白条天牛DNA条形码鉴定技术

白条天牛属(鞘翅目:天牛科)昆虫是口岸植物检疫工作中多次截获的类群,为探讨线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(mt DNA COI)基因的特定区段作为DNA条形码鉴定白条天牛种类的可行性,尝试应用该技术对国内外13种白条天牛进行分子鉴定,测定各种类mt DNA COI基因序列(其中10种检疫性白条天牛COI基因序列为国内外首次测序)并进行比对,采用MEGA 5.05构建系统进化树。结果表明:基于mt DNA COI基因的DNA条形码技术可实现对白条天牛种类快速、准确的鉴定。     

DNA条形码技术及其在野生动物保护中的应用

DNA条形码技术可以快速准确的进行物种鉴定,能够为野生动物的物种保护提供技术支撑.为此,对DNA条形码技术的原理、研究进展、优势与局限性,以及在野生动物保护中的应用前景进行了概述.     

植物DNA条形码研究进展

DNA条形码技术是利用标准的、具有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段在物种内的特异性和种间的多样性而创建的一种新的生物身份识别系统,从而实现对物种的快速自动鉴定。本文从植物DNA条形码的开发、应用、国内研究现状、植物DNA条形码面临的挑战以及发展前景等进行了综合分析,以期推动我国植物DNA条形码和分类学研究的发展。     

木材DNA条形码鉴定研究进展

木材种属鉴定具备显著的生物学与经济意义, 但传统的以显微特征观察为主的方法已不能适应高通量和精细化鉴别的需要。DNA条形码是根据特定基因片段的序列差异, 利用生物信息学技术对生物物种进行快速分类与鉴别的方法。近年来, DNA条形码技术已被陆续应用于木本植物及相应木材的种质鉴定, 在目标基因选择、木材DNA提取及生物信息学分析等方面均取得显著进展。在使用优化的微量DNA提取技术的前提下, 干燥木材中也可提取出满足扩增要求的DNA。经过生命条形码联盟等国际机构的长期努力, 确定了rbcL+ matK组合等通用植物条形码标记及ITS2等补充标记, 并建立了BOLD等数据库系统。传统的条形码序列分析主要通过BLAST比对、遗传距离分析及系统进化分析来实现, 近年来随着生物信息学的发展, DNA条码数据库不断完善, 新的数据分析方法和软件正不断涌现。文中在总结现有研究成果和实施规范的基础上, 综述国内外应用DNA条形码技术进行木材鉴别的新进展, 并着重阐述新型序列分析方法和相应的生物信息学工具。     

DNA技术在木材来源鉴定中的应用

DNA技术在木材树种鉴别和产地鉴定方面有较高的准确性,可用于提高木材合法性检验的可信度和木制品产销链跟踪,具有国际通用性和可行性.然而由于DNA技术特点和木材特性,其实际应用尚有一定难度.未来还需加大投资和研发力度,尽快建立公共数据库,发挥其在合法木材贸易中的重要作用.     

DNA条形码技术在林业科学研究中的应用

DNA条形码是利用生物体内普遍存在的一个或几个、较短的且标准化的基因片段作为通用片段,通过碱基序列差异来实现物种水平准确鉴定的工具。相对于传统的分类学,DNA条形码技术具有不依赖形态特征和发育阶段、鉴定数字化、快速准确、操作简单规范等优势。已成功应用在生物多样性监控、海关、中药材真伪鉴定、法医鉴定、动植物检疫、生物入侵、食品和药物市场监督等诸多领域。经过15年时间发展,DNA条形码研究已基本确定针对不同生物类群使用不同的通用片段,同时构建了标准的全球生命条形码数字化数据库。目前DNA条形码研究主要集中在如何提高近缘类群物种分辨率和构建区域条形码数据库两个方向。在林业科学研究中,DNA条形码在木材识别、森林群落生态和生物多样性监控与评估等领域发展迅猛,但同时也面临一些问题,如木材DNA降解、整条片段的扩增等,需要在条形码片段选择、数据库构建、数据库与高通量测序技术结合、分析方法改进等进一步深入研究。未来DNA条形码将在林业资源评价、保护和可持续利用等方向具有广阔的应用前景。     

降香黄檀木材DNA提取及rDNA-ITS序列条形码分子鉴定

以不同产地人工林中采取的降香黄檀(Dalbergia odorifera T.Chen)木材为研究对象,提取并扩增不同温度处理后的降香黄檀心、边材DNA和ITS片段,分析不同温度处理对降香黄檀木材DNA提取和PCR扩增的影响;对不同产地的降香黄檀木材及其近缘种多裂黄檀(Dalbergia rimosa Roxb)木材的rDNA-ITS序列进行测定和差异分析。结果表明,25℃和65℃热处理后的木材DNA呈不同程度的弥散分布,105℃热处理后的木材DNA降解成250bp以下的小片段;不同温度处理后的降香黄檀木材,仅有25℃处理后的木材ITS片段能够被成功地扩增。降香黄檀和多裂黄檀ITS序列共存在6个变异位点且ITS2区变异大于ITS1区,聚类分析结果可以将降香黄檀及其近缘种多裂黄檀木材区分开来,为利用ITS条形码序列鉴定降香黄檀木材及其常见混伪品提供理论依据。     

竹类植物DNA分子标记研究的现状与问题点

DNA分子标记在竹类植物的分类、系统演化、遗传多样性研究等方面都有广泛的应用。综述了几种常用的DNA分子标记技术在这些方面的研究进展,提出其存在的问题,并展望了其在竹类植物研究上的应用前景。     

中国竹类物种的多样性

全世界约有竹类植物1 500多种。中国是世界上竹类物种多样性最丰富的国家。截止目前,中国实际按照《国际植物命名法规》（ICBN）公开发表的竹类植物有44属、762种,约占世界竹类种数的50%以上。这其中不包括55变种、147变型、5个杂交竹,计207个种下分类群以及竹类栽培品种和许多存疑竹类。文章详细列出了中国已公开发表的762种竹类植物名称,显示了中国竹类物种的多样性。     

条形码技术在森林资源管理工作中的应用

在目前伐区调查设计过程中，虽采取全林每木调查的方法，但对采伐木的标记方法仍沿用原始砍刀标记法、油漆画号或号锤打号标记法。这种方法既陈旧落后，又很容易被人为破坏或仿造，致使森林采伐量得不到有效地控制。而条形码技术是对采伐树木(甚至对整个样园内径级6cm以上树木)     

竹类分子系统学中的DNA标记

竹类极少开花,根据外部形态特征进行系统分类存在争议.自20世纪80年代末,DNA分子标记技术首次用于竹类研究以来,先后发展了RFLP、RAPD、ITS等分子标记技术,其准确性和稳定性不断提高,有效解决了竹类研究中存在的许多有争议的问题.特别是在竹类遗传多样性和系统分类的研究中,分子标记技术结合形态学研究开拓了竹类研究新的发展空间.简述了RFLP、RAPD、ITS、SSR、EST、AFLP、SCAR等分子标记技术在竹类研究中的应用,结合竹类分子系统学的发展,为以后深入研究提供参考.     

穿山甲的走私贸易概况、物种鉴定与形态比较

简要介绍世界上穿山甲的资源种类、资源价值、利用和贸易走私概况以及濒危原因、国内外研究现状。重点对现存的7种穿山甲的形态特征做一个系统详细的描述和比较,以此来科学有效地鉴定和区分不同种类的穿山甲,为打击穿山甲的走私贸易犯罪提供科学、正确、快速和有效的司法鉴定依据。     

DNA条形码技术及其在动物物证鉴定中的应用

正野生动植物是地球自然资源的重要组成部分,具有很高的生态意义,并包括了科学、文化、经济在内的多方面价值。然而,随着人类文明的不断发展和社会的进步,野生动物的栖息地已经并仍在被人类不断侵蚀,加之动植物资源过度消耗,全球动植物资源总量下降较快。由于高额利益驱使,近年来,非法野生动植物及其制品贸易犯罪链条已相当完备,犯罪手法不断变换,     

舞毒蛾标本DNA提取和COI基因扩增

[目的]探讨适合舞毒蛾标本的保存和DNA提取方法,分析舞毒蛾标本的保存时间和保存方式对基因序列扩增的影响。[方法]利用SDS法、磁珠法以及E.Z.N.A.^TM昆虫DNA提取试剂盒3种方法对舞毒蛾新鲜样本、干燥成虫标本和福尔马幼虫林标本进行DNA提取,并对3种方法提取DNA的浓度和纯度进行分析比较。利用1956年至1996年收集的舞毒蛾干燥成虫标本和福尔马林幼虫标本分析并比较保存时间和保存方式对15对COI基因(cytochrome oxidase subunit I)引物(目的片段长度为216 bp～977 bp)扩增成功率的影响。[结果]表明与SDS法和磁珠法相比,E.Z.N.A.^TM昆虫DNA提取试剂盒对舞毒蛾3种标本的DNA提取效果最好,提取过程中未对标本DNA产生额外损伤。标本保存时间越久扩增长序列目的片段的成功率越低,福尔马林幼虫标本总体扩增成功率比干燥成虫标本的略高。[结论]E.Z.N.A.^TM昆虫DNA提取试剂盒更适合舞毒蛾新鲜样本、干燥成虫标本和福尔马林幼虫标本的DNA提取。舞毒蛾标本的保存时间和保存方式...     

将乐林场栲类次生林物种组成与多样性研究

选用福建将乐林场的栲类次生林固定样地调查数据,研究栲类次生林的树种组成和物种多样性特征,为以后的栲类次生林的研究提供一定的参考依据。采用物种丰富度、香农威娜指数、辛普森多样性指数、优势度和均匀度作为多样性测度指标分析各样地乔木层、灌木层和草本层物种多样性,根据各样地乔木层物种多样性指数进行聚类分析,划分样地类型。(1)物种组成丰富,乔木层树种76种,灌木层树种77种,草本物种22种。(2)各样地的乔木层、灌木层和草本层多样性指数差异都比较大;而各样地均匀度和优势度指数差异不是很大,物种分布相对比较均匀;(3)香浓威纳指数、多样性指数、丰富度指数、均匀度的数值大小排序为:乔木层>灌木层>草本层,优势度指数的大小排序则相反。(4)经分析可将栲树次生林可以划分成三个类型,其中类型Ⅰ包括样地1、2和样地11;类型Ⅱ包括样地5、6、10、12、13和样地14;类型Ⅲ包括样地9、17和样地18。香浓威纳指数、多样性指数、丰富度指数、均匀度的数值大小排序为类型Ⅲ>类型Ⅱ>类型Ⅰ,优势度指数数值排序则相反。该区栲类次生林物种组成丰富,各样地各层次物种多样性存在较大差异,而相同类型的样地具有相似的物种多样性,说明其干扰程度相似。     

基于线粒体COI基因鉴定大小蠹属昆虫

以口岸经常截获的红脂大小蠹、黄杉大小蠹、山松大小蠹、间大小蠹、红翅大小蠹和落叶松大小蠹等6种大小蠹属昆虫为样本,根据其昆虫检索表制作了近缘关系树;利用分子手段对其线粒体COI基因进行扩增,分析同源序列的多样性、遗传距离和系统进化关系,并将近缘关系树和分子进化树进行比较,研究利用分子手段对大小蠹属昆虫进行快速鉴定的可行性和准确性。结果表明:同种的大小蠹碱基差异较小,而不同种间的碱基差异较大,能明显区分出不同种;大小蠹属的遗传距离和邻接法系统进化树也证实,分子鉴定结果和检索表分类的结果一致。可利用分子鉴定的方法对不同种的大小蠹属昆虫进行快速准确的鉴定。     

河北黑龙山蛾类物种多样性及主要种类发生态势

该文于2015年5月至9月在河北黑龙山国家森林公园选取多个样地,采用灯光诱集的方法对其蛾类的物种多样性进行了调查。经鉴定共计21科255属364种;其中夜蛾科物种多样性最高,为135种,占总物种数的37.09%;20种以上的科6个(占总种数80.22%),10种及以上的科9个(占90.12%),5种以上的科12个(占95.88%),其余9科共有15种,占4.12%。表明该森林公园的蛾类物种多样性总体较高。采用ɑ-多样性测度方法分别对该森林公园蛾类的物种丰富度(S)、多样性指数(H)、均匀度指数(J)和优势度指数(D)进行了分析,发现物种丰富度和多样性指数在7月份达到最高,分别为250和11.6215,9月份均匀度指数最高,达到2.1816,日土苔蛾为全年中的优势种。初步结果表明:不同月份间蛾类群落的组成存在较大差异,说明该森林公园的整体生态结构较稳定,环境较好。