不同模型对贵州半细毛羊的遗传参数估计比较

采用平均信息与期望最大结合约束似然法用不同混合动物模型估计贵州半细毛羊的生长性状遗传参数,并采用赤池信息量准则(AIC)指数对不同模型进行比较。各模型中均包含固定效应、随机效应和残差效应。不同模型对随机效应做了不同的考虑:模型1中随机效应包括个体加性遗传效应、模型2中包括个体加性遗传效应、母体遗传效应;模型3中包括个体加性遗传效应、永久环境效应。各模型估计的初生重遗传力为:0.208 9⁰.380 2;断奶重遗传力为:0.253 60.380 2;断奶重遗传力为:0.253 6⁰.292 6;周岁重遗传力范围:0.224 60.292 6;周岁重遗传力范围:0.224 6⁰.344 2;成年体重遗传力范围:0.221 20.344 2;成年体重遗传力范围:0.221 2⁰.399 6;模型间比较结果表明:对于初生重和断奶重,模型2估计效果最优;对于周岁重和成年重,模型1估计效果最优。生长性状中初生重、断奶重受母体遗传效应影响显著;周岁重和成年重受母体效应影响不显著。     

基于系谱和基因组信息估计荷斯坦青年母牛体重性状遗传参数

旨在设计利用不同信息来源的模型估计荷斯坦后备牛不同月龄体重性状的遗传参数。本研究于2014—2020年测定并收集了7 122头荷斯坦牛32 338条0～12月龄体重数据,分别利用系谱信息(linear mixed model with pedigree relationship matrix, LM＿A)和系谱-基因组信息构建亲缘关系矩阵(linear mixed model with genotype-pedigree joint relationship matrix, LM＿H),基于母体效应动物模型估计初生重,基于是否考虑初生重作为协变量的单性状动物模型估计2～12月龄各月龄体重遗传力,并利用双性状动物模型估计初生重与其它月龄体重的遗传相关。结果显示,对于初生重,根据赤池信息量准则(Akaike information criterion, AIC),LM＿H方法的拟合程度显著优于LM＿A方法,但两种方法估计的遗传参数相差不大：直接遗传力分别为0.30和0.32,母体遗传力分别为0.08和0.09,个体直接遗传效应和母体遗传效应遗传相关系数分别为-0.65和-0.64;对于2～...     

新疆褐牛不同生长阶段体尺体重的遗传参数估计

试验旨在构建新疆褐牛不同生长阶段体尺体重性状的遗传参数估计模型,估计新疆褐牛生长发育性状的遗传参数,为新疆褐牛育种目标性状的确定和综合选择指数的制定提供理论依据。以1983－2017年收集的4个新疆褐牛核心育种场81头公牛后代的2 504条新疆褐牛体尺体重数据为研究材料,以初生及6、12和18月龄阶段的体重、体高、体斜长和胸围性状为研究对象,通过DMU软件构建多性状动物模型,以场、出生年份、出生季节和性别为固定效应,以加性效应和母体效应为随机效应,估计各性状的遗传力和遗传相关。结果显示,新疆褐牛初生至18月龄阶段体重遗传力估计值为0.22~0.61,体高遗传力估计值为0.43~0.46,体斜长遗传力估计值为0.29~0.52,胸围遗传力估计值为0.35~0.61。相同和不同生长阶段新疆褐牛各体尺体重性状间均呈现正的遗传相关和表型相关,其中相同生长阶段各体尺体重性状间的遗传相关系数为0.11~0.92,表型相关系数为0.05~0.92;不同生长阶段各体尺体重性状间的遗传相关系数为0.08~0.92,表型相关系数为0.01~0.72。18月龄与其他各生长阶段间体尺体重性状的遗传相关系数较高,且均属于中高遗传力性状。因此,在制定新疆褐牛综合选择指数时,应重点考虑18月龄阶段的体尺体重性状,从而进一步提升新疆褐牛生长发育性状的遗传进展。     

非遗传因素对高山美利奴羊早期生长性状及其遗传力估计的影响

本研究利用ASReml软件分析了不同非遗传因素组合对20 057只高山美利奴羊早期生长性状及其遗传力估计的影响。结果表明:血统、性别、出生类型、出生年份、配种月份、初生月份、群别以及某些非遗传因素间的互作效应对高山美利奴羊早期生长性状均有极显著影响(P0.001)。研究发现,高山美利奴羊早期生长性状遗传参数估计过程中有无考虑非遗传因素间的互作效应对其结果影响较大,未考虑固定效应间互作效应时所估计各性状的直接遗传力均高于考虑了固定效应间互作效应所估计出的各性状直接遗传力;考虑了固定效应间互作效应后所估计的母体效应遗传力略高于未考虑固定效应间互作效应时所估计的母体效应遗传力。本研究结果不仅为优化高山美利奴羊早期生长性状遗传评估模型提供科学依据,更为该品种的早期科学选种及后期选育提高奠定了基础。     

我国肉用西门塔尔牛群体生长发育性状遗传参数估计及其遗传进展

旨在对我国国家肉牛遗传评估中心收集的于2000-2019年出生的6 837头肉用西门塔尔牛的各阶段体重和日增重数据进行遗传参数估计,并估计其在2007-2017年取得的遗传进展。本研究利用REML算法估计我国肉用西门塔尔牛各性状遗传力,通过ASREML软件计算所有个体的育种值,再估计各性状的遗传进展。结果显示,我国肉用西门塔尔牛初生重、6月龄重、12月龄重、18月龄重和24月龄重的遗传力估计值分别为0.44、0.42、0.35、0.38和0.46,初生至6月龄日增重、6～12月龄日增重、12～18月龄日增重、18～24月龄日增重的遗传力估计值分别为0.47、0.32、0.36、0.39。我国肉用西门塔尔牛在2007-2017年初生重、6月龄重、12月龄重、18月龄重和24月龄重的平均每年遗传进展为0.46、2.65、4.31、4.12和2.44 kg,初生至6月龄日增重、6～12月龄日增重、12～18月龄日增重、18～24月龄日增重的平均每年遗传进展为0.014、0.016、0.009和0.007 kg·d~(-1)。本研究对我国肉用西门塔尔牛群体生长发育性状的遗传参数做了系统评估分析,并评估了我国肉用西门塔尔牛取得的遗传进展,为下一步我国肉牛遗传改良计划的实施提供理论依据。     

我国肉用西门塔尔牛群体生长发育性状遗传参数估计及其遗传进展

旨在对我国国家肉牛遗传评估中心收集的于2000-2019年出生的6 837头肉用西门塔尔牛的各阶段体重和日增重数据进行遗传参数估计,并估计其在2007-2017年取得的遗传进展。本研究利用REML算法估计我国肉用西门塔尔牛各性状遗传力,通过ASREML软件计算所有个体的育种值,再估计各性状的遗传进展。结果显示,我国肉用西门塔尔牛初生重、6月龄重、12月龄重、18月龄重和24月龄重的遗传力估计值分别为0.44、0.42、0.35、0.38和0.46,初生至6月龄日增重、6~12月龄日增重、12~18月龄日增重、18~24月龄日增重的遗传力估计值分别为0.47、0.32、0.36、0.39。我国肉用西门塔尔牛在2007-2017年初生重、6月龄重、12月龄重、18月龄重和24月龄重的平均每年遗传进展为0.46、2.65、4.31、4.12和2.44 kg,初生至6月龄日增重、6~12月龄日增重、12~18月龄日增重、18~24月龄日增重的平均每年遗传进展为0.014、0.016、0.009和0.007 kg·d^-1。本研究对我国肉用西门塔尔牛群体生长发育性状的遗传参数做了系统评估分析,并评估了我国肉用西门塔尔牛取得的遗传进展,为下一步我国肉牛遗传改良计划的实施提供理论依据。     

辽育白牛体尺体重测定与体重遗传力估计

文章比较并分析品种审定时期与当下的辽育白牛的生长发育性能变化及其原因,利用BLUP算法估计辽育白牛各生长阶段体重相关性状的遗传力。结果表明,与辽育白牛品种审定时期相比,当下的辽育白牛生长性状有所提高;辽育白牛初生重遗传力为0.47,12月龄重和18月龄重遗传力为0.09和0.12。研究表明,辽育白牛在生长期间具有充分的遗传改良空间。     

估计猪早期生长性状和繁殖性状的动物模型比较

分析了三种模型对出生重，21、60、90日龄重，总产仔数，以及出生窝重性状遗传参数估计中的加性遗传效应、母体效应、窝效应和残差效应的方差组分、遗传力及其变化趋势。结果表明，出生重、21日龄重和60日龄重采用包含加性遗传效应、母体效应、窝效应和残差效应的模型进行估计比较适宜。90日龄重、总产仔、产活仔和出生窝重性状采用包含加性遗传效应、母体效应和残差效应的模型进行估计效果较好。     

考力代羊体重生长的遗传参数估计

本研究对1 269只考力代羊的初生、断奶、8月龄、12月龄和18月龄等五个月龄的体重,共3 332个生长发育记录,采用3个步骤进行分析:①利用SPSS?软件的GLM筛选遗传分析模型中应包括的固定效应。其中被筛选的固定效应为性别、出生年份、出生月份、出生日期和出生类型等5个非遗传因素的主效应及其间所有二级互作效应;②配合9个包含不同随机效应的混合模型进行单性状遗传分析,根据似然比检验(LRT)筛选出用于多性状遗传分析的最宜模型,并将所得的方差组分估值作为多性状遗传分析的初值;③用多性状分析最宜模型下的遗传参数。结果表明:①筛选后初生重遗传分析模型中包含的固定效应为出生年份和出生类型;断奶重、8月龄重、周岁重和18月龄重遗传分析模型中应包含的固定效应为出生年份、出生月份、性别和出生类型;②用单性状遗传分析选出的最宜模型为模型3,即y=Xb+Z1a+W2c+e,且最宜模型下单性状分析所得初生、断奶、8月龄、12月龄和18月龄的遗传力估值依次为0.32、0.27、0.28、0.12和0.30。③多性状遗传分析中,若考虑误差间的协方差,则由此所得的遗传力估值与单性状分析的估计结果一致;若不考虑误差间的协方差,其遗传力估值偏高。     

母猪生产力性状的遗传分析

对二花脸猪、大白猪及其杂交一代3个群体共1686窝的生产力性状资料进行了遗传分析。用公畜模型估计了初生窝重、初生仔猪平均重、20日龄窝重、20日龄仔猪平均重、45日龄窝重、45日龄仔猪平均重的表型参数和遗传参数。与大白猪相比，二花脸猪抚育能力较强，生长速度较慢。前4个性状受母体影响较大，后2个性状受母体影响较小。6个性状的遗传力分别为0．251、0．277、0．341、0．330、0．235、0．186，表明直接选择有一定效果。从6个性状中选出初生窝重和20日龄窝重来反映母猪生产力，前者反映母猪繁殖力，后者反映母猪抚育能力。     

杜洛克仔猪初生重对生长和繁殖性能的影响

本研究旨在对仔猪初生重进行表型与遗传分析，探究其对生长和繁殖性能的影响，为发挥其在选种过程中的价值奠定基础。实验选取某核心场近8年杜洛克仔猪生长和繁殖性状记录，利用DMU软件和动物模型估计了初生重的加性方差、窝效应方差、表型效应方差和残差方差，计算初生重的遗传力；并估计了杜洛克仔猪初生重与主要繁殖和生长性状之间的表型和遗传相关；此外，分析了随着初生重不断增加，其对应父系指数及各性状育种值的变化情况。结果表明：性别和年份季节效应对仔猪初生重均有极显著影响；仔猪初生重遗传力达到0.24；相关性分析表明：表型与遗传相关分析结果较为相近，初生重与达115 kg体重日龄呈中等负相关，与体长和达115 kg体重日增重呈中等正相关，与达115 kg体重背膘厚、眼肌面积、总仔数、活仔数和健仔数相关均接近于0。综上，依据仔猪初生重进行早期选择，能够对种猪生长速度起到较好的选择效果，但对其他性状影响较小，建议可通过淘汰较低初生重个体（1 kg以下）来达到初选目的。     

不同数据结构和动物模型对高山美利奴羊经济性状遗传参数估计的比较

本试验旨在比较不同数据结构和单性状动物模型对高山美利奴羊(14月龄)重要数量性状遗传参数估计的影响,筛选出估计体重、产毛量、净毛率、净毛量、羊毛纤维直径、羊毛纤维直径变异系数和羊毛长度7个重要经济性状遗传参数的最适模型,准确估计遗传力并为下一步遗传评定奠定基础。使用R语言数据整理相关函数将涉及20 720只14月龄高山美利奴羊数据按系谱完整度和数据量分为数据集1和数据集2。采用R语言ANOVA分析检验鉴定年份、出生类型(单胎或双胎)、群别、性别4个非遗传因素在两个数据集中的显著性,将极显著效应(P0.01)放入动物模型中作为固定效应。将两个数据集和两个单性状动物模型组合得到4个模型,其中模型1、模型2分别使用数据集1、数据集2,随机效应为个体加性遗传效应、残差效应;模型3、模型4分别使用数据集1、数据集2,随机效应为个体加性遗传效应、个体永久环境效应和残差效应。用ASReml4软件实现方差组分估计。通过AIC准则、BIC准则评价各模型,用LRT检验比较各模型。最后,针对各性状选出最适模型进行遗传力估计。结果显示:①非遗传效应显著性检验得到鉴定年份和群别对数据集1和数据集2中所有性状均极显著(P0.01),出生类型对体重和数据集1中产毛量极显著(P0.01),性别仅对体重反应极显著(P0.01)。②各模型估计的体重遗传力为0.1614～0.2392;产毛量遗传力为0.1958～0.3254;净毛率遗传力为0.4395～0.5539;净毛量遗传力为0.2003～0.2393;羊毛纤维直径遗传力为0.4024～0.5897;羊毛纤维直径变异系数遗传力为0.3174～0.6077;毛长遗传力为0.2960～0.3669。③似然比检验结果表明,模型1和模型3对所有性状差异均不显著(P0.05);模型1和模型4对体重和毛长差异极显著(P0.01);模型2和模型3对净毛量差异极显著(P0.01),对其他性状差异不显著(P0.05);模型2和模型4对所有性状差异不显著(P0.05)。最终得到对净毛量最适模型为模型1,体重、产毛量、净毛率、羊毛纤维直径、羊毛纤维直径变异系数、毛长的最适模型为模型2。所有性状受个体永久环境影响均不显著(P0.05)。基于最适模型估计高山美利奴羊(14月龄)体重、产毛量、净毛率、净毛量、羊毛纤维直径、羊毛纤维直径变异系数、毛长遗传力分别为0.2392、0.3254、0.4394、0.2893、0.4222、0.3175、0.3670。     

云南黑山羊早期生长发育规律研究

为了探讨云南黑山羊的早期生长发育规律,测定了其初生重以及3月龄、6月龄和12月龄的体重、体尺,并采用Logistic和Gompertz模型拟合了云南黑山羊早期生长发育过程。结果表明:云南黑山羊体重、体尺的累积生长随着月龄逐渐增加,各月龄公羊体重、体尺均极显著高于母羊(P0.01),同时,公、母羊在3月龄达到绝对生长高峰,且生长强度最大,后期生长强度明显不如前期,相对生长曲线大致呈下降趋势。2种非线性模型拟合的效果都很好(r~20.95),但以Gompertz模型更优,通过Gompertz模型计算云南黑山羊拐点月龄和拐点体重,公羊拐点月龄和拐点体重分别为3.7月龄和23.87 kg,Gompertz模型方程为W_t=64.89 e-2.39 e(-0.24 t);母羊拐点月龄和拐点体重分别为2.3月龄和14.00 kg,Gompertz模型方程为Wt=38.05 e~(-2.25)e(-0.35 t)。     

法系獭兔数量性状遗传参数估计

用单元内同胞相关法对法系獭兔3个世代的繁殖性状和生长发育性状进行了遗传力估计，并对6月龄的体重体尺进行了相关分析。结果表明：产仔数（0．15）和初生窝重（0．20）属中等遗传力性状；21日龄个体重（0．42）、32日龄断奶个体重（0．38）及成活数（0．42）皆属高遗传性状；3月龄体重（0．37）及体尺（0．28－0．37）属较高遗传力性状，而6月龄的相应性状遗传力值（0．47－0．63）明显地高于3月龄。3月龄体重与6月龄体重、6月龄体尺间皆有很高的遗传相关（0．81－0．96）和表型相关（0．46－0．79）。     

晋南牛不同生长阶段体重和体尺性状遗传参数估计

旨在利用从山西省运城市国家级晋南牛遗传资源基因保护中心采集的2011—2021年564头晋南牛(公牛279头，母牛285头)共1 937条体重和体尺性状数据，对晋南牛初生、6、12、18、24月龄阶段体重和体尺性状进行遗传参数估计。本研究运用ASREML软件中的REML算法配合多性状动物模型，以出生年份、出生季节和性别为固定效应，估计晋南牛5个不同生长阶段体重和体尺性状的遗传力、遗传相关和表型相关。结果表明，出生年份对晋南牛不同生长阶段的体重和体尺性状有着极显著影响(P<0.01);出生季节和性别对晋南牛生长发育前期影响较小，对其生长发育后期有着较大影响。晋南牛初生至24月龄体重遗传力估计值范围为0.22～0.35,体高遗传力估计值范围为0.18～0.31,十字部高遗传力估计值范围为0.17～0.43,体斜长遗传力估计值范围为0.10～0.24,胸围遗传力估计值范围为0.22～0.29,腹围遗传力估计值范围为0.25～0.33,管围遗传力估计值范围为0.16～0.56。晋南牛不同生长阶段体重和体尺性状均呈现出较强的遗传正相关和表型正相关。其中遗传相关和表型相关的范围分别为0.37...     

中卫山羊早期体型及羊毛性状的遗传参数估计

本研究通过对国家级保护品种中卫山羊15个初生时期和35日龄的体型和羊毛性状的遗传力、遗传相关和表型相关进行估计,分析了性别和出生年份固定效应对这些性状的影响,旨在为中卫山羊的保种工作提供参考。运用DMU软件的DMUAI模块,用单性状动物模型估计遗传力,用多性状动物模型估计遗传相关与表型相关。结果发现,除了35日龄的肩部和臀部毛弯曲数的遗传力小于0.1外其他各性状遗传力的范围为0.10～0.62,均属于中等或偏高遗传力,各性状遗传相关的范围为-0.799～0.991,表型相关的范围为-0.407～0.904。出生年份对除35日龄管围外的其余性状均有极显著影响,性别效应对所有体型性状均有显著影响,但对于初生时期2个毛长性状和35日龄的2个羊毛弯曲数性状影响不显著。中卫山羊早期体型和羊毛性状具有选育提高潜力,可将初生体长和毛股长作为中卫山羊早期选择性状。     

不同数据结构和动物模型对高山美利奴羊经济性状遗传参数估计的比较

本试验旨在比较不同数据结构和单性状动物模型对高山美利奴羊（14月龄）重要数量性状遗传参数估计的影响，筛选出估计体重、产毛量、净毛率、净毛量、羊毛纤维直径、羊毛纤维直径变异系数和羊毛长度7个重要经济性状遗传参数的最适模型，准确估计遗传力并为下一步遗传评定奠定基础。使用R语言数据整理相关函数将涉及20 720只14月龄高山美利奴羊数据按系谱完整度和数据量分为数据集1和数据集2。采用R语言ANOVA分析检验鉴定年份、出生类型（单胎或双胎）、群别、性别4个非遗传因素在两个数据集中的显著性，将极显著效应（P < 0.01）放入动物模型中作为固定效应。将两个数据集和两个单性状动物模型组合得到4个模型，其中模型1、模型2分别使用数据集1、数据集2，随机效应为个体加性遗传效应、残差效应；模型3、模型4分别使用数据集1、数据集2，随机效应为个体加性遗传效应、个体永久环境效应和残差效应。用ASReml4软件实现方差组分估计。通过AIC准则、BIC准则评价各模型，用LRT检验比较各模型。最后，针对各性状选出最适模型进行遗传力估计。结果显示：①非遗传效应显著性检验得到鉴定年份和群别对数据集1和数据集2中所有性状均极显著（P < 0.01），出生类型对体重和数据集1中产毛量极显著（P < 0.01），性别仅对体重反应极显著（P < 0.01）。②各模型估计的体重遗传力为0.1614~0.2392；产毛量遗传力为0.1958~0.3254；净毛率遗传力为0.4395~0.5539；净毛量遗传力为0.2003~0.2393；羊毛纤维直径遗传力为0.4024~0.5897；羊毛纤维直径变异系数遗传力为0.3174~0.6077；毛长遗传力为0.2960~0.3669。③似然比检验结果表明，模型1和模型3对所有性状差异均不显著（P > 0.05）；模型1和模型4对体重和毛长差异极显著（P < 0.01）；模型2和模型3对净毛量差异极显著（P < 0.01），对其他性状差异不显著（P > 0.05）；模型2和模型4对所有性状差异不显著（P > 0.05）。最终得到对净毛量最适模型为模型1，体重、产毛量、净毛率、羊毛纤维直径、羊毛纤维直径变异系数、毛长的最适模型为模型2。所有性状受个体永久环境影响均不显著（P > 0.05）。基于最适模型估计高山美利奴羊（14月龄）体重、产毛量、净毛率、净毛量、羊毛纤维直径、羊毛纤维直径变异系数、毛长遗传力分别为0.2392、0.3254、0.4394、0.2893、0.4222、0.3175、0.3670。     

大白猪繁殖和生产性状母体遗传效应估计

用非求导约束最大似然法估计了大白猪部分性状的直接和母体遗传效应。总产仔数,活产仔数和初生重的直接效应遗传力分别为０．１５,０．２５和０．０９,母体效应的遗传力分别为０．１２,０．１９和０．６４,直接和母体效应间遗传相关分别为－０．５４,－０．１８,和０．６６。     

南江黄羊早期生长发育性状遗传参数的估计

南江黄羊初生重的遗传力为低遗传力(P＞0.05),2月龄和6月龄体高、体长、胸围的遗传力均为中等遗传力.2月龄体重和6月龄体重的遗传力均为显著的高遗传力(P＜0.01).早期生长发育各性状表型值之间均呈极显著的正相关(P＜0.01),其中初生重与2月龄体长、6月龄体高、6月龄体重和体长的遗传相关不显著(P＞0.05),而与2月龄体重、体高、胸围和6月龄胸围的遗传相关显著或极显著;2月龄体重除与6月龄体长和体高的遗传相关不显著外,与其余性状的遗传相关均显著或极显著;6月龄体重与初生重、2月龄体长和体高、6月龄体高的遗传相关均不显著(P＞0.05),而与2月龄体重和胸围、6月龄的体长和胸围的遗传相关呈极显著的正相关(P＜0.01);2月龄胸围与其余性状之间的遗传相关均极显著(P＜0.01).     

金堂黑山羊杂交改良修水黑山羊效果研究

选择40头体况相近的修水黑山羊母羊,分组与金堂黑山羊进行杂交改良,结果显示,杂交一代初生重、1月龄、3月龄和12月龄体重分别提高28.6%、30.1%、32.64%和31.12%,表明金堂黑山羊改良修水黑山羊效果显著,值得推广。