王宁教授主持的国家自然基金面上项目通过验收

王宁教授主持的国家自然基金面上项目《鸡脂肪细胞分化负调控转录因子的高通量分离与功能验证》,主要内容是无菌采取10日龄肉仔鸡腹部脂肪组织,胶原酶消化法培养鸡前脂肪细胞,油酸诱导分化。采用高通量基因表达谱芯片技术检测鸡前脂肪细胞向成熟脂肪细胞分化过程中基因表达谱的变化,并利用生物信息学分析检测结果,从而分离筛选出鸡脂肪细胞分化的负调控转录因子,最后应用基因过表达（Gene overexpression）和RNA干扰技术（RNA interference）对分离筛选的鸡脂肪细胞分化的负调控转录因子进行功能验证。     

RAD测序法用于鸡双向选择家系群体遗传差异分析

SNPs遗传标记已成为群体遗传学和数量遗传学研究重要工具。RAD测序法是基于新一代高通量测序技术进行SNPs开发最为有效、经济的方法之一。研究以针对脂肪性状进行双向选择的髙脂-低脂鸡家系和针对体重性状进行双向选择的高体重鸡-低体重鸡家系为对象,利用RAD测序法进行简化基因组测序及群体遗传差异分析。测序和分析结果显示,实验共获得57.88 M reads,平均每个个体检测到98 671个SNPs。群体pairwise Fst结果发现,在高脂-低脂鸡双向选择家系中,许多位点存在差异性,其中部分位点与前人研究结果相一致。在高脂-低脂双向选择家系中,例如5号染色体上的NOVA1区域呈现显著差异,表明该区域可能与鸡脂类代谢和腹脂沉积有重要关联;在高体重-低体重鸡双向选择家系中,存在一些群体差异缺失标签,例如高体重鸡的13号染色体上SH3RF2除第一个外显子以外区域基因信息的缺失,导致鸡体重显著增加,推测这种结构缺失变异可能与高强度人工选择有关。研究表明,RAD测序法不仅能够快速、准确地获得高通量SNPs遗传标记,而且具有较高分辨率,能够适用于诸如双向选择家系这种存在微小遗传差异群体间的遗传检测和分析。     

鸡长链非编码RNA发掘及组织特异性表达分析

长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lnc RNA)是一类长度大于200个核苷酸、缺少蛋白编码功能的RNA。lnc RNA可从多层面调控基因表达,影响表型性状。鸡作为重要经济动物和模式生物,lnc RNA研究相对滞后。为加快鸡lnc RNA研究进展,利用公共数据库(如NCBI-SRA等)中鸡高通量转录组测序(RNA-seq)数据,通过生物信息学方法发掘8 040条鸡lnc RNA,发现大量组织特异性表达lnc RNA,为鸡lnc RNA功能研究奠定基础。     

鸡miR-181a组织的表达谱及其转录调控区域

【目的】分析鸡miR-181a的转录起始位点,并分析其在1日龄和成年鸡不同组织中的表达谱,以期为研究miR-181a的功能奠定基础。【方法】采用qPCR技术构建miR-181a 在1日龄和成年鸡肝脏、脾脏、肺、小肠、大脑、小脑、下丘脑、脑干、胸腺、心脏和肾脏组织中的表达谱。用version(1.83)分析miR-181a的保守性,并采用ENCODE数据库进行miR-181a转录起始位点和启动子区域的分析。【结果】①采用qPCR检测miR-181a在鸡下丘脑中的表达量和高通量测序的结果一致,1日龄下丘脑中的表达量显著低于成年鸡的表达量（P＜0.05）;②miR-181a 在11个组织中均有表达,且在1日龄和成年鸡脾脏、肺、小肠、大脑、小脑、下丘脑、脑干、胸腺、心脏和肾脏组织的表达量差异显著（P＜0.05）,而在肝脏中表达量的差异不显著（P＞0.05）;③miR-181a的前体miR-181a-1上游区域有一个启动子区和一个潜在的转录起始位点;④miR-181a-1的转录调控区域内存在的多个转录因子,转录因子主要有NFKB,c-Fos等。【结论】鸡miR-181a的表达有组织和时序差异,其成熟序列在脊椎动物中十分保守,上游有一个转录起始位点及启动子区。     

鸡原始生殖细胞中lncRNA-CEPT8编码小肽能力的研究

为探究lncRNA在鸡生殖细胞中的调控作用,以如皋黄鸡受精蛋为试验材料,基于高通量测序筛选结果,利用RACE技术获取lncRNA-CEPT8序列全长,通过荧光定量检测和核质分离试验确定lncRNA-CEPT8的富集位置,并进行ORF开放阅读框预测及构建原核融合表达载体,提取蛋白质后利用Western blot技术检测lncRNA-CEPT8编码的小肽。结果表明:lncRNA-CEPT8全长为1 248 bp,在鸡原始生殖细胞质中富集,具有大小为246 bp且编码81个氨基酸的ORF, Western blot检测结果表明lncRNA-CEPT8编码一条大小约为9 ku的小肽。这一研究为进一步探究lncRNA-CEPT8编码的小肽在鸡原始生殖细胞中的调控作用及其对生殖细胞的影响奠定了基础。     

柔嫩艾美耳球虫感染对鸡盲肠菌群的影响

将60只健康罗曼粉鸡随机分为正常组和模型组,每组30只,模型组灌服1×104个孢子化卵囊进行人工复制鸡球虫病模型,正常组灌服等体积生理盐水,感染5 d,剖杀试验鸡,无菌采集鸡盲肠内容物,并通过Illumina PE250型高通量测序仪对肉鸡盲肠内菌群进行16SrDNA基因V3～V4可变区检测,对肠道菌群可操作分类单元(OTUs)数、α多样性、β多样性及差异菌门与菌属进行综合性分析与评价,探究柔嫩艾美耳球虫感染对鸡盲肠菌群结构和多样性的影响。结果表明：与正常组相比,感染柔嫩艾美耳球虫后鸡肠道菌群的OTUs数、Chao1指数极显著降低,Shannon指数显著降低,Simpson指数显著升高;门水平上,模型组变形菌门的相对丰度极显著升高,而厚壁菌门的相对丰度显著降低,拟杆菌门和柔膜菌门的相对丰度显著降低;属水平上,正常组的优势菌属为拟杆菌属、瘤胃菌属–UCG014、副拟杆菌属,而模型组瘤胃球菌属–uncultured、球藻菌属、埃希菌–志贺菌属相对丰度极显著升高。可见,艾美耳球虫破坏了盲肠菌群的完整性,促进潜在致病菌的建立和生长,尤其使埃希菌–志贺菌属大量繁殖,快速生长。     

枯草芽孢杆菌对SPF鸡肠道菌群的影响

研究选用枯草芽孢杆菌作为益生菌,将其添加在基础日粮中,来评估其对10日龄SPF鸡肠道菌群的影响。将SPF鸡24只随机分为两组:枯草芽孢杆菌处理组(A组)和正常对照组(B组),连续饲喂7 d,收集各组盲肠内容物,采用高通量测序技术对各组SPF鸡盲肠内容物菌群进行分析。结果表明,A组盲肠内容菌群物种多样性高于B组,A组盲肠内容物菌群中有益菌所占的比例(8%)高于B组(2%),试验表明,枯草芽孢杆菌能够通过调节肠道菌群,增加肠道微生物的多样性,抑制有害菌的生长,促进有益菌的生长。     

高通量技术在微生物培养中的应用进展及分子测序对比分析

高通量技术是以微型生物反应器为操作平台,实现对生物细胞的分离培养和分子测序。通过着重分析几种实用型高通量技术在微生物分离培养及分子测序中的应用进展,发现微包埋技术在高通量试验中的研究及应用较为深入;而对不同环境菌样的分离培养中,海洋微生物方面的应用最为突出。另外,通过对比高通量分子测序技术可以发现,Illumina测序法的平均测序速度最快;单分子测序法所得数据的精确度最高,测序读长最长,周期相对最短。最后,对高通量技术在微生物学应用中的一些不足进行总结,并提出假设性解决方法。     

育成期高能饲喂下开产与未开产蛋鸡肝脏转录组差异分析

对育成期高能饲喂的开产与未开产蛋鸡进行肝脏转录表达谱差异分析,探明在高能饮食状态下肝脏中影响开产的基因,为提高产蛋打下基础.以高能饲粮饲喂育成期蛋鸡为对象,运用高通量测序平台对开产与未开产鸡的肝脏进行转录组测序,使用HTSeq和DESeq等方法分析基因表达量并运用qRT-PCR验证,并以超几何分布对差异表达基因进行GO...     

贵州兴义矮脚鸡与矮脚黄鸡早期生长及屠宰性能的比较

试验对贵州兴义矮脚鸡与矮脚黄鸡的早期生长发育规律及屠宰性能进行了比较研究.结果表明兴义矮脚鸡初生及2周龄时体重显著低于矮脚黄鸡(p<0.05),而在10～12周龄后显著高于矮脚黄鸡(p<0.05);胫长在初生到2周龄时极显著低于矮脚黄鸡(p<0.01),在10、12周龄时极显著高于矮脚黄鸡(p<0.01),12周龄胫长分别为6.51 cm和5.79 cm.兴义矮脚鸡的屠宰率显著高于矮脚黄鸡(p<0.05),但它的胸肌率极显著低于矮脚黄鸡(p<0.01),表明兴义矮脚鸡产肉性能不及矮脚黄鸡.兴义矮脚鸡和矮脚黄鸡0～12周龄全期的料肉比分别为3.34与3.71,表明前者具有较高的饲料报酬,值得进一步开发和利用.     

鸡白痢沙门氏菌感染对雏鸡脾脏miRNA表达谱的影响

【目的】鉴定感染鸡白痢沙门氏菌后雏鸡脾脏差异表达的miRNA，为阐明miRNA在鸡白痢沙门氏菌感染中的调控机制提供理论基础。【方法】采集感染和未感染鸡白痢沙门氏菌的SPF雏鸡脾脏，提取脾脏RNA，构建6个miRNA文库；利用Illumina Hiseq 2500测序技术和生物信息学分析筛选差异表达miRNA，通过TargetScan和miRanda算法预测差异表达miRNA的靶基因，并进行GO功能富集和KEGG通路富集分析，最后利用RT-qPCR方法验证测序结果。【结果】鉴定到29个差异表达miRNAs，其中15个显著上调、14个显著下调。GO分析表明：脂多糖介导的信号通路正调控以及NIK/NF-κB介导的信号通路负调控等免疫相关生物学过程显著富集；KEGG分析显示：差异表达的miRNA主要参与溶酶体和内吞作用等免疫相关通路。高通量测序结果与RT-qPCR结果一致。【结论】成功鉴定到鸡白痢沙门氏菌感染雏鸡脾脏miRNA表达谱，获得29个鸡白痢沙门氏菌感染潜在相关miRNAs。     

我国主要地方鸡品种性能测定与聚类分析

在同一饲养与实验条件下,对我国12个主要地方鸡品种进行了系统种质测定;并根据表型标记进行地方鸡种间的亲缘关系聚类分析。12个地方鸡品种分为4个类群：油鸡、斗鸡、固始鸡、藏鸡、大骨鸡和白耳鸡一类;仙居鸡、乌骨鸡和茶花鸡集成第2个类群;萧山鸡和鹿苑鸡集成第3个类群;狼山鸡自成一类。     

云南鸡[土从]菌属系统关系的初步研究

分子系统学研究表明云南分布的鸡,以菌为一个自然单系群,臧穆命名的华鸡[土从]菌属真菌与鸡[土从]菌属其他真菌有较密切的亲缘关系;根据ITS序列建立的亲缘关系可以将云南产鸡[土从]菌属真菌划分为以下6个分支：（1）海姆鸡[土从]菌、乳头盖鸡[土从]菌和空柄鸡[土从]菌;（2）黑根鸡[土从]菌;（3）烟灰鸡[土从]菌、云南鸡[土从]菌和真根鸡拟菌;（4）条纹鸡[土从]菌、灰褐条纹鸡[土从]菌和炭黑条纹鸡[土从]菌;（5）小果鸡[土从]菌;（6）端圆鸡[土从]菌．     

优质肉鸡肌肉品质的组织学特性研究

采用冰冻切片法,借助TIGER细胞图像分析仪对南海麻黄鸡、江西鸡、黄鸡M系、黄鸡N系、黄鸡K系的胸部肌肉的肌纤维直径和肌纤维密度进行了测定。结果表明:①肌纤维直径由小到大依次为江西鸡(30.1±3.1μm)、南海麻黄鸡(35.3±7.8μm)、黄鸡N系(36.7±1.9μm)、黄鸡K系(37.2±0.7μm)、黄鸡M系(38.1±3.1μm),江西鸡与黄鸡N系、K系之间的差异均达到极显著水平(P<0.01)。②肌纤维密度(根/mm2)由小到大依次为黄鸡K系(424.5±39.3)、M系(465.5±91.9)、N系(471.5±63.0)、南海麻黄鸡(568.1±59.7)和江西鸡(655.5±182.6)。③优质肉鸡的肌纤维直径和密度与肌肉品质之间有密切关系。     

鸡法氏囊病免疫程序的改进

<正> 近年来,鸡法氏囊病的预防工作提到了重要地位,很多养殖专业户和养鸡场按鸡法氏囊病的免疫程序(14日龄,鸡法氏囊病中等毒力疫苗每只鸡1羽份饮水;24日龄,鸡法氏囊病中等毒力疫苗每只鸡2羽份饮水;40日龄,鸡法氏囊病中等毒力疫苗每只鸡2     

浅谈鸡沙门氏菌病的综合防治

<正>鸡沙门氏菌病是由沙门氏杆菌引起的一类常见多发病的总称,包括鸡白痢、鸡副伤寒、鸡伤寒等病,严重危害鸡只的健康,常常给养鸡场造成严重经济损失,由于可以垂直传播,因此,发病率极高。由鸡白痢沙门氏杆菌引起的称为鸡白痢,由鸡伤寒沙门氏杆菌引起的称为鸡伤寒,由有鞭毛能运动的沙门氏杆菌引起的禽类疾病统称为禽副伤寒。沙门氏杆菌病广泛存在于自然界中,对养鸡业危害较大。一、流行特点1、鸡白痢各品种、各年龄的鸡均可感染,3周龄以内的雏鸡发病严重,死亡率极高,成年鸡为慢性,严重影响产蛋;可垂直传播,几乎无法彻底消除。2、鸡伤寒     

新扬州鸡与莱航鸡遗传变异的RAPD分析

应用 2 1个 1 0碱基寡聚核苷酸随机引物对新扬州鸡、莱航鸡进行 RAPD扩增。结果表明 :1 3个随机引物有扩增条带 ;平均条带共享率 ,新扬州鸡公鸡与母鸡差异不显著 (P>0 .0 5) ,母鸡群与莱航鸡差异显著 (P<0 .0 5) ;遗传多样性指数 ,新扬州鸡公鸡与母鸡无显著差异 (P>0 .0 5) ,而新扬州鸡公、母鸡与莱航鸡存在显著和极显著差异。新扬州鸡遗传变异大于莱航鸡 ,说明新扬州鸡仍有选择余地     

鸡呼吸道疾病的鉴别和防治

<正>一、常见鸡呼吸道疾病的辨别我市有许多养鸡户,因而熟悉掌握流行的鸡呼吸道疾病是十分必要的。常见的鸡呼吸道疾病通常有鸡传染性支气管炎、鸡慢性呼吸道病、鸡传染性鼻炎、曲霉菌病、黏膜型鸡痘、鸡传染性喉气管炎。1.鸡传染性鼻炎该种疾病主要是由鸡嗜血杆菌的细菌引起的常见的鸡呼吸道疾病,而且其发病与鸡的年龄是无关的,不论是何年龄都有可能,其中成鸡、产蛋鸡患该病可能性较大。鸡传染性鼻炎的传播速度快,可能会在短时间内涉及全群。所以需要对其进行极度重视。     

鸡沙门氏菌病流行概况及防治

<正> 80年代中期以前,鸡沙门氏菌病在我国曾得到了较好地控制,但近年来危害比较严重,成为困扰我国养鸡业的主要疾病之一。 鸡沙门氏菌病是由沙门氏菌属的某些致病性沙门氏菌引起的鸡的细菌性传染病,一般分鸡白痢、鸡伤寒、副伤寒三种病型,各种年龄的鸡均易感。其中鸡白痢和副伤寒雏鸡多发,成年鸡带菌;而鸡伤寒成年鸡多发。从发病情况和危害性     

发挥品牌资源优势 做强武定鸡产业

介绍了武定鸡的饲养方式、年出栏量、产值及获得的各种殊荣,分析了存在的问题,提出发展对策：切实加强武定鸡产业建设的领导;建立健全武定鸡标准化生产体系;加强武定鸡种质资源保护和开发;发展规模养殖,辐射带动家庭饲养;提升品牌,规范市场行为;抓好技术支撑体系建设;建立健全人才保障机制;加大政策支持和财务投入;大力发展武定鸡加工业;建立健全激励机制.