猪肺炎支原体和猪鼻支原体双重荧光定量PCR检测方法的建立

建立同时检测猪肺炎支原体和猪鼻支原体的双重荧光定量PCR方法。根据猪肺炎支原体P97序列和猪鼻支原体P37序列的特异性引物,分别标记FAM和Texas Red荧光报告基团的2条TaqMan探针,建立和优化双重实时荧光定量PCR反应条件和体系,同时检测其敏感性、特异性和重复性。建立的双重荧光定量PCR对猪肺炎支原体和猪鼻支原体的最低检测值均为10copies·μL-1;与猪源致病菌、病毒和其他常见细菌均无交叉反应;各浓度标准品的Ct值变异系数小于5%,重复性好。检测72份临床样本,其中猪肺炎支原体的肺阳性率为80%,鼻拭子阳性率22%,支气管肺泡灌洗液阳性率58.33%;猪鼻支原体的肺阳性率为40%,鼻拭子阳性率66%,支气管肺泡灌洗液阳性率41.67%。建立的双重荧光定量PCR方法比普通PCR更加敏感,实用性强,可用于临床样品的检测。该方法能同时快速和定量地检测猪肺炎支原体和猪鼻支原体,在短时间内获得样品的多个信息,快速地解决了多次检测所需的时间以及经济消耗,为猪肺炎支原体和猪鼻支原体的监测和防控提供了新型、可靠的检测技术。     

西宁市猪圆环病毒2型感染的流行病学调查

为了解西宁市部分地区猪群中猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)的感染状况。应用酶联免疫吸附试验(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)对采自西宁市3个县6个规模猪场的365份血清样品进行PCV2抗体检测,并运用荧光定量PCR技术同步进行PCV2核酸检测。结果显示:PCV2抗体检测的平均阳性率为71.23%,猪场PCV2抗体阳性率最高达95.83%。荧光定量PCR对样品进行病原检测,阳性率达49.94%,此次调查反映了西宁市部分地区PCV2的感染情况,为西宁市PCV2的防控工作提供理论依据和指导。     

2016～2017年山东省三种亚型猪流感血清学调查

猪流感是一种人畜共患传染病,猪流感病毒(Swine influenza virus,SIV)在全世界各国的猪群中普遍存在。为了解山东省猪群中SIV的感染情况,2016年6月至2017年12月在山东省各地共采集7000份血清,采用HI抗体检测方法,分别用类禽型猪H1N1(EA H1N1)、2009甲型H1N1(2009/H1N1)和H3N2亚型抗原为标准抗原进行检测。结果显示,SIV抗体总阳性率为63.79%,其中EA H1N1抗体阳性率为56.31%,2009/H1N1抗体阳性率为24.61%,H3N2亚型抗体阳性率为1.61%。本研究结果表明2016～2017年山东省SIV感染比较普遍,类禽型猪H1N1抗体阳性率最高,2009甲型H1N1,H3N2抗体阳性率较低。     

多重RT-PCR方法检测新型甲型H_1N_1流感病毒的研究

为了建立快速检测新型甲型H1N1流感病毒的多重PCR技术,根据GenBank中公布甲型H1N1流感病毒(2009年流行株)的HA和NA基因序列,设计并合成两套特异性引物。使用TaKaRa公司的一步法RT-PCR试剂盒和自行设计合成的引物建立多重RT-PCR反应,按照预期的PCR产物序列合成的DNA作为阳性对照。结果表明,该方法具有良好的特异性,可以将甲型H1N1流感病毒(2009年流行株)与传统甲型H1N1、H3N2、H5N1、H6N2和H9N2亚型流感病毒区分。该方法同时具有较高的灵敏度,最低可以检测到100个拷贝的阳性克隆质粒。在对183份发热病人临床咽拭子样品检测中发现了10份阳性样品,对350份猪鼻腔拭子样品检测全部呈阴性,结果与中国检验检疫科学研究院试剂盒检测结果一致,说明了该多重RT-PCR方法在临床检测新型甲型H1N1流感病毒方面具有广阔的应用前景。     

2019年～2020年四川省猪伪狂犬病毒野毒感染情况调查及其遗传进化分析

为调查四川省猪群PRV野毒(也即流行株)的感染及其遗传进化情况,本实验对2019年～2020年来自四川省11个地区55个猪场的466份疑似PRV感染猪的不同组织样品进行了PRV gE基因的荧光定量PCR检测,并统计不同类型猪和不同地区猪PRV的感染情况.结果显示,当前四川省11个地区PRV总阳性率为10.94％(51/...     

2016年山东省猪病毒性疫病的病原学检测

为了解2016年山东省几种主要猪病毒性疫病的流行情况,采用荧光定量RT-PCR或PCR方法,对山东省部分猪场送检的730份病料进行了病原学检测。结果检出248份阳性病料,样品个体阳性检出率由高到低的病原依次为猪圆环病毒2型（13.02%）、猪蓝耳病病毒（10.41%）、古典猪瘟病毒（8.08%）、猪流行性腹泻病毒（7.26%）、猪伪狂犬病毒（3.84%）、猪轮状病毒（1.65%）、猪传染性胃肠炎病毒（0.14%）;样品混合感染阳性率为8.08%,以猪蓝耳病病毒和猪圆环病毒2型混合感染最为常见（3.02%）。本次病原学检测为山东省猪场病毒性疾病的综合防控提供了数据参考。     

我国北方地区部分规模奶牛场Q热流行情况初步调查

为了解我国北方地区规模奶牛场的Q热流行情况,在7个规模奶牛场采集233份奶牛血清,应用酶联免疫吸附试验(ELISA)进行Q热抗体检测;采集103份棉拭子,采用荧光定量PCR方法进行Q热病原检测。结果显示:从233份血清中检测到Q热阳性抗体34份,血清学阳性率为14.59%;从103份棉拭子样品中检测到Q热病原核酸12份,病原学阳性率为11.65%;7个规模奶牛场均存在不同程度的Q热病原感染,阳性率介于3%～33%。结果表明,我国北方地区规模奶牛场Q热流行较为广泛,应引起养殖场和相关部门的高度重视,有必要加强Q热的流行病学调查和监测以及新型诊断技术研发,以控制该病在动物间传播,降低人员感染风险。     

新疆哺乳动物流感病毒血清学监测与分析

为了解新疆地区哺乳动物流感病毒的感染流行情况,本研究于2009年～2011年对新疆6个地区的5种哺乳动物进行流感病毒部分亚型的血清学监测,采集猪血清样品1 519份、马血清样品1 095份、驴血清样品802份、狗血清样品130份和猫血清样品40份.用HI方法进行流感病毒血清学监测.结果表明,猪血清中流感病毒H1亚型抗体阳性率为0～31.5％,H3抗体阳性率为0.75％～5.32％,H5亚型抗体阳性率为0～2.7％,H9亚型抗体阳性率为0～10.19％;马血清和驴血清样品的流感病毒H1、H3、H5、H7和H9亚型抗体均为阴性;狗血清流感病毒H9抗体阳性率为1.75％;猫血清样品流感病毒H1抗体阳性率为2.5％.     

河南省猪传染性胃肠炎血清流行病学调查分析

正为了解河南省猪传染性胃肠炎的流行情况和流行规律,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)对河南省36个规模化养猪场的2536份血清样本进行传染性胃肠炎抗体水平检测。结果表明,河南省猪传染性胃肠炎抗体总阳性率为1.5%,成年猪抗体阳性率为1.1%,仔猪抗体阳性率为0.4%,无效血清52份,其余2447份血清为阴性。猪传染性胃肠炎抗体阳性率较低,但病毒仍然在猪场存在,因此仍应该重视对该病的防治。     

5种猪源消化道传播病原体荧光定量PCR检测方法的建立

猪源人兽共患病不仅威胁公共卫生安全,还威胁生猪养殖业的健康发展;其中消化道传播是其主要的传播途径。为及时鉴定出经消化道传播的病原体,本试验建立了猪源大肠杆菌、沙门菌、单增李斯特菌和志贺菌的四重荧光定量PCR和戊型肝炎病毒荧光定量PCR检测方法,并优化反应体系和条件,实现5种病原体的同时检测;并利用荧光定量PCR与普通PCR对117份猪临床样品(病变组织、粪便和肌肉等)进行对比检测。结果显示,建立的荧光定量PCR能够在1.5 h内完成对大肠杆菌、沙门菌、单增李斯特菌、志贺菌和戊型肝炎病毒5种病原体的特异性检测,与其他常见细菌和病毒无交叉反应,检测极限值可达5个拷贝,标准曲线相关系数均不低于0.997,线性范围涵盖1×10¹～1×10⁹,批内和批间变异系数(CV)均低于3.16%。建立的荧光定量PCR与普通PCR方法检测结果的符合率达到95.73%～100%,具有较好的一致性。117份临床样品中大肠杆菌、沙门菌、单增李斯特菌、志贺菌和戊型肝炎病毒各自的阳性率分别为31.62%、17.95%、6.84%、5.13%和11.11%。结果表明,本试验所...     

一株人源H1N1亚型猪流感病毒的进化分析与生物学特性研究

为了解猪流感病毒(SIV)的变异情况,我们2009年11月从河北某养殖场采集呈流感症状的猪鼻拭子40份,接种10日龄SPF鸡胚,分离到一株猪流感病毒,通过RT-PCR和血凝抑制试验鉴定为H1N1亚型,命名为A/swine/Hebei/15/2009(H1N1),其全基因序列测定及同源性分析发现,8个基因片段均与2000年左右H1N1人流感病毒有较高的同源性。系统遗传演化显示,该病毒分离株是由2000年人源H1N1流感病毒A/Dunedin/2/2000(H1N1)进化而来。抗原性分析显示该株与甲型H1N1流感病毒和经典H1N1病毒株抗原性差异较大。对小鼠致病性试验表明该病毒株可以直接感染小鼠并导致小鼠轻微临床症状和组织病理学变化,但不致死小鼠,表现为低致病性。     

部分省市猪群猪流感的血清学调查及猪流感病毒的分离与鉴定

对黑龙江、吉林、辽宁、安徽、山东、内蒙、河南、河北、江苏、安徽、浙江、湖北、福建、广东、海南、上海等省、市猪群进行了猪流感的血清学和病原学调查研究。从 130 6份猪鼻棉拭子样品和死亡猪肺、气管样品中分离到 39株H3N2亚型猪流感病毒 ,12株 H1亚型猪流感病毒及其它亚型猪流感病毒 ,病毒粒子在透射电镜下呈现典型的正粘病毒特征 ,有囊膜和纤突 ,多为椭圆形、圆形、或杆形 ,直径约 80～ 12 0 nm。对 1997- 2 0 0 1年 3895份猪血清的血清学调查结果表明 ,近年中国多个地区猪群存在抗SWTN77(H1)、SWCO77(H3)、DKAT6 9(H1)、TKUK6 3(H3)流感病毒抗体 ;1998年来自河北的猪血清中抗 SWTN77阳性率高达 33.3% ;1999年来自内蒙的猪血清中抗 TKUK6 3和SWCO77阳性率分别为 13.3%和 2 6 .7% ;2 0 0 0- 2 0 0 1年调查的所有省市的猪群中均存在抗SWCO77抗体 ,阳性率从 3.2 %～ 10 0 %。说明近年我国猪群中 H3亚型猪流感的污染相当普遍     

1株H1N1亚型猪流感病毒的全基因组特征及其对小鼠的致病性

旨在了解河南省猪流感病毒的流行情况及其遗传进化和基因组特征。2018年4月，从河南省某一出现疑似流感症状猪群中采集鼻拭子样品150份用于分离病毒，对分离病毒的全基因组进行序列测定和分析。同时感染6周龄BALB/c小鼠，研究其对小鼠的致病性。结果显示，获得1株H1N1亚型病毒[命名为A/swine/Henan/NY20/2018（H1N1）]。遗传进化表明，其HA和NA基因属于欧亚类禽H1N1分支，PB2、PB1、PA、NP和M基因属于2009甲型H1N1分支，NS基因属于经典H1N1分支。HA蛋白的裂解位点序列为PSIQSR↓GL，具有低致病性流感病毒的分子特征，在小鼠肺和鼻甲有效复制并能引起肺组织病理学变化。本研究分离到1株3源重排H1N1亚型病毒，对小鼠呈现一定致病力，提示应进一步加强对SIV的监测。     

胶东地区规模鸡场3种主要病毒感染情况的调查

应用RT-PCR对山东青岛、潍坊和烟台3个地区2008年1月至2009年6月送检的1837份具有呼吸道症状鸡的病料进行新城疫病毒(NDV)、传染性支气管炎病毒(IBV)和H9亚型禽流感病毒(AIV)3种主要病毒感染情况的调查。调查显示,3个地区3种病毒的感染率可达65.76%,其中NDV、IBV和AIV(H9)的平均阳性率分别为12.36%、12.30%和41.10%。青岛地区NDV、AIV(H9)和IBV的阳性率最高,分别为13.45%、17.37%和44.08%。2008年下半年较2008年上半年3种病毒的检出率均有所升高,以AIV(H9)升高最为显著;2009年上半年较2008年上半年AIV(H9)阳性率上升最为明显。3种病毒混合感染的阳性率可达11.00%,以IBV+AIV(H9)和NDV+AIV(H9)二重混合感染临床最为常见。表明山东省胶东地区NDV、IBV和AIV(H9)的感染情况比较普遍,且存在一定程度的混合感染。本调查结果为山东省制定规模鸡场3种疫病的防控措施提供了科学资料。     

安徽省北部地区猪高热病流行病学调查

2008年7月,安徽省北部地区生猪出现疫病,表现为不食、高热等特征,为查明病因,进行流行病学调查,同时采集发病猪群样品进行病原学和血清学检测。结果137份血清样品中,HPRRSV、PRRSV、PPV带毒率分别为25.5%、23.4%、37.9%;PRRSV、SIV(H1N1、H3N2)抗体阳性率分别为86.5%、9.49%和3.65%,仔猪CSFV抗体免疫合格率为50%;6份组织样品中HPRRSV、PRRSV、CSFV、PRV、PPV带毒率分别为50%、100%、66.7%、33.3%、33.3%。表明引起本次猪病为PRRSV、CSFV、PPV等多种病原体混合感染。     

1型、2型牛病毒性腹泻病毒通用RT-PCR检测方法的建立与应用

为建立一种快速检测1型、2型牛病毒性腹泻病毒(BVDV)的通用RT-PCR方法,根据GenBank上收录的64株1型、2型BVDV以及1株猪瘟病毒(CSFV)的全基因组序列,应用Primer 6.0软件设计针对5'-UTR区域的1型、2型BVDV特异性通用引物对,扩增目的片段,并对该方法进行特异性、敏感性、重复性试验及利用该方法开展临床样品检测。结果显示:扩增的目的片段长度约为302 bp;该方法的灵敏度为2.09×102 copies/μL,无非特异性扩增,且重复性良好。对采自山东省发病牛场的13份鼻腔棉拭子和9份牛血清临床样品进行检测,发现有8份鼻腔棉拭子和8份血清为BVDV阳性,随机抽取4份阳性样品送测序,发现3份样品毒株为1型BVDV,1份样品还需进一步鉴定。本研究建立的RT-PCR方法可实现对1型、2型BVDV核酸的特异性检测,也可用于该病的流行病学调查研究。     

1株猪源H9N2亚型流感病毒的分子特征

旨在进一步了解山东省猪流感的流行情况及其病原特征,笔者于2019年春季,在山东省泰安某屠宰场采集130份猪鼻拭子,进行病毒分离鉴定;并对分离病毒进行全基因组测序和分子特征分析;用禽H9N2亚型标准抗原联合血凝抑制方法检测2018—2019年从山东省8个地区猪场采集的1 527份猪血清样品中的猪流感病毒抗体。结果显示：分离到1株H9N2亚型流感病毒,命名为A/swine/Shandong/TA009/2019（H9N2）。分离病毒与A/environment-air/Kunshan/NIOSH-BL20/2018（H9N2）和A/environment-air/Kunshan/NIOSH-BL25/2018（H9N2）遗传关系最近,其基因片段的核苷酸相似性均在99.5%以上。分离病毒的HA和NA基因属于Y280-like分支,PB2和M基因属于G1-like分支,PB1、PA、NP和NS基因属于SH/F98-like分支。分离病毒HA蛋白裂解位点处的氨基酸序列为“PSRSSR/GL”,符合低致病性禽流感病毒的分子生物学特性。HA蛋白的216位为L,具有结合人源唾液酸α 2,6-Gal的能力。血清学分析结果显示,9份血清中H9N2抗体呈阳性,其总阳性率为0.59%。综上：本研究分离到1株猪源H9N2亚型流感病毒,并在猪血清中检测到H9N2抗体,提示应加强对猪流感的流行情况及其病原特征的持续监测。     

Molecular Characterization of a H9N2 Subtype Swine Influenza Virus

The objective of this study was to explore the epidemic situation and pathogenic characteristics of swine influenza virus (SIV) in Shandong Province. In the spring of 2019, 130 swine nasal swab samples were collected from a slaughterhouse in Tai'an city, Shandong Province for virus isolation and identification. The whole genome of isolated virus was sequenced and analyzed. Meanwhile, 1 527 swine serum samples were collected from swine farms in 8 regions of Shandong province and their anti-SIV antibody were detected by HI assay using standard avian H9N2 antigen. The results showed that a H9N2 subtype influenza virus strain was isolated and named as A/swine/Shandong/TA009/2019(H9N2). The homology analysis showed that the isolated virus had close genetic relationship with A/environment-air/Kunshan/NIOSH-BL20/2018(H9N2) and A/environment-air/Kunshan/NIOSH-BL25/2018(H9N2), and the nucleotide homology of the gene fragments were above 99.5%. Phylogenetic analysis results demonstrated that HA and NA genes of the isolated virus belong to the Y280-like lineage, PB2 and M genes belong to the G1-like lineage, and PB1, PA, NP and NS genes belong to the SH/F98-like lineage. The cleavage site in HA protein is “PSRSSR/GL”, which was in accordance with the molecular biological characteristics of low pathogenic avian influenza virus.The position 216 of HA protein is L, and it has the ability to bind human-derived sialic acid α 2,6-Gal. The results of HI showed that 9 among 1 527 serum samples were positive with a positive rate of 0.59%. The isolated virus was swine-derived H9N2 virus, and serological investigations revealed that H9N2 subtype virus infection was present in swine herds in Shandong Province. The results of this study suggest that continuous surveillance of the SIV epidemiological situation and its pathogenic characteristics should be strengthened.     

Pathogenesis and Subsequent Cross‐Protection of Influenza Virus Infection in Pigs Sustained by an H1N2 Strain

The H1N1, H3N2 and, more recently, H1N2 subtypes of influenza A virus are presently co‐circulating in swine herds in several countries. The objectives of this study were to investigate the pathogenesis of Sw/Italy/1521/98 (H1N2) influenza virus, isolated from respiratory tissues of pigs from herds in Northern Italy, and to evaluate its potential cross‐protection against the Sw/Fin/2899/82 (H1N1) strain. In the pathogenesis test, eight pigs were intranasally infected with H1N2 virus; at pre‐determined intervals, these animals were killed and necropsied, along with eight uninfected animals. In the cross‐protection test, sixteen pigs were infected by intranasal (i.n.) and intratracheal (i.t.) routes with either H1N2 or H1N1 virus. Twenty days later, all pigs were challenged (by the same route), with either the homologous H1N2 or heterologous H1N1 virus strains. Control group was inoculated with culture medium alone. On post‐challenge days (PCD) 1 and 3, two pigs from each infected group, along with one control pig, were killed. Clinical, virological, serological and histopathological investigations were performed in both the pathogenicity and cross‐protection tests. In the pathogenicity test, mild clinical signs were observed in two pigs during 3 and 4 days, respectively. Virus was isolated from two pigs over 6 days and from lung samples of pigs killed on post‐infection days 2 and 4. Seroconversion was detected in the two infected animals killed 15 days after infection. In the cross‐protection study, mild clinical respiratory signs were detected in all pigs infected with either the H1N2 or H1N1 virus. The virus was isolated from nasal swabs of almost all pigs till 6 days. After the challenge infection, the pigs remained clinically healthy and virus isolation from the nasal secretions or lung samples was sporadic. Antibody titres in H1N1 or H1N2 infected groups were similar, whereas the H1N2 sub‐type induced less protection against re‐infection by homologous and heterologous virus than H1N1 sub‐type. The controls had no signs of the disease. In the H1N2 infected pigs, a reduced number of goblet cells in nasal and tracheal mucosa and small foci of lymphomononuclear cell infiltrates in the submucosa were detected. Furthermore, the goblet cell reduction was related to the time of infection. Diffuse mild interstitial pneumonia was also recorded in pigs infected with the H1N2 virus and challenged with either H1N1or H1N2 pigs. These studies showed the moderate virulence of the H1N2 virus and a partial cross‐protection against heterologous infection.