on legs, and black hair on belly were determined at 12, 18, 24, 36, and 48 mon of age. Males were heavier （P〈0.01 or P〈0.05） than females; and except for chest depth at 24 mon of age （P 〉 0.05）, all other body measurements were also higher （P 〈 0.01 or P 〈 0.05） in males. HW, BL, CD, HG, and BW increased （P 〈 0.01） with age, except for 48 mon of females （P 〉 0.05）; while CCB did not always increase with age. HG had the highest correlation （P〈0.01） with body weights of both sexes. No differences were observed between the two sexes in the colour of the coat, horn type, tip horn torsion, nose type, ear lobes, black back line, and black hair on belly. However, differences exist between the two sexes in the presence of hair on forehead, wattles and long hair on legs. The female goats absence of tip horn torsion had positive effect on all variables measured at 36 and 48 mort of age （P〈0.01 or P〈0.05）. The presence of wattles was associated with heavier body weights from 18 mort （P〈0.01） of age onward, and also with longer HW, BL and CD （P〈0.01 or P〈0.05） in female goats. Female goats with ear lobes had heavier body weights at 12, 36 and 48 mon （P〈0.01） and longer CCB at 12 and 24 mon of ages （P〈0.05）. Hair on legs and black hair on belly only had partly effect body measurements on 12 mon of Longling Yellow female goats. Results of this study provide valuable information that will assist breeders and genetic improvement specialists when conducting selection and preservation programs in Longling Yellow goats in China.