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1.
采用RAPD分子标记技术对12个芒果品种进行遗传多样性研究。结果发现,6条RAPD引物共检测到36条清晰谱带,其中多态性条带占比为77.78%。芒果在物种水平上遗传多样性较高,而在居群水平上遗传多样性相对较低;居群间遗传变异较高,在居群水平上,金白花的遗传多样性最高,遗传分化程度最低;乳芒和马亚的遗传多样性最低,遗传分化程度最高。聚类分析结果表明,相似系数为0.72时,12种芒果品种可分为4个大类群,金白花和鹰嘴芒的遗传一致度最大,贵妃和鹰嘴芒遗传一致度最低。 相似文献
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长江滩地杨树无性系苗期选择研究 总被引:4,自引:0,他引:4
在定期观测引种的81个杨树无性系苗期生长量的基础上,运用DPS软件对引种的81个杨树无性系的扦插成活率、I级苗率进行系统聚类分析.结果表明,81个杨树无性系分成3种类型,第二类的17个无性系表现优良.这17个杨树无性系早期生长统计分析结果,杨树无性系以14、65、41、43、44和32生长较好. 相似文献
3.
地黄品种遗传多样性RAPD分析 总被引:2,自引:1,他引:2
用CTAB法提取10个地黄品种幼叶的基因组DNA,用紫外分析法和琼脂糖凝胶电泳方法检测基因组DNA的纯度、大小和浓度。结果表明,从80条RAPD引物中分别筛选出适合于地黄RAPD标记分析的引物17条。17条RAPD引物对10个地黄品种(系)扩增出177条带,多态条带比率(PPB)为61.58%,平均多样性指数(I)为0.3135,遗传相似系数(GS)在0.63~0.93,平均GS为0.7545。RAPD标记的聚类分析结果,将10个地黄品种分为2类:第1类含有6个品种,包括组培85—5、大田85—5、组培9302、金白地黄、金状元和大田9302;第2类含有4个品种,包括北京1号、大红袍、地黄9104和野生地黄。 相似文献
4.
为了解贵州地方油菜种质资源的遗传多样性,选取136份贵州省白菜型油菜,通过RAPD分子标记,进行遗传多样性分析.筛选了17个随机引物获得172个标记住点,其中106个位点具有多态性,多态率达61.6%.在遗传距离为0.94上,可以分为4个类群,从聚类结果看出:来源相同或相近地区的种质基本上能聚为一簇,但它们的亲缘关系与其产地的地理分布又并不是完全一致,可能是由于贵州特殊地理环境、人为因素等的影响. 相似文献
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红皮云杉地理种源遗传多样性的RAPD分析 总被引:10,自引:0,他引:10
以来自东北地区红皮云杉种源试验林8个种源的80个样本为材料,采用RAPD分子标记技术,对种源的遗传多样性进行研究的结果表明:红皮云杉在DNA水平上具有较高的遗传变异,多态位点比率达到73.68%,各种源多态位点比率的变化范围为35.09%~45.03%。采用Nei基因多样性指数和Shannon信息指数估算种源的遗传多样性。证明各种源的遗传变异程度由桦楠、鸟伊岭、柴河、穆棱、天桥岭、爱辉、高峰、大丰依次递增;种源间和种源内遗传分化分别为42.26%和57.74%。各种源间具有较高水平的遗传一致度,其平均值为0.8622。遗传距离聚类分析表明,8个种源可聚为3大类:天桥岭、穆棱种源为第1类;柴河、桦楠种源为第2类;大丰、鸟伊岭、爱辉和高峰种源为第3类。红皮云杉种源间遗传距离和地理距离之间存在着一定程度的正相关。 相似文献
6.
从50条随机引物中筛选出10条有效引物,采用RAPD技术对蒙自响水河和草坝的2个鲤鱼群体进行遗传多样性分析。结果表明:在2个群体中分别检测到47、53个位点,多态位点分别为44、51个,平均多态位点比例分别为93.61%和96.23%;利用Popgene version1.32软件分析获得2个鲤鱼群体Shannon信息指数(I)分别为0.479 9和0.455 7,Nei's基因多样性指数(H)分别为0.328 7和0.298 4,等位基因观察数(Na)分别为1.821 4和1.910 7,有效等位基因数(Ne)分别为1.584 3和1.487 9,群体间的遗传相似性系数为0.958 1,遗传距离为0.041 9。2个鲤鱼群体间的遗传分化系数Gst为0.082 4,表明群体间的遗传变异占总的遗传变异的8.24%,群体内的遗传变异占总变异的91.76%。 相似文献
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应用RAPD标记分析黑麦属的遗传多样性 总被引:4,自引:0,他引:4
采用随机扩增多态性DNA(RAPD)标记,对黑麦属(Secale L)7个种共12份材料进行了遗传多样性检测。结果表明,被测材料间RAPD标记多态性较高。40个随机引物中,有25个引物(占62.5%)的扩增产物具有多态性。25个引物共扩增出167条带,其中89条带(占53.2%)有多态性,每个引物可扩增出1-10条多态性带,平均3.6条。RAPD标记遗传距离(GD)变异范围为0.1382-0.4512,平均值为0.2712。聚类分析表明,在GD值0.3850水平上,12份材料可聚3类,S.africamum和S.silvestre与其它材料间的遗传分化较大,分别单独聚为一类,其余10份材料则聚为一类。据此认为,RAPD标记可以作为黑麦属物种鉴定的指纹图谱。 相似文献
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油茶优良无性系的RAPD分子鉴别 总被引:26,自引:3,他引:26
油茶优良无性系是当前生产上的主要良种.通过采用RAPD分子标记方法。从180多个引物中筛选出22个具有多态性的随机引物进行扩增。得到141个位点。其中有91个是多态位点。以此为基础建立油茶优良无性系的RAPD分子鉴别体系.同时还探索出油茶叶片总DNA的分离技术和建立了RAPD反应体系,为油茶分子技术育种积累了相关的知识并奠定了DNA技术基础. 相似文献
9.
柴松遗传多样性的RAPD分析 总被引:1,自引:0,他引:1
以柴松现存2个居群各50个个体为样本,利用随机扩增多态DNA(RAPD)标记研究了其遗传多样性。50条引物共扩增出349个位点,其中多态位点为321个。用POPGEN32版软件对数据进行了分析,结果表明:(1)柴松的遗传多样性水平很高。在物种水平上,多态位点百分率(PPB)为92.51%,Nei’s基因多样度指数(H)为0.317 3,Shannon多样性信息指数(I)为0.478 2,总基因多样度(Ht)为0.317 4。在居群水平上,平均多态位点百分率为89.92%,H和I平均值分别为0.302 5和0.456 6;(2)居群间的遗传分化较低。居群间遗传分化系数(Gst)为0.046 7,基因流(Nm)为10.201 8,Shannon’s居群分化系数((Isp-Ipop)/Isp)为0.045 2。表明柴松的遗传变异主要存在于居群内,占总变异的95%以上,居群间的遗传变异不足5%。并根据柴松的遗传多样性现状提出了相应的保护策略和措施。 相似文献
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辣椒遗传多样性的RAPD分析 总被引:19,自引:0,他引:19
利用RAPD标记对从国内外收集的灯笼椒、长椒、圆锥椒和簇生椒等1年生辣椒(CapsicumannuumL.)自交系和杂交组合的遗传多样性进行了研究.采用14个随机引物、22个参试材料共扩增出1258条带,其中多态条带比率(PPB)接近50%,表明供试辣椒之间的遗传基础较窄.D=0.69时,聚类分析将供试材料分为3类:灯笼椒,圆锥椒,第三类包括簇生椒(朝天椒)和长辣椒(牛角椒);D=0.75时,供试材料分成4类,将簇生椒和长辣椒区分开来;D=0.77时,进一步区分长椒的杂种一代和自交系.聚类分析结果表明,4个辣椒变种中,簇生椒与长椒亲缘关系较近,与圆锥椒次之,与灯笼椒最远. 相似文献
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基因组SSR与EST-SSR标记在杨树不同种间的遗传差异 总被引:1,自引:0,他引:1
为探讨基因组SSR与EST-SSR标记在杨树不同种间的遗传差异,采用两种SSR标记技术对来自5个杨树不同派间不同种的15份材料进行了遗传分析,并对两种不同标记方法进行分析比较.结果表明:EST-SSR标记相比基因组SSR在杨树不同种间具有更好的通用性,而且EST-SSR位点整体揭示的遗传多样度高于基因组SSR位点;同时... 相似文献
12.
[目的]找出一种适合秀珍菇的分子标记方法,研究其遗传多样性。[方法]应用RAPD技术对11株秀珍菇(Pleurotus geesteranus)菌株进行了遗传多样性分析。[结果]在供试的60条RAPD随机引物中,有13条可扩增出清晰、稳定的DNA条带。聚类分析表明,在相似系数0.820水平上,可将供试菌株分为4类:第1类包括土秀、灰平260、高平172、夏丰1号;第2类包括凤尾、秀珍菇、秀12、高678、秀18;第3类仅有3014;第4类仅有灰秀。[结论]该研究揭示了北京地区秀珍菇菌株的遗传多样性。 相似文献
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DI Hong LIU Zhaojun CHEN Yili 《东北农业大学学报(英文版)》2006,13(1):16-21
DNA fingerprints of 37 PVY resistant potato varieties (clones) were generated using PCR-based RAPD analysis. All 37 varieties were differentiated by banding patterns obtained from 17 primers that generated 164 polymorphisms. Similarity matrices were calculated with the simple matching coefficient. The genetic distance value among them was between 0.27 and 0.50, with average value being 0.35. The average link clustering algorithm was used to construct a dendrogram with Statistica. They were classified into three groups according to clustering results, and the results presented some geographic relationship. Dendrogram showed close genetic relationships between a number of varieties (clones) of similar pedigree. This study has shown that RAPD marker is a useful tool for potato variety identification, differentiation, and estimation of genetic relationships. 相似文献
14.
Total 69 random primers were screened out through RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) markers to analyze the genetic bands of 32 Kentucky bluegrass cultivars. A total of 197 bands were amplified from 46 primers of them, among which 195 bands were polymorphic. Each primer could amplify one to nine polymorphic bands with an average of 4.3 being amplified from an average of primer. Based on the similarity coefficient analysis of RAPD results, NTSYS software and cluster analysis by using average UPGMA method, the result showed that 18 of 32 cultivars were in group 1, three cultivars were in group 2, two cultivars were in group 3, eight cultivars were in group 4, and there was only one cultivar in group 5, which was C2. 相似文献
15.
[目的]利用RAPD标记分析葱属7个栽培品种的遗传多样性。[方法]采取改良CTAB法提取植物的总DNA,从68个RAPD引物中筛选出25条具有多态性且扩增稳定的引物用于品种的DNA多态性分析,采用优化后的RAPD的PCR反应体系进行PCR扩增。利用MEGA4软件进行各品种间UPGMA聚类分析。[结果]从25个引物中共扩增出245条DNA带,其中99条为多态性带。根据聚类分析,葱属7个栽培品种可分为2类:汉中冬韭、阜丰1号和豫韭2号为1类;其他4个为1类,其中怀化大蒜和南宁大蒜、连葱6号和杭州分葱各为1小类;7个品种的相似系数范围为80.2%~99.8%。该聚类结果与依据表型特征的传统分类的结果一致。[结论]该研究为准确地进行葱属植物种质资源的鉴定、筛选和利用提供了科学依据。 相似文献
16.
[目的]找出一种适合杏鲍菇自身的分子标记方法,为其亲缘关系研究提供借鉴。[方法]利用随机扩增多样性DNA(RAPD)对23种来自我国不同地区的杏鲍菇品种进行遗传多样性分析,寻找一种适合杏鲍菇自身的分子标记方法。[结果]筛选出的12个RAPD引物扩增出谱带121条,多态性谱带95条,多态率为78%,表现出丰富的RAPD多态性;利用NTYS-PC2.1软件进行UPGMA聚类分析,可将该23份材料分为5大类,存在较大的遗传差异性。[结论]RAPD技术用于杏鲍菇遗传多样性的分析是有效的,并且能检测到更高的品种间遗传差异。 相似文献
17.
基于RAPD的风信子遗传多样性分析 总被引:1,自引:0,他引:1
利用RAPD分子标记法,对20个风信子品种的遗传多样性以及亲缘关系进行研究。结果表明,筛选出的12条随机引物共扩增出93条指纹谱带,其中多态性条带67条,占扩增条带总数的72.0%;使用NTSYS-pc2.10对扩增出的条带进行统计分析,得到20个风信子品种的遗传相似系数及亲缘关系树状图,以遗传相似系数0.83为分界线将20个风信子品种分为2个大类,发现各品种间亲缘关系相对较近;相同色系的品种在聚类中基本聚为一类。风信子在引进栽培过程中,在环境的驯化作用下产生了一些芽变品种,这些品种提高了风信子种群遗传多样性的丰富程度。本研究通过RAPD技术对风信子种质资源进行研究,为风信子进一步创新种质资源提供了基础。 相似文献
18.
用RAPD技术对南阳牛种质资源的DNA进行检测,采用Popgene软件对扩增结果进行统计分析表明:筛选的16个引物共得到了236条扩增DNA片断,其中89.7%的扩增条带表现出多态性。平均每个位点有1.989 6个等位基因,有效等位基因数为1.233 3。Nei遗传多样性指数为0.159 7,Shannon's遗传多样性指数为0.270 3。种群总的遗传多样性Ht为0.163 7,种群内的遗传多样性Hs为0.130 5,种群的基因分化系数为0.202 8,种群间的基因流为1.965 3。 相似文献